MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016818	CT	3	6	240807	240812	0 %	50 %	0 %	50 %	383188186
5002	NC_016818	GGC	2	6	240854	240859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188186
5003	NC_016818	CGA	2	6	240913	240918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188186
5004	NC_016818	CCTC	2	8	240948	240955	0 %	25 %	0 %	75 %	383188186
5005	NC_016818	ACG	2	6	241047	241052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188186
5006	NC_016818	GAA	2	6	241109	241114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188186
5007	NC_016818	GAA	2	6	241157	241162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188186
5008	NC_016818	GGC	2	6	241168	241173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188186
5009	NC_016818	TCAG	2	8	241203	241210	25 %	25 %	25 %	25 %	383188186
5010	NC_016818	TGA	2	6	241267	241272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188186
5011	NC_016818	CAA	3	9	241294	241302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188186
5012	NC_016818	TGCGC	2	10	241387	241396	0 %	20 %	40 %	40 %	383188186
5013	NC_016818	TGG	2	6	241427	241432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188186
5014	NC_016818	GGC	2	6	241439	241444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188186
5015	NC_016818	GAC	2	6	241445	241450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188186
5016	NC_016818	GCA	2	6	241510	241515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188186
5017	NC_016818	GCTG	2	8	241542	241549	0 %	25 %	50 %	25 %	383188186
5018	NC_016818	GCC	2	6	241591	241596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188186
5019	NC_016818	TGA	2	6	241639	241644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188186
5020	NC_016818	GGCG	2	8	241677	241684	0 %	0 %	75 %	25 %	383188186
5021	NC_016818	GCA	2	6	241685	241690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188186
5022	NC_016818	CCG	2	6	241886	241891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188187
5023	NC_016818	CAT	2	6	241914	241919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188187
5024	NC_016818	CGC	2	6	241957	241962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188187
5025	NC_016818	GCA	2	6	242001	242006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188187
5026	NC_016818	TCTT	2	8	242023	242030	0 %	75 %	0 %	25 %	383188187
5027	NC_016818	GAA	2	6	242035	242040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188187
5028	NC_016818	CCG	2	6	242108	242113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188187
5029	NC_016818	CCG	2	6	242142	242147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188187
5030	NC_016818	ACT	2	6	242201	242206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188187
5031	NC_016818	GCCT	2	8	242254	242261	0 %	25 %	25 %	50 %	383188187
5032	NC_016818	CG	3	6	242270	242275	0 %	0 %	50 %	50 %	383188187
5033	NC_016818	ATCAC	2	10	242318	242327	40 %	20 %	0 %	40 %	383188187
5034	NC_016818	TCG	2	6	242333	242338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188187
5035	NC_016818	CGC	2	6	242354	242359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188187
5036	NC_016818	GAA	2	6	242440	242445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188187
5037	NC_016818	CG	3	6	242521	242526	0 %	0 %	50 %	50 %	383188187
5038	NC_016818	GCC	2	6	242568	242573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188187
5039	NC_016818	GC	3	6	242610	242615	0 %	0 %	50 %	50 %	383188187
5040	NC_016818	ATCTGG	2	12	242618	242629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383188187
5041	NC_016818	GCC	2	6	242697	242702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188187
5042	NC_016818	TGG	2	6	242756	242761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188187
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5044	NC_016818	GTT	2	6	242805	242810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188187
5045	NC_016818	TTCT	2	8	242829	242836	0 %	75 %	0 %	25 %	383188187
5046	NC_016818	CAT	2	6	242853	242858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188187
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5049	NC_016818	TGTT	2	8	243122	243129	0 %	75 %	25 %	0 %	383188188
5050	NC_016818	GGC	2	6	243156	243161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188188
5051	NC_016818	CGC	2	6	243188	243193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188188
5052	NC_016818	A	6	6	243249	243254	100 %	0 %	0 %	0 %	383188188
5053	NC_016818	TGAT	2	8	243349	243356	25 %	50 %	25 %	0 %	383188188
5054	NC_016818	TCG	2	6	243402	243407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188188
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5057	NC_016818	CG	3	6	243646	243651	0 %	0 %	50 %	50 %	383188188
5058	NC_016818	GAAA	2	8	243755	243762	75 %	0 %	25 %	0 %	383188188
5059	NC_016818	GGC	2	6	243823	243828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188188
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5061	NC_016818	TGA	2	6	243875	243880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188188
5062	NC_016818	TGC	2	6	243883	243888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188188
5063	NC_016818	GC	3	6	243894	243899	0 %	0 %	50 %	50 %	383188188
5064	NC_016818	ACG	2	6	243901	243906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188188
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5067	NC_016818	GGC	4	12	244124	244135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188188
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5069	NC_016818	CGG	2	6	244199	244204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188188
5070	NC_016818	CGG	2	6	244301	244306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188188
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5072	NC_016818	GGT	2	6	244319	244324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188188
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5094	NC_016818	ACA	2	6	245132	245137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188189
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5242	NC_016818	T	6	6	252195	252200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5479	NC_016818	ATTGA	2	10	263019	263028	40 %	40 %	20 %	0 %	383188204
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5486	NC_016818	GC	3	6	263458	263463	0 %	0 %	50 %	50 %	383188204
5487	NC_016818	TGC	2	6	263617	263622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188204
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5489	NC_016818	CGG	2	6	263638	263643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188204
5490	NC_016818	AGG	2	6	263647	263652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188204
5491	NC_016818	GCG	2	6	263659	263664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188204
5492	NC_016818	GGA	2	6	263684	263689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188204
5493	NC_016818	GAAA	2	8	263765	263772	75 %	0 %	25 %	0 %	383188204
5494	NC_016818	GTATT	2	10	263814	263823	20 %	60 %	20 %	0 %	383188204
5495	NC_016818	CTTT	2	8	263840	263847	0 %	75 %	0 %	25 %	383188204
5496	NC_016818	CCGC	2	8	263849	263856	0 %	0 %	25 %	75 %	383188204
5497	NC_016818	CT	3	6	263954	263959	0 %	50 %	0 %	50 %	383188204
5498	NC_016818	GCA	2	6	264013	264018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188204
5499	NC_016818	ATG	2	6	264096	264101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188204
5500	NC_016818	GCT	2	6	264104	264109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188204

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