MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 2260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015970	GC	3	6	46885	46890	0 %	0 %	50 %	50 %	345301838
1002	NC_015970	ACTGAT	2	12	46922	46933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345301838
1003	NC_015970	AAGTTA	2	12	46960	46971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	345301838
1004	NC_015970	CGG	2	6	47018	47023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301838
1005	NC_015970	CG	3	6	47079	47084	0 %	0 %	50 %	50 %	345301838
1006	NC_015970	GCT	2	6	47085	47090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301838
1007	NC_015970	GC	3	6	47094	47099	0 %	0 %	50 %	50 %	345301838
1008	NC_015970	GTT	2	6	47172	47177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301838
1009	NC_015970	AGC	2	6	47197	47202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301838
1010	NC_015970	CTG	2	6	47205	47210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301838
1011	NC_015970	ATC	2	6	47268	47273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301838
1012	NC_015970	CCA	2	6	47369	47374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301838
1013	NC_015970	CTT	2	6	47395	47400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301838
1014	NC_015970	CGC	2	6	47444	47449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301838
1015	NC_015970	TCCA	2	8	47488	47495	25 %	25 %	0 %	50 %	345301838
1016	NC_015970	GCC	3	9	47556	47564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301838
1017	NC_015970	AGT	2	6	47567	47572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301838
1018	NC_015970	CCA	2	6	47588	47593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301838
1019	NC_015970	CCAT	2	8	47602	47609	25 %	25 %	0 %	50 %	345301838
1020	NC_015970	CG	4	8	47630	47637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_015970	GCT	2	6	47676	47681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_015970	GTGA	2	8	47794	47801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015970	ATTA	2	8	47815	47822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015970	ATC	2	6	47890	47895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015970	GCG	2	6	47998	48003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015970	CTG	2	6	48007	48012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015970	TCG	2	6	48033	48038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_015970	GATT	2	8	48107	48114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015970	TTCC	2	8	48125	48132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_015970	AGG	2	6	48140	48145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015970	CCG	2	6	48265	48270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_015970	CAG	2	6	48305	48310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_015970	GCC	2	6	48353	48358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_015970	A	6	6	48364	48369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015970	GCC	2	6	48400	48405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_015970	GTC	2	6	48460	48465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_015970	CAC	2	6	48560	48565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_015970	CGG	2	6	48566	48571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_015970	CGG	2	6	48583	48588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_015970	ACGC	2	8	48607	48614	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_015970	CCT	2	6	48619	48624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_015970	CCCA	2	8	48632	48639	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1043	NC_015970	GCCTC	2	10	48691	48700	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1044	NC_015970	GCGTG	2	10	48706	48715	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1045	NC_015970	TGCT	2	8	48774	48781	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_015970	CG	3	6	48812	48817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_015970	GCA	2	6	48838	48843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015970	GCC	2	6	48870	48875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_015970	ACCC	2	8	48878	48885	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1050	NC_015970	A	6	6	48978	48983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015970	TTC	2	6	48989	48994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015970	CAG	2	6	49106	49111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015970	TGC	2	6	49281	49286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_015970	GAAG	2	8	49317	49324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015970	GCC	2	6	49332	49337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_015970	GC	3	6	49385	49390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_015970	TGG	2	6	49514	49519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015970	CCGAC	2	10	49582	49591	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1059	NC_015970	CCGT	2	8	49593	49600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_015970	CAG	2	6	49608	49613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015970	CCGA	2	8	49665	49672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_015970	ATG	2	6	49685	49690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015970	TAT	2	6	49702	49707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015970	GAG	2	6	49754	49759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015970	TGT	2	6	49801	49806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015970	TGCG	2	8	49818	49825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_015970	CGA	3	9	49829	49837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_015970	CCG	2	6	49839	49844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_015970	AGC	2	6	49896	49901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_015970	AT	3	6	49933	49938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015970	CCTT	2	8	49994	50001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_015970	CTGC	3	12	50103	50114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_015970	AGC	2	6	50166	50171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_015970	GCT	2	6	50180	50185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015970	CCGC	2	8	50223	50230	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1076	NC_015970	CGT	2	6	50241	50246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015970	CGGA	2	8	50351	50358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_015970	GCTG	2	8	50373	50380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_015970	CGG	2	6	50437	50442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_015970	GTC	2	6	50465	50470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_015970	GTT	2	6	50734	50739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015970	T	6	6	50861	50866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015970	A	6	6	50882	50887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015970	CT	3	6	50942	50947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_015970	TAT	2	6	50952	50957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015970	TGG	2	6	51023	51028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301839
1087	NC_015970	T	6	6	51039	51044	0 %	100 %	0 %	0 %	345301839
1088	NC_015970	TGGC	2	8	51097	51104	0 %	25 %	50 %	25 %	345301839
1089	NC_015970	CCA	2	6	51179	51184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301839
1090	NC_015970	ATA	2	6	51193	51198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345301839
1091	NC_015970	CCAC	2	8	51224	51231	25 %	0 %	0 %	75 %	345301839
1092	NC_015970	CGG	2	6	51248	51253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301839
1093	NC_015970	CCT	2	6	51254	51259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301839
1094	NC_015970	GTA	2	6	51265	51270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301839
1095	NC_015970	GCC	2	6	51271	51276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301839
1096	NC_015970	CCCAT	2	10	51311	51320	20 %	20 %	0 %	60 %	345301839
1097	NC_015970	CCA	2	6	51329	51334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301839
1098	NC_015970	GCA	2	6	51383	51388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301839
1099	NC_015970	GCA	2	6	51422	51427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301839
1100	NC_015970	GCA	2	6	51487	51492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301839
1101	NC_015970	ATC	2	6	51522	51527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301839
1102	NC_015970	TCA	2	6	51535	51540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301839
1103	NC_015970	CTG	2	6	51564	51569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301839
1104	NC_015970	CAC	2	6	51598	51603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301839
1105	NC_015970	TGCG	2	8	51638	51645	0 %	25 %	50 %	25 %	345301839
1106	NC_015970	CTC	2	6	51681	51686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301839
1107	NC_015970	GCG	2	6	51697	51702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301839
1108	NC_015970	CCT	2	6	51704	51709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301839
1109	NC_015970	AT	3	6	51758	51763	50 %	50 %	0 %	0 %	345301839
1110	NC_015970	A	6	6	51814	51819	100 %	0 %	0 %	0 %	345301839
1111	NC_015970	TCG	2	6	51943	51948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301839
1112	NC_015970	GCT	2	6	51957	51962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301839
1113	NC_015970	CAG	2	6	51987	51992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301839
1114	NC_015970	CCTTT	2	10	52019	52028	0 %	60 %	0 %	40 %	345301839
1115	NC_015970	T	7	7	52026	52032	0 %	100 %	0 %	0 %	345301839
1116	NC_015970	AGA	2	6	52046	52051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301839
1117	NC_015970	TCC	2	6	52054	52059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301839
1118	NC_015970	A	7	7	52073	52079	100 %	0 %	0 %	0 %	345301839
1119	NC_015970	CT	3	6	52086	52091	0 %	50 %	0 %	50 %	345301839
1120	NC_015970	TCT	2	6	52157	52162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301839
1121	NC_015970	CCA	2	6	52172	52177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301839
1122	NC_015970	GCAG	2	8	52190	52197	25 %	0 %	50 %	25 %	345301839
1123	NC_015970	GCT	2	6	52259	52264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301839
1124	NC_015970	GCT	2	6	52328	52333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301839
1125	NC_015970	GTC	2	6	52358	52363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301839
1126	NC_015970	CGC	2	6	52370	52375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301839
1127	NC_015970	GCG	2	6	52401	52406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301839
1128	NC_015970	TGT	2	6	52424	52429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301839
1129	NC_015970	CCT	2	6	52490	52495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301839
1130	NC_015970	CAG	2	6	52509	52514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301839
1131	NC_015970	ATGA	2	8	52560	52567	50 %	25 %	25 %	0 %	345301839
1132	NC_015970	CTGT	2	8	52650	52657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_015970	CAG	2	6	52758	52763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301840
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1249	NC_015970	GC	3	6	57853	57858	0 %	0 %	50 %	50 %	345301844
1250	NC_015970	CCGTA	2	10	57903	57912	20 %	20 %	20 %	40 %	345301844
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1258	NC_015970	GAC	2	6	58172	58177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1386	NC_015970	CAT	2	6	64013	64018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301849
1387	NC_015970	GGC	2	6	64109	64114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301849
1388	NC_015970	CCA	2	6	64115	64120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301849
1389	NC_015970	GCA	2	6	64211	64216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301849
1390	NC_015970	TGC	2	6	64217	64222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301849
1391	NC_015970	CGG	2	6	64225	64230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301849
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1398	NC_015970	GCA	2	6	64493	64498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301849
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1409	NC_015970	TCG	2	6	65206	65211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_015970	CAA	2	6	65288	65293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1462	NC_015970	TCT	2	6	67893	67898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301854
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1498	NC_015970	ACA	2	6	69348	69353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301855
1499	NC_015970	CTC	2	6	69514	69519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301855
1500	NC_015970	CAC	2	6	69581	69586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301855

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