MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016818	GTCA	2	8	167123	167130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_016818	AAAAT	2	10	167131	167140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_016818	T	7	7	167161	167167	0 %	100 %	0 %	0 %	383188120
3504	NC_016818	A	6	6	167178	167183	100 %	0 %	0 %	0 %	383188120
3505	NC_016818	GC	3	6	167210	167215	0 %	0 %	50 %	50 %	383188120
3506	NC_016818	ATT	2	6	167239	167244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188120
3507	NC_016818	TGGT	2	8	167270	167277	0 %	50 %	50 %	0 %	383188120
3508	NC_016818	GCC	2	6	167296	167301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188120
3509	NC_016818	ATTA	2	8	167317	167324	50 %	50 %	0 %	0 %	383188120
3510	NC_016818	TGT	2	6	167417	167422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188120
3511	NC_016818	CGG	2	6	167442	167447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188120
3512	NC_016818	G	6	6	167544	167549	0 %	0 %	100 %	0 %	383188120
3513	NC_016818	GAT	2	6	167552	167557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188120
3514	NC_016818	TTA	2	6	167591	167596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188120
3515	NC_016818	ATA	2	6	167646	167651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188120
3516	NC_016818	GGCA	2	8	167662	167669	25 %	0 %	50 %	25 %	383188120
3517	NC_016818	GTCA	2	8	167679	167686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_016818	AAAT	2	8	167687	167694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_016818	GA	3	6	167698	167703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_016818	T	7	7	167715	167721	0 %	100 %	0 %	0 %	383188121
3521	NC_016818	A	6	6	167732	167737	100 %	0 %	0 %	0 %	383188121
3522	NC_016818	GC	3	6	167764	167769	0 %	0 %	50 %	50 %	383188121
3523	NC_016818	ATT	2	6	167793	167798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188121
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3527	NC_016818	TGGCG	2	10	167922	167931	0 %	20 %	60 %	20 %	383188121
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3531	NC_016818	CGAA	2	8	168087	168094	50 %	0 %	25 %	25 %	383188121
3532	NC_016818	G	6	6	168098	168103	0 %	0 %	100 %	0 %	383188121
3533	NC_016818	GAT	2	6	168106	168111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188121
3534	NC_016818	TTA	2	6	168145	168150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188121
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3540	NC_016818	TGA	2	6	168413	168418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188122
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3543	NC_016818	GC	3	6	168535	168540	0 %	0 %	50 %	50 %	383188122
3544	NC_016818	GAT	2	6	168543	168548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188122
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3550	NC_016818	T	6	6	168816	168821	0 %	100 %	0 %	0 %	383188122
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3555	NC_016818	TAA	2	6	169034	169039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188122
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3557	NC_016818	TGG	2	6	169165	169170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188122
3558	NC_016818	GGC	2	6	169212	169217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188122
3559	NC_016818	GAG	2	6	169236	169241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188122
3560	NC_016818	G	6	6	169268	169273	0 %	0 %	100 %	0 %	383188122
3561	NC_016818	TGA	2	6	169286	169291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188122
3562	NC_016818	TTCCC	2	10	169363	169372	0 %	40 %	0 %	60 %	383188122
3563	NC_016818	CAG	2	6	169476	169481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188122
3564	NC_016818	CTGG	2	8	169544	169551	0 %	25 %	50 %	25 %	383188122
3565	NC_016818	CAGT	2	8	169574	169581	25 %	25 %	25 %	25 %	383188122
3566	NC_016818	AAC	2	6	169597	169602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188122
3567	NC_016818	GCTG	2	8	169720	169727	0 %	25 %	50 %	25 %	383188122
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3572	NC_016818	ATG	2	6	169939	169944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188122
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3575	NC_016818	CGG	2	6	170033	170038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_016818	CCG	2	6	170047	170052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_016818	TTGCC	2	10	170148	170157	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3578	NC_016818	TTG	2	6	170220	170225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3582	NC_016818	T	7	7	170318	170324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_016818	CAA	2	6	170348	170353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3586	NC_016818	CAT	2	6	170501	170506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188123
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3590	NC_016818	TGC	2	6	170852	170857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188123
3591	NC_016818	ATGG	2	8	170937	170944	25 %	25 %	50 %	0 %	383188123
3592	NC_016818	CAC	2	6	170978	170983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188123
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3597	NC_016818	CGG	2	6	171260	171265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188123
3598	NC_016818	AGC	2	6	171329	171334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188123
3599	NC_016818	GC	3	6	171340	171345	0 %	0 %	50 %	50 %	383188123
3600	NC_016818	TAT	2	6	171377	171382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188123
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3603	NC_016818	A	6	6	171660	171665	100 %	0 %	0 %	0 %	383188123
3604	NC_016818	CGG	2	6	171677	171682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188123
3605	NC_016818	AGT	2	6	171704	171709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188123
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3608	NC_016818	ATG	2	6	171780	171785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188123
3609	NC_016818	CTG	2	6	171789	171794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188123
3610	NC_016818	GC	3	6	171812	171817	0 %	0 %	50 %	50 %	383188123
3611	NC_016818	ATC	2	6	171852	171857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188123
3612	NC_016818	GAT	2	6	171950	171955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188123
3613	NC_016818	A	7	7	172065	172071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_016818	AG	3	6	172079	172084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_016818	T	7	7	172088	172094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_016818	TTAG	2	8	172104	172111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_016818	AACC	2	8	172117	172124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_016818	ACTT	2	8	172213	172220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3619	NC_016818	GC	3	6	172245	172250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_016818	TA	3	6	172411	172416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_016818	TGA	2	6	172443	172448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_016818	ATG	2	6	172458	172463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_016818	AACGTT	2	12	172469	172480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3624	NC_016818	T	7	7	172550	172556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3867	NC_016818	TTTA	2	8	183658	183665	25 %	75 %	0 %	0 %	383188133
3868	NC_016818	GGC	2	6	183678	183683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188133
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3873	NC_016818	CTG	2	6	183865	183870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188133
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3994	NC_016818	GCAG	2	8	189903	189910	25 %	0 %	50 %	25 %	383188140
3995	NC_016818	CCG	2	6	189939	189944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188140
3996	NC_016818	GCGCC	2	10	189951	189960	0 %	0 %	40 %	60 %	383188140
3997	NC_016818	CCG	2	6	189963	189968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188140
3998	NC_016818	GAA	2	6	190004	190009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188140
3999	NC_016818	ATC	2	6	190032	190037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188140
4000	NC_016818	TGG	3	9	190084	190092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188140

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