MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016835	TTG	2	6	24876	24881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703949
502	NC_016835	CTGTC	2	10	24939	24948	0 %	40 %	20 %	40 %	379703949
503	NC_016835	AC	3	6	24967	24972	50 %	0 %	0 %	50 %	379703949
504	NC_016835	CTG	2	6	24973	24978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703949
505	NC_016835	AGAT	2	8	25110	25117	50 %	25 %	25 %	0 %	379703949
506	NC_016835	ATCT	2	8	25133	25140	25 %	50 %	0 %	25 %	379703949
507	NC_016835	AGC	2	6	25160	25165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703949
508	NC_016835	GAA	2	6	25274	25279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703949
509	NC_016835	GTT	2	6	25327	25332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703949
510	NC_016835	TGAG	2	8	25440	25447	25 %	25 %	50 %	0 %	379703949
511	NC_016835	GATACC	2	12	25472	25483	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379703949
512	NC_016835	GAAT	2	8	25558	25565	50 %	25 %	25 %	0 %	379703949
513	NC_016835	ATG	2	6	25694	25699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703949
514	NC_016835	ATG	2	6	25704	25709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703949
515	NC_016835	CA	3	6	25727	25732	50 %	0 %	0 %	50 %	379703949
516	NC_016835	CGG	2	6	25780	25785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703949
517	NC_016835	AAC	2	6	25815	25820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703949
518	NC_016835	CAC	2	6	25942	25947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703949
519	NC_016835	TGA	2	6	25998	26003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703949
520	NC_016835	ATG	2	6	26030	26035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703949
521	NC_016835	TGC	2	6	26049	26054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703949
522	NC_016835	GAT	2	6	26084	26089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703949
523	NC_016835	TTG	2	6	26118	26123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703949
524	NC_016835	ACC	2	6	26133	26138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703949
525	NC_016835	TGC	2	6	26166	26171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703949
526	NC_016835	TGC	2	6	26247	26252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703949
527	NC_016835	CTT	2	6	26257	26262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703949
528	NC_016835	GCT	2	6	26454	26459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703950
529	NC_016835	CACC	2	8	26576	26583	25 %	0 %	0 %	75 %	379703950
530	NC_016835	ACC	2	6	26590	26595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703950
531	NC_016835	CGA	2	6	26643	26648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703950
532	NC_016835	CGG	2	6	26659	26664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703950
533	NC_016835	ACC	2	6	26705	26710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703950
534	NC_016835	TGA	2	6	26714	26719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703950
535	NC_016835	CTG	2	6	26935	26940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703950
536	NC_016835	CAGCG	2	10	27040	27049	20 %	0 %	40 %	40 %	379703950
537	NC_016835	AAAGG	2	10	27061	27070	60 %	0 %	40 %	0 %	379703950
538	NC_016835	TGA	2	6	27098	27103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703950
539	NC_016835	GAA	2	6	27115	27120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703950
540	NC_016835	CGG	2	6	27138	27143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703950
541	NC_016835	TGC	2	6	27233	27238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703950
542	NC_016835	CGG	2	6	27252	27257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703950
543	NC_016835	TTA	2	6	27379	27384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703950
544	NC_016835	T	6	6	27450	27455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016835	GAA	2	6	27462	27467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016835	AAT	2	6	27489	27494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703951
547	NC_016835	TCGC	2	8	27688	27695	0 %	25 %	25 %	50 %	379703951
548	NC_016835	CGC	2	6	27741	27746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703951
549	NC_016835	GCT	3	9	27759	27767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703951
550	NC_016835	CGA	2	6	27774	27779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703951
551	NC_016835	GGT	2	6	27882	27887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703951
552	NC_016835	GTT	2	6	27891	27896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703951
553	NC_016835	ACA	2	6	27912	27917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703951
554	NC_016835	GTG	2	6	27931	27936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703951
555	NC_016835	GTT	2	6	28002	28007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703951
556	NC_016835	TCT	2	6	28056	28061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703952
557	NC_016835	TGC	2	6	28220	28225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703952
558	NC_016835	CCG	2	6	28316	28321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703952
559	NC_016835	GCT	2	6	28362	28367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703952
560	NC_016835	GTG	2	6	28417	28422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703952
561	NC_016835	GACC	2	8	28521	28528	25 %	0 %	25 %	50 %	379703952
562	NC_016835	CGC	2	6	28781	28786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703952
563	NC_016835	GC	3	6	28796	28801	0 %	0 %	50 %	50 %	379703952
564	NC_016835	GCGCC	2	10	28811	28820	0 %	0 %	40 %	60 %	379703952
565	NC_016835	CGC	3	9	28881	28889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703952
566	NC_016835	CAC	2	6	28962	28967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703952
567	NC_016835	TCG	2	6	29054	29059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703952
568	NC_016835	CCG	2	6	29140	29145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703952
569	NC_016835	CGG	2	6	29316	29321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703952
570	NC_016835	ACGGCT	2	12	29324	29335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379703952
571	NC_016835	CGG	2	6	29382	29387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703952
572	NC_016835	CGC	3	9	29409	29417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703952
573	NC_016835	GGA	2	6	29508	29513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379703952
574	NC_016835	GAG	2	6	29524	29529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379703952
575	NC_016835	TCG	2	6	29582	29587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703952
576	NC_016835	CGCGC	2	10	29598	29607	0 %	0 %	40 %	60 %	379703952
577	NC_016835	CGA	2	6	29631	29636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703952
578	NC_016835	GCG	2	6	29651	29656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703952
579	NC_016835	CGCAGG	2	12	29690	29701	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379703952
580	NC_016835	CG	3	6	29719	29724	0 %	0 %	50 %	50 %	379703952
581	NC_016835	GCC	2	6	29776	29781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703952
582	NC_016835	GGT	2	6	29859	29864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703952
583	NC_016835	GC	3	6	29873	29878	0 %	0 %	50 %	50 %	379703952
584	NC_016835	GCG	2	6	29900	29905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703952
585	NC_016835	GCC	2	6	29930	29935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703952
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588	NC_016835	A	6	6	30113	30118	100 %	0 %	0 %	0 %	379703952
589	NC_016835	CGG	2	6	30129	30134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703952
590	NC_016835	GGC	3	9	30182	30190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703952
591	NC_016835	ACGGC	2	10	30225	30234	20 %	0 %	40 %	40 %	379703952
592	NC_016835	CGC	2	6	30255	30260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703952
593	NC_016835	GGC	2	6	30289	30294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703952
594	NC_016835	GCC	2	6	30302	30307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703952
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597	NC_016835	TGA	2	6	30413	30418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703953
598	NC_016835	AT	3	6	30634	30639	50 %	50 %	0 %	0 %	379703953
599	NC_016835	TTCCT	2	10	30655	30664	0 %	60 %	0 %	40 %	379703953
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601	NC_016835	T	6	6	30702	30707	0 %	100 %	0 %	0 %	379703953
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604	NC_016835	TTC	2	6	30905	30910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_016835	GTA	2	6	30929	30934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703954
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607	NC_016835	TA	3	6	30986	30991	50 %	50 %	0 %	0 %	379703954
608	NC_016835	ATT	2	6	31010	31015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703954
609	NC_016835	GAT	2	6	31037	31042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703954
610	NC_016835	G	6	6	31043	31048	0 %	0 %	100 %	0 %	379703954
611	NC_016835	TAA	2	6	31128	31133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703954
612	NC_016835	ACAAA	2	10	31158	31167	80 %	0 %	0 %	20 %	379703954
613	NC_016835	G	6	6	31349	31354	0 %	0 %	100 %	0 %	379703955
614	NC_016835	GTT	2	6	31356	31361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703955
615	NC_016835	GAA	2	6	31434	31439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703955
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617	NC_016835	AAT	2	6	31598	31603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703955
618	NC_016835	CTG	2	6	31653	31658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703955
619	NC_016835	T	6	6	31686	31691	0 %	100 %	0 %	0 %	379703955
620	NC_016835	ATGA	2	8	31695	31702	50 %	25 %	25 %	0 %	379703955
621	NC_016835	AAGC	2	8	31755	31762	50 %	0 %	25 %	25 %	379703955
622	NC_016835	AGA	2	6	31865	31870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703955
623	NC_016835	AAT	2	6	31925	31930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379703955
624	NC_016835	CAAA	2	8	31933	31940	75 %	0 %	0 %	25 %	379703955
625	NC_016835	A	6	6	31987	31992	100 %	0 %	0 %	0 %	379703956
626	NC_016835	AT	3	6	32010	32015	50 %	50 %	0 %	0 %	379703956
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628	NC_016835	TGA	2	6	32197	32202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703956
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