MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 32796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4003	NC_016050	TAAT	2	8	158776	158783	50 %	50 %	0 %	0 %	350273163
4004	NC_016050	A	6	6	158790	158795	100 %	0 %	0 %	0 %	350273163
4005	NC_016050	A	6	6	158865	158870	100 %	0 %	0 %	0 %	350273164
4006	NC_016050	ATT	2	6	158876	158881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273164
4007	NC_016050	A	7	7	158924	158930	100 %	0 %	0 %	0 %	350273164
4008	NC_016050	ATT	2	6	158975	158980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273164
4009	NC_016050	TCTT	2	8	159080	159087	0 %	75 %	0 %	25 %	350273164
4010	NC_016050	GTA	2	6	159164	159169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273164
4011	NC_016050	AGT	2	6	159178	159183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273164
4012	NC_016050	TCG	2	6	159184	159189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273164
4013	NC_016050	TAT	2	6	159200	159205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273164
4014	NC_016050	AG	3	6	159241	159246	50 %	0 %	50 %	0 %	350273164
4015	NC_016050	GCA	2	6	159272	159277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273164
4016	NC_016050	AT	3	6	159287	159292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016050	CAT	2	6	159349	159354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_016050	AGC	2	6	159359	159364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_016050	ATA	2	6	159391	159396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016050	TTTATC	2	12	159510	159521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	350273165
4021	NC_016050	GAA	2	6	159574	159579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273165
4022	NC_016050	CTT	2	6	159602	159607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273165
4023	NC_016050	TA	3	6	159651	159656	50 %	50 %	0 %	0 %	350273165
4024	NC_016050	TAC	3	9	159675	159683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273165
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4026	NC_016050	TA	3	6	159723	159728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016050	AT	3	6	159756	159761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016050	AAT	2	6	159762	159767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273166
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4031	NC_016050	A	6	6	159826	159831	100 %	0 %	0 %	0 %	350273166
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4033	NC_016050	TA	4	8	159885	159892	50 %	50 %	0 %	0 %	350273166
4034	NC_016050	AATTT	2	10	159893	159902	40 %	60 %	0 %	0 %	350273166
4035	NC_016050	CGG	2	6	159918	159923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350273166
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4037	NC_016050	GTA	3	9	160055	160063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273166
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4040	NC_016050	TTG	2	6	160154	160159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273166
4041	NC_016050	TGC	2	6	160356	160361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273166
4042	NC_016050	TAT	2	6	160371	160376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273166
4043	NC_016050	GTA	2	6	160399	160404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273166
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4045	NC_016050	A	8	8	160444	160451	100 %	0 %	0 %	0 %	350273166
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4051	NC_016050	TTG	2	6	160716	160721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016050	TCATTG	2	12	160734	160745	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4081	NC_016050	GAG	2	6	162139	162144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016050	GCGA	2	8	162176	162183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_016050	ATA	2	6	162218	162223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4094	NC_016050	ATTG	2	8	162661	162668	25 %	50 %	25 %	0 %	350273168
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4096	NC_016050	A	7	7	162692	162698	100 %	0 %	0 %	0 %	350273168
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4098	NC_016050	TA	4	8	162820	162827	50 %	50 %	0 %	0 %	350273168
4099	NC_016050	GATA	2	8	162830	162837	50 %	25 %	25 %	0 %	350273168
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4108	NC_016050	GAT	2	6	163216	163221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273169
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4110	NC_016050	A	6	6	163389	163394	100 %	0 %	0 %	0 %	350273169
4111	NC_016050	TA	3	6	163396	163401	50 %	50 %	0 %	0 %	350273169
4112	NC_016050	GAA	2	6	163417	163422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273169
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4116	NC_016050	ATC	2	6	163616	163621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273169
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4118	NC_016050	AT	3	6	163630	163635	50 %	50 %	0 %	0 %	350273169
4119	NC_016050	GTAAAA	2	12	163687	163698	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	350273169
4120	NC_016050	AACA	2	8	163706	163713	75 %	0 %	0 %	25 %	350273169
4121	NC_016050	CA	3	6	163723	163728	50 %	0 %	0 %	50 %	350273169
4122	NC_016050	AAG	2	6	163733	163738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273169
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4126	NC_016050	AC	3	6	163863	163868	50 %	0 %	0 %	50 %	350273170
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4252	NC_016050	CTA	2	6	168366	168371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273174
4253	NC_016050	CTG	2	6	168400	168405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273174
4254	NC_016050	CTA	2	6	168456	168461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273174
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4256	NC_016050	TCC	2	6	168512	168517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350273174
4257	NC_016050	TTATT	2	10	168546	168555	20 %	80 %	0 %	0 %	350273174
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4260	NC_016050	AT	3	6	168630	168635	50 %	50 %	0 %	0 %	350273174
4261	NC_016050	ATT	2	6	168652	168657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273174
4262	NC_016050	A	6	6	168692	168697	100 %	0 %	0 %	0 %	350273174
4263	NC_016050	TA	3	6	168808	168813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_016050	AT	4	8	168819	168826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_016050	ATA	2	6	168845	168850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4273	NC_016050	TGT	2	6	169028	169033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273175
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4289	NC_016050	AGAT	2	8	169808	169815	50 %	25 %	25 %	0 %	350273175
4290	NC_016050	AGT	2	6	169826	169831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273175
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4293	NC_016050	ACT	2	6	169877	169882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273175
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4320	NC_016050	GTT	2	6	170937	170942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273177
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4358	NC_016050	AGA	2	6	172310	172315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273177
4359	NC_016050	A	6	6	172332	172337	100 %	0 %	0 %	0 %	350273177
4360	NC_016050	GTA	3	9	172375	172383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273177
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4362	NC_016050	ATA	2	6	172571	172576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_016050	ATGA	2	8	172589	172596	50 %	25 %	25 %	0 %	350273178
4364	NC_016050	A	6	6	172596	172601	100 %	0 %	0 %	0 %	350273178
4365	NC_016050	AGA	2	6	172636	172641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273178
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4369	NC_016050	AAGA	2	8	172865	172872	75 %	0 %	25 %	0 %	350273178
4370	NC_016050	ATT	2	6	172893	172898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273178
4371	NC_016050	AT	3	6	172924	172929	50 %	50 %	0 %	0 %	350273178
4372	NC_016050	CAG	2	6	173075	173080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273178
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