MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 2308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016819	GA	3	6	76731	76736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016819	ATC	2	6	76796	76801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_016819	AATA	2	8	76835	76842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016819	AGG	2	6	76859	76864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016819	GTG	2	6	76883	76888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192383
1506	NC_016819	AGA	2	6	76905	76910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192383
1507	NC_016819	A	6	6	76936	76941	100 %	0 %	0 %	0 %	383192383
1508	NC_016819	A	6	6	76949	76954	100 %	0 %	0 %	0 %	383192383
1509	NC_016819	A	6	6	77002	77007	100 %	0 %	0 %	0 %	383192383
1510	NC_016819	ATT	2	6	77093	77098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016819	TCA	2	6	77124	77129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_016819	TGA	2	6	77195	77200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016819	T	6	6	77201	77206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016819	ATA	2	6	77254	77259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016819	CAT	2	6	77348	77353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192384
1516	NC_016819	GAT	2	6	77367	77372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192384
1517	NC_016819	GC	3	6	77444	77449	0 %	0 %	50 %	50 %	383192384
1518	NC_016819	CAA	2	6	77510	77515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192384
1519	NC_016819	CCTGA	2	10	77540	77549	20 %	20 %	20 %	40 %	383192384
1520	NC_016819	TAT	2	6	77559	77564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192384
1521	NC_016819	TATC	2	8	77600	77607	25 %	50 %	0 %	25 %	383192384
1522	NC_016819	CGC	2	6	77645	77650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192384
1523	NC_016819	CAG	2	6	77658	77663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192384
1524	NC_016819	ATC	2	6	77673	77678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192384
1525	NC_016819	ATT	2	6	77685	77690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192384
1526	NC_016819	GAA	2	6	77727	77732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192384
1527	NC_016819	AAC	2	6	77759	77764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192384
1528	NC_016819	AATG	2	8	77794	77801	50 %	25 %	25 %	0 %	383192384
1529	NC_016819	CTG	2	6	77812	77817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192384
1530	NC_016819	TAC	2	6	77829	77834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192384
1531	NC_016819	CG	3	6	77861	77866	0 %	0 %	50 %	50 %	383192384
1532	NC_016819	ATT	2	6	77874	77879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192384
1533	NC_016819	AGA	2	6	77890	77895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192384
1534	NC_016819	GACCC	2	10	77972	77981	20 %	0 %	20 %	60 %	383192384
1535	NC_016819	ATT	2	6	78018	78023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192384
1536	NC_016819	ATC	2	6	78162	78167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192384
1537	NC_016819	GC	3	6	78252	78257	0 %	0 %	50 %	50 %	383192384
1538	NC_016819	TTC	2	6	78282	78287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192384
1539	NC_016819	GCAG	2	8	78301	78308	25 %	0 %	50 %	25 %	383192384
1540	NC_016819	CAA	2	6	78311	78316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192384
1541	NC_016819	GAG	2	6	78456	78461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192384
1542	NC_016819	ATAA	2	8	78483	78490	75 %	25 %	0 %	0 %	383192384
1543	NC_016819	ATA	2	6	78553	78558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192384
1544	NC_016819	CAGT	2	8	78604	78611	25 %	25 %	25 %	25 %	383192384
1545	NC_016819	CAT	2	6	78614	78619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192384
1546	NC_016819	CTT	2	6	78649	78654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_016819	TAA	2	6	78661	78666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016819	TAT	2	6	78817	78822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192385
1549	NC_016819	ATC	2	6	78867	78872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192385
1550	NC_016819	ATA	2	6	78955	78960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192385
1551	NC_016819	CGA	2	6	78967	78972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192385
1552	NC_016819	TCA	2	6	79068	79073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192385
1553	NC_016819	CAT	2	6	79082	79087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192385
1554	NC_016819	ATG	2	6	79131	79136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192385
1555	NC_016819	GCG	2	6	79153	79158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192385
1556	NC_016819	TGA	2	6	79163	79168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192385
1557	NC_016819	GAAA	2	8	79190	79197	75 %	0 %	25 %	0 %	383192385
1558	NC_016819	GAT	2	6	79208	79213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192385
1559	NC_016819	TAA	2	6	79216	79221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192385
1560	NC_016819	TTTAT	2	10	79233	79242	20 %	80 %	0 %	0 %	383192385
1561	NC_016819	AAC	2	6	79311	79316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192385
1562	NC_016819	GCAT	2	8	79335	79342	25 %	25 %	25 %	25 %	383192385
1563	NC_016819	TAA	2	6	79356	79361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192385
1564	NC_016819	CAC	2	6	79372	79377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192385
1565	NC_016819	ATC	2	6	79416	79421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192385
1566	NC_016819	CAG	2	6	79463	79468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192385
1567	NC_016819	ACA	2	6	79491	79496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192385
1568	NC_016819	ATCGTC	2	12	79554	79565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383192385
1569	NC_016819	CCAG	2	8	79597	79604	25 %	0 %	25 %	50 %	383192385
1570	NC_016819	GAG	2	6	79626	79631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192385
1571	NC_016819	GAAA	2	8	79657	79664	75 %	0 %	25 %	0 %	383192385
1572	NC_016819	GACA	2	8	79671	79678	50 %	0 %	25 %	25 %	383192385
1573	NC_016819	GTG	2	6	79818	79823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192385
1574	NC_016819	TG	3	6	79897	79902	0 %	50 %	50 %	0 %	383192385
1575	NC_016819	ATG	2	6	79923	79928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192385
1576	NC_016819	AAT	2	6	79965	79970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192385
1577	NC_016819	TCTTT	2	10	80083	80092	0 %	80 %	0 %	20 %	383192385
1578	NC_016819	ATA	2	6	80142	80147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192385
1579	NC_016819	TGA	2	6	80190	80195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016819	AAT	2	6	80252	80257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_016819	GCT	2	6	80297	80302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192386
1582	NC_016819	CTT	2	6	80347	80352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192386
1583	NC_016819	TTTG	2	8	80430	80437	0 %	75 %	25 %	0 %	383192386
1584	NC_016819	TAT	2	6	80449	80454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192386
1585	NC_016819	CTT	2	6	80498	80503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192386
1586	NC_016819	ATA	2	6	80514	80519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192386
1587	NC_016819	TA	3	6	80539	80544	50 %	50 %	0 %	0 %	383192386
1588	NC_016819	T	7	7	80692	80698	0 %	100 %	0 %	0 %	383192386
1589	NC_016819	CCT	2	6	80731	80736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192386
1590	NC_016819	CAA	2	6	80740	80745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192386
1591	NC_016819	GGT	2	6	80753	80758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192386
1592	NC_016819	A	7	7	80828	80834	100 %	0 %	0 %	0 %	383192386
1593	NC_016819	GT	3	6	80990	80995	0 %	50 %	50 %	0 %	383192386
1594	NC_016819	CTT	2	6	81031	81036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192386
1595	NC_016819	ACG	3	9	81084	81092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192386
1596	NC_016819	ATT	2	6	81209	81214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192386
1597	NC_016819	T	6	6	81251	81256	0 %	100 %	0 %	0 %	383192386
1598	NC_016819	ATG	3	9	81279	81287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192386
1599	NC_016819	TGT	2	6	81356	81361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016819	ACA	2	6	81421	81426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_016819	ATT	2	6	81445	81450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192387
1602	NC_016819	TTG	2	6	81461	81466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192387
1603	NC_016819	AT	3	6	81472	81477	50 %	50 %	0 %	0 %	383192387
1604	NC_016819	C	6	6	81484	81489	0 %	0 %	0 %	100 %	383192387
1605	NC_016819	TCAG	2	8	81534	81541	25 %	25 %	25 %	25 %	383192387
1606	NC_016819	AAT	2	6	81587	81592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192387
1607	NC_016819	TG	3	6	81636	81641	0 %	50 %	50 %	0 %	383192387
1608	NC_016819	CCG	2	6	81645	81650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192387
1609	NC_016819	TTG	2	6	81739	81744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192387
1610	NC_016819	GTC	2	6	81780	81785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192387
1611	NC_016819	TA	3	6	81821	81826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016819	T	7	7	81903	81909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016819	AATG	2	8	81918	81925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016819	TGA	2	6	82020	82025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192388
1615	NC_016819	AATC	2	8	82053	82060	50 %	25 %	0 %	25 %	383192388
1616	NC_016819	ATC	2	6	82167	82172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192388
1617	NC_016819	TTG	2	6	82244	82249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192388
1618	NC_016819	CAG	2	6	82412	82417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192388
1619	NC_016819	GTG	2	6	82499	82504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192388
1620	NC_016819	TTGT	2	8	82629	82636	0 %	75 %	25 %	0 %	383192388
1621	NC_016819	TCA	2	6	82649	82654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192388
1622	NC_016819	CAA	2	6	82664	82669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192388
1623	NC_016819	GAA	2	6	82681	82686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192388
1624	NC_016819	CTT	2	6	82699	82704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192388
1625	NC_016819	TA	4	8	82741	82748	50 %	50 %	0 %	0 %	383192388
1626	NC_016819	GCA	2	6	82780	82785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192388
1627	NC_016819	TGCC	2	8	82794	82801	0 %	25 %	25 %	50 %	383192388
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1629	NC_016819	T	6	6	83017	83022	0 %	100 %	0 %	0 %	383192389
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1998	NC_016819	CCCAG	2	10	101425	101434	20 %	0 %	20 %	60 %	383192403
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