MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 9536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016835	GGT	2	6	223355	223360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704134
4502	NC_016835	CGG	2	6	223390	223395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704134
4503	NC_016835	GCG	2	6	223440	223445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704134
4504	NC_016835	CAC	2	6	223460	223465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704134
4505	NC_016835	GGC	2	6	223469	223474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704134
4506	NC_016835	CGT	2	6	223489	223494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704134
4507	NC_016835	TGC	2	6	223545	223550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704134
4508	NC_016835	TCG	2	6	223641	223646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704134
4509	NC_016835	GCG	2	6	223651	223656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704134
4510	NC_016835	CGG	2	6	223670	223675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704134
4511	NC_016835	GCA	2	6	223761	223766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704134
4512	NC_016835	AGC	2	6	223770	223775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704134
4513	NC_016835	AGG	3	9	223830	223838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704135
4514	NC_016835	GGC	2	6	223844	223849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704135
4515	NC_016835	CGC	2	6	223855	223860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704135
4516	NC_016835	GC	3	6	223868	223873	0 %	0 %	50 %	50 %	379704135
4517	NC_016835	A	6	6	223876	223881	100 %	0 %	0 %	0 %	379704135
4518	NC_016835	CGG	2	6	223886	223891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704135
4519	NC_016835	GCCA	2	8	223897	223904	25 %	0 %	25 %	50 %	379704135
4520	NC_016835	GCC	2	6	223950	223955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704135
4521	NC_016835	GCC	2	6	223986	223991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704135
4522	NC_016835	GAC	2	6	223996	224001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704135
4523	NC_016835	GC	3	6	224015	224020	0 %	0 %	50 %	50 %	379704135
4524	NC_016835	TGT	2	6	224029	224034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704135
4525	NC_016835	CAG	2	6	224094	224099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704135
4526	NC_016835	GCA	2	6	224120	224125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704135
4527	NC_016835	CAGC	2	8	224130	224137	25 %	0 %	25 %	50 %	379704135
4528	NC_016835	CGG	2	6	224142	224147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704135
4529	NC_016835	GAC	2	6	224185	224190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704135
4530	NC_016835	CGG	2	6	224233	224238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704135
4531	NC_016835	CCA	2	6	224433	224438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704135
4532	NC_016835	GCG	2	6	224458	224463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704135
4533	NC_016835	TGGCG	2	10	224469	224478	0 %	20 %	60 %	20 %	379704135
4534	NC_016835	ACA	2	6	224492	224497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704135
4535	NC_016835	CAG	2	6	224562	224567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704135
4536	NC_016835	CGG	2	6	224612	224617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704135
4537	NC_016835	CAG	2	6	224682	224687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704135
4538	NC_016835	GC	3	6	224711	224716	0 %	0 %	50 %	50 %	379704135
4539	NC_016835	CAGG	2	8	224730	224737	25 %	0 %	50 %	25 %	379704135
4540	NC_016835	AGC	2	6	224776	224781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704135
4541	NC_016835	CAC	2	6	224799	224804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704135
4542	NC_016835	CAG	2	6	224811	224816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704135
4543	NC_016835	CG	3	6	224827	224832	0 %	0 %	50 %	50 %	379704135
4544	NC_016835	GC	3	6	224849	224854	0 %	0 %	50 %	50 %	379704135
4545	NC_016835	TGC	2	6	224875	224880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704135
4546	NC_016835	ATC	2	6	224934	224939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704135
4547	NC_016835	CAC	2	6	224964	224969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704135
4548	NC_016835	CTG	2	6	224998	225003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704135
4549	NC_016835	AGC	3	9	225007	225015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704135
4550	NC_016835	GCA	2	6	225102	225107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704136
4551	NC_016835	GC	3	6	225134	225139	0 %	0 %	50 %	50 %	379704136
4552	NC_016835	CGC	2	6	225174	225179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704136
4553	NC_016835	CAG	2	6	225190	225195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704136
4554	NC_016835	CGTG	2	8	225228	225235	0 %	25 %	50 %	25 %	379704136
4555	NC_016835	TCG	2	6	225329	225334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704136
4556	NC_016835	CCA	2	6	225336	225341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704136
4557	NC_016835	AAC	2	6	225425	225430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704136
4558	NC_016835	AAT	2	6	225517	225522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704136
4559	NC_016835	CGG	2	6	225541	225546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704136
4560	NC_016835	CCGG	2	8	225554	225561	0 %	0 %	50 %	50 %	379704136
4561	NC_016835	CGC	2	6	225651	225656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704136
4562	NC_016835	CAG	2	6	225676	225681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704136
4563	NC_016835	CAG	2	6	225688	225693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704136
4564	NC_016835	GGA	2	6	225694	225699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704136
4565	NC_016835	GGC	2	6	225741	225746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704136
4566	NC_016835	TGCG	2	8	225785	225792	0 %	25 %	50 %	25 %	379704136
4567	NC_016835	AGAA	2	8	225795	225802	75 %	0 %	25 %	0 %	379704136
4568	NC_016835	GGC	2	6	225819	225824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704136
4569	NC_016835	TGCAGA	2	12	225833	225844	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379704136
4570	NC_016835	GCG	2	6	225922	225927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704137
4571	NC_016835	GCG	2	6	225937	225942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704137
4572	NC_016835	CCA	2	6	226007	226012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704137
4573	NC_016835	GC	3	6	226036	226041	0 %	0 %	50 %	50 %	379704137
4574	NC_016835	GCG	2	6	226054	226059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704137
4575	NC_016835	CAG	2	6	226083	226088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704137
4576	NC_016835	CCA	2	6	226184	226189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704137
4577	NC_016835	CGCCAG	2	12	226212	226223	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379704137
4578	NC_016835	CCG	2	6	226243	226248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704137
4579	NC_016835	CCG	2	6	226256	226261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704137
4580	NC_016835	GCG	2	6	226336	226341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704137
4581	NC_016835	TCA	2	6	226373	226378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704137
4582	NC_016835	GGA	2	6	226395	226400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704137
4583	NC_016835	GGC	2	6	226428	226433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704137
4584	NC_016835	CA	3	6	226457	226462	50 %	0 %	0 %	50 %	379704137
4585	NC_016835	TGC	2	6	226484	226489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704137
4586	NC_016835	ACCGGA	2	12	226548	226559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704137
4587	NC_016835	TGT	2	6	226685	226690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704137
4588	NC_016835	GT	3	6	226689	226694	0 %	50 %	50 %	0 %	379704137
4589	NC_016835	ATAAC	2	10	226738	226747	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4590	NC_016835	ATG	2	6	226838	226843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_016835	GCT	2	6	226852	226857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_016835	ATG	2	6	226869	226874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_016835	TC	3	6	226921	226926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_016835	ATC	2	6	226927	226932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_016835	GAC	2	6	226940	226945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_016835	CGG	2	6	226973	226978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704138
4597	NC_016835	GTT	2	6	227029	227034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704138
4598	NC_016835	AT	3	6	227190	227195	50 %	50 %	0 %	0 %	379704138
4599	NC_016835	GGGC	2	8	227243	227250	0 %	0 %	75 %	25 %	379704138
4600	NC_016835	GGT	2	6	227299	227304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704138
4601	NC_016835	CCG	2	6	227409	227414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704138
4602	NC_016835	GAC	2	6	227489	227494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704138
4603	NC_016835	TG	3	6	227505	227510	0 %	50 %	50 %	0 %	379704138
4604	NC_016835	CAAA	2	8	227527	227534	75 %	0 %	0 %	25 %	379704138
4605	NC_016835	GCTG	2	8	227548	227555	0 %	25 %	50 %	25 %	379704138
4606	NC_016835	ATT	2	6	227627	227632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704138
4607	NC_016835	ACC	2	6	227634	227639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704138
4608	NC_016835	GGC	2	6	227729	227734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704138
4609	NC_016835	TAGT	2	8	227742	227749	25 %	50 %	25 %	0 %	379704138
4610	NC_016835	CAC	2	6	227759	227764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704138
4611	NC_016835	ATG	2	6	227825	227830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704138
4612	NC_016835	GCC	2	6	227835	227840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704138
4613	NC_016835	CTT	2	6	227882	227887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704138
4614	NC_016835	CTGG	2	8	227906	227913	0 %	25 %	50 %	25 %	379704138
4615	NC_016835	GCCA	2	8	227930	227937	25 %	0 %	25 %	50 %	379704138
4616	NC_016835	TGA	2	6	228057	228062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704139
4617	NC_016835	T	6	6	228228	228233	0 %	100 %	0 %	0 %	379704139
4618	NC_016835	CCA	2	6	228279	228284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704139
4619	NC_016835	ACG	2	6	228386	228391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704139
4620	NC_016835	GTT	2	6	228394	228399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704139
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4622	NC_016835	CATC	2	8	228527	228534	25 %	25 %	0 %	50 %	379704139
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4993	NC_016835	GC	3	6	246938	246943	0 %	0 %	50 %	50 %	379704152
4994	NC_016835	CGC	2	6	246962	246967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704152
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4998	NC_016835	ATTA	2	8	247144	247151	50 %	50 %	0 %	0 %	379704152
4999	NC_016835	GCA	2	6	247157	247162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704152
5000	NC_016835	CTG	2	6	247168	247173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704152

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