MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 32796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_016050	TA	3	6	117850	117855	50 %	50 %	0 %	0 %	350273136
3003	NC_016050	A	7	7	117885	117891	100 %	0 %	0 %	0 %	350273136
3004	NC_016050	A	7	7	117893	117899	100 %	0 %	0 %	0 %	350273136
3005	NC_016050	TTA	2	6	117904	117909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273136
3006	NC_016050	TTA	2	6	117931	117936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273136
3007	NC_016050	A	6	6	117941	117946	100 %	0 %	0 %	0 %	350273136
3008	NC_016050	AGA	2	6	117954	117959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273136
3009	NC_016050	TAC	2	6	117972	117977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273136
3010	NC_016050	TA	3	6	118022	118027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_016050	GTC	2	6	118043	118048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_016050	TAA	2	6	118066	118071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016050	TGA	2	6	118098	118103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016050	GCT	2	6	118123	118128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_016050	A	6	6	118157	118162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_016050	AT	3	6	118175	118180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016050	ATT	2	6	118274	118279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273137
3018	NC_016050	TA	4	8	118338	118345	50 %	50 %	0 %	0 %	350273137
3019	NC_016050	TGA	2	6	118355	118360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273137
3020	NC_016050	AT	3	6	118419	118424	50 %	50 %	0 %	0 %	350273137
3021	NC_016050	A	7	7	118433	118439	100 %	0 %	0 %	0 %	350273137
3022	NC_016050	ATT	2	6	118451	118456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273137
3023	NC_016050	TAT	2	6	118518	118523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273137
3024	NC_016050	TGG	2	6	118541	118546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350273137
3025	NC_016050	CTAA	2	8	118551	118558	50 %	25 %	0 %	25 %	350273137
3026	NC_016050	GAA	2	6	118620	118625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273137
3027	NC_016050	A	6	6	118644	118649	100 %	0 %	0 %	0 %	350273137
3028	NC_016050	AAGA	2	8	118671	118678	75 %	0 %	25 %	0 %	350273137
3029	NC_016050	TCT	2	6	118730	118735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273137
3030	NC_016050	AGT	2	6	118736	118741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273137
3031	NC_016050	TAA	2	6	118751	118756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273137
3032	NC_016050	AGT	2	6	118808	118813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273137
3033	NC_016050	ATG	2	6	118861	118866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273137
3034	NC_016050	GAA	2	6	118929	118934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273137
3035	NC_016050	TGA	2	6	119054	119059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273137
3036	NC_016050	AGCA	2	8	119080	119087	50 %	0 %	25 %	25 %	350273137
3037	NC_016050	ATG	2	6	119092	119097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273137
3038	NC_016050	GTT	2	6	119132	119137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_016050	TTC	2	6	119265	119270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_016050	ATA	2	6	119292	119297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016050	AAAT	2	8	119324	119331	75 %	25 %	0 %	0 %	350273138
3042	NC_016050	TGC	2	6	119337	119342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273138
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3045	NC_016050	A	6	6	119392	119397	100 %	0 %	0 %	0 %	350273138
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3050	NC_016050	TTG	2	6	119567	119572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273138
3051	NC_016050	GAA	3	9	119683	119691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273138
3052	NC_016050	CGT	2	6	119734	119739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273138
3053	NC_016050	AT	3	6	119744	119749	50 %	50 %	0 %	0 %	350273138
3054	NC_016050	TAG	2	6	119825	119830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273138
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3057	NC_016050	T	6	6	119971	119976	0 %	100 %	0 %	0 %	350273138
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3064	NC_016050	A	7	7	120203	120209	100 %	0 %	0 %	0 %	350273138
3065	NC_016050	TGT	3	9	120310	120318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016050	ACTAGT	2	12	120384	120395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3067	NC_016050	T	7	7	120443	120449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_016050	AAT	2	6	120458	120463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_016050	A	6	6	120497	120502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_016050	ACTC	2	8	120512	120519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_016050	CAAA	2	8	120534	120541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3072	NC_016050	TC	3	6	120585	120590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_016050	CTAT	2	8	120604	120611	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_016050	TAA	2	6	120612	120617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_016050	T	6	6	120629	120634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_016050	TAA	2	6	120641	120646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_016050	TTA	3	9	120690	120698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_016050	TA	3	6	120974	120979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_016050	A	7	7	121111	121117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_016050	GTC	2	6	121190	121195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3086	NC_016050	TAC	2	6	121408	121413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3089	NC_016050	AGT	2	6	121628	121633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3094	NC_016050	TGC	2	6	122004	122009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273139
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3096	NC_016050	A	7	7	122072	122078	100 %	0 %	0 %	0 %	350273139
3097	NC_016050	TA	3	6	122106	122111	50 %	50 %	0 %	0 %	350273139
3098	NC_016050	ATC	2	6	122115	122120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273139
3099	NC_016050	TAGCGG	2	12	122150	122161	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	350273139
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3103	NC_016050	A	6	6	122502	122507	100 %	0 %	0 %	0 %	350273139
3104	NC_016050	CTTTTT	2	12	122509	122520	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	350273139
3105	NC_016050	TAG	2	6	122562	122567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273139
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3107	NC_016050	TATC	2	8	122681	122688	25 %	50 %	0 %	25 %	350273139
3108	NC_016050	AAG	2	6	122756	122761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273139
3109	NC_016050	AACG	2	8	122771	122778	50 %	0 %	25 %	25 %	350273139
3110	NC_016050	TAT	2	6	122798	122803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273139
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3115	NC_016050	TAA	2	6	123075	123080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273139
3116	NC_016050	ATAAA	2	10	123097	123106	80 %	20 %	0 %	0 %	350273139
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3120	NC_016050	CAT	2	6	123144	123149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273139
3121	NC_016050	CT	3	6	123159	123164	0 %	50 %	0 %	50 %	350273140
3122	NC_016050	TAT	2	6	123272	123277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273140
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3124	NC_016050	TA	3	6	123385	123390	50 %	50 %	0 %	0 %	350273140
3125	NC_016050	TAT	2	6	123419	123424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273140
3126	NC_016050	TAG	2	6	123484	123489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273140
3127	NC_016050	CTA	2	6	123493	123498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273140
3128	NC_016050	CTA	2	6	123520	123525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273140
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3132	NC_016050	T	6	6	123782	123787	0 %	100 %	0 %	0 %	350273140
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3135	NC_016050	TAAG	2	8	123860	123867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3239	NC_016050	GAG	2	6	128282	128287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3247	NC_016050	GCAG	2	8	128485	128492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3248	NC_016050	TAA	2	6	128496	128501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_016050	AT	3	6	128541	128546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_016050	GTT	2	6	128670	128675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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