MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 32796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016050	ACA	2	6	137806	137811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_016050	A	6	6	137811	137816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_016050	AAAT	2	8	137867	137874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_016050	ATT	2	6	137905	137910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273157
3505	NC_016050	AGC	2	6	137920	137925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273157
3506	NC_016050	CAA	2	6	137942	137947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273157
3507	NC_016050	TTA	2	6	138023	138028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273157
3508	NC_016050	TTA	2	6	138033	138038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273157
3509	NC_016050	AAAT	2	8	138039	138046	75 %	25 %	0 %	0 %	350273157
3510	NC_016050	CTG	2	6	138063	138068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273157
3511	NC_016050	ATG	2	6	138069	138074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273157
3512	NC_016050	CTTA	2	8	138109	138116	25 %	50 %	0 %	25 %	350273157
3513	NC_016050	AGA	2	6	138161	138166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273157
3514	NC_016050	TTA	2	6	138234	138239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273157
3515	NC_016050	T	6	6	138287	138292	0 %	100 %	0 %	0 %	350273157
3516	NC_016050	TA	3	6	138315	138320	50 %	50 %	0 %	0 %	350273157
3517	NC_016050	AAG	2	6	138362	138367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273157
3518	NC_016050	TAA	2	6	138382	138387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273157
3519	NC_016050	GAAA	2	8	138418	138425	75 %	0 %	25 %	0 %	350273157
3520	NC_016050	GCG	2	6	138555	138560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350273157
3521	NC_016050	T	6	6	138626	138631	0 %	100 %	0 %	0 %	350273157
3522	NC_016050	AAG	2	6	138652	138657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273157
3523	NC_016050	CTTTGT	2	12	138775	138786	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	350273157
3524	NC_016050	CAT	2	6	138926	138931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273157
3525	NC_016050	ATA	2	6	138954	138959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273157
3526	NC_016050	AT	3	6	138975	138980	50 %	50 %	0 %	0 %	350273157
3527	NC_016050	GCA	2	6	138989	138994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273157
3528	NC_016050	TA	3	6	139085	139090	50 %	50 %	0 %	0 %	350273157
3529	NC_016050	TAC	2	6	139204	139209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273157
3530	NC_016050	TTTTA	2	10	139223	139232	20 %	80 %	0 %	0 %	350273157
3531	NC_016050	TGA	2	6	139299	139304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273157
3532	NC_016050	T	6	6	139349	139354	0 %	100 %	0 %	0 %	350273157
3533	NC_016050	GAG	2	6	139365	139370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350273157
3534	NC_016050	TAAT	2	8	139410	139417	50 %	50 %	0 %	0 %	350273157
3535	NC_016050	ATA	2	6	139539	139544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273157
3536	NC_016050	GAT	2	6	139712	139717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273157
3537	NC_016050	TA	3	6	139800	139805	50 %	50 %	0 %	0 %	350273157
3538	NC_016050	TGA	2	6	139858	139863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273157
3539	NC_016050	TGC	2	6	139975	139980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273157
3540	NC_016050	CAA	2	6	140009	140014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273157
3541	NC_016050	T	7	7	140028	140034	0 %	100 %	0 %	0 %	350273157
3542	NC_016050	AT	3	6	140092	140097	50 %	50 %	0 %	0 %	350273157
3543	NC_016050	TTAA	2	8	140099	140106	50 %	50 %	0 %	0 %	350273157
3544	NC_016050	CTA	2	6	140118	140123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273157
3545	NC_016050	T	6	6	140131	140136	0 %	100 %	0 %	0 %	350273157
3546	NC_016050	AG	3	6	140249	140254	50 %	0 %	50 %	0 %	350273157
3547	NC_016050	CTGT	2	8	140322	140329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_016050	ATT	2	6	140440	140445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273158
3549	NC_016050	GTA	2	6	140451	140456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273158
3550	NC_016050	TGC	2	6	140589	140594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273158
3551	NC_016050	TTG	2	6	140619	140624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273158
3552	NC_016050	TC	3	6	140658	140663	0 %	50 %	0 %	50 %	350273158
3553	NC_016050	ATTT	2	8	140712	140719	25 %	75 %	0 %	0 %	350273158
3554	NC_016050	GCTTT	2	10	140799	140808	0 %	60 %	20 %	20 %	350273158
3555	NC_016050	TAA	2	6	140812	140817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273158
3556	NC_016050	AATT	2	8	140823	140830	50 %	50 %	0 %	0 %	350273158
3557	NC_016050	TTGCTA	2	12	140865	140876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	350273158
3558	NC_016050	GAT	2	6	140906	140911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273158
3559	NC_016050	A	8	8	140933	140940	100 %	0 %	0 %	0 %	350273158
3560	NC_016050	TGA	2	6	140974	140979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273158
3561	NC_016050	AT	3	6	141011	141016	50 %	50 %	0 %	0 %	350273158
3562	NC_016050	AAGATA	2	12	141030	141041	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	350273158
3563	NC_016050	AT	3	6	141094	141099	50 %	50 %	0 %	0 %	350273158
3564	NC_016050	TAA	2	6	141127	141132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273158
3565	NC_016050	CTTTAG	2	12	141192	141203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	350273158
3566	NC_016050	GATG	2	8	141224	141231	25 %	25 %	50 %	0 %	350273158
3567	NC_016050	AGT	2	6	141265	141270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273158
3568	NC_016050	TATGT	2	10	141449	141458	20 %	60 %	20 %	0 %	350273158
3569	NC_016050	T	6	6	141458	141463	0 %	100 %	0 %	0 %	350273158
3570	NC_016050	GCC	2	6	141493	141498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273158
3571	NC_016050	TA	3	6	141509	141514	50 %	50 %	0 %	0 %	350273158
3572	NC_016050	TGC	2	6	141673	141678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273158
3573	NC_016050	TCCG	2	8	141679	141686	0 %	25 %	25 %	50 %	350273158
3574	NC_016050	TCTT	2	8	141706	141713	0 %	75 %	0 %	25 %	350273158
3575	NC_016050	ATT	2	6	141771	141776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273158
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3578	NC_016050	TTTAGT	2	12	141851	141862	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	350273158
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3581	NC_016050	ATG	2	6	141911	141916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273158
3582	NC_016050	TGC	2	6	141961	141966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273158
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3592	NC_016050	T	6	6	142496	142501	0 %	100 %	0 %	0 %	350273158
3593	NC_016050	GTTA	2	8	142549	142556	25 %	50 %	25 %	0 %	350273158
3594	NC_016050	TAG	2	6	142591	142596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273158
3595	NC_016050	TGC	2	6	142612	142617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273158
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3597	NC_016050	GCAA	2	8	142663	142670	50 %	0 %	25 %	25 %	350273158
3598	NC_016050	TGC	2	6	142708	142713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273158
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3603	NC_016050	TGC	2	6	142831	142836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273158
3604	NC_016050	AAC	2	6	142864	142869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273158
3605	NC_016050	TCT	2	6	142883	142888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273158
3606	NC_016050	AGT	2	6	142916	142921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273158
3607	NC_016050	TGT	2	6	142936	142941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273158
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3611	NC_016050	ATA	2	6	143061	143066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273158
3612	NC_016050	A	6	6	143078	143083	100 %	0 %	0 %	0 %	350273158
3613	NC_016050	ATA	2	6	143091	143096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273158
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3620	NC_016050	TAGC	2	8	143482	143489	25 %	25 %	25 %	25 %	350273159
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