MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 32796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016050	CTG	2	6	219151	219156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273214
5502	NC_016050	A	6	6	219165	219170	100 %	0 %	0 %	0 %	350273214
5503	NC_016050	CTT	2	6	219214	219219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273214
5504	NC_016050	T	6	6	219305	219310	0 %	100 %	0 %	0 %	350273214
5505	NC_016050	CTC	2	6	219353	219358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350273214
5506	NC_016050	CAATA	2	10	219382	219391	60 %	20 %	0 %	20 %	350273214
5507	NC_016050	TAA	2	6	219433	219438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273214
5508	NC_016050	TAT	2	6	219443	219448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273214
5509	NC_016050	AG	3	6	219449	219454	50 %	0 %	50 %	0 %	350273214
5510	NC_016050	TAA	2	6	219477	219482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016050	ATT	2	6	219483	219488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_016050	TCG	2	6	219523	219528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_016050	A	8	8	219590	219597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_016050	T	6	6	219644	219649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_016050	AAATT	2	10	219711	219720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_016050	TTTCT	2	10	219726	219735	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5517	NC_016050	TAA	2	6	219755	219760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273215
5518	NC_016050	GCA	2	6	219780	219785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273215
5519	NC_016050	ACG	2	6	219820	219825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273215
5520	NC_016050	GAT	2	6	219831	219836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273215
5521	NC_016050	CTTT	2	8	219852	219859	0 %	75 %	0 %	25 %	350273215
5522	NC_016050	ATA	2	6	219868	219873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273215
5523	NC_016050	TAA	2	6	219962	219967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273215
5524	NC_016050	TAT	2	6	220066	220071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273215
5525	NC_016050	CTA	2	6	220078	220083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273215
5526	NC_016050	AGT	2	6	220094	220099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273215
5527	NC_016050	TAT	2	6	220240	220245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_016050	TTC	2	6	220311	220316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_016050	AAT	2	6	220350	220355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273216
5530	NC_016050	AAAT	2	8	220370	220377	75 %	25 %	0 %	0 %	350273216
5531	NC_016050	A	6	6	220398	220403	100 %	0 %	0 %	0 %	350273216
5532	NC_016050	TCT	2	6	220413	220418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273216
5533	NC_016050	ACT	2	6	220502	220507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273216
5534	NC_016050	TTG	2	6	220552	220557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273216
5535	NC_016050	AGC	2	6	220565	220570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273216
5536	NC_016050	TTA	2	6	220603	220608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273216
5537	NC_016050	ATA	2	6	220618	220623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273216
5538	NC_016050	ATA	2	6	220630	220635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273216
5539	NC_016050	AAT	2	6	220637	220642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273216
5540	NC_016050	T	6	6	220686	220691	0 %	100 %	0 %	0 %	350273216
5541	NC_016050	T	6	6	220701	220706	0 %	100 %	0 %	0 %	350273216
5542	NC_016050	GAA	2	6	220719	220724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273216
5543	NC_016050	ATT	2	6	220728	220733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273216
5544	NC_016050	ATT	2	6	220919	220924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273216
5545	NC_016050	TAAAG	2	10	220928	220937	60 %	20 %	20 %	0 %	350273216
5546	NC_016050	AAT	2	6	221023	221028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273216
5547	NC_016050	TAT	2	6	221067	221072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_016050	T	7	7	221081	221087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_016050	GAT	2	6	221110	221115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273217
5550	NC_016050	TGT	2	6	221132	221137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273217
5551	NC_016050	ATT	2	6	221177	221182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273217
5552	NC_016050	GTTTCA	2	12	221208	221219	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	350273217
5553	NC_016050	TA	3	6	221230	221235	50 %	50 %	0 %	0 %	350273217
5554	NC_016050	ATT	2	6	221237	221242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273217
5555	NC_016050	T	6	6	221241	221246	0 %	100 %	0 %	0 %	350273217
5556	NC_016050	TGC	2	6	221279	221284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273217
5557	NC_016050	ATC	2	6	221291	221296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273217
5558	NC_016050	TTC	2	6	221369	221374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273217
5559	NC_016050	TTTG	2	8	221419	221426	0 %	75 %	25 %	0 %	350273217
5560	NC_016050	ATG	2	6	221443	221448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273217
5561	NC_016050	TTC	2	6	221453	221458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273217
5562	NC_016050	T	7	7	221476	221482	0 %	100 %	0 %	0 %	350273217
5563	NC_016050	TTG	2	6	221497	221502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273217
5564	NC_016050	TTA	2	6	221517	221522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273217
5565	NC_016050	TAA	2	6	221530	221535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273217
5566	NC_016050	TA	3	6	221551	221556	50 %	50 %	0 %	0 %	350273217
5567	NC_016050	TAGC	2	8	221569	221576	25 %	25 %	25 %	25 %	350273217
5568	NC_016050	GTT	2	6	221589	221594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273217
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5570	NC_016050	T	7	7	221613	221619	0 %	100 %	0 %	0 %	350273217
5571	NC_016050	TTA	2	6	221673	221678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273217
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5574	NC_016050	GCC	2	6	221783	221788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273217
5575	NC_016050	ATT	2	6	221799	221804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273217
5576	NC_016050	AGTT	2	8	221828	221835	25 %	50 %	25 %	0 %	350273217
5577	NC_016050	TAG	2	6	221836	221841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273217
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5580	NC_016050	AT	4	8	221882	221889	50 %	50 %	0 %	0 %	350273217
5581	NC_016050	CTT	2	6	221920	221925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273217
5582	NC_016050	TTTA	2	8	221933	221940	25 %	75 %	0 %	0 %	350273217
5583	NC_016050	CAGT	2	8	221995	222002	25 %	25 %	25 %	25 %	350273217
5584	NC_016050	ATC	2	6	222068	222073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273217
5585	NC_016050	TA	3	6	222098	222103	50 %	50 %	0 %	0 %	350273217
5586	NC_016050	T	6	6	222189	222194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_016050	A	6	6	222197	222202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_016050	GTCAA	2	10	222204	222213	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5589	NC_016050	TTA	2	6	222224	222229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_016050	TAT	2	6	222233	222238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_016050	TGT	2	6	222268	222273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_016050	ATT	2	6	222333	222338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273218
5593	NC_016050	AGT	2	6	222358	222363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273218
5594	NC_016050	TTAC	2	8	222371	222378	25 %	50 %	0 %	25 %	350273218
5595	NC_016050	AAAAGC	2	12	222393	222404	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	350273218
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5598	NC_016050	T	8	8	222462	222469	0 %	100 %	0 %	0 %	350273218
5599	NC_016050	TAG	2	6	222474	222479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273218
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5602	NC_016050	ATA	2	6	222715	222720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273218
5603	NC_016050	TGG	2	6	222786	222791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350273218
5604	NC_016050	TAG	2	6	222800	222805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273218
5605	NC_016050	AAAT	2	8	222861	222868	75 %	25 %	0 %	0 %	350273218
5606	NC_016050	TTC	2	6	222887	222892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273218
5607	NC_016050	TAT	2	6	222906	222911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273218
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5609	NC_016050	AG	3	6	222983	222988	50 %	0 %	50 %	0 %	350273218
5610	NC_016050	AAGT	2	8	223035	223042	50 %	25 %	25 %	0 %	350273218
5611	NC_016050	AGT	2	6	223077	223082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273218
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5620	NC_016050	TAA	2	6	223333	223338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273219
5621	NC_016050	T	6	6	223372	223377	0 %	100 %	0 %	0 %	350273219
5622	NC_016050	AT	3	6	223541	223546	50 %	50 %	0 %	0 %	350273219
5623	NC_016050	CAT	2	6	223549	223554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273219
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5625	NC_016050	AAT	2	6	223649	223654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273219
5626	NC_016050	GT	3	6	223749	223754	0 %	50 %	50 %	0 %	350273219
5627	NC_016050	AAGGC	2	10	223757	223766	40 %	0 %	40 %	20 %	350273219
5628	NC_016050	TGC	2	6	223793	223798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273220
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5631	NC_016050	AT	3	6	223875	223880	50 %	50 %	0 %	0 %	350273220
5632	NC_016050	CT	3	6	223999	224004	0 %	50 %	0 %	50 %	350273220
5633	NC_016050	TAT	2	6	224028	224033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273220
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5635	NC_016050	AT	3	6	224058	224063	50 %	50 %	0 %	0 %	350273221
5636	NC_016050	ATG	2	6	224171	224176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273221
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5664	NC_016050	TTG	2	6	225152	225157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5665	NC_016050	TAT	2	6	225225	225230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5735	NC_016050	AT	3	6	228217	228222	50 %	50 %	0 %	0 %	350273223
5736	NC_016050	A	8	8	228306	228313	100 %	0 %	0 %	0 %	350273223
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5738	NC_016050	ATT	2	6	228448	228453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5739	NC_016050	TA	3	6	228484	228489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5740	NC_016050	TA	3	6	228529	228534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5741	NC_016050	T	6	6	228538	228543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5742	NC_016050	A	6	6	228547	228552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5743	NC_016050	T	6	6	228560	228565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5744	NC_016050	TAC	2	6	228594	228599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5745	NC_016050	TAATA	2	10	228673	228682	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5746	NC_016050	TA	3	6	228686	228691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5747	NC_016050	A	6	6	228756	228761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5748	NC_016050	TAT	2	6	228774	228779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273224
5749	NC_016050	TA	3	6	228789	228794	50 %	50 %	0 %	0 %	350273224
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5751	NC_016050	TAT	2	6	228849	228854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273224
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