MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 19848

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016050	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
2	NC_016050	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273054
3	NC_016050	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
4	NC_016050	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
5	NC_016050	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273054
6	NC_016050	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273054
7	NC_016050	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
8	NC_016050	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273054
9	NC_016050	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273054
10	NC_016050	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273054
11	NC_016050	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016050	TGT	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016050	ATA	2	6	1042	1047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273055
14	NC_016050	TGA	2	6	1101	1106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273055
15	NC_016050	GTA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273055
16	NC_016050	CAA	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273055
17	NC_016050	TAA	2	6	1230	1235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273055
18	NC_016050	TCT	2	6	1350	1355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273056
19	NC_016050	ATA	3	9	1614	1622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273056
20	NC_016050	TGG	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350273056
21	NC_016050	TGA	2	6	1780	1785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273056
22	NC_016050	GAA	2	6	1837	1842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273056
23	NC_016050	AAT	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273056
24	NC_016050	AAG	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273056
25	NC_016050	TTA	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273056
26	NC_016050	CAA	3	9	1985	1993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273056
27	NC_016050	CGG	2	6	2206	2211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350273057
28	NC_016050	AGC	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273057
29	NC_016050	ATA	2	6	2282	2287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273057
30	NC_016050	ATA	2	6	2420	2425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273057
31	NC_016050	TAA	2	6	2451	2456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273057
32	NC_016050	ATG	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273057
33	NC_016050	TAT	2	6	2701	2706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273057
34	NC_016050	TTA	2	6	2715	2720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273057
35	NC_016050	CTC	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350273058
36	NC_016050	ATT	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
37	NC_016050	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
38	NC_016050	ATT	2	6	3049	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
39	NC_016050	AGA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
40	NC_016050	AGA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
41	NC_016050	AGC	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273058
42	NC_016050	TGC	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273058
43	NC_016050	ATT	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
44	NC_016050	TAT	2	6	3624	3629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
45	NC_016050	GCA	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273058
46	NC_016050	AGA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
47	NC_016050	CTA	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273058
48	NC_016050	TAT	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
49	NC_016050	TTA	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
50	NC_016050	TGT	2	6	3927	3932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273058
51	NC_016050	ATA	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
52	NC_016050	GGC	2	6	4372	4377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350273058
53	NC_016050	GCA	2	6	4396	4401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273058
54	NC_016050	GGA	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350273058
55	NC_016050	GAA	2	6	4495	4500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
56	NC_016050	AAG	2	6	4526	4531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
57	NC_016050	AAT	2	6	4537	4542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
58	NC_016050	GAA	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
59	NC_016050	TAA	2	6	4563	4568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
60	NC_016050	CTA	2	6	4587	4592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273058
61	NC_016050	AGT	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
62	NC_016050	AAG	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
63	NC_016050	ATA	2	6	5015	5020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
64	NC_016050	ATT	2	6	5066	5071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
65	NC_016050	TAA	2	6	5088	5093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
66	NC_016050	GAT	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
67	NC_016050	TGC	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273058
68	NC_016050	ATT	2	6	5189	5194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
69	NC_016050	TGC	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273058
70	NC_016050	CTA	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273058
71	NC_016050	AGT	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
72	NC_016050	CGC	2	6	5360	5365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273058
73	NC_016050	TTG	2	6	5396	5401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273058
74	NC_016050	TTA	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
75	NC_016050	ATA	2	6	5447	5452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
76	NC_016050	TAA	2	6	5516	5521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
77	NC_016050	ATA	2	6	5539	5544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
78	NC_016050	GAA	2	6	5545	5550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
79	NC_016050	ATA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
80	NC_016050	ATG	2	6	5626	5631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
81	NC_016050	GTT	2	6	5833	5838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273059
82	NC_016050	CTT	2	6	5876	5881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273059
83	NC_016050	ATA	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273059
84	NC_016050	CAA	2	6	5947	5952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273059
85	NC_016050	GTT	2	6	5984	5989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273059
86	NC_016050	GAT	2	6	6012	6017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273059
87	NC_016050	AAC	2	6	6037	6042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273059
88	NC_016050	CAA	2	6	6087	6092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273059
89	NC_016050	TAT	2	6	6112	6117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273059
90	NC_016050	TTC	2	6	6138	6143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016050	TAA	2	6	6192	6197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016050	CTT	2	6	6212	6217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016050	GTT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016050	TCC	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_016050	CTA	3	9	6450	6458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273060
96	NC_016050	ATT	2	6	6497	6502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273060
97	NC_016050	TTC	2	6	6563	6568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273060
98	NC_016050	ATC	2	6	6714	6719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273060
99	NC_016050	CCG	2	6	6762	6767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273060
100	NC_016050	ATT	2	6	6768	6773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273060
101	NC_016050	TAC	2	6	6824	6829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273060
102	NC_016050	ATT	2	6	6830	6835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273060
103	NC_016050	ATT	3	9	6881	6889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273060
104	NC_016050	TCA	2	6	6901	6906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273060
105	NC_016050	CCA	2	6	6909	6914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350273060
106	NC_016050	TAT	2	6	6955	6960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273060
107	NC_016050	TAC	2	6	7079	7084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273060
108	NC_016050	GCA	2	6	7111	7116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273060
109	NC_016050	GTA	2	6	7194	7199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273060
110	NC_016050	CTT	2	6	7412	7417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273061
111	NC_016050	TAG	2	6	7424	7429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273061
112	NC_016050	AGC	2	6	7455	7460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273061
113	NC_016050	CTA	2	6	7601	7606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273061
114	NC_016050	TCT	2	6	7676	7681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016050	AAT	2	6	7719	7724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016050	GAC	2	6	7807	7812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016050	CAA	3	9	7826	7834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016050	ATA	3	9	7897	7905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273062
119	NC_016050	ATA	2	6	7924	7929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273062
120	NC_016050	GCC	2	6	7944	7949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273062
121	NC_016050	TGC	2	6	8075	8080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273062
122	NC_016050	ATA	2	6	8107	8112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273062
123	NC_016050	TAG	2	6	8210	8215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273062
124	NC_016050	ATT	2	6	8235	8240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273062
125	NC_016050	ACG	2	6	8341	8346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273062
126	NC_016050	TGT	2	6	8380	8385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273062
127	NC_016050	TAT	2	6	8450	8455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273062
128	NC_016050	TAA	2	6	8462	8467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273062
129	NC_016050	CAA	2	6	8531	8536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273062
130	NC_016050	ATT	2	6	8548	8553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273062
131	NC_016050	TAA	2	6	8631	8636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273062
132	NC_016050	AGC	3	9	8685	8693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273062
133	NC_016050	AGG	2	6	8808	8813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350273062
134	NC_016050	TAC	2	6	8882	8887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273062
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136	NC_016050	CAA	2	6	8951	8956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016050	ATA	2	6	9044	9049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016050	ATG	2	6	9097	9102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016050	CAA	2	6	9119	9124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016050	TTA	2	6	9173	9178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016050	AAG	2	6	9245	9250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016050	TAA	2	6	9311	9316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016050	TAA	2	6	9329	9334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016050	AAC	2	6	9383	9388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_016050	TGA	2	6	9816	9821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016050	AGT	2	6	9897	9902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_016050	TGA	2	6	9952	9957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_016050	TGA	2	6	10183	10188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_016050	TAT	2	6	10341	10346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016050	AAC	2	6	10347	10352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_016050	ATC	2	6	11091	11096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_016050	ATT	2	6	11116	11121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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395	NC_016050	ATA	2	6	26340	26345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_016050	ATG	2	6	26370	26375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
398	NC_016050	TAT	2	6	26419	26424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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