MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 2260

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< Previous 1 2 3 45Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015970	CCT	2	6	93256	93261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301873
2002	NC_015970	CCA	2	6	93262	93267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301873
2003	NC_015970	TTTC	2	8	93298	93305	0 %	75 %	0 %	25 %	345301873
2004	NC_015970	TGT	3	9	93318	93326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_015970	TAC	2	6	93422	93427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_015970	TAC	2	6	93494	93499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_015970	GACAGC	2	12	93548	93559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301874
2008	NC_015970	CGC	2	6	93623	93628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301874
2009	NC_015970	TCA	2	6	93633	93638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301874
2010	NC_015970	CCT	2	6	93725	93730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301874
2011	NC_015970	GCT	2	6	93731	93736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301874
2012	NC_015970	GAAA	2	8	93739	93746	75 %	0 %	25 %	0 %	345301874
2013	NC_015970	CCTT	2	8	93832	93839	0 %	50 %	0 %	50 %	345301874
2014	NC_015970	GAA	2	6	93923	93928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301874
2015	NC_015970	GTT	2	6	93995	94000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301874
2016	NC_015970	GCT	2	6	94009	94014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301874
2017	NC_015970	GC	3	6	94024	94029	0 %	0 %	50 %	50 %	345301874
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2023	NC_015970	CGG	2	6	94494	94499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301874
2024	NC_015970	TCA	2	6	94516	94521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301874
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2047	NC_015970	A	6	6	95753	95758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2109	NC_015970	CCCAT	2	10	98963	98972	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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2114	NC_015970	GGC	2	6	99170	99175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2118	NC_015970	TGCTT	2	10	99318	99327	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2119	NC_015970	TCC	2	6	99351	99356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2121	NC_015970	GTT	2	6	99451	99456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_015970	GACCA	2	10	99468	99477	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2123	NC_015970	ACGC	2	8	99491	99498	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2124	NC_015970	GGCG	2	8	99544	99551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2125	NC_015970	ATGG	2	8	99751	99758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_015970	GAG	2	6	99764	99769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2127	NC_015970	AGTA	2	8	99777	99784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_015970	GGT	2	6	99789	99794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_015970	GCA	2	6	99884	99889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_015970	GTC	2	6	99912	99917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_015970	TTG	2	6	99967	99972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_015970	GAA	2	6	99975	99980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_015970	GGCCA	2	10	100094	100103	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2134	NC_015970	CGTTG	2	10	100146	100155	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2135	NC_015970	TCC	2	6	100177	100182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2136	NC_015970	GGA	2	6	100190	100195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_015970	CTTG	2	8	100214	100221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2138	NC_015970	CTT	2	6	100357	100362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2139	NC_015970	CCT	2	6	100363	100368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2140	NC_015970	GAT	2	6	100487	100492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2141	NC_015970	GGA	2	6	100502	100507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2142	NC_015970	ATA	2	6	100558	100563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2143	NC_015970	CTTC	2	8	100656	100663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2144	NC_015970	CCTTC	2	10	100675	100684	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2145	NC_015970	CGA	2	6	100765	100770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2146	NC_015970	T	7	7	100772	100778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_015970	CAT	2	6	100825	100830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301880
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2150	NC_015970	CAC	2	6	100918	100923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301880
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2152	NC_015970	TTC	2	6	100943	100948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301880
2153	NC_015970	GGC	2	6	100949	100954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301880
2154	NC_015970	CAT	2	6	100982	100987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301880
2155	NC_015970	ACT	2	6	101085	101090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301880
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2164	NC_015970	GCT	2	6	101440	101445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301880
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2174	NC_015970	CCG	2	6	101894	101899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301881
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2177	NC_015970	CTC	2	6	101973	101978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2180	NC_015970	GAG	2	6	102008	102013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2182	NC_015970	CT	3	6	102143	102148	0 %	50 %	0 %	50 %	345301882
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2193	NC_015970	AGC	2	6	102738	102743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2195	NC_015970	TGGG	2	8	102795	102802	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2196	NC_015970	CCCAT	2	10	102889	102898	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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2254	NC_015970	CTC	2	6	104952	104957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301884
2255	NC_015970	CAG	2	6	104964	104969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301884
2256	NC_015970	CTG	2	6	105024	105029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301884
2257	NC_015970	CCAG	2	8	105086	105093	25 %	0 %	25 %	50 %	345301884
2258	NC_015970	GCA	3	9	105128	105136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301884
2259	NC_015970	CGG	2	6	105295	105300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301885
2260	NC_015970	CCCT	2	8	105320	105327	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding

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