MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_016835	GCA	2	6	462356	462361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704339
9502	NC_016835	CCGTGG	2	12	462391	462402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379704339
9503	NC_016835	GCA	2	6	462450	462455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704339
9504	NC_016835	AG	3	6	462500	462505	50 %	0 %	50 %	0 %	379704339
9505	NC_016835	GCT	2	6	462542	462547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704339
9506	NC_016835	CAGGG	2	10	462569	462578	20 %	0 %	60 %	20 %	379704339
9507	NC_016835	ATG	2	6	462606	462611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704339
9508	NC_016835	AAC	2	6	462645	462650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704339
9509	NC_016835	CTGG	2	8	462836	462843	0 %	25 %	50 %	25 %	379704339
9510	NC_016835	GCA	2	6	462848	462853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704339
9511	NC_016835	TCC	2	6	462872	462877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704339
9512	NC_016835	CCG	2	6	462888	462893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704339
9513	NC_016835	GCTC	2	8	462976	462983	0 %	25 %	25 %	50 %	379704339
9514	NC_016835	TGG	2	6	463003	463008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704339
9515	NC_016835	GCTG	2	8	463027	463034	0 %	25 %	50 %	25 %	379704339
9516	NC_016835	AC	3	6	463049	463054	50 %	0 %	0 %	50 %	379704339
9517	NC_016835	CAA	2	6	463195	463200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704339
9518	NC_016835	CGT	2	6	463230	463235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704339
9519	NC_016835	TCA	2	6	463293	463298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704339
9520	NC_016835	TGAT	2	8	463301	463308	25 %	50 %	25 %	0 %	379704339
9521	NC_016835	GAC	2	6	463370	463375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704340
9522	NC_016835	GCA	2	6	463422	463427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704340
9523	NC_016835	AAC	2	6	463472	463477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704340
9524	NC_016835	TTC	2	6	463537	463542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704340
9525	NC_016835	ACC	2	6	463568	463573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704340
9526	NC_016835	CTG	2	6	463590	463595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704340
9527	NC_016835	ACG	2	6	463617	463622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704340
9528	NC_016835	ACC	2	6	463728	463733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704340
9529	NC_016835	A	6	6	463758	463763	100 %	0 %	0 %	0 %	379704340
9530	NC_016835	CAT	2	6	463789	463794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704340
9531	NC_016835	GAAC	2	8	463810	463817	50 %	0 %	25 %	25 %	379704340
9532	NC_016835	ACC	2	6	463820	463825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704340
9533	NC_016835	CAG	2	6	463839	463844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9534	NC_016835	CTG	2	6	463857	463862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9535	NC_016835	GCC	2	6	463877	463882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9536	NC_016835	CAAA	2	8	463898	463905	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.