MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016819	AG	3	6	595	600	50 %	0 %	50 %	0 %	383192312
2	NC_016819	CG	4	8	763	770	0 %	0 %	50 %	50 %	383192312
3	NC_016819	GC	3	6	1268	1273	0 %	0 %	50 %	50 %	383192312
4	NC_016819	CT	3	6	2095	2100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016819	AC	3	6	3657	3662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016819	GC	3	6	4041	4046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016819	GA	3	6	4853	4858	50 %	0 %	50 %	0 %	383192317
8	NC_016819	GC	3	6	5008	5013	0 %	0 %	50 %	50 %	383192317
9	NC_016819	AC	3	6	5280	5285	50 %	0 %	0 %	50 %	383192317
10	NC_016819	TG	3	6	5383	5388	0 %	50 %	50 %	0 %	383192317
11	NC_016819	AG	4	8	5588	5595	50 %	0 %	50 %	0 %	383192317
12	NC_016819	AG	3	6	5825	5830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016819	AG	3	6	5902	5907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016819	AC	3	6	6056	6061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016819	GC	3	6	6323	6328	0 %	0 %	50 %	50 %	383192318
16	NC_016819	AG	3	6	6641	6646	50 %	0 %	50 %	0 %	383192318
17	NC_016819	AG	3	6	6859	6864	50 %	0 %	50 %	0 %	383192318
18	NC_016819	CG	3	6	6898	6903	0 %	0 %	50 %	50 %	383192318
19	NC_016819	TC	3	6	7333	7338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016819	CT	3	6	7807	7812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016819	CT	3	6	8294	8299	0 %	50 %	0 %	50 %	383192319
22	NC_016819	AT	3	6	8517	8522	50 %	50 %	0 %	0 %	383192319
23	NC_016819	AC	3	6	9886	9891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016819	CT	3	6	9904	9909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016819	AT	3	6	10232	10237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016819	GC	3	6	10344	10349	0 %	0 %	50 %	50 %	383192321
27	NC_016819	CA	3	6	10834	10839	50 %	0 %	0 %	50 %	383192321
28	NC_016819	GA	3	6	10919	10924	50 %	0 %	50 %	0 %	383192321
29	NC_016819	CG	3	6	10997	11002	0 %	0 %	50 %	50 %	383192321
30	NC_016819	AG	3	6	12755	12760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016819	CG	3	6	12973	12978	0 %	0 %	50 %	50 %	383192323
32	NC_016819	GC	3	6	13292	13297	0 %	0 %	50 %	50 %	383192323
33	NC_016819	GC	3	6	14448	14453	0 %	0 %	50 %	50 %	383192324
34	NC_016819	GC	5	10	15826	15835	0 %	0 %	50 %	50 %	383192325
35	NC_016819	TG	3	6	16004	16009	0 %	50 %	50 %	0 %	383192325
36	NC_016819	CA	3	6	17554	17559	50 %	0 %	0 %	50 %	383192327
37	NC_016819	CG	3	6	19741	19746	0 %	0 %	50 %	50 %	383192329
38	NC_016819	AC	3	6	20652	20657	50 %	0 %	0 %	50 %	383192330
39	NC_016819	TC	3	6	21783	21788	0 %	50 %	0 %	50 %	383192330
40	NC_016819	GC	3	6	22104	22109	0 %	0 %	50 %	50 %	383192330
41	NC_016819	CT	3	6	22857	22862	0 %	50 %	0 %	50 %	383192330
42	NC_016819	AT	3	6	23876	23881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016819	AT	3	6	26068	26073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016819	AG	3	6	26605	26610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016819	CA	3	6	26924	26929	50 %	0 %	0 %	50 %	383192336
46	NC_016819	CA	3	6	27222	27227	50 %	0 %	0 %	50 %	383192336
47	NC_016819	GA	3	6	29592	29597	50 %	0 %	50 %	0 %	383192338
48	NC_016819	GA	3	6	29923	29928	50 %	0 %	50 %	0 %	383192338
49	NC_016819	CA	3	6	30414	30419	50 %	0 %	0 %	50 %	383192339
50	NC_016819	AG	3	6	30477	30482	50 %	0 %	50 %	0 %	383192339
51	NC_016819	TA	3	6	30594	30599	50 %	50 %	0 %	0 %	383192339
52	NC_016819	GC	3	6	31514	31519	0 %	0 %	50 %	50 %	383192341
53	NC_016819	GA	3	6	31806	31811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016819	GC	3	6	32715	32720	0 %	0 %	50 %	50 %	383192342
55	NC_016819	AG	3	6	33098	33103	50 %	0 %	50 %	0 %	383192342
56	NC_016819	AT	3	6	33163	33168	50 %	50 %	0 %	0 %	383192342
57	NC_016819	TA	3	6	35968	35973	50 %	50 %	0 %	0 %	383192345
58	NC_016819	AT	3	6	37771	37776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016819	AT	3	6	37920	37925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016819	GC	3	6	38943	38948	0 %	0 %	50 %	50 %	383192347
61	NC_016819	TA	4	8	39376	39383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016819	TG	3	6	39641	39646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016819	AG	3	6	40773	40778	50 %	0 %	50 %	0 %	383192349
64	NC_016819	AG	3	6	41120	41125	50 %	0 %	50 %	0 %	383192349
65	NC_016819	TC	3	6	41378	41383	0 %	50 %	0 %	50 %	383192349
66	NC_016819	GC	3	6	41386	41391	0 %	0 %	50 %	50 %	383192349
67	NC_016819	CG	3	6	41433	41438	0 %	0 %	50 %	50 %	383192349
68	NC_016819	TC	3	6	41581	41586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016819	AG	3	6	42763	42768	50 %	0 %	50 %	0 %	383192351
70	NC_016819	CT	3	6	43329	43334	0 %	50 %	0 %	50 %	383192351
71	NC_016819	GT	3	6	43552	43557	0 %	50 %	50 %	0 %	383192351
72	NC_016819	GA	3	6	44804	44809	50 %	0 %	50 %	0 %	383192352
73	NC_016819	AT	4	8	47785	47792	50 %	50 %	0 %	0 %	383192357
74	NC_016819	CT	3	6	48736	48741	0 %	50 %	0 %	50 %	383192358
75	NC_016819	CG	3	6	50227	50232	0 %	0 %	50 %	50 %	383192359
76	NC_016819	AG	3	6	50307	50312	50 %	0 %	50 %	0 %	383192359
77	NC_016819	TA	4	8	51526	51533	50 %	50 %	0 %	0 %	383192360
78	NC_016819	CA	3	6	52124	52129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016819	TA	3	6	52420	52425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016819	TC	3	6	53228	53233	0 %	50 %	0 %	50 %	383192361
81	NC_016819	TG	3	6	53679	53684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016819	GC	3	6	54356	54361	0 %	0 %	50 %	50 %	383192363
83	NC_016819	GC	3	6	54451	54456	0 %	0 %	50 %	50 %	383192363
84	NC_016819	GA	3	6	55053	55058	50 %	0 %	50 %	0 %	383192364
85	NC_016819	TC	3	6	55953	55958	0 %	50 %	0 %	50 %	383192365
86	NC_016819	GT	3	6	57464	57469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016819	TG	3	6	59077	59082	0 %	50 %	50 %	0 %	383192368
88	NC_016819	TG	3	6	59994	59999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016819	AG	4	8	60103	60110	50 %	0 %	50 %	0 %	383192369
90	NC_016819	AG	3	6	60252	60257	50 %	0 %	50 %	0 %	383192369
91	NC_016819	GC	3	6	60517	60522	0 %	0 %	50 %	50 %	383192369
92	NC_016819	CG	3	6	60581	60586	0 %	0 %	50 %	50 %	383192369
93	NC_016819	TC	4	8	60674	60681	0 %	50 %	0 %	50 %	383192369
94	NC_016819	GC	3	6	60805	60810	0 %	0 %	50 %	50 %	383192369
95	NC_016819	GA	3	6	61194	61199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016819	TA	4	8	63491	63498	50 %	50 %	0 %	0 %	383192372
97	NC_016819	CT	3	6	63725	63730	0 %	50 %	0 %	50 %	383192372
98	NC_016819	GT	3	6	64085	64090	0 %	50 %	50 %	0 %	383192372
99	NC_016819	GT	3	6	64493	64498	0 %	50 %	50 %	0 %	383192372
100	NC_016819	AT	3	6	64651	64656	50 %	50 %	0 %	0 %	383192372
101	NC_016819	CT	3	6	65990	65995	0 %	50 %	0 %	50 %	383192372
102	NC_016819	TA	3	6	66360	66365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016819	CG	4	8	67356	67363	0 %	0 %	50 %	50 %	383192374
104	NC_016819	CG	3	6	67512	67517	0 %	0 %	50 %	50 %	383192374
105	NC_016819	GT	3	6	67575	67580	0 %	50 %	50 %	0 %	383192374
106	NC_016819	CG	3	6	69334	69339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016819	GC	3	6	69447	69452	0 %	0 %	50 %	50 %	383192376
108	NC_016819	GC	3	6	69983	69988	0 %	0 %	50 %	50 %	383192377
109	NC_016819	AT	3	6	70257	70262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016819	AT	3	6	70293	70298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016819	TC	3	6	70332	70337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016819	TG	3	6	70630	70635	0 %	50 %	50 %	0 %	383192378
113	NC_016819	GC	3	6	70723	70728	0 %	0 %	50 %	50 %	383192378
114	NC_016819	CG	3	6	71010	71015	0 %	0 %	50 %	50 %	383192378
115	NC_016819	CA	3	6	71674	71679	50 %	0 %	0 %	50 %	383192378
116	NC_016819	CG	3	6	74086	74091	0 %	0 %	50 %	50 %	383192380
117	NC_016819	GT	3	6	75138	75143	0 %	50 %	50 %	0 %	383192380
118	NC_016819	AT	3	6	76326	76331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016819	GA	3	6	76731	76736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016819	GC	3	6	77444	77449	0 %	0 %	50 %	50 %	383192384
121	NC_016819	CG	3	6	77861	77866	0 %	0 %	50 %	50 %	383192384
122	NC_016819	GC	3	6	78252	78257	0 %	0 %	50 %	50 %	383192384
123	NC_016819	TG	3	6	79897	79902	0 %	50 %	50 %	0 %	383192385
124	NC_016819	TA	3	6	80539	80544	50 %	50 %	0 %	0 %	383192386
125	NC_016819	GT	3	6	80990	80995	0 %	50 %	50 %	0 %	383192386
126	NC_016819	AT	3	6	81472	81477	50 %	50 %	0 %	0 %	383192387
127	NC_016819	TG	3	6	81636	81641	0 %	50 %	50 %	0 %	383192387
128	NC_016819	TA	3	6	81821	81826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016819	TA	4	8	82741	82748	50 %	50 %	0 %	0 %	383192388
130	NC_016819	GA	3	6	83620	83625	50 %	0 %	50 %	0 %	383192390
131	NC_016819	AG	3	6	84135	84140	50 %	0 %	50 %	0 %	383192390
132	NC_016819	GC	3	6	84186	84191	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
133	NC_016819	CG	3	6	84366	84371	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
134	NC_016819	CG	3	6	84416	84421	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
135	NC_016819	CG	3	6	84677	84682	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
136	NC_016819	GC	3	6	84753	84758	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
137	NC_016819	GC	3	6	84843	84848	0 %	0 %	50 %	50 %	383192390
138	NC_016819	TC	3	6	86662	86667	0 %	50 %	0 %	50 %	383192392
139	NC_016819	AG	3	6	88848	88853	50 %	0 %	50 %	0 %	383192394
140	NC_016819	TG	3	6	89318	89323	0 %	50 %	50 %	0 %	383192395
141	NC_016819	GC	3	6	91068	91073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016819	TG	3	6	91323	91328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016819	AT	3	6	91392	91397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016819	CG	3	6	92639	92644	0 %	0 %	50 %	50 %	383192397
145	NC_016819	CG	3	6	93209	93214	0 %	0 %	50 %	50 %	383192397
146	NC_016819	TG	3	6	93531	93536	0 %	50 %	50 %	0 %	383192397
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.