MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 1541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016819	ACT	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016819	CAT	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016819	AGC	2	6	394	399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016819	TGG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016819	CGC	2	6	545	550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016819	ATG	2	6	559	564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016819	GCA	3	9	570	578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016819	TGA	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192312
9	NC_016819	GTC	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192312
10	NC_016819	GCC	2	6	665	670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192312
11	NC_016819	GCC	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192312
12	NC_016819	GAT	2	6	910	915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192312
13	NC_016819	CAG	2	6	941	946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192312
14	NC_016819	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192312
15	NC_016819	CAA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192312
16	NC_016819	CAG	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192312
17	NC_016819	CTG	2	6	1201	1206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192312
18	NC_016819	ATG	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192312
19	NC_016819	CCA	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192312
20	NC_016819	ATT	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192312
21	NC_016819	GGT	2	6	1469	1474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192312
22	NC_016819	TAT	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192313
23	NC_016819	TGG	2	6	1665	1670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192313
24	NC_016819	TTA	2	6	1739	1744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192313
25	NC_016819	GAT	2	6	1816	1821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016819	TAA	2	6	1868	1873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016819	TTA	2	6	1881	1886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016819	TCA	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016819	TAA	2	6	2057	2062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016819	TTA	2	6	2128	2133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016819	CAA	3	9	2163	2171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016819	GAA	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016819	TTA	2	6	2236	2241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016819	TTA	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016819	CAT	2	6	2256	2261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016819	TGG	2	6	2380	2385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016819	GCA	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016819	TTA	2	6	2540	2545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192314
39	NC_016819	AAC	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192314
40	NC_016819	ACG	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192314
41	NC_016819	GTT	2	6	2791	2796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192315
42	NC_016819	CTG	3	9	3003	3011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192315
43	NC_016819	CAA	2	6	3122	3127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192315
44	NC_016819	CGC	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192315
45	NC_016819	ACC	2	6	3236	3241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192315
46	NC_016819	CGA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192315
47	NC_016819	AGT	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192315
48	NC_016819	AAT	2	6	3360	3365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192315
49	NC_016819	ATA	2	6	3410	3415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016819	TTA	2	6	3473	3478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016819	GCC	2	6	3493	3498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016819	AAT	2	6	3535	3540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016819	AAT	2	6	3563	3568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016819	ATT	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016819	ACA	2	6	3638	3643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016819	GTT	2	6	3785	3790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016819	CGG	2	6	3897	3902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016819	CGT	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016819	CAG	2	6	4009	4014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016819	ATT	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192316
61	NC_016819	TGC	2	6	4147	4152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192316
62	NC_016819	AAT	2	6	4242	4247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192316
63	NC_016819	CAA	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192316
64	NC_016819	AAG	2	6	4335	4340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192316
65	NC_016819	GCT	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192316
66	NC_016819	GTG	2	6	4489	4494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192316
67	NC_016819	GAG	2	6	4651	4656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016819	GCA	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192317
69	NC_016819	ACA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192317
70	NC_016819	GAC	2	6	4943	4948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192317
71	NC_016819	CAG	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192317
72	NC_016819	TTG	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192317
73	NC_016819	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192317
74	NC_016819	ACA	2	6	5293	5298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192317
75	NC_016819	ATT	2	6	5552	5557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192317
76	NC_016819	AGC	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016819	TAA	2	6	5809	5814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016819	ACT	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016819	AAC	2	6	6063	6068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016819	CAG	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016819	CTG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016819	ACA	2	6	6211	6216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016819	GTT	2	6	6272	6277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192318
84	NC_016819	TTC	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192318
85	NC_016819	AAT	2	6	6360	6365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192318
86	NC_016819	TCG	2	6	6370	6375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192318
87	NC_016819	CAT	2	6	6392	6397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192318
88	NC_016819	GCC	2	6	6437	6442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192318
89	NC_016819	GTT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192318
90	NC_016819	GAA	3	9	6692	6700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192318
91	NC_016819	ACA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192318
92	NC_016819	ATA	2	6	6804	6809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192318
93	NC_016819	CCT	2	6	6815	6820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192318
94	NC_016819	TTG	2	6	6842	6847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192318
95	NC_016819	GAG	2	6	6892	6897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192318
96	NC_016819	GCT	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192318
97	NC_016819	GTT	2	6	7419	7424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016819	TTA	2	6	7525	7530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016819	CAT	2	6	7637	7642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016819	TGA	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016819	GAT	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016819	TTA	2	6	7928	7933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016819	GAG	2	6	7990	7995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016819	ATG	2	6	8039	8044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016819	ACG	2	6	8347	8352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192319
106	NC_016819	TAC	2	6	8403	8408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192319
107	NC_016819	TCA	2	6	8421	8426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192319
108	NC_016819	AAC	2	6	8537	8542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192319
109	NC_016819	GTA	2	6	8572	8577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192319
110	NC_016819	TCA	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192319
111	NC_016819	TTG	2	6	8820	8825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016819	TTA	2	6	8829	8834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016819	CCG	2	6	8840	8845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_016819	TCA	2	6	8924	8929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192320
115	NC_016819	TCT	2	6	8965	8970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192320
116	NC_016819	TTG	2	6	9094	9099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192320
117	NC_016819	AAT	2	6	9177	9182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192320
118	NC_016819	ATT	2	6	9240	9245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192320
119	NC_016819	ATA	2	6	9250	9255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192320
120	NC_016819	TAT	2	6	9290	9295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016819	ACT	2	6	9397	9402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016819	GTT	2	6	9433	9438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016819	TAT	2	6	9528	9533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016819	AAT	2	6	9646	9651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016819	TAT	2	6	9689	9694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016819	TTA	2	6	9709	9714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016819	AGT	2	6	9736	9741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016819	AAG	2	6	9749	9754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016819	TGA	2	6	9773	9778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016819	TAT	2	6	9802	9807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016819	GAT	2	6	10119	10124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016819	ACA	2	6	10148	10153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016819	ACG	2	6	10392	10397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192321
134	NC_016819	CCA	2	6	10419	10424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192321
135	NC_016819	TAT	2	6	10425	10430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192321
136	NC_016819	CCG	2	6	10572	10577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192321
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261	NC_016819	GCC	2	6	21753	21758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192330
262	NC_016819	GTG	2	6	21795	21800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192330
263	NC_016819	CTG	2	6	21930	21935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192330
264	NC_016819	CTG	2	6	22056	22061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192330
265	NC_016819	ATG	2	6	22222	22227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192330
266	NC_016819	GGA	2	6	22265	22270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192330
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270	NC_016819	GCA	2	6	22427	22432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192330
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274	NC_016819	TCC	2	6	22551	22556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192330
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276	NC_016819	GTT	2	6	22638	22643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192330
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280	NC_016819	CCG	2	6	22893	22898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192330
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282	NC_016819	GTG	2	6	22923	22928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192330
283	NC_016819	TGC	2	6	22966	22971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192330
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289	NC_016819	ATT	2	6	23403	23408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192330
290	NC_016819	CAG	2	6	23483	23488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_016819	CAG	2	6	23500	23505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_016819	TCT	2	6	23758	23763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192331
293	NC_016819	CCA	2	6	23779	23784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192331
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296	NC_016819	TAA	2	6	23855	23860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_016819	AAC	2	6	24150	24155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192332
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325	NC_016819	TCT	2	6	25878	25883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
326	NC_016819	TCA	2	6	25896	25901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
327	NC_016819	TAA	2	6	25986	25991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_016819	AAT	2	6	26017	26022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
329	NC_016819	ATT	2	6	26040	26045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_016819	TAA	2	6	26131	26136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_016819	ATA	2	6	26199	26204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_016819	TTC	2	6	26372	26377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192335
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340	NC_016819	CAA	2	6	26683	26688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192336
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361	NC_016819	TGA	2	6	28411	28416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192337
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368	NC_016819	GGC	2	6	28998	29003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192337
369	NC_016819	TTG	2	6	29124	29129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192337
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371	NC_016819	CGT	2	6	29276	29281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
372	NC_016819	TGA	2	6	29334	29339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192338
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379	NC_016819	CTG	2	6	29668	29673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192338
380	NC_016819	TCA	2	6	29691	29696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192338
381	NC_016819	GCA	2	6	29777	29782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192338
382	NC_016819	CAG	2	6	29884	29889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192338
383	NC_016819	CCG	2	6	29915	29920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192338
384	NC_016819	CTT	2	6	29943	29948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192338
385	NC_016819	CGT	2	6	30072	30077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192338
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455	NC_016819	AAG	2	6	36200	36205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_016819	ATT	2	6	39666	39671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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