MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016818	GGA	2	6	264170	264175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188204
5502	NC_016818	CTGG	2	8	264176	264183	0 %	25 %	50 %	25 %	383188204
5503	NC_016818	GGC	2	6	264235	264240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188204
5504	NC_016818	GGA	2	6	264260	264265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188204
5505	NC_016818	TGA	2	6	264275	264280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188204
5506	NC_016818	GCT	2	6	264293	264298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188204
5507	NC_016818	GCG	2	6	264314	264319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188204
5508	NC_016818	CGT	2	6	264328	264333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188204
5509	NC_016818	G	6	6	264407	264412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_016818	G	6	6	264463	264468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016818	A	7	7	264498	264504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_016818	CTG	2	6	264535	264540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_016818	CGC	2	6	264570	264575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188205
5514	NC_016818	TCAG	2	8	264584	264591	25 %	25 %	25 %	25 %	383188205
5515	NC_016818	GCA	2	6	264624	264629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188205
5516	NC_016818	TTCT	2	8	264631	264638	0 %	75 %	0 %	25 %	383188205
5517	NC_016818	ATCA	2	8	264661	264668	50 %	25 %	0 %	25 %	383188205
5518	NC_016818	CCG	3	9	264686	264694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188205
5519	NC_016818	CAT	2	6	264714	264719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188205
5520	NC_016818	ACC	2	6	264745	264750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188205
5521	NC_016818	TGGC	2	8	264752	264759	0 %	25 %	50 %	25 %	383188205
5522	NC_016818	GCG	2	6	264810	264815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188205
5523	NC_016818	GC	3	6	264918	264923	0 %	0 %	50 %	50 %	383188205
5524	NC_016818	TCA	2	6	264929	264934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188205
5525	NC_016818	CTT	2	6	265065	265070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188205
5526	NC_016818	GCA	2	6	265106	265111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188205
5527	NC_016818	TAA	2	6	265116	265121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188205
5528	NC_016818	ACT	2	6	265148	265153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_016818	GT	3	6	265207	265212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_016818	AGC	2	6	265214	265219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_016818	TGGCA	2	10	265366	265375	20 %	20 %	40 %	20 %	383188206
5532	NC_016818	CTG	2	6	265406	265411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188206
5533	NC_016818	TGC	2	6	265425	265430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188206
5534	NC_016818	CAGC	2	8	265481	265488	25 %	0 %	25 %	50 %	383188206
5535	NC_016818	GC	3	6	265487	265492	0 %	0 %	50 %	50 %	383188206
5536	NC_016818	GAG	2	6	265565	265570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188206
5537	NC_016818	GCA	2	6	265618	265623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188206
5538	NC_016818	GTG	2	6	265641	265646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188206
5539	NC_016818	ATC	2	6	265722	265727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188206
5540	NC_016818	TGG	2	6	265736	265741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188206
5541	NC_016818	CGCAG	2	10	265795	265804	20 %	0 %	40 %	40 %	383188206
5542	NC_016818	GCA	2	6	265805	265810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188206
5543	NC_016818	G	6	6	265811	265816	0 %	0 %	100 %	0 %	383188206
5544	NC_016818	CAGA	2	8	265939	265946	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5545	NC_016818	TGC	2	6	266011	266016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188207
5546	NC_016818	TGAT	2	8	266092	266099	25 %	50 %	25 %	0 %	383188207
5547	NC_016818	CGC	2	6	266168	266173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188207
5548	NC_016818	TGG	2	6	266218	266223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188207
5549	NC_016818	CCAG	2	8	266224	266231	25 %	0 %	25 %	50 %	383188207
5550	NC_016818	GCC	2	6	266471	266476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188207
5551	NC_016818	GC	3	6	266572	266577	0 %	0 %	50 %	50 %	383188207
5552	NC_016818	T	7	7	266748	266754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_016818	TTA	2	6	266827	266832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_016818	CTTT	2	8	266925	266932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5555	NC_016818	CAAA	2	8	266972	266979	75 %	0 %	0 %	25 %	383188208
5556	NC_016818	GGC	2	6	267027	267032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188208
5557	NC_016818	GAT	2	6	267036	267041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188208
5558	NC_016818	AGA	2	6	267048	267053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188208
5559	NC_016818	AGA	2	6	267129	267134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188208
5560	NC_016818	GCTG	2	8	267144	267151	0 %	25 %	50 %	25 %	383188208
5561	NC_016818	GGC	2	6	267160	267165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188208
5562	NC_016818	GAA	3	9	267195	267203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188208
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5564	NC_016818	TGC	2	6	267244	267249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_016818	T	6	6	267280	267285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_016818	GCT	2	6	267412	267417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_016818	CGC	2	6	267582	267587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188209
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5569	NC_016818	TCCGT	2	10	267616	267625	0 %	40 %	20 %	40 %	383188209
5570	NC_016818	GTG	2	6	267699	267704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188209
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5572	NC_016818	CTTT	2	8	267734	267741	0 %	75 %	0 %	25 %	383188209
5573	NC_016818	GCC	3	9	268074	268082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188209
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5577	NC_016818	TCGTGG	2	12	268177	268188	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383188209
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5583	NC_016818	GTC	3	9	268714	268722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188209
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5593	NC_016818	GCCA	2	8	269180	269187	25 %	0 %	25 %	50 %	383188209
5594	NC_016818	ATG	2	6	269207	269212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188210
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5604	NC_016818	A	6	6	269663	269668	100 %	0 %	0 %	0 %	383188210
5605	NC_016818	ATT	2	6	269747	269752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188210
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5615	NC_016818	CGG	2	6	270133	270138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188211
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5619	NC_016818	CCGG	2	8	270312	270319	0 %	0 %	50 %	50 %	383188211
5620	NC_016818	GAG	2	6	270387	270392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188211
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5623	NC_016818	GCA	2	6	270644	270649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188212
5624	NC_016818	CGCTG	2	10	270678	270687	0 %	20 %	40 %	40 %	383188212
5625	NC_016818	GGC	2	6	270693	270698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188212
5626	NC_016818	AGA	2	6	270699	270704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188212
5627	NC_016818	CTG	3	9	270736	270744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188212
5628	NC_016818	CGG	2	6	270750	270755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188212
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5633	NC_016818	CCGT	2	8	271002	271009	0 %	25 %	25 %	50 %	383188212
5634	NC_016818	A	6	6	271117	271122	100 %	0 %	0 %	0 %	383188212
5635	NC_016818	GCA	2	6	271194	271199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188212
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5638	NC_016818	ATGA	2	8	271365	271372	50 %	25 %	25 %	0 %	383188213
5639	NC_016818	GTG	2	6	271395	271400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188213
5640	NC_016818	GCGG	2	8	271431	271438	0 %	0 %	75 %	25 %	383188213
5641	NC_016818	TGACGC	2	12	271493	271504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383188213
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5648	NC_016818	CTG	2	6	271872	271877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188213
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5652	NC_016818	CAG	2	6	272040	272045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188213
5653	NC_016818	CTG	2	6	272164	272169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5654	NC_016818	A	7	7	272195	272201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5655	NC_016818	T	6	6	272231	272236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5656	NC_016818	TCA	2	6	272294	272299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188214
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5663	NC_016818	TGC	2	6	272756	272761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188214
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5670	NC_016818	TGCAT	2	10	273204	273213	20 %	40 %	20 %	20 %	383188214
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5673	NC_016818	GAC	2	6	273294	273299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188215
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5688	NC_016818	ATTG	2	8	274070	274077	25 %	50 %	25 %	0 %	383188216
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5702	NC_016818	AACG	2	8	274812	274819	50 %	0 %	25 %	25 %	383188216
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5720	NC_016818	GAT	2	6	276344	276349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5723	NC_016818	TCATC	2	10	276619	276628	20 %	40 %	0 %	40 %	383188220
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5730	NC_016818	ACCGC	2	10	277097	277106	20 %	0 %	20 %	60 %	383188221
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5732	NC_016818	ACC	2	6	277193	277198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188221
5733	NC_016818	CTT	2	6	277200	277205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188221
5734	NC_016818	ACTG	2	8	277294	277301	25 %	25 %	25 %	25 %	383188221
5735	NC_016818	GC	3	6	277362	277367	0 %	0 %	50 %	50 %	383188221
5736	NC_016818	GCA	3	9	277440	277448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188221
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5741	NC_016818	CGC	2	6	277612	277617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188221
5742	NC_016818	CAT	2	6	277669	277674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188221
5743	NC_016818	CG	3	6	277692	277697	0 %	0 %	50 %	50 %	383188221
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5902	NC_016818	GAATG	2	10	285255	285264	40 %	20 %	40 %	0 %	383188226
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5939	NC_016818	GGC	2	6	287672	287677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188226
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5963	NC_016818	CTG	2	6	288813	288818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188226
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5970	NC_016818	T	7	7	288978	288984	0 %	100 %	0 %	0 %	383188227
5971	NC_016818	GTC	2	6	289008	289013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188227
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5987	NC_016818	CCG	2	6	289917	289922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188227
5988	NC_016818	TAC	2	6	289925	289930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188227
5989	NC_016818	TTTA	2	8	290000	290007	25 %	75 %	0 %	0 %	383188227
5990	NC_016818	TGC	2	6	290031	290036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188227
5991	NC_016818	GCG	2	6	290274	290279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188227
5992	NC_016818	TGAG	2	8	290397	290404	25 %	25 %	50 %	0 %	383188227
5993	NC_016818	TGC	2	6	290430	290435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188227
5994	NC_016818	TCG	2	6	290443	290448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188227
5995	NC_016818	GGGAA	2	10	290571	290580	40 %	0 %	60 %	0 %	383188227
5996	NC_016818	CAA	2	6	290596	290601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188227
5997	NC_016818	CGC	3	9	290620	290628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188227
5998	NC_016818	AGC	2	6	290706	290711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188227
5999	NC_016818	GTG	2	6	290758	290763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188227
6000	NC_016818	CCGG	2	8	290827	290834	0 %	0 %	50 %	50 %	383188227

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