MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016835	AAT	2	6	247216	247221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704152
5002	NC_016835	AAT	2	6	247265	247270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704152
5003	NC_016835	ATC	2	6	247292	247297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_016835	T	6	6	247400	247405	0 %	100 %	0 %	0 %	379704153
5005	NC_016835	TCTT	2	8	247428	247435	0 %	75 %	0 %	25 %	379704153
5006	NC_016835	TGT	2	6	247483	247488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704153
5007	NC_016835	T	6	6	247505	247510	0 %	100 %	0 %	0 %	379704153
5008	NC_016835	TCTT	2	8	247542	247549	0 %	75 %	0 %	25 %	379704153
5009	NC_016835	GTG	2	6	247572	247577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704153
5010	NC_016835	CAT	2	6	247589	247594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704153
5011	NC_016835	CAT	3	9	247607	247615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704153
5012	NC_016835	T	6	6	247625	247630	0 %	100 %	0 %	0 %	379704153
5013	NC_016835	GTT	2	6	247670	247675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016835	CCG	2	6	247691	247696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704154
5015	NC_016835	CAG	2	6	247861	247866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704154
5016	NC_016835	CCG	2	6	247941	247946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704154
5017	NC_016835	CGC	2	6	247989	247994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704154
5018	NC_016835	TGT	2	6	248061	248066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704154
5019	NC_016835	TCT	2	6	248153	248158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704154
5020	NC_016835	AAACGG	2	12	248176	248187	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379704154
5021	NC_016835	ATC	2	6	248195	248200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704154
5022	NC_016835	CAGC	2	8	248239	248246	25 %	0 %	25 %	50 %	379704154
5023	NC_016835	CGC	2	6	248337	248342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704154
5024	NC_016835	T	7	7	248466	248472	0 %	100 %	0 %	0 %	379704154
5025	NC_016835	T	6	6	248479	248484	0 %	100 %	0 %	0 %	379704154
5026	NC_016835	GCA	2	6	248508	248513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704155
5027	NC_016835	CCA	2	6	248541	248546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704155
5028	NC_016835	GCA	2	6	248556	248561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704155
5029	NC_016835	CCA	2	6	248571	248576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704155
5030	NC_016835	CG	3	6	248606	248611	0 %	0 %	50 %	50 %	379704155
5031	NC_016835	GCC	2	6	248620	248625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704155
5032	NC_016835	GC	3	6	248633	248638	0 %	0 %	50 %	50 %	379704155
5033	NC_016835	AGC	2	6	248639	248644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704155
5034	NC_016835	CAC	2	6	248665	248670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704155
5035	NC_016835	GGC	2	6	248719	248724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704155
5036	NC_016835	GC	3	6	248723	248728	0 %	0 %	50 %	50 %	379704155
5037	NC_016835	TGT	2	6	248736	248741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704155
5038	NC_016835	ATC	2	6	248752	248757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704155
5039	NC_016835	GCG	2	6	248780	248785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704155
5040	NC_016835	CG	3	6	248805	248810	0 %	0 %	50 %	50 %	379704155
5041	NC_016835	CCGG	2	8	248839	248846	0 %	0 %	50 %	50 %	379704155
5042	NC_016835	TCA	2	6	248856	248861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704155
5043	NC_016835	GCC	2	6	248923	248928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704155
5044	NC_016835	GCG	2	6	248976	248981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704155
5045	NC_016835	TGA	2	6	249095	249100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704155
5046	NC_016835	GT	3	6	249110	249115	0 %	50 %	50 %	0 %	379704155
5047	NC_016835	TAAA	2	8	249198	249205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016835	CGG	2	6	249217	249222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_016835	GAA	2	6	249288	249293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704156
5050	NC_016835	TGA	2	6	249351	249356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704156
5051	NC_016835	CGC	2	6	249375	249380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704156
5052	NC_016835	TGC	2	6	249446	249451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704156
5053	NC_016835	GCC	2	6	249476	249481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704156
5054	NC_016835	ATT	2	6	249514	249519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704156
5055	NC_016835	TGG	2	6	249611	249616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704156
5056	NC_016835	CGG	2	6	249637	249642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704156
5057	NC_016835	ATC	2	6	249737	249742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704156
5058	NC_016835	CG	3	6	249761	249766	0 %	0 %	50 %	50 %	379704156
5059	NC_016835	TGT	2	6	249776	249781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704156
5060	NC_016835	CTT	2	6	249783	249788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704156
5061	NC_016835	GAG	2	6	249982	249987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704156
5062	NC_016835	GCT	2	6	250050	250055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704157
5063	NC_016835	GCA	2	6	250159	250164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704157
5064	NC_016835	AAT	2	6	250165	250170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704157
5065	NC_016835	TCG	2	6	250283	250288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704157
5066	NC_016835	TGC	2	6	250293	250298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704157
5067	NC_016835	C	6	6	250300	250305	0 %	0 %	0 %	100 %	379704157
5068	NC_016835	GAC	2	6	250307	250312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704157
5069	NC_016835	CAG	2	6	250318	250323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704157
5070	NC_016835	GATT	2	8	250326	250333	25 %	50 %	25 %	0 %	379704157
5071	NC_016835	GCGCC	2	10	250421	250430	0 %	0 %	40 %	60 %	379704157
5072	NC_016835	ATC	2	6	250447	250452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704157
5073	NC_016835	CAT	2	6	250467	250472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704157
5074	NC_016835	TCT	2	6	250473	250478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704157
5075	NC_016835	CTG	2	6	250573	250578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704157
5076	NC_016835	GC	3	6	250583	250588	0 %	0 %	50 %	50 %	379704157
5077	NC_016835	CGG	2	6	250653	250658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704157
5078	NC_016835	GCCG	2	8	250695	250702	0 %	0 %	50 %	50 %	379704157
5079	NC_016835	CGC	2	6	250804	250809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704157
5080	NC_016835	CGC	2	6	250844	250849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704157
5081	NC_016835	ATC	2	6	250895	250900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704157
5082	NC_016835	TGA	2	6	250905	250910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704157
5083	NC_016835	A	6	6	250951	250956	100 %	0 %	0 %	0 %	379704157
5084	NC_016835	GGC	2	6	250961	250966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704157
5085	NC_016835	ATT	2	6	250977	250982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704157
5086	NC_016835	CGT	2	6	251007	251012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704157
5087	NC_016835	GAT	2	6	251154	251159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704157
5088	NC_016835	CAGG	2	8	251242	251249	25 %	0 %	50 %	25 %	379704157
5089	NC_016835	CGGGC	2	10	251277	251286	0 %	0 %	60 %	40 %	379704157
5090	NC_016835	CGTC	3	12	251316	251327	0 %	25 %	25 %	50 %	379704157
5091	NC_016835	CAA	2	6	251340	251345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704157
5092	NC_016835	GGGCTG	2	12	251359	251370	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379704157
5093	NC_016835	GAC	2	6	251537	251542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_016835	GAC	2	6	251569	251574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_016835	TGGTC	2	10	251638	251647	0 %	40 %	40 %	20 %	379704158
5096	NC_016835	CGT	2	6	251723	251728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704158
5097	NC_016835	TGGG	2	8	251781	251788	0 %	25 %	75 %	0 %	379704158
5098	NC_016835	CATT	2	8	251806	251813	25 %	50 %	0 %	25 %	379704158
5099	NC_016835	GTG	2	6	251820	251825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704158
5100	NC_016835	CTG	2	6	251868	251873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704158
5101	NC_016835	CGA	2	6	251905	251910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704158
5102	NC_016835	T	7	7	251966	251972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016835	AG	3	6	251995	252000	50 %	0 %	50 %	0 %	379704159
5104	NC_016835	CTG	2	6	252011	252016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704159
5105	NC_016835	TGA	2	6	252067	252072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704159
5106	NC_016835	ATG	2	6	252234	252239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704159
5107	NC_016835	GTTT	2	8	252306	252313	0 %	75 %	25 %	0 %	379704159
5108	NC_016835	T	7	7	252311	252317	0 %	100 %	0 %	0 %	379704159
5109	NC_016835	T	6	6	252331	252336	0 %	100 %	0 %	0 %	379704159
5110	NC_016835	CGC	2	6	252363	252368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704159
5111	NC_016835	CAT	2	6	252379	252384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704159
5112	NC_016835	T	8	8	252384	252391	0 %	100 %	0 %	0 %	379704159
5113	NC_016835	GCG	2	6	252462	252467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_016835	GCA	2	6	252535	252540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_016835	GCC	2	6	252586	252591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_016835	CTG	2	6	252602	252607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_016835	ATC	2	6	252615	252620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_016835	CTGC	2	8	252817	252824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_016835	GTT	2	6	252850	252855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_016835	TC	5	10	252856	252865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_016835	TCA	3	9	252909	252917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_016835	GCT	2	6	252942	252947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_016835	CCGC	2	8	253001	253008	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5124	NC_016835	TG	3	6	253021	253026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_016835	AAT	2	6	253084	253089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_016835	ATT	2	6	253106	253111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_016835	T	8	8	253179	253186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_016835	TAT	2	6	253255	253260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_016835	GGT	2	6	253270	253275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_016835	AAT	2	6	253282	253287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_016835	TTA	2	6	253295	253300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_016835	T	6	6	253314	253319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_016835	A	6	6	253357	253362	100 %	0 %	0 %	0 %	379704160
5134	NC_016835	TTA	2	6	253363	253368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704160
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5140	NC_016835	TA	3	6	253633	253638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_016835	TAT	2	6	253747	253752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_016835	ATC	2	6	253758	253763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5143	NC_016835	TCTGG	2	10	253776	253785	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5144	NC_016835	CCA	2	6	253804	253809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704161
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5146	NC_016835	CG	3	6	253830	253835	0 %	0 %	50 %	50 %	379704161
5147	NC_016835	CAC	2	6	253857	253862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704161
5148	NC_016835	GCTG	2	8	253864	253871	0 %	25 %	50 %	25 %	379704161
5149	NC_016835	GAT	2	6	253914	253919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704161
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5151	NC_016835	TGG	2	6	254017	254022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704161
5152	NC_016835	T	6	6	254024	254029	0 %	100 %	0 %	0 %	379704161
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5157	NC_016835	TGA	2	6	254322	254327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704162
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5163	NC_016835	CTGG	2	8	254437	254444	0 %	25 %	50 %	25 %	379704162
5164	NC_016835	GCA	2	6	254446	254451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704162
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5180	NC_016835	ATAA	2	8	255329	255336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5181	NC_016835	AC	3	6	255396	255401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5182	NC_016835	A	7	7	255405	255411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5183	NC_016835	TCACGC	2	12	255440	255451	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379704163
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5221	NC_016835	AC	3	6	257490	257495	50 %	0 %	0 %	50 %	379704163
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5228	NC_016835	T	6	6	257848	257853	0 %	100 %	0 %	0 %	379704164
5229	NC_016835	T	6	6	257884	257889	0 %	100 %	0 %	0 %	379704164
5230	NC_016835	CTGC	2	8	257891	257898	0 %	25 %	25 %	50 %	379704164
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5235	NC_016835	GTCG	2	8	258091	258098	0 %	25 %	50 %	25 %	379704164
5236	NC_016835	ATC	2	6	258152	258157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704164
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5241	NC_016835	ATC	2	6	258269	258274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704164
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5246	NC_016835	CG	3	6	258417	258422	0 %	0 %	50 %	50 %	379704164
5247	NC_016835	CTCG	2	8	258448	258455	0 %	25 %	25 %	50 %	379704164
5248	NC_016835	CAG	2	6	258482	258487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704164
5249	NC_016835	GCA	2	6	258583	258588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704164
5250	NC_016835	GAT	2	6	258604	258609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704164
5251	NC_016835	GCA	2	6	258619	258624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704164
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5256	NC_016835	T	6	6	258827	258832	0 %	100 %	0 %	0 %	379704165
5257	NC_016835	TGC	2	6	258878	258883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704165
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5259	NC_016835	TGG	2	6	258944	258949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704165
5260	NC_016835	TGC	2	6	258953	258958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704165
5261	NC_016835	CTGGCG	2	12	258970	258981	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379704165
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5274	NC_016835	TGC	2	6	259490	259495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704165
5275	NC_016835	CTG	2	6	259543	259548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704165
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5290	NC_016835	CTGA	2	8	260205	260212	25 %	25 %	25 %	25 %	379704166
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5292	NC_016835	CTG	2	6	260253	260258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704166
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5294	NC_016835	CTG	2	6	260328	260333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704166
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5300	NC_016835	GCACC	2	10	260508	260517	20 %	0 %	20 %	60 %	379704166
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5324	NC_016835	TGA	2	6	261384	261389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704167
5325	NC_016835	CATTC	2	10	261514	261523	20 %	40 %	0 %	40 %	379704168
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5330	NC_016835	CGA	2	6	261785	261790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704168
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5336	NC_016835	T	6	6	262117	262122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5337	NC_016835	TTA	2	6	262201	262206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704169
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5350	NC_016835	TC	3	6	263062	263067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5351	NC_016835	GA	3	6	263133	263138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5361	NC_016835	A	6	6	263435	263440	100 %	0 %	0 %	0 %	379704171
5362	NC_016835	CTGTCT	2	12	263463	263474	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379704171
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5365	NC_016835	CGC	2	6	263671	263676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704171
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5470	NC_016835	CCA	2	6	268967	268972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704175
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5477	NC_016835	CGGCG	2	10	269461	269470	0 %	0 %	60 %	40 %	379704176
5478	NC_016835	TCT	2	6	269523	269528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704176
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5484	NC_016835	GAT	2	6	269785	269790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704176
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5486	NC_016835	TGT	2	6	269861	269866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704176
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