MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016818	AC	3	6	47136	47141	50 %	0 %	0 %	50 %	383188010
1002	NC_016818	GTT	2	6	47227	47232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188010
1003	NC_016818	TAA	2	6	47262	47267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188010
1004	NC_016818	ATT	2	6	47327	47332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188010
1005	NC_016818	TGC	2	6	47452	47457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_016818	ATA	2	6	47482	47487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016818	ACG	2	6	47515	47520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_016818	ATCA	2	8	47524	47531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_016818	TTTTG	2	10	47599	47608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016818	CCCA	2	8	47619	47626	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1011	NC_016818	GGGA	2	8	47643	47650	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016818	AAT	2	6	47678	47683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188011
1013	NC_016818	GCA	2	6	47759	47764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188011
1014	NC_016818	TCA	2	6	47789	47794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188011
1015	NC_016818	CAG	2	6	47854	47859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188011
1016	NC_016818	TGT	2	6	47930	47935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188011
1017	NC_016818	GCG	2	6	47940	47945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188011
1018	NC_016818	GC	3	6	47990	47995	0 %	0 %	50 %	50 %	383188011
1019	NC_016818	TCT	2	6	48056	48061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188011
1020	NC_016818	TCT	3	9	48113	48121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188011
1021	NC_016818	CTG	2	6	48130	48135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188011
1022	NC_016818	GC	3	6	48174	48179	0 %	0 %	50 %	50 %	383188011
1023	NC_016818	GCC	2	6	48187	48192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188011
1024	NC_016818	CTG	2	6	48211	48216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188011
1025	NC_016818	CGC	2	6	48249	48254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188011
1026	NC_016818	GCT	2	6	48349	48354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_016818	CA	3	6	48414	48419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_016818	GCG	2	6	48516	48521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188012
1029	NC_016818	CTGC	2	8	48574	48581	0 %	25 %	25 %	50 %	383188012
1030	NC_016818	CGGCAG	2	12	48613	48624	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383188012
1031	NC_016818	CCA	2	6	48634	48639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188012
1032	NC_016818	GCG	2	6	48642	48647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188012
1033	NC_016818	TGT	2	6	48651	48656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188012
1034	NC_016818	ATA	2	6	48741	48746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188012
1035	NC_016818	CTGC	2	8	48868	48875	0 %	25 %	25 %	50 %	383188012
1036	NC_016818	CGA	2	6	48910	48915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188012
1037	NC_016818	CGG	2	6	48958	48963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188012
1038	NC_016818	TGA	2	6	49003	49008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188012
1039	NC_016818	CCG	2	6	49086	49091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188012
1040	NC_016818	GTT	2	6	49174	49179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188012
1041	NC_016818	GGC	2	6	49187	49192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188012
1042	NC_016818	TTC	2	6	49196	49201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188012
1043	NC_016818	CTG	2	6	49214	49219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188012
1044	NC_016818	CGG	2	6	49249	49254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188012
1045	NC_016818	GCC	2	6	49263	49268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188012
1046	NC_016818	TCA	2	6	49348	49353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188012
1047	NC_016818	TCA	2	6	49365	49370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188012
1048	NC_016818	CCG	2	6	49420	49425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188012
1049	NC_016818	CAT	2	6	49517	49522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188012
1050	NC_016818	CAG	2	6	49619	49624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188012
1051	NC_016818	TCA	2	6	49699	49704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188012
1052	NC_016818	T	6	6	49751	49756	0 %	100 %	0 %	0 %	383188012
1053	NC_016818	ATC	2	6	49772	49777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188012
1054	NC_016818	CTG	2	6	50021	50026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188012
1055	NC_016818	TTTG	2	8	50143	50150	0 %	75 %	25 %	0 %	383188012
1056	NC_016818	CAT	2	6	50200	50205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188012
1057	NC_016818	CTGA	2	8	50252	50259	25 %	25 %	25 %	25 %	383188012
1058	NC_016818	ATG	2	6	50292	50297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188012
1059	NC_016818	ACCCAG	2	12	50324	50335	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383188012
1060	NC_016818	GCG	2	6	50494	50499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_016818	A	6	6	50527	50532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016818	AGA	2	6	50543	50548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016818	A	6	6	50594	50599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016818	CCG	2	6	50614	50619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_016818	CAT	2	6	50630	50635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_016818	GGC	2	6	50649	50654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_016818	TGC	2	6	50688	50693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188013
1068	NC_016818	GTA	2	6	50760	50765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188013
1069	NC_016818	CAG	2	6	50790	50795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188013
1070	NC_016818	GCT	2	6	50923	50928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188013
1071	NC_016818	CTT	2	6	50939	50944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188013
1072	NC_016818	GTG	2	6	51004	51009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188013
1073	NC_016818	GCC	2	6	51051	51056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188013
1074	NC_016818	GTT	2	6	51060	51065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188013
1075	NC_016818	GCA	2	6	51068	51073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188013
1076	NC_016818	T	6	6	51078	51083	0 %	100 %	0 %	0 %	383188013
1077	NC_016818	TTC	2	6	51117	51122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188013
1078	NC_016818	CAGG	2	8	51143	51150	25 %	0 %	50 %	25 %	383188013
1079	NC_016818	CAGCG	2	10	51156	51165	20 %	0 %	40 %	40 %	383188013
1080	NC_016818	CGT	2	6	51245	51250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188013
1081	NC_016818	GGC	2	6	51307	51312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_016818	TTAA	2	8	51355	51362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016818	AAGAA	2	10	51456	51465	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016818	GGTC	2	8	51479	51486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_016818	AAT	2	6	51506	51511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016818	CGG	2	6	51806	51811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188014
1087	NC_016818	GCT	2	6	51815	51820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188014
1088	NC_016818	GCG	2	6	52024	52029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188014
1089	NC_016818	CCA	2	6	52124	52129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188014
1090	NC_016818	GCC	2	6	52173	52178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188014
1091	NC_016818	GTCA	2	8	52218	52225	25 %	25 %	25 %	25 %	383188014
1092	NC_016818	CATAAT	2	12	52235	52246	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383188014
1093	NC_016818	AAG	2	6	52297	52302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188014
1094	NC_016818	AGC	2	6	52407	52412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188014
1095	NC_016818	T	6	6	52537	52542	0 %	100 %	0 %	0 %	383188014
1096	NC_016818	TGT	2	6	52554	52559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188014
1097	NC_016818	ATA	3	9	52605	52613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188014
1098	NC_016818	AAC	2	6	52614	52619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188014
1099	NC_016818	ATC	2	6	52623	52628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188014
1100	NC_016818	AGA	2	6	52686	52691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188014
1101	NC_016818	CTG	3	9	52730	52738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188014
1102	NC_016818	CATT	2	8	52793	52800	25 %	50 %	0 %	25 %	383188014
1103	NC_016818	CTT	2	6	52859	52864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188014
1104	NC_016818	AGA	2	6	52867	52872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188014
1105	NC_016818	CAT	2	6	52889	52894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188014
1106	NC_016818	T	6	6	52936	52941	0 %	100 %	0 %	0 %	383188014
1107	NC_016818	GAG	2	6	52965	52970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188014
1108	NC_016818	GAA	2	6	52981	52986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188014
1109	NC_016818	TTA	2	6	52987	52992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188014
1110	NC_016818	ATT	2	6	53068	53073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016818	TAA	2	6	53082	53087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016818	AT	3	6	53097	53102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016818	GAT	2	6	53113	53118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016818	GA	3	6	53207	53212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016818	GCCCG	2	10	53303	53312	0 %	0 %	40 %	60 %	383188015
1116	NC_016818	GTG	2	6	53369	53374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188015
1117	NC_016818	GCG	2	6	53375	53380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188015
1118	NC_016818	GTT	2	6	53481	53486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188015
1119	NC_016818	GCG	2	6	53562	53567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188015
1120	NC_016818	CGG	2	6	53577	53582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188015
1121	NC_016818	CGTG	2	8	53583	53590	0 %	25 %	50 %	25 %	383188015
1122	NC_016818	GCGG	2	8	53691	53698	0 %	0 %	75 %	25 %	383188015
1123	NC_016818	CGC	2	6	53730	53735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188015
1124	NC_016818	CGG	2	6	53759	53764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188015
1125	NC_016818	AAT	2	6	53869	53874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188015
1126	NC_016818	CAT	2	6	53929	53934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188015
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1254	NC_016818	TGA	2	6	59873	59878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188020
1255	NC_016818	TTA	2	6	59957	59962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188020
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1257	NC_016818	TGA	2	6	60089	60094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188020
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1261	NC_016818	GCT	2	6	60261	60266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188020
1262	NC_016818	CTG	2	6	60354	60359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188020
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1268	NC_016818	CTG	2	6	60595	60600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1303	NC_016818	AT	3	6	62231	62236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1369	NC_016818	TGCC	2	8	64611	64618	0 %	25 %	25 %	50 %	383188024
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