MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 2308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016819	A	6	6	51125	51130	100 %	0 %	0 %	0 %	383192359
1002	NC_016819	TGA	2	6	51201	51206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016819	GTC	2	6	51242	51247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192360
1004	NC_016819	GTCA	2	8	51374	51381	25 %	25 %	25 %	25 %	383192360
1005	NC_016819	TA	4	8	51526	51533	50 %	50 %	0 %	0 %	383192360
1006	NC_016819	TTG	2	6	51551	51556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192360
1007	NC_016819	TGA	2	6	51589	51594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192360
1008	NC_016819	CGC	2	6	51649	51654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192360
1009	NC_016819	ACT	2	6	51708	51713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_016819	ATCT	2	8	51722	51729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_016819	T	6	6	51756	51761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016819	GCG	2	6	51826	51831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016819	ATT	2	6	51910	51915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016819	TCA	2	6	52013	52018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016819	GTC	2	6	52055	52060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_016819	CA	3	6	52124	52129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_016819	TGC	2	6	52144	52149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016819	GAA	3	9	52185	52193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016819	AAT	2	6	52211	52216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016819	T	7	7	52245	52251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016819	TGA	2	6	52264	52269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016819	TGA	2	6	52271	52276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016819	AAT	2	6	52311	52316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016819	TCC	2	6	52346	52351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_016819	CTTT	2	8	52369	52376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_016819	T	6	6	52395	52400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016819	TA	3	6	52420	52425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016819	AGT	2	6	52463	52468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016819	CTT	2	6	52543	52548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_016819	CGT	2	6	52566	52571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_016819	CTAT	2	8	52598	52605	25 %	50 %	0 %	25 %	383192361
1032	NC_016819	GAA	2	6	52652	52657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192361
1033	NC_016819	AGG	2	6	52695	52700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192361
1034	NC_016819	TGA	2	6	52728	52733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192361
1035	NC_016819	GGT	2	6	52755	52760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192361
1036	NC_016819	CAA	2	6	52851	52856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192361
1037	NC_016819	GAAC	2	8	52979	52986	50 %	0 %	25 %	25 %	383192361
1038	NC_016819	CTG	2	6	53105	53110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192361
1039	NC_016819	TC	3	6	53228	53233	0 %	50 %	0 %	50 %	383192361
1040	NC_016819	TCC	2	6	53243	53248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192361
1041	NC_016819	CAAA	2	8	53433	53440	75 %	0 %	0 %	25 %	383192361
1042	NC_016819	AGGA	2	8	53532	53539	50 %	0 %	50 %	0 %	383192361
1043	NC_016819	GAT	2	6	53602	53607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192361
1044	NC_016819	A	6	6	53619	53624	100 %	0 %	0 %	0 %	383192361
1045	NC_016819	CAT	2	6	53633	53638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192361
1046	NC_016819	A	6	6	53645	53650	100 %	0 %	0 %	0 %	383192361
1047	NC_016819	TCA	2	6	53667	53672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_016819	ATG	2	6	53675	53680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016819	TG	3	6	53679	53684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016819	ATGTTT	2	12	53690	53701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016819	TGC	2	6	53716	53721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_016819	GCA	2	6	53751	53756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192362
1053	NC_016819	GAT	2	6	53780	53785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192362
1054	NC_016819	TGAA	2	8	53872	53879	50 %	25 %	25 %	0 %	383192362
1055	NC_016819	GAA	2	6	53883	53888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192362
1056	NC_016819	ATG	2	6	53904	53909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192362
1057	NC_016819	ATA	2	6	54043	54048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192362
1058	NC_016819	ACA	2	6	54077	54082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192362
1059	NC_016819	CGT	2	6	54122	54127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192362
1060	NC_016819	GAA	2	6	54327	54332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192363
1061	NC_016819	GC	3	6	54356	54361	0 %	0 %	50 %	50 %	383192363
1062	NC_016819	GGC	2	6	54414	54419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192363
1063	NC_016819	GTT	2	6	54437	54442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192363
1064	NC_016819	GC	3	6	54451	54456	0 %	0 %	50 %	50 %	383192363
1065	NC_016819	T	6	6	54479	54484	0 %	100 %	0 %	0 %	383192363
1066	NC_016819	CTGG	2	8	54575	54582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_016819	ATG	2	6	54593	54598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016819	GGTC	2	8	54662	54669	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_016819	ATTG	2	8	54678	54685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016819	TGC	2	6	54732	54737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_016819	CAG	2	6	54765	54770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_016819	A	6	6	54875	54880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016819	AAT	2	6	54921	54926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192364
1074	NC_016819	GA	3	6	55053	55058	50 %	0 %	50 %	0 %	383192364
1075	NC_016819	TGCC	2	8	55115	55122	0 %	25 %	25 %	50 %	383192364
1076	NC_016819	CTG	2	6	55227	55232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192364
1077	NC_016819	AGT	2	6	55235	55240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192364
1078	NC_016819	TCA	2	6	55241	55246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192364
1079	NC_016819	ATC	2	6	55305	55310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192364
1080	NC_016819	CTT	2	6	55343	55348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192364
1081	NC_016819	ATA	2	6	55441	55446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192364
1082	NC_016819	GTA	2	6	55501	55506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192364
1083	NC_016819	GTC	2	6	55539	55544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_016819	CAG	2	6	55594	55599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_016819	ATA	2	6	55632	55637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016819	GCA	2	6	55684	55689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192365
1087	NC_016819	CAGC	2	8	55798	55805	25 %	0 %	25 %	50 %	383192365
1088	NC_016819	TCA	2	6	55821	55826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192365
1089	NC_016819	CATG	2	8	55828	55835	25 %	25 %	25 %	25 %	383192365
1090	NC_016819	TCA	2	6	55866	55871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192365
1091	NC_016819	TC	3	6	55953	55958	0 %	50 %	0 %	50 %	383192365
1092	NC_016819	TGA	2	6	55979	55984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192365
1093	NC_016819	GCA	2	6	56049	56054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192365
1094	NC_016819	GCA	2	6	56107	56112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192365
1095	NC_016819	CAC	2	6	56191	56196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192365
1096	NC_016819	AAC	2	6	56219	56224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192365
1097	NC_016819	TGA	2	6	56252	56257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192365
1098	NC_016819	GCG	2	6	56321	56326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192365
1099	NC_016819	CTG	2	6	56351	56356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192365
1100	NC_016819	GAA	2	6	56360	56365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192365
1101	NC_016819	AAT	2	6	56417	56422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192365
1102	NC_016819	ATTTA	2	10	56532	56541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016819	T	6	6	56548	56553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016819	AAT	2	6	56587	56592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016819	T	6	6	56666	56671	0 %	100 %	0 %	0 %	383192366
1106	NC_016819	CCA	2	6	56783	56788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192366
1107	NC_016819	TGC	2	6	56841	56846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192366
1108	NC_016819	T	6	6	56991	56996	0 %	100 %	0 %	0 %	383192366
1109	NC_016819	TGA	2	6	57086	57091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192366
1110	NC_016819	CAG	2	6	57117	57122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192366
1111	NC_016819	CAT	2	6	57167	57172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192366
1112	NC_016819	CAGC	2	8	57173	57180	25 %	0 %	25 %	50 %	383192366
1113	NC_016819	CAA	2	6	57263	57268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192366
1114	NC_016819	T	6	6	57292	57297	0 %	100 %	0 %	0 %	383192366
1115	NC_016819	ACAG	2	8	57328	57335	50 %	0 %	25 %	25 %	383192366
1116	NC_016819	AGT	2	6	57354	57359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192366
1117	NC_016819	ATG	2	6	57376	57381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192366
1118	NC_016819	T	6	6	57400	57405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016819	CAT	2	6	57421	57426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_016819	CGGA	2	8	57449	57456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_016819	GT	3	6	57464	57469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016819	TGT	2	6	57472	57477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016819	CTCC	2	8	57510	57517	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1124	NC_016819	TTC	2	6	57557	57562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192367
1125	NC_016819	GCC	2	6	57564	57569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192367
1126	NC_016819	AGG	2	6	57577	57582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192367
1127	NC_016819	CAG	2	6	57602	57607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192367
1128	NC_016819	AAC	2	6	57617	57622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192367
1129	NC_016819	TCT	2	6	57678	57683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192367
1130	NC_016819	GCA	2	6	57796	57801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192367
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1132	NC_016819	GCC	2	6	57840	57845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192367
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1135	NC_016819	CGG	2	6	58058	58063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192367
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1140	NC_016819	TAAA	2	8	58273	58280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_016819	GTC	2	6	58403	58408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_016819	TAA	2	6	58419	58424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_016819	T	6	6	58518	58523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1241	NC_016819	TA	4	8	63491	63498	50 %	50 %	0 %	0 %	383192372
1242	NC_016819	CGC	2	6	63518	63523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192372
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1245	NC_016819	CT	3	6	63725	63730	0 %	50 %	0 %	50 %	383192372
1246	NC_016819	TCA	3	9	63778	63786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192372
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1250	NC_016819	CAG	2	6	64067	64072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192372
1251	NC_016819	GT	3	6	64085	64090	0 %	50 %	50 %	0 %	383192372
1252	NC_016819	TGA	2	6	64108	64113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192372
1253	NC_016819	TGACC	2	10	64192	64201	20 %	20 %	20 %	40 %	383192372
1254	NC_016819	GTT	2	6	64254	64259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192372
1255	NC_016819	GCC	2	6	64275	64280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192372
1256	NC_016819	T	6	6	64289	64294	0 %	100 %	0 %	0 %	383192372
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