MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 12080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016818	GCTT	2	8	670	677	0 %	50 %	25 %	25 %	383187968
2	NC_016818	GTCA	2	8	747	754	25 %	25 %	25 %	25 %	383187968
3	NC_016818	CAGC	2	8	763	770	25 %	0 %	25 %	50 %	383187968
4	NC_016818	TGCA	2	8	1021	1028	25 %	25 %	25 %	25 %	383187968
5	NC_016818	TTCG	2	8	1548	1555	0 %	50 %	25 %	25 %	383187968
6	NC_016818	GCCC	2	8	1686	1693	0 %	0 %	25 %	75 %	383187968
7	NC_016818	ACCA	2	8	1728	1735	50 %	0 %	0 %	50 %	383187968
8	NC_016818	CGTT	2	8	2334	2341	0 %	50 %	25 %	25 %	383187969
9	NC_016818	CGAC	2	8	2396	2403	25 %	0 %	25 %	50 %	383187969
10	NC_016818	GCGT	2	8	2723	2730	0 %	25 %	50 %	25 %	383187969
11	NC_016818	GGTC	2	8	3078	3085	0 %	25 %	50 %	25 %	383187970
12	NC_016818	TTTC	2	8	3650	3657	0 %	75 %	0 %	25 %	383187970
13	NC_016818	GCGG	2	8	3875	3882	0 %	0 %	75 %	25 %	383187970
14	NC_016818	CCGA	2	8	3926	3933	25 %	0 %	25 %	50 %	383187970
15	NC_016818	CTGG	2	8	5300	5307	0 %	25 %	50 %	25 %	383187971
16	NC_016818	GCGG	2	8	5384	5391	0 %	0 %	75 %	25 %	383187971
17	NC_016818	TGGA	2	8	5987	5994	25 %	25 %	50 %	0 %	383187971
18	NC_016818	CGTG	2	8	6052	6059	0 %	25 %	50 %	25 %	383187971
19	NC_016818	GGCT	2	8	6610	6617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016818	AATT	2	8	6684	6691	50 %	50 %	0 %	0 %	383187972
21	NC_016818	ATGG	2	8	6701	6708	25 %	25 %	50 %	0 %	383187972
22	NC_016818	CAGT	2	8	7583	7590	25 %	25 %	25 %	25 %	383187973
23	NC_016818	GCCC	2	8	7736	7743	0 %	0 %	25 %	75 %	383187973
24	NC_016818	TGGG	2	8	8157	8164	0 %	25 %	75 %	0 %	383187973
25	NC_016818	CTGC	2	8	8343	8350	0 %	25 %	25 %	50 %	383187973
26	NC_016818	CGGA	2	8	8575	8582	25 %	0 %	50 %	25 %	383187973
27	NC_016818	CCGG	2	8	8801	8808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016818	AAGC	2	8	9274	9281	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016818	TCTG	2	8	9340	9347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016818	GGTC	2	8	9519	9526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016818	TTTA	2	8	9630	9637	25 %	75 %	0 %	0 %	383187975
32	NC_016818	GTTG	2	8	9693	9700	0 %	50 %	50 %	0 %	383187975
33	NC_016818	TTCT	2	8	11640	11647	0 %	75 %	0 %	25 %	383187978
34	NC_016818	TCAT	2	8	11836	11843	25 %	50 %	0 %	25 %	383187978
35	NC_016818	GAAT	2	8	12031	12038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016818	GGCG	2	8	12203	12210	0 %	0 %	75 %	25 %	383187979
37	NC_016818	ATTG	2	8	12770	12777	25 %	50 %	25 %	0 %	383187979
38	NC_016818	CTTC	2	8	13005	13012	0 %	50 %	0 %	50 %	383187979
39	NC_016818	GAAA	2	8	13094	13101	75 %	0 %	25 %	0 %	383187979
40	NC_016818	ATTT	2	8	13437	13444	25 %	75 %	0 %	0 %	383187980
41	NC_016818	GCAG	2	8	13517	13524	25 %	0 %	50 %	25 %	383187980
42	NC_016818	GCTG	2	8	13879	13886	0 %	25 %	50 %	25 %	383187980
43	NC_016818	CAGC	2	8	15109	15116	25 %	0 %	25 %	50 %	383187981
44	NC_016818	GCCA	2	8	15204	15211	25 %	0 %	25 %	50 %	383187981
45	NC_016818	AGGC	2	8	15839	15846	25 %	0 %	50 %	25 %	383187982
46	NC_016818	GTCA	2	8	16763	16770	25 %	25 %	25 %	25 %	383187983
47	NC_016818	CGCC	2	8	16864	16871	0 %	0 %	25 %	75 %	383187983
48	NC_016818	GCGA	2	8	16949	16956	25 %	0 %	50 %	25 %	383187983
49	NC_016818	TCAA	2	8	17277	17284	50 %	25 %	0 %	25 %	383187983
50	NC_016818	TCCT	2	8	17444	17451	0 %	50 %	0 %	50 %	383187983
51	NC_016818	AGAA	2	8	19021	19028	75 %	0 %	25 %	0 %	383187984
52	NC_016818	GCCA	2	8	19233	19240	25 %	0 %	25 %	50 %	383187985
53	NC_016818	GCTG	2	8	19417	19424	0 %	25 %	50 %	25 %	383187985
54	NC_016818	AAAT	2	8	20376	20383	75 %	25 %	0 %	0 %	383187985
55	NC_016818	TGCG	2	8	20769	20776	0 %	25 %	50 %	25 %	383187985
56	NC_016818	CGCC	2	8	21451	21458	0 %	0 %	25 %	75 %	383187986
57	NC_016818	GTAC	2	8	22640	22647	25 %	25 %	25 %	25 %	383187987
58	NC_016818	CTGC	2	8	23253	23260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016818	CTTT	2	8	23973	23980	0 %	75 %	0 %	25 %	383187989
60	NC_016818	GGCA	2	8	24629	24636	25 %	0 %	50 %	25 %	383187990
61	NC_016818	GTGA	2	8	25092	25099	25 %	25 %	50 %	0 %	383187990
62	NC_016818	GGCG	2	8	25391	25398	0 %	0 %	75 %	25 %	383187990
63	NC_016818	GTCC	2	8	25855	25862	0 %	25 %	25 %	50 %	383187990
64	NC_016818	GGAT	2	8	25909	25916	25 %	25 %	50 %	0 %	383187990
65	NC_016818	GCTC	2	8	26083	26090	0 %	25 %	25 %	50 %	383187990
66	NC_016818	ACGG	2	8	26154	26161	25 %	0 %	50 %	25 %	383187990
67	NC_016818	TGGC	2	8	26345	26352	0 %	25 %	50 %	25 %	383187990
68	NC_016818	ACTT	2	8	27235	27242	25 %	50 %	0 %	25 %	383187991
69	NC_016818	ACCG	2	8	28816	28823	25 %	0 %	25 %	50 %	383187992
70	NC_016818	CTGG	2	8	28838	28845	0 %	25 %	50 %	25 %	383187992
71	NC_016818	GAAC	2	8	29013	29020	50 %	0 %	25 %	25 %	383187992
72	NC_016818	GCTG	2	8	29457	29464	0 %	25 %	50 %	25 %	383187992
73	NC_016818	GATG	2	8	29694	29701	25 %	25 %	50 %	0 %	383187992
74	NC_016818	GTGG	2	8	29943	29950	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016818	GCTG	2	8	30287	30294	0 %	25 %	50 %	25 %	383187993
76	NC_016818	GAAA	2	8	31406	31413	75 %	0 %	25 %	0 %	383187994
77	NC_016818	AATT	2	8	31722	31729	50 %	50 %	0 %	0 %	383187994
78	NC_016818	TATT	2	8	31955	31962	25 %	75 %	0 %	0 %	383187995
79	NC_016818	ATTT	2	8	32420	32427	25 %	75 %	0 %	0 %	383187995
80	NC_016818	CATT	2	8	32527	32534	25 %	50 %	0 %	25 %	383187995
81	NC_016818	GCGG	2	8	32606	32613	0 %	0 %	75 %	25 %	383187995
82	NC_016818	GCGG	2	8	33700	33707	0 %	0 %	75 %	25 %	383187996
83	NC_016818	TTGC	2	8	33718	33725	0 %	50 %	25 %	25 %	383187996
84	NC_016818	GGCT	2	8	33821	33828	0 %	25 %	50 %	25 %	383187996
85	NC_016818	TTAT	2	8	34274	34281	25 %	75 %	0 %	0 %	383187996
86	NC_016818	TTCC	2	8	34600	34607	0 %	50 %	0 %	50 %	383187997
87	NC_016818	ATGG	2	8	35234	35241	25 %	25 %	50 %	0 %	383187998
88	NC_016818	CTGG	2	8	35260	35267	0 %	25 %	50 %	25 %	383187998
89	NC_016818	CTGA	2	8	35546	35553	25 %	25 %	25 %	25 %	383187998
90	NC_016818	GTCA	2	8	35981	35988	25 %	25 %	25 %	25 %	383187999
91	NC_016818	GAAA	2	8	36286	36293	75 %	0 %	25 %	0 %	383187999
92	NC_016818	TGAT	2	8	36938	36945	25 %	50 %	25 %	0 %	383188000
93	NC_016818	TGTC	2	8	37035	37042	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016818	AATT	2	8	37157	37164	50 %	50 %	0 %	0 %	383188001
95	NC_016818	AATT	2	8	37310	37317	50 %	50 %	0 %	0 %	383188001
96	NC_016818	AGAA	2	8	37596	37603	75 %	0 %	25 %	0 %	383188001
97	NC_016818	GGTA	2	8	38220	38227	25 %	25 %	50 %	0 %	383188001
98	NC_016818	GACG	2	8	39013	39020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016818	GCGG	2	8	39850	39857	0 %	0 %	75 %	25 %	383188002
100	NC_016818	ATTT	2	8	39895	39902	25 %	75 %	0 %	0 %	383188002
101	NC_016818	TGGC	2	8	40229	40236	0 %	25 %	50 %	25 %	383188002
102	NC_016818	CCTG	2	8	40377	40384	0 %	25 %	25 %	50 %	383188002
103	NC_016818	CTGA	2	8	40417	40424	25 %	25 %	25 %	25 %	383188002
104	NC_016818	AGCC	2	8	40530	40537	25 %	0 %	25 %	50 %	383188002
105	NC_016818	CAGT	2	8	41557	41564	25 %	25 %	25 %	25 %	383188003
106	NC_016818	AAAG	2	8	42360	42367	75 %	0 %	25 %	0 %	383188004
107	NC_016818	AAAT	2	8	43005	43012	75 %	25 %	0 %	0 %	383188004
108	NC_016818	GTTG	2	8	43041	43048	0 %	50 %	50 %	0 %	383188005
109	NC_016818	ACTT	2	8	43067	43074	25 %	50 %	0 %	25 %	383188005
110	NC_016818	TGAC	2	8	43897	43904	25 %	25 %	25 %	25 %	383188007
111	NC_016818	CCGT	2	8	43998	44005	0 %	25 %	25 %	50 %	383188007
112	NC_016818	GTCA	2	8	44027	44034	25 %	25 %	25 %	25 %	383188007
113	NC_016818	ATAA	2	8	45382	45389	75 %	25 %	0 %	0 %	383188007
114	NC_016818	GGAT	2	8	45419	45426	25 %	25 %	50 %	0 %	383188008
115	NC_016818	CTGC	2	8	45443	45450	0 %	25 %	25 %	50 %	383188008
116	NC_016818	TGCC	2	8	45578	45585	0 %	25 %	25 %	50 %	383188008
117	NC_016818	GCCA	2	8	46052	46059	25 %	0 %	25 %	50 %	383188009
118	NC_016818	GAAA	2	8	46069	46076	75 %	0 %	25 %	0 %	383188009
119	NC_016818	AAGA	2	8	46175	46182	75 %	0 %	25 %	0 %	383188009
120	NC_016818	ATGC	2	8	46454	46461	25 %	25 %	25 %	25 %	383188010
121	NC_016818	CTTT	2	8	46473	46480	0 %	75 %	0 %	25 %	383188010
122	NC_016818	ATCA	2	8	47524	47531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016818	CCCA	2	8	47619	47626	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_016818	GGGA	2	8	47643	47650	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016818	CTGC	2	8	48574	48581	0 %	25 %	25 %	50 %	383188012
126	NC_016818	CTGC	2	8	48868	48875	0 %	25 %	25 %	50 %	383188012
127	NC_016818	TTTG	2	8	50143	50150	0 %	75 %	25 %	0 %	383188012
128	NC_016818	CTGA	2	8	50252	50259	25 %	25 %	25 %	25 %	383188012
129	NC_016818	CAGG	2	8	51143	51150	25 %	0 %	50 %	25 %	383188013
130	NC_016818	TTAA	2	8	51355	51362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016818	GGTC	2	8	51479	51486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016818	GTCA	2	8	52218	52225	25 %	25 %	25 %	25 %	383188014
133	NC_016818	CATT	2	8	52793	52800	25 %	50 %	0 %	25 %	383188014
134	NC_016818	CGTG	2	8	53583	53590	0 %	25 %	50 %	25 %	383188015
135	NC_016818	GCGG	2	8	53691	53698	0 %	0 %	75 %	25 %	383188015
136	NC_016818	GCTC	2	8	54040	54047	0 %	25 %	25 %	50 %	383188015
137	NC_016818	TACT	2	8	54406	54413	25 %	50 %	0 %	25 %	383188016
138	NC_016818	GCTG	2	8	54726	54733	0 %	25 %	50 %	25 %	383188016
139	NC_016818	GCTG	2	8	56148	56155	0 %	25 %	50 %	25 %	383188016
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