MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_016818	ACA	2	6	316305	316310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188248
6503	NC_016818	CGTG	2	8	316336	316343	0 %	25 %	50 %	25 %	383188248
6504	NC_016818	CAG	2	6	316417	316422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188248
6505	NC_016818	TCG	2	6	316432	316437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188248
6506	NC_016818	GAA	3	9	316550	316558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188248
6507	NC_016818	GT	3	6	316598	316603	0 %	50 %	50 %	0 %	383188248
6508	NC_016818	GGT	2	6	316645	316650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188248
6509	NC_016818	GAT	2	6	316727	316732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188248
6510	NC_016818	AGC	2	6	316842	316847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188248
6511	NC_016818	GT	3	6	316854	316859	0 %	50 %	50 %	0 %	383188248
6512	NC_016818	CAG	2	6	316876	316881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188248
6513	NC_016818	GCA	2	6	316896	316901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188248
6514	NC_016818	TGAA	2	8	316905	316912	50 %	25 %	25 %	0 %	383188248
6515	NC_016818	TCTG	2	8	317013	317020	0 %	50 %	25 %	25 %	383188249
6516	NC_016818	GCGG	2	8	317065	317072	0 %	0 %	75 %	25 %	383188249
6517	NC_016818	TGATG	2	10	317088	317097	20 %	40 %	40 %	0 %	383188249
6518	NC_016818	GGCC	2	8	317129	317136	0 %	0 %	50 %	50 %	383188249
6519	NC_016818	CTG	2	6	317392	317397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188249
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6521	NC_016818	ATT	2	6	317473	317478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188249
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6523	NC_016818	CGC	2	6	317547	317552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188249
6524	NC_016818	TGAC	2	8	317655	317662	25 %	25 %	25 %	25 %	383188249
6525	NC_016818	CGC	2	6	317668	317673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188250
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6528	NC_016818	GCGT	2	8	317880	317887	0 %	25 %	50 %	25 %	383188250
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6533	NC_016818	TGC	2	6	318033	318038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188250
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6536	NC_016818	A	6	6	318098	318103	100 %	0 %	0 %	0 %	383188250
6537	NC_016818	TGC	2	6	318196	318201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188250
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6543	NC_016818	GGC	2	6	318761	318766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188251
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6545	NC_016818	CGGT	2	8	318799	318806	0 %	25 %	50 %	25 %	383188251
6546	NC_016818	AAG	2	6	318945	318950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188251
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6549	NC_016818	CTG	2	6	319101	319106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188251
6550	NC_016818	CT	3	6	319113	319118	0 %	50 %	0 %	50 %	383188251
6551	NC_016818	TGA	2	6	319279	319284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188251
6552	NC_016818	AAG	2	6	319285	319290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188251
6553	NC_016818	GAA	2	6	319328	319333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188251
6554	NC_016818	T	6	6	319415	319420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_016818	AGTTG	2	10	319488	319497	20 %	40 %	40 %	0 %	383188252
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6558	NC_016818	TGC	2	6	319598	319603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188252
6559	NC_016818	CTG	2	6	319641	319646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188252
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6565	NC_016818	CA	3	6	320014	320019	50 %	0 %	0 %	50 %	383188252
6566	NC_016818	TCCGC	2	10	320049	320058	0 %	20 %	20 %	60 %	383188252
6567	NC_016818	ACG	2	6	320062	320067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188252
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6570	NC_016818	CGT	2	6	320253	320258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188252
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6582	NC_016818	A	6	6	320823	320828	100 %	0 %	0 %	0 %	383188252
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6584	NC_016818	GGC	2	6	320884	320889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_016818	T	6	6	321034	321039	0 %	100 %	0 %	0 %	383188253
6586	NC_016818	CGC	2	6	321201	321206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188253
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6595	NC_016818	CGG	2	6	321572	321577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188254
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6598	NC_016818	CCGTG	2	10	321655	321664	0 %	20 %	40 %	40 %	383188254
6599	NC_016818	GCC	2	6	321672	321677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188254
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6603	NC_016818	GC	3	6	321980	321985	0 %	0 %	50 %	50 %	383188254
6604	NC_016818	TGC	2	6	322171	322176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188254
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6608	NC_016818	TATT	2	8	322261	322268	25 %	75 %	0 %	0 %	383188254
6609	NC_016818	CAG	2	6	322269	322274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188254
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6622	NC_016818	CAGTTT	2	12	322830	322841	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383188254
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6748	NC_016818	CTGG	2	8	330321	330328	0 %	25 %	50 %	25 %	383188261
6749	NC_016818	TCA	2	6	330352	330357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188261
6750	NC_016818	ATCA	2	8	330372	330379	50 %	25 %	0 %	25 %	383188261
6751	NC_016818	ATATC	2	10	330383	330392	40 %	40 %	0 %	20 %	383188261
6752	NC_016818	GCT	2	6	330416	330421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188261
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6760	NC_016818	TC	3	6	330827	330832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6761	NC_016818	GA	3	6	331000	331005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6762	NC_016818	AGCG	2	8	331063	331070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6763	NC_016818	TTCACG	2	12	331283	331294	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383188262
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6821	NC_016818	TCT	2	6	334310	334315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6826	NC_016818	CGTG	2	8	334608	334615	0 %	25 %	50 %	25 %	383188264
6827	NC_016818	TGAAG	2	10	334620	334629	40 %	20 %	40 %	0 %	383188264
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6853	NC_016818	GCT	2	6	335610	335615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188265
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6856	NC_016818	TGG	2	6	335882	335887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188266
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6862	NC_016818	GCA	2	6	336267	336272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188266
6863	NC_016818	CAG	2	6	336337	336342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188266
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6865	NC_016818	TAA	2	6	336418	336423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188266
6866	NC_016818	CAC	3	9	336460	336468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188266
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6868	NC_016818	CTG	2	6	336499	336504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188266
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6993	NC_016818	TGT	2	6	342690	342695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188272
6994	NC_016818	CGG	2	6	342699	342704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188272
6995	NC_016818	TGCC	2	8	342758	342765	0 %	25 %	25 %	50 %	383188272
6996	NC_016818	TGG	2	6	342803	342808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188272
6997	NC_016818	CGG	2	6	342842	342847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188272
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6999	NC_016818	CAG	2	6	342889	342894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188272
7000	NC_016818	GTT	2	6	342933	342938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188272

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