MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 32796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32005	NC_016050	T	6	6	1252502	1252507	0 %	100 %	0 %	0 %	350274000
32006	NC_016050	ATT	2	6	1252514	1252519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350274000
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32236	NC_016050	GA	3	6	1261560	1261565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32237	NC_016050	CA	3	6	1261681	1261686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32238	NC_016050	ATT	2	6	1261703	1261708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32239	NC_016050	CCAT	2	8	1261750	1261757	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32240	NC_016050	A	6	6	1261820	1261825	100 %	0 %	0 %	0 %	350274011
32241	NC_016050	CAAA	2	8	1261827	1261834	75 %	0 %	0 %	25 %	350274011
32242	NC_016050	CTA	2	6	1261842	1261847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350274011
32243	NC_016050	A	6	6	1261865	1261870	100 %	0 %	0 %	0 %	350274011
32244	NC_016050	GCT	2	6	1261880	1261885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350274011
32245	NC_016050	TAGTA	2	10	1261910	1261919	40 %	40 %	20 %	0 %	350274011
32246	NC_016050	TATT	2	8	1261947	1261954	25 %	75 %	0 %	0 %	350274011
32247	NC_016050	CTT	2	6	1261979	1261984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350274011
32248	NC_016050	TAT	2	6	1262014	1262019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350274011
32249	NC_016050	TAA	2	6	1262035	1262040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350274011
32250	NC_016050	TTA	2	6	1262044	1262049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350274011
32251	NC_016050	ATCTAT	2	12	1262055	1262066	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	350274011
32252	NC_016050	AAT	2	6	1262067	1262072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350274011
32253	NC_016050	AATT	2	8	1262089	1262096	50 %	50 %	0 %	0 %	350274011
32254	NC_016050	TAA	2	6	1262117	1262122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350274011
32255	NC_016050	TTA	2	6	1262177	1262182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350274011
32256	NC_016050	TA	3	6	1262181	1262186	50 %	50 %	0 %	0 %	350274011
32257	NC_016050	TCT	2	6	1262187	1262192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350274011
32258	NC_016050	AAT	2	6	1262247	1262252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350274011
32259	NC_016050	TAA	2	6	1262285	1262290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350274011
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32263	NC_016050	AT	4	8	1262419	1262426	50 %	50 %	0 %	0 %	350274011
32264	NC_016050	ATA	2	6	1262428	1262433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350274011
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32271	NC_016050	AATT	2	8	1262644	1262651	50 %	50 %	0 %	0 %	350274011
32272	NC_016050	AAT	2	6	1262669	1262674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350274011
32273	NC_016050	T	7	7	1262719	1262725	0 %	100 %	0 %	0 %	350274011
32274	NC_016050	A	7	7	1262742	1262748	100 %	0 %	0 %	0 %	350274011
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32280	NC_016050	ATTT	3	12	1262998	1263009	25 %	75 %	0 %	0 %	350274012
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32282	NC_016050	TA	3	6	1263074	1263079	50 %	50 %	0 %	0 %	350274012
32283	NC_016050	ATA	2	6	1263120	1263125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350274012
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32288	NC_016050	TGC	2	6	1263384	1263389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350274012
32289	NC_016050	T	6	6	1263407	1263412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32290	NC_016050	TTG	2	6	1263546	1263551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32291	NC_016050	CAT	2	6	1263623	1263628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350274013
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32315	NC_016050	AT	3	6	1264446	1264451	50 %	50 %	0 %	0 %	350274013
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32320	NC_016050	ATT	2	6	1264739	1264744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350274013
32321	NC_016050	GTTT	2	8	1264772	1264779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32322	NC_016050	TA	3	6	1264791	1264796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32323	NC_016050	ATT	2	6	1264824	1264829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32324	NC_016050	T	6	6	1264847	1264852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32325	NC_016050	TTC	2	6	1264857	1264862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32326	NC_016050	GCTT	2	8	1264930	1264937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32327	NC_016050	TATAT	2	10	1264942	1264951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32328	NC_016050	ATATA	2	10	1264969	1264978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32329	NC_016050	AT	3	6	1265062	1265067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32330	NC_016050	GAA	2	6	1265086	1265091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32331	NC_016050	T	6	6	1265208	1265213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32332	NC_016050	TGT	2	6	1265226	1265231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32333	NC_016050	TTTA	2	8	1265313	1265320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32334	NC_016050	TAT	2	6	1265346	1265351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32335	NC_016050	TAT	2	6	1265367	1265372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32338	NC_016050	TGT	2	6	1265407	1265412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32339	NC_016050	AGA	2	6	1265425	1265430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32340	NC_016050	TAT	2	6	1265483	1265488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32341	NC_016050	TTA	2	6	1265500	1265505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32342	NC_016050	AATAA	2	10	1265537	1265546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32343	NC_016050	ATA	2	6	1265560	1265565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32344	NC_016050	ATC	2	6	1265631	1265636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32345	NC_016050	T	6	6	1265706	1265711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32346	NC_016050	AATTT	2	10	1265756	1265765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32347	NC_016050	AAT	2	6	1265784	1265789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32348	NC_016050	T	7	7	1265808	1265814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32349	NC_016050	ATT	2	6	1265869	1265874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32350	NC_016050	ATAAA	2	10	1265891	1265900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32351	NC_016050	A	6	6	1265930	1265935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32352	NC_016050	AG	3	6	1265948	1265953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32353	NC_016050	GCTTT	2	10	1265967	1265976	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32354	NC_016050	CAG	2	6	1265997	1266002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32355	NC_016050	TAC	2	6	1266034	1266039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32356	NC_016050	ACC	2	6	1266052	1266057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32357	NC_016050	AGC	2	6	1266091	1266096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32358	NC_016050	T	6	6	1266107	1266112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32359	NC_016050	T	7	7	1266176	1266182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32360	NC_016050	A	6	6	1266195	1266200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32361	NC_016050	CAA	2	6	1266211	1266216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32362	NC_016050	CTG	2	6	1266233	1266238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32363	NC_016050	CAT	2	6	1266256	1266261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32365	NC_016050	ATATA	2	10	1266365	1266374	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32490	NC_016050	AAAG	2	8	1270952	1270959	75 %	0 %	25 %	0 %	350274018
32491	NC_016050	A	6	6	1270998	1271003	100 %	0 %	0 %	0 %	350274018
32492	NC_016050	TACT	2	8	1271019	1271026	25 %	50 %	0 %	25 %	350274018
32493	NC_016050	ATTTTT	2	12	1271041	1271052	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	350274018
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32495	NC_016050	AG	3	6	1271159	1271164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32496	NC_016050	AGC	2	6	1271263	1271268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350274019
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32499	NC_016050	T	8	8	1271562	1271569	0 %	100 %	0 %	0 %	350274019
32500	NC_016050	CTA	2	6	1271582	1271587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350274019

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