MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 32796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016050	TACCA	2	10	239315	239324	40 %	20 %	0 %	40 %	350273231
6002	NC_016050	TTTG	2	8	239336	239343	0 %	75 %	25 %	0 %	350273231
6003	NC_016050	ATTT	2	8	239392	239399	25 %	75 %	0 %	0 %	350273231
6004	NC_016050	ACG	2	6	239438	239443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273231
6005	NC_016050	ATT	2	6	239457	239462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273231
6006	NC_016050	CTTT	2	8	239472	239479	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6007	NC_016050	T	8	8	239492	239499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_016050	GCT	2	6	239667	239672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273232
6009	NC_016050	CTT	2	6	239697	239702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273232
6010	NC_016050	GAT	2	6	239718	239723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273232
6011	NC_016050	TA	3	6	239737	239742	50 %	50 %	0 %	0 %	350273232
6012	NC_016050	CAT	2	6	239743	239748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273232
6013	NC_016050	GAG	2	6	239823	239828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350273232
6014	NC_016050	TAA	2	6	239832	239837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273232
6015	NC_016050	ATA	2	6	239847	239852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273232
6016	NC_016050	T	6	6	239932	239937	0 %	100 %	0 %	0 %	350273232
6017	NC_016050	AAC	2	6	239995	240000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273232
6018	NC_016050	ACA	2	6	240005	240010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273232
6019	NC_016050	TA	3	6	240057	240062	50 %	50 %	0 %	0 %	350273232
6020	NC_016050	ATC	2	6	240067	240072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273232
6021	NC_016050	TTG	2	6	240120	240125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273232
6022	NC_016050	AAAG	2	8	240133	240140	75 %	0 %	25 %	0 %	350273232
6023	NC_016050	CTT	2	6	240180	240185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273232
6024	NC_016050	AGT	2	6	240235	240240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273232
6025	NC_016050	GCT	2	6	240248	240253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273232
6026	NC_016050	TTC	2	6	240325	240330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273232
6027	NC_016050	TTG	2	6	240375	240380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273232
6028	NC_016050	TAT	2	6	240429	240434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273232
6029	NC_016050	TAT	2	6	240486	240491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273232
6030	NC_016050	ATT	2	6	240550	240555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273232
6031	NC_016050	ATTT	2	8	240586	240593	25 %	75 %	0 %	0 %	350273232
6032	NC_016050	TTC	2	6	240601	240606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273232
6033	NC_016050	CAGT	2	8	240626	240633	25 %	25 %	25 %	25 %	350273232
6034	NC_016050	CTT	2	6	240738	240743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273232
6035	NC_016050	ATTT	2	8	240818	240825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_016050	CGA	2	6	240894	240899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_016050	TAC	2	6	240926	240931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_016050	ATG	2	6	240952	240957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_016050	ATT	2	6	240958	240963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016050	TGC	2	6	240993	240998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273233
6041	NC_016050	TAT	2	6	241022	241027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273233
6042	NC_016050	CT	3	6	241065	241070	0 %	50 %	0 %	50 %	350273233
6043	NC_016050	ATT	2	6	241089	241094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273233
6044	NC_016050	CTT	2	6	241103	241108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273233
6045	NC_016050	TA	3	6	241134	241139	50 %	50 %	0 %	0 %	350273233
6046	NC_016050	TTC	2	6	241164	241169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273233
6047	NC_016050	AAAT	2	8	241178	241185	75 %	25 %	0 %	0 %	350273233
6048	NC_016050	TAT	2	6	241196	241201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273233
6049	NC_016050	T	7	7	241203	241209	0 %	100 %	0 %	0 %	350273233
6050	NC_016050	T	8	8	241227	241234	0 %	100 %	0 %	0 %	350273233
6051	NC_016050	TAA	2	6	241259	241264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273233
6052	NC_016050	TTGT	2	8	241345	241352	0 %	75 %	25 %	0 %	350273233
6053	NC_016050	A	6	6	241384	241389	100 %	0 %	0 %	0 %	350273233
6054	NC_016050	GTA	2	6	241390	241395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273233
6055	NC_016050	TAA	2	6	241440	241445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273233
6056	NC_016050	ATC	2	6	241482	241487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273233
6057	NC_016050	GTA	2	6	241528	241533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273233
6058	NC_016050	ACAT	2	8	241543	241550	50 %	25 %	0 %	25 %	350273233
6059	NC_016050	ATT	2	6	241551	241556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273233
6060	NC_016050	GCC	2	6	241561	241566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273233
6061	NC_016050	GCT	2	6	241674	241679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273233
6062	NC_016050	AAT	2	6	241698	241703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273233
6063	NC_016050	T	6	6	241753	241758	0 %	100 %	0 %	0 %	350273233
6064	NC_016050	ATT	2	6	241854	241859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273233
6065	NC_016050	TA	3	6	241866	241871	50 %	50 %	0 %	0 %	350273233
6066	NC_016050	GTA	2	6	241873	241878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273233
6067	NC_016050	AAGC	3	12	241967	241978	50 %	0 %	25 %	25 %	350273233
6068	NC_016050	AGCT	2	8	241986	241993	25 %	25 %	25 %	25 %	350273233
6069	NC_016050	CAAT	2	8	242008	242015	50 %	25 %	0 %	25 %	350273233
6070	NC_016050	T	7	7	242129	242135	0 %	100 %	0 %	0 %	350273233
6071	NC_016050	GTACGA	2	12	242161	242172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	350273233
6072	NC_016050	CTT	2	6	242207	242212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273233
6073	NC_016050	TTC	2	6	242262	242267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273233
6074	NC_016050	ATT	2	6	242286	242291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273233
6075	NC_016050	GTTT	2	8	242345	242352	0 %	75 %	25 %	0 %	350273233
6076	NC_016050	TAA	2	6	242354	242359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273233
6077	NC_016050	CTA	2	6	242435	242440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273233
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6079	NC_016050	CTA	2	6	242569	242574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273233
6080	NC_016050	GCA	2	6	242587	242592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273233
6081	NC_016050	ATT	2	6	242613	242618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273233
6082	NC_016050	CCG	2	6	242638	242643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273233
6083	NC_016050	AGC	2	6	242652	242657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273233
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6085	NC_016050	TGC	2	6	242741	242746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273233
6086	NC_016050	TCA	2	6	242920	242925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273233
6087	NC_016050	CTA	2	6	242978	242983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273233
6088	NC_016050	TTAG	2	8	242986	242993	25 %	50 %	25 %	0 %	350273233
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6090	NC_016050	TGTA	2	8	243135	243142	25 %	50 %	25 %	0 %	350273233
6091	NC_016050	CTTCTA	2	12	243158	243169	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	350273233
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6093	NC_016050	AGA	2	6	243201	243206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273233
6094	NC_016050	TTA	2	6	243229	243234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273233
6095	NC_016050	TA	3	6	243233	243238	50 %	50 %	0 %	0 %	350273233
6096	NC_016050	T	7	7	243244	243250	0 %	100 %	0 %	0 %	350273233
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6103	NC_016050	TAT	3	9	243623	243631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273233
6104	NC_016050	A	6	6	243645	243650	100 %	0 %	0 %	0 %	350273233
6105	NC_016050	TA	3	6	243698	243703	50 %	50 %	0 %	0 %	350273233
6106	NC_016050	CAA	2	6	243710	243715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273233
6107	NC_016050	AAAT	2	8	243732	243739	75 %	25 %	0 %	0 %	350273233
6108	NC_016050	T	7	7	243746	243752	0 %	100 %	0 %	0 %	350273233
6109	NC_016050	TCT	2	6	243757	243762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273233
6110	NC_016050	ATT	2	6	243768	243773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_016050	GCGA	2	8	243810	243817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6112	NC_016050	TTC	2	6	243845	243850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_016050	TTA	2	6	243898	243903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_016050	TA	3	6	243931	243936	50 %	50 %	0 %	0 %	350273234
6115	NC_016050	T	6	6	243951	243956	0 %	100 %	0 %	0 %	350273234
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6118	NC_016050	ATT	2	6	244033	244038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273234
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6120	NC_016050	T	6	6	244099	244104	0 %	100 %	0 %	0 %	350273234
6121	NC_016050	TA	3	6	244389	244394	50 %	50 %	0 %	0 %	350273234
6122	NC_016050	TTC	2	6	244411	244416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273234
6123	NC_016050	CTAC	2	8	244478	244485	25 %	25 %	0 %	50 %	350273234
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6362	NC_016050	T	7	7	253366	253372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6363	NC_016050	T	6	6	253376	253381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6364	NC_016050	A	6	6	253384	253389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6365	NC_016050	TAA	2	6	253393	253398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6366	NC_016050	CAC	2	6	253425	253430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6367	NC_016050	GAT	4	12	253436	253447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6369	NC_016050	A	6	6	253466	253471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6371	NC_016050	ATG	2	6	253511	253516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6372	NC_016050	ATA	2	6	253550	253555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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