MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 32576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016639	ATC	2	6	19541	19546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016639	AGAT	2	8	19555	19562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016639	ATT	2	6	19616	19621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016639	ATT	2	6	19692	19697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016639	TAAA	2	8	19720	19727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016639	GATA	2	8	19800	19807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016639	GTA	2	6	19837	19842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016639	AGCA	2	8	19868	19875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_016639	TA	3	6	19907	19912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016639	T	6	6	19913	19918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016639	T	6	6	19930	19935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016639	T	6	6	19959	19964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016639	TAC	2	6	19984	19989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_016639	TCC	2	6	19993	19998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_016639	TGA	2	6	20043	20048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016639	AAT	2	6	20122	20127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016639	AGTA	2	8	20133	20140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016639	AT	3	6	20151	20156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016639	AAAC	2	8	20183	20190	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_016639	A	6	6	20193	20198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016639	A	7	7	20201	20207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016639	TTG	2	6	20208	20213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016639	AAT	2	6	20248	20253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016639	TAAA	2	8	20259	20266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016639	ATT	2	6	20291	20296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016639	GTT	2	6	20313	20318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016639	TA	4	8	20361	20368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016639	AAT	2	6	20383	20388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016639	TA	3	6	20433	20438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016639	TTAT	2	8	20454	20461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016639	TTTAA	2	10	20491	20500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016639	AAC	2	6	20532	20537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318786
533	NC_016639	A	7	7	20545	20551	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
534	NC_016639	AAG	2	6	20631	20636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318786
535	NC_016639	TAA	2	6	20656	20661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318786
536	NC_016639	TTG	2	6	20663	20668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318786
537	NC_016639	GCA	2	6	20716	20721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318786
538	NC_016639	GTA	2	6	20865	20870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318786
539	NC_016639	A	6	6	20937	20942	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
540	NC_016639	TAA	2	6	21009	21014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318786
541	NC_016639	TAC	2	6	21106	21111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318786
542	NC_016639	CAT	2	6	21126	21131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318786
543	NC_016639	ACC	2	6	21199	21204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374318786
544	NC_016639	GCA	2	6	21227	21232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318786
545	NC_016639	CAA	2	6	21263	21268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318786
546	NC_016639	TCC	2	6	21307	21312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374318786
547	NC_016639	A	8	8	21340	21347	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
548	NC_016639	GTAA	2	8	21374	21381	50 %	25 %	25 %	0 %	374318786
549	NC_016639	GAT	2	6	21400	21405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318786
550	NC_016639	A	6	6	21455	21460	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
551	NC_016639	A	6	6	21464	21469	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
552	NC_016639	A	6	6	21507	21512	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
553	NC_016639	TCAAG	2	10	21525	21534	40 %	20 %	20 %	20 %	374318786
554	NC_016639	ATAAA	2	10	21579	21588	80 %	20 %	0 %	0 %	374318786
555	NC_016639	AGAT	2	8	21628	21635	50 %	25 %	25 %	0 %	374318786
556	NC_016639	A	6	6	21651	21656	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
557	NC_016639	CAA	2	6	21666	21671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318786
558	NC_016639	AGCA	2	8	21747	21754	50 %	0 %	25 %	25 %	374318786
559	NC_016639	TAA	2	6	21784	21789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318786
560	NC_016639	AAAT	2	8	21790	21797	75 %	25 %	0 %	0 %	374318786
561	NC_016639	AGT	2	6	21821	21826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318786
562	NC_016639	AGAAA	2	10	21841	21850	80 %	0 %	20 %	0 %	374318786
563	NC_016639	A	6	6	21848	21853	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
564	NC_016639	AAG	2	6	21855	21860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318786
565	NC_016639	GCT	2	6	21935	21940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318786
566	NC_016639	A	6	6	21947	21952	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
567	NC_016639	AATG	2	8	21991	21998	50 %	25 %	25 %	0 %	374318786
568	NC_016639	TTA	2	6	22040	22045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318786
569	NC_016639	TGT	2	6	22051	22056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318786
570	NC_016639	AAAGC	2	10	22097	22106	60 %	0 %	20 %	20 %	374318786
571	NC_016639	AAC	2	6	22149	22154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318786
572	NC_016639	CAG	2	6	22193	22198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318786
573	NC_016639	ATTA	2	8	22292	22299	50 %	50 %	0 %	0 %	374318786
574	NC_016639	ATAG	2	8	22340	22347	50 %	25 %	25 %	0 %	374318786
575	NC_016639	ATAG	2	8	22352	22359	50 %	25 %	25 %	0 %	374318786
576	NC_016639	TAT	2	6	22581	22586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318786
577	NC_016639	ATC	2	6	22615	22620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318786
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579	NC_016639	ACA	2	6	22683	22688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318786
580	NC_016639	TTC	2	6	22711	22716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318786
581	NC_016639	ATTTAG	2	12	22749	22760	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374318786
582	NC_016639	CGTT	2	8	22770	22777	0 %	50 %	25 %	25 %	374318786
583	NC_016639	AAC	2	6	22788	22793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318786
584	NC_016639	TAA	2	6	22824	22829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318786
585	NC_016639	AAT	2	6	22877	22882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318786
586	NC_016639	ACA	2	6	22906	22911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318786
587	NC_016639	A	6	6	22923	22928	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
588	NC_016639	GAT	2	6	22955	22960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318786
589	NC_016639	GAA	2	6	23003	23008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318786
590	NC_016639	A	6	6	23033	23038	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
591	NC_016639	TAATA	2	10	23044	23053	60 %	40 %	0 %	0 %	374318786
592	NC_016639	AG	3	6	23055	23060	50 %	0 %	50 %	0 %	374318786
593	NC_016639	CAAA	2	8	23087	23094	75 %	0 %	0 %	25 %	374318786
594	NC_016639	CAAAG	2	10	23136	23145	60 %	0 %	20 %	20 %	374318786
595	NC_016639	TAGT	2	8	23217	23224	25 %	50 %	25 %	0 %	374318786
596	NC_016639	A	7	7	23233	23239	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
597	NC_016639	AAC	2	6	23290	23295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318786
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599	NC_016639	AGTT	2	8	23317	23324	25 %	50 %	25 %	0 %	374318786
600	NC_016639	TC	3	6	23370	23375	0 %	50 %	0 %	50 %	374318786
601	NC_016639	CAG	2	6	23384	23389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318786
602	NC_016639	A	8	8	23439	23446	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
603	NC_016639	AGCAG	2	10	23462	23471	40 %	0 %	40 %	20 %	374318786
604	NC_016639	TAA	2	6	23482	23487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318786
605	NC_016639	AGATGT	2	12	23497	23508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318786
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607	NC_016639	TA	3	6	23613	23618	50 %	50 %	0 %	0 %	374318786
608	NC_016639	CAA	2	6	23633	23638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318786
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614	NC_016639	CTC	2	6	23880	23885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374318786
615	NC_016639	GAAGCT	2	12	23900	23911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374318786
616	NC_016639	A	6	6	23960	23965	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
617	NC_016639	CTA	2	6	23991	23996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318786
618	NC_016639	TA	3	6	23995	24000	50 %	50 %	0 %	0 %	374318786
619	NC_016639	GTTA	2	8	24008	24015	25 %	50 %	25 %	0 %	374318786
620	NC_016639	AT	3	6	24038	24043	50 %	50 %	0 %	0 %	374318786
621	NC_016639	ATT	2	6	24109	24114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318786
622	NC_016639	A	7	7	24292	24298	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
623	NC_016639	A	6	6	24312	24317	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
624	NC_016639	TGA	2	6	24394	24399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318786
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626	NC_016639	TAA	2	6	24538	24543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318786
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631	NC_016639	TAA	2	6	24751	24756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318786
632	NC_016639	TA	3	6	24773	24778	50 %	50 %	0 %	0 %	374318786
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