MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Roseburia hominis A2-183 chromosome

Total Repeats: 2483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015977	ATGAA	2	10	884	893	60 %	20 %	20 %	0 %	347530299
2	NC_015977	GACGA	2	10	1300	1309	40 %	0 %	40 %	20 %	347530299
3	NC_015977	CAAAT	2	10	1704	1713	60 %	20 %	0 %	20 %	347530300
4	NC_015977	GGATC	2	10	3460	3469	20 %	20 %	40 %	20 %	347530302
5	NC_015977	AGCGC	2	10	3505	3514	20 %	0 %	40 %	40 %	347530302
6	NC_015977	ACCGG	2	10	6856	6865	20 %	0 %	40 %	40 %	347530304
7	NC_015977	TCCAT	2	10	10096	10105	20 %	40 %	0 %	40 %	347530306
8	NC_015977	AAGAC	2	10	12241	12250	60 %	0 %	20 %	20 %	347530308
9	NC_015977	AAATG	2	10	14835	14844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015977	GGTGT	2	10	15663	15672	0 %	40 %	60 %	0 %	347530313
11	NC_015977	ATCGT	2	10	15989	15998	20 %	40 %	20 %	20 %	347530313
12	NC_015977	CTGTG	2	10	20785	20794	0 %	40 %	40 %	20 %	347530318
13	NC_015977	AAATG	2	10	21219	21228	60 %	20 %	20 %	0 %	347530319
14	NC_015977	AATAT	2	10	21659	21668	60 %	40 %	0 %	0 %	347530319
15	NC_015977	GATTG	2	10	22547	22556	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015977	GTTCG	2	10	24608	24617	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015977	AAAAT	2	10	24887	24896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015977	ATGTA	2	10	26461	26470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015977	TCGTG	2	10	26519	26528	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015977	AGCGG	2	10	27134	27143	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015977	ACCAA	2	10	27570	27579	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015977	GAAAG	2	10	28042	28051	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015977	GGGAG	2	10	28187	28196	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015977	CCGTA	2	10	29286	29295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015977	AGAGG	2	10	29512	29521	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015977	TTATG	2	10	31122	31131	20 %	60 %	20 %	0 %	347530323
27	NC_015977	GTCAG	2	10	31187	31196	20 %	20 %	40 %	20 %	347530323
28	NC_015977	CGGAG	2	10	31356	31365	20 %	0 %	60 %	20 %	347530323
29	NC_015977	GCTGG	2	10	31413	31422	0 %	20 %	60 %	20 %	347530323
30	NC_015977	CGGAG	2	10	32187	32196	20 %	0 %	60 %	20 %	347530323
31	NC_015977	GCTGC	2	10	32218	32227	0 %	20 %	40 %	40 %	347530323
32	NC_015977	GAACT	2	10	33901	33910	40 %	20 %	20 %	20 %	347530324
33	NC_015977	ATTCC	2	10	34579	34588	20 %	40 %	0 %	40 %	347530325
34	NC_015977	TGATG	2	10	34821	34830	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015977	GGGGA	2	10	35175	35184	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015977	AATCA	2	10	37332	37341	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015977	GGAAA	2	10	37450	37459	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015977	ATTCC	2	10	38195	38204	20 %	40 %	0 %	40 %	347530328
39	NC_015977	TTTCC	2	10	49820	49829	0 %	60 %	0 %	40 %	347530337
40	NC_015977	GGCAG	2	10	51431	51440	20 %	0 %	60 %	20 %	347530339
41	NC_015977	ACCGG	2	10	51625	51634	20 %	0 %	40 %	40 %	347530339
42	NC_015977	CGAAT	2	10	53840	53849	40 %	20 %	20 %	20 %	347530340
43	NC_015977	TACAA	2	10	56078	56087	60 %	20 %	0 %	20 %	347530342
44	NC_015977	AGAAA	2	10	56523	56532	80 %	0 %	20 %	0 %	347530343
45	NC_015977	ACGGT	2	10	56585	56594	20 %	20 %	40 %	20 %	347530343
46	NC_015977	ATCTC	2	10	59656	59665	20 %	40 %	0 %	40 %	347530345
47	NC_015977	GAATG	2	10	59816	59825	40 %	20 %	40 %	0 %	347530345
48	NC_015977	GATAA	2	10	60219	60228	60 %	20 %	20 %	0 %	347530345
49	NC_015977	AAAGC	2	10	61970	61979	60 %	0 %	20 %	20 %	347530348
50	NC_015977	TTTAT	2	10	63119	63128	20 %	80 %	0 %	0 %	347530350
51	NC_015977	TAATA	2	10	63563	63572	60 %	40 %	0 %	0 %	347530350
52	NC_015977	AAAGC	2	10	63690	63699	60 %	0 %	20 %	20 %	347530350
53	NC_015977	TTGAA	2	10	64401	64410	40 %	40 %	20 %	0 %	347530351
54	NC_015977	CATAT	2	10	64452	64461	40 %	40 %	0 %	20 %	347530351
55	NC_015977	GGTGT	2	10	65827	65836	0 %	40 %	60 %	0 %	347530353
56	NC_015977	ATGGT	2	10	68269	68278	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015977	AGAAA	2	10	68586	68595	80 %	0 %	20 %	0 %	347530356
58	NC_015977	TAAGA	2	10	68888	68897	60 %	20 %	20 %	0 %	347530357
59	NC_015977	GCAGA	2	10	70612	70621	40 %	0 %	40 %	20 %	347530358
60	NC_015977	CGCTC	2	10	71541	71550	0 %	20 %	20 %	60 %	347530359
61	NC_015977	AGGAA	2	10	74945	74954	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015977	TTTCA	2	10	76105	76114	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015977	GGCAC	2	10	79882	79891	20 %	0 %	40 %	40 %	347530363
64	NC_015977	GAAAA	2	10	81064	81073	80 %	0 %	20 %	0 %	347530364
65	NC_015977	TCTGC	2	10	82046	82055	0 %	40 %	20 %	40 %	347530365
66	NC_015977	GCATT	2	10	82060	82069	20 %	40 %	20 %	20 %	347530365
67	NC_015977	ATCCG	2	10	83876	83885	20 %	20 %	20 %	40 %	347530366
68	NC_015977	TGACC	2	10	84787	84796	20 %	20 %	20 %	40 %	347530367
69	NC_015977	AAAAC	2	10	87521	87530	80 %	0 %	0 %	20 %	347530370
70	NC_015977	CTGAC	2	10	87649	87658	20 %	20 %	20 %	40 %	347530370
71	NC_015977	GTAAA	2	10	88222	88231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015977	ATAGC	2	10	89287	89296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015977	AAGCG	2	10	90215	90224	40 %	0 %	40 %	20 %	347530372
74	NC_015977	ATTAC	2	10	91870	91879	40 %	40 %	0 %	20 %	347530374
75	NC_015977	AGCGC	2	10	92248	92257	20 %	0 %	40 %	40 %	347530375
76	NC_015977	TGTCC	2	10	95075	95084	0 %	40 %	20 %	40 %	347530377
77	NC_015977	CAAAG	2	10	97368	97377	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015977	CATGA	2	10	98023	98032	40 %	20 %	20 %	20 %	347530379
79	NC_015977	TGCAG	2	10	98276	98285	20 %	20 %	40 %	20 %	347530379
80	NC_015977	AAAAG	2	10	100180	100189	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015977	AGGAA	2	10	100314	100323	60 %	0 %	40 %	0 %	347530381
82	NC_015977	GGCAG	2	10	104942	104951	20 %	0 %	60 %	20 %	347530384
83	NC_015977	TCTGG	2	10	104986	104995	0 %	40 %	40 %	20 %	347530384
84	NC_015977	GTGCG	2	10	105894	105903	0 %	20 %	60 %	20 %	347530385
85	NC_015977	TGGAG	2	10	106917	106926	20 %	20 %	60 %	0 %	347530386
86	NC_015977	GCAGC	2	10	107176	107185	20 %	0 %	40 %	40 %	347530386
87	NC_015977	GAAAA	2	10	107550	107559	80 %	0 %	20 %	0 %	347530387
88	NC_015977	TACTG	2	10	109541	109550	20 %	40 %	20 %	20 %	347530389
89	NC_015977	GAAAG	2	10	109779	109788	60 %	0 %	40 %	0 %	347530389
90	NC_015977	GCAGA	2	10	113700	113709	40 %	0 %	40 %	20 %	347530392
91	NC_015977	TGAAG	2	10	116051	116060	40 %	20 %	40 %	0 %	347530394
92	NC_015977	AACGG	2	10	121570	121579	40 %	0 %	40 %	20 %	347530398
93	NC_015977	GCAGC	2	10	122825	122834	20 %	0 %	40 %	40 %	347530400
94	NC_015977	ATGAG	2	10	124211	124220	40 %	20 %	40 %	0 %	347530402
95	NC_015977	AAGTA	2	10	131608	131617	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015977	CGGAC	2	10	132849	132858	20 %	0 %	40 %	40 %	347530409
97	NC_015977	TGGGA	2	10	135445	135454	20 %	20 %	60 %	0 %	347530411
98	NC_015977	TTTTC	2	10	136413	136422	0 %	80 %	0 %	20 %	347530413
99	NC_015977	TGATG	2	10	136730	136739	20 %	40 %	40 %	0 %	347530413
100	NC_015977	GGAAG	2	10	137123	137132	40 %	0 %	60 %	0 %	347530414
101	NC_015977	CGGTG	2	10	137775	137784	0 %	20 %	60 %	20 %	347530415
102	NC_015977	GTTTT	2	10	138943	138952	0 %	80 %	20 %	0 %	347530415
103	NC_015977	GTGAT	2	10	142641	142650	20 %	40 %	40 %	0 %	347530420
104	NC_015977	GGCAA	2	10	147037	147046	40 %	0 %	40 %	20 %	347530422
105	NC_015977	AGCGG	2	10	148549	148558	20 %	0 %	60 %	20 %	347530425
106	NC_015977	ACGGT	2	10	150145	150154	20 %	20 %	40 %	20 %	347530426
107	NC_015977	TAAAG	2	10	151049	151058	60 %	20 %	20 %	0 %	347530426
108	NC_015977	AAAGC	2	10	152384	152393	60 %	0 %	20 %	20 %	347530428
109	NC_015977	GATAA	2	10	152441	152450	60 %	20 %	20 %	0 %	347530428
110	NC_015977	ACAGA	2	10	153518	153527	60 %	0 %	20 %	20 %	347530429
111	NC_015977	AGCGG	2	10	156783	156792	20 %	0 %	60 %	20 %	347530432
112	NC_015977	AAAAT	2	10	157683	157692	80 %	20 %	0 %	0 %	347530432
113	NC_015977	GCGGA	2	10	157966	157975	20 %	0 %	60 %	20 %	347530433
114	NC_015977	GGCAT	2	10	158249	158258	20 %	20 %	40 %	20 %	347530433
115	NC_015977	ATTTT	2	10	159175	159184	20 %	80 %	0 %	0 %	347530434
116	NC_015977	GTACC	2	10	159428	159437	20 %	20 %	20 %	40 %	347530434
117	NC_015977	GGATG	2	10	159761	159770	20 %	20 %	60 %	0 %	347530434
118	NC_015977	TCAAA	2	10	160033	160042	60 %	20 %	0 %	20 %	347530434
119	NC_015977	CGGAT	2	10	162509	162518	20 %	20 %	40 %	20 %	347530437
120	NC_015977	CGCAG	2	10	164004	164013	20 %	0 %	40 %	40 %	347530439
121	NC_015977	ATCTG	2	10	169195	169204	20 %	40 %	20 %	20 %	347530442
122	NC_015977	ACGGA	2	10	169296	169305	40 %	0 %	40 %	20 %	347530442
123	NC_015977	ATGAT	2	10	169381	169390	40 %	40 %	20 %	0 %	347530442
124	NC_015977	GCGGA	2	10	169824	169833	20 %	0 %	60 %	20 %	347530443
125	NC_015977	TGCAT	2	10	170737	170746	20 %	40 %	20 %	20 %	347530443
126	NC_015977	TAAGA	2	10	171882	171891	60 %	20 %	20 %	0 %	347530444
127	NC_015977	CCATA	2	10	172506	172515	40 %	20 %	0 %	40 %	347530445
128	NC_015977	GATGA	2	10	172523	172532	40 %	20 %	40 %	0 %	347530445
129	NC_015977	ATAAA	2	10	173201	173210	80 %	20 %	0 %	0 %	347530446
130	NC_015977	GCAAT	2	10	174517	174526	40 %	20 %	20 %	20 %	347530448
131	NC_015977	GCGAT	2	10	175390	175399	20 %	20 %	40 %	20 %	347530449
132	NC_015977	CGCAG	2	10	176125	176134	20 %	0 %	40 %	40 %	347530450
133	NC_015977	ATGTG	2	10	179096	179105	20 %	40 %	40 %	0 %	347530452
134	NC_015977	GAAAA	2	10	179942	179951	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015977	GCAGG	2	10	182587	182596	20 %	0 %	60 %	20 %	347530455
136	NC_015977	CATGC	2	10	183477	183486	20 %	20 %	20 %	40 %	347530456
137	NC_015977	GCTCG	2	10	183760	183769	0 %	20 %	40 %	40 %	347530456
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142	NC_015977	CGAAT	2	10	193402	193411	40 %	20 %	20 %	20 %	347530463
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402	NC_015977	AAGTG	2	10	570859	570868	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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