MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016835	TCT	2	6	50507	50512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703973
1002	NC_016835	CGG	2	6	50543	50548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703973
1003	NC_016835	GCCA	2	8	50556	50563	25 %	0 %	25 %	50 %	379703973
1004	NC_016835	GCT	2	6	50658	50663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703973
1005	NC_016835	TGA	2	6	50723	50728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703973
1006	NC_016835	CTG	2	6	50740	50745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703973
1007	NC_016835	CTT	2	6	50791	50796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703973
1008	NC_016835	CGG	2	6	50831	50836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703973
1009	NC_016835	CGT	2	6	50913	50918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703973
1010	NC_016835	TGGC	2	8	50955	50962	0 %	25 %	50 %	25 %	379703973
1011	NC_016835	TGG	2	6	50987	50992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703973
1012	NC_016835	GCTT	2	8	51003	51010	0 %	50 %	25 %	25 %	379703973
1013	NC_016835	GCGG	2	8	51193	51200	0 %	0 %	75 %	25 %	379703973
1014	NC_016835	TGCCT	2	10	51302	51311	0 %	40 %	20 %	40 %	379703973
1015	NC_016835	ACTC	2	8	51363	51370	25 %	25 %	0 %	50 %	379703973
1016	NC_016835	CGG	2	6	51399	51404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703973
1017	NC_016835	AGG	2	6	51465	51470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379703973
1018	NC_016835	TCT	2	6	51493	51498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703973
1019	NC_016835	G	7	7	51540	51546	0 %	0 %	100 %	0 %	379703973
1020	NC_016835	TATT	2	8	51557	51564	25 %	75 %	0 %	0 %	379703973
1021	NC_016835	CGG	2	6	51566	51571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703973
1022	NC_016835	GGTC	2	8	51618	51625	0 %	25 %	50 %	25 %	379703973
1023	NC_016835	ATC	2	6	51688	51693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_016835	TTG	2	6	51740	51745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016835	CGG	2	6	51872	51877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_016835	ACA	2	6	52007	52012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_016835	TA	3	6	52080	52085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016835	ATA	2	6	52095	52100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016835	TA	3	6	52149	52154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016835	TTAATT	2	12	52157	52168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016835	CAT	2	6	52266	52271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703974
1032	NC_016835	CGG	2	6	52473	52478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703974
1033	NC_016835	TTC	2	6	52519	52524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703974
1034	NC_016835	GGTC	2	8	52569	52576	0 %	25 %	50 %	25 %	379703974
1035	NC_016835	CTT	2	6	52587	52592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703974
1036	NC_016835	TGG	2	6	52604	52609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703974
1037	NC_016835	CGT	2	6	52695	52700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703974
1038	NC_016835	ATGG	2	8	52875	52882	25 %	25 %	50 %	0 %	379703974
1039	NC_016835	TCG	2	6	52889	52894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703974
1040	NC_016835	CCCG	2	8	52989	52996	0 %	0 %	25 %	75 %	379703974
1041	NC_016835	AGA	2	6	53142	53147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703974
1042	NC_016835	CAT	2	6	53184	53189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703974
1043	NC_016835	CTG	2	6	53203	53208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703974
1044	NC_016835	CCCG	2	8	53267	53274	0 %	0 %	25 %	75 %	379703974
1045	NC_016835	GCT	2	6	53289	53294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703974
1046	NC_016835	CTG	2	6	53320	53325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703974
1047	NC_016835	GTGG	2	8	53361	53368	0 %	25 %	75 %	0 %	379703974
1048	NC_016835	CTG	2	6	53446	53451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703974
1049	NC_016835	CTG	2	6	53585	53590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703974
1050	NC_016835	A	6	6	53623	53628	100 %	0 %	0 %	0 %	379703974
1051	NC_016835	TGAT	2	8	53631	53638	25 %	50 %	25 %	0 %	379703974
1052	NC_016835	TAT	2	6	53644	53649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703975
1053	NC_016835	GATG	2	8	53692	53699	25 %	25 %	50 %	0 %	379703975
1054	NC_016835	ATG	2	6	53759	53764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703975
1055	NC_016835	CTGG	2	8	53803	53810	0 %	25 %	50 %	25 %	379703975
1056	NC_016835	TGT	2	6	53995	54000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703975
1057	NC_016835	TCAG	2	8	54009	54016	25 %	25 %	25 %	25 %	379703975
1058	NC_016835	GCTG	2	8	54087	54094	0 %	25 %	50 %	25 %	379703975
1059	NC_016835	TGG	2	6	54126	54131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703975
1060	NC_016835	GCT	2	6	54142	54147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703975
1061	NC_016835	AGA	2	6	54192	54197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703975
1062	NC_016835	TCA	2	6	54222	54227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703975
1063	NC_016835	CTG	2	6	54230	54235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703975
1064	NC_016835	TAT	2	6	54247	54252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703975
1065	NC_016835	TGCCGG	2	12	54327	54338	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379703975
1066	NC_016835	CTG	2	6	54407	54412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703975
1067	NC_016835	ATT	2	6	54470	54475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703975
1068	NC_016835	CAT	2	6	54504	54509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703975
1069	NC_016835	A	6	6	54513	54518	100 %	0 %	0 %	0 %	379703975
1070	NC_016835	GCG	2	6	54542	54547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703975
1071	NC_016835	ATT	2	6	54551	54556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703975
1072	NC_016835	TTA	2	6	54586	54591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703975
1073	NC_016835	GCG	2	6	54650	54655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_016835	ATT	2	6	54663	54668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016835	AGG	2	6	54685	54690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016835	TGA	2	6	54694	54699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703976
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1078	NC_016835	TGG	2	6	54790	54795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703976
1079	NC_016835	ATG	3	9	54810	54818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703976
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1081	NC_016835	CAG	2	6	54862	54867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_016835	TTC	2	6	54926	54931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703977
1083	NC_016835	GCG	2	6	55008	55013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703977
1084	NC_016835	GAT	2	6	55072	55077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703977
1085	NC_016835	GGGT	2	8	55139	55146	0 %	25 %	75 %	0 %	379703977
1086	NC_016835	TGCC	2	8	55186	55193	0 %	25 %	25 %	50 %	379703977
1087	NC_016835	CGC	2	6	55198	55203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703977
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1089	NC_016835	CGG	2	6	55262	55267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703977
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1091	NC_016835	CCA	2	6	55443	55448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703977
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1093	NC_016835	A	6	6	55718	55723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016835	T	7	7	55796	55802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016835	A	6	6	55874	55879	100 %	0 %	0 %	0 %	379703978
1096	NC_016835	CCG	3	9	55890	55898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703978
1097	NC_016835	AGA	2	6	56053	56058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703978
1098	NC_016835	GC	3	6	56064	56069	0 %	0 %	50 %	50 %	379703978
1099	NC_016835	GTA	2	6	56096	56101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703978
1100	NC_016835	GTC	2	6	56239	56244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703978
1101	NC_016835	GTTT	2	8	56464	56471	0 %	75 %	25 %	0 %	379703978
1102	NC_016835	GAA	2	6	56504	56509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703978
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1105	NC_016835	ATT	2	6	56668	56673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703979
1106	NC_016835	CTG	2	6	56708	56713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703979
1107	NC_016835	GC	3	6	56742	56747	0 %	0 %	50 %	50 %	379703979
1108	NC_016835	GCG	2	6	56763	56768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703979
1109	NC_016835	GGT	2	6	56947	56952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703979
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1111	NC_016835	CGG	2	6	57157	57162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703979
1112	NC_016835	CAAAGG	2	12	57172	57183	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379703979
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1114	NC_016835	AC	3	6	57297	57302	50 %	0 %	0 %	50 %	379703979
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1119	NC_016835	GGTCA	2	10	57440	57449	20 %	20 %	40 %	20 %	379703979
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1123	NC_016835	CCG	2	6	57629	57634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703980
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