MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 2260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015970	AGA	2	6	69663	69668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015970	T	6	6	69684	69689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015970	CG	3	6	69754	69759	0 %	0 %	50 %	50 %	345301856
1504	NC_015970	CTC	2	6	69764	69769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301856
1505	NC_015970	CTG	2	6	69797	69802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301856
1506	NC_015970	GCG	2	6	69845	69850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301856
1507	NC_015970	GCG	2	6	69891	69896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301856
1508	NC_015970	TGT	2	6	69900	69905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301856
1509	NC_015970	GGC	2	6	69911	69916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301856
1510	NC_015970	CGA	2	6	69948	69953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301856
1511	NC_015970	AGC	2	6	70062	70067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301856
1512	NC_015970	ACA	2	6	70119	70124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301856
1513	NC_015970	GCA	2	6	70156	70161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301856
1514	NC_015970	GCA	2	6	70219	70224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301856
1515	NC_015970	CAG	2	6	70271	70276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301856
1516	NC_015970	CTT	2	6	70318	70323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301856
1517	NC_015970	CCG	2	6	70338	70343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301856
1518	NC_015970	TCC	2	6	70389	70394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301856
1519	NC_015970	GCCC	2	8	70402	70409	0 %	0 %	25 %	75 %	345301856
1520	NC_015970	AC	3	6	70420	70425	50 %	0 %	0 %	50 %	345301856
1521	NC_015970	CCG	2	6	70457	70462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301856
1522	NC_015970	GCT	2	6	70564	70569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301856
1523	NC_015970	CCCTG	2	10	70625	70634	0 %	20 %	20 %	60 %	345301857
1524	NC_015970	A	6	6	70680	70685	100 %	0 %	0 %	0 %	345301857
1525	NC_015970	GCA	2	6	70715	70720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301857
1526	NC_015970	AGC	2	6	70804	70809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301857
1527	NC_015970	CCAG	2	8	70856	70863	25 %	0 %	25 %	50 %	345301857
1528	NC_015970	ACG	2	6	71026	71031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1529	NC_015970	CCG	2	6	71059	71064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301858
1530	NC_015970	CTC	2	6	71070	71075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301858
1531	NC_015970	GTC	2	6	71093	71098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1532	NC_015970	GC	3	6	71138	71143	0 %	0 %	50 %	50 %	345301858
1533	NC_015970	GC	3	6	71231	71236	0 %	0 %	50 %	50 %	345301858
1534	NC_015970	CAG	3	9	71256	71264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1535	NC_015970	GCA	2	6	71366	71371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1536	NC_015970	GC	3	6	71488	71493	0 %	0 %	50 %	50 %	345301858
1537	NC_015970	TCG	2	6	71512	71517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1538	NC_015970	GCG	2	6	71523	71528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301858
1539	NC_015970	GGCC	2	8	71534	71541	0 %	0 %	50 %	50 %	345301858
1540	NC_015970	GCC	2	6	71653	71658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301858
1541	NC_015970	GATA	2	8	71686	71693	50 %	25 %	25 %	0 %	345301858
1542	NC_015970	AGC	2	6	71716	71721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1543	NC_015970	CAC	2	6	71763	71768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301858
1544	NC_015970	CCA	2	6	71774	71779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301858
1545	NC_015970	GGGC	2	8	71783	71790	0 %	0 %	75 %	25 %	345301858
1546	NC_015970	GCA	2	6	71795	71800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1547	NC_015970	GCC	2	6	71807	71812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301858
1548	NC_015970	GAC	2	6	71832	71837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1549	NC_015970	GCG	2	6	71853	71858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301858
1550	NC_015970	TGCC	2	8	71895	71902	0 %	25 %	25 %	50 %	345301858
1551	NC_015970	CGG	2	6	71907	71912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301858
1552	NC_015970	A	6	6	71947	71952	100 %	0 %	0 %	0 %	345301858
1553	NC_015970	GGC	3	9	72004	72012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301858
1554	NC_015970	ATGA	2	8	72024	72031	50 %	25 %	25 %	0 %	345301858
1555	NC_015970	GCC	2	6	72064	72069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301858
1556	NC_015970	TCG	2	6	72079	72084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1557	NC_015970	TGT	2	6	72108	72113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301858
1558	NC_015970	CCA	2	6	72161	72166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301858
1559	NC_015970	GCC	2	6	72178	72183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301858
1560	NC_015970	TCG	2	6	72214	72219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1561	NC_015970	CACCG	2	10	72277	72286	20 %	0 %	20 %	60 %	345301858
1562	NC_015970	GCCA	2	8	72307	72314	25 %	0 %	25 %	50 %	345301858
1563	NC_015970	GTA	2	6	72369	72374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301858
1564	NC_015970	CGC	2	6	72379	72384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301858
1565	NC_015970	CAG	2	6	72421	72426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1566	NC_015970	CGT	2	6	72446	72451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301858
1567	NC_015970	AAG	2	6	72576	72581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015970	T	6	6	72585	72590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015970	CTT	2	6	72614	72619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_015970	GCGG	2	8	72796	72803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_015970	GT	3	6	72930	72935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_015970	CGT	2	6	72961	72966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_015970	TTC	2	6	73007	73012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_015970	CCAGT	2	10	73038	73047	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1575	NC_015970	CGT	2	6	73125	73130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_015970	GC	3	6	73304	73309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_015970	A	6	6	73320	73325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_015970	C	6	6	73372	73377	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1579	NC_015970	AGGGG	2	10	73429	73438	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_015970	GTTG	2	8	73852	73859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015970	ATGA	2	8	73864	73871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015970	CTT	2	6	73896	73901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301860
1586	NC_015970	TTC	2	6	73943	73948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301860
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1589	NC_015970	TGC	2	6	74052	74057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301860
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1591	NC_015970	CGGG	2	8	74223	74230	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_015970	TGG	2	6	74236	74241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015970	GGT	2	6	74244	74249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015970	GTT	2	6	74305	74310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015970	TTCG	2	8	74311	74318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_015970	GGT	2	6	74354	74359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015970	AGC	2	6	74431	74436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_015970	GGC	2	6	74440	74445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_015970	CGG	2	6	74506	74511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301861
1600	NC_015970	CCA	2	6	74544	74549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301861
1601	NC_015970	TGC	2	6	74651	74656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301861
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1604	NC_015970	GCCG	2	8	74725	74732	0 %	0 %	50 %	50 %	345301861
1605	NC_015970	CTC	2	6	74746	74751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301861
1606	NC_015970	ATC	2	6	74762	74767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301861
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1613	NC_015970	TCC	2	6	75030	75035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301862
1614	NC_015970	GTC	2	6	75074	75079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301862
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1617	NC_015970	GGA	2	6	75263	75268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1619	NC_015970	CAGA	2	8	75312	75319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_015970	CGAA	2	8	75346	75353	50 %	0 %	25 %	25 %	345301863
1621	NC_015970	CAG	2	6	75354	75359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301863
1622	NC_015970	CTGG	2	8	75383	75390	0 %	25 %	50 %	25 %	345301863
1623	NC_015970	ACG	2	6	75397	75402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301863
1624	NC_015970	C	6	6	75405	75410	0 %	0 %	0 %	100 %	345301863
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1626	NC_015970	GC	3	6	75521	75526	0 %	0 %	50 %	50 %	345301863
1627	NC_015970	TCG	2	6	75607	75612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301863
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1999	NC_015970	GGCT	2	8	93229	93236	0 %	25 %	50 %	25 %	345301873
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