MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 2260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015970	TCG	2	6	23479	23484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301815
502	NC_015970	CT	3	6	23510	23515	0 %	50 %	0 %	50 %	345301815
503	NC_015970	TGCG	2	8	23548	23555	0 %	25 %	50 %	25 %	345301815
504	NC_015970	GAC	2	6	23562	23567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301815
505	NC_015970	CGGA	2	8	23638	23645	25 %	0 %	50 %	25 %	345301815
506	NC_015970	T	6	6	23655	23660	0 %	100 %	0 %	0 %	345301815
507	NC_015970	CTG	2	6	23673	23678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015970	GTC	2	6	23723	23728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_015970	TGC	2	6	23731	23736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015970	ATC	2	6	23768	23773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015970	CCG	2	6	23784	23789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_015970	A	7	7	23799	23805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015970	T	7	7	23810	23816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015970	GTG	2	6	23850	23855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301816
515	NC_015970	GCT	3	9	23888	23896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301816
516	NC_015970	GCCG	2	8	23906	23913	0 %	0 %	50 %	50 %	345301816
517	NC_015970	TGA	2	6	23930	23935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301816
518	NC_015970	TGAA	2	8	23959	23966	50 %	25 %	25 %	0 %	345301816
519	NC_015970	CTT	2	6	23993	23998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301816
520	NC_015970	GAT	2	6	24020	24025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301816
521	NC_015970	GTG	3	9	24093	24101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301816
522	NC_015970	CCAC	2	8	24248	24255	25 %	0 %	0 %	75 %	345301816
523	NC_015970	CGT	2	6	24302	24307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301817
524	NC_015970	CTTCG	2	10	24338	24347	0 %	40 %	20 %	40 %	345301817
525	NC_015970	GTG	2	6	24361	24366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301817
526	NC_015970	CAA	2	6	24372	24377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301817
527	NC_015970	AGG	2	6	24404	24409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301817
528	NC_015970	GGGA	2	8	24470	24477	25 %	0 %	75 %	0 %	345301817
529	NC_015970	T	6	6	24485	24490	0 %	100 %	0 %	0 %	345301817
530	NC_015970	CGTT	2	8	24544	24551	0 %	50 %	25 %	25 %	345301817
531	NC_015970	GGA	3	9	24612	24620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301817
532	NC_015970	GAG	2	6	24624	24629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301817
533	NC_015970	GTTGGC	2	12	24685	24696	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345301817
534	NC_015970	AGCG	2	8	24724	24731	25 %	0 %	50 %	25 %	345301817
535	NC_015970	GGA	2	6	24795	24800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301817
536	NC_015970	GGC	2	6	24984	24989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301817
537	NC_015970	CGA	2	6	24997	25002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301817
538	NC_015970	CG	3	6	25030	25035	0 %	0 %	50 %	50 %	345301817
539	NC_015970	CTGAT	2	10	25040	25049	20 %	40 %	20 %	20 %	345301817
540	NC_015970	ATGC	2	8	25072	25079	25 %	25 %	25 %	25 %	345301817
541	NC_015970	GGC	2	6	25086	25091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301817
542	NC_015970	TGCG	2	8	25100	25107	0 %	25 %	50 %	25 %	345301817
543	NC_015970	TGG	2	6	25130	25135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301817
544	NC_015970	TGG	2	6	25190	25195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301817
545	NC_015970	GGC	2	6	25236	25241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301817
546	NC_015970	GCG	2	6	25254	25259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301817
547	NC_015970	CGC	2	6	25347	25352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301817
548	NC_015970	GCGG	2	8	25380	25387	0 %	0 %	75 %	25 %	345301817
549	NC_015970	CCG	2	6	25401	25406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301817
550	NC_015970	GA	3	6	25415	25420	50 %	0 %	50 %	0 %	345301817
551	NC_015970	CAG	2	6	25468	25473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301817
552	NC_015970	ACA	2	6	25492	25497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301817
553	NC_015970	CTT	2	6	25658	25663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301818
554	NC_015970	GC	3	6	25737	25742	0 %	0 %	50 %	50 %	345301818
555	NC_015970	GTGC	2	8	25743	25750	0 %	25 %	50 %	25 %	345301818
556	NC_015970	GGC	2	6	25791	25796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301818
557	NC_015970	GGT	2	6	25868	25873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301818
558	NC_015970	GGC	2	6	25913	25918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301818
559	NC_015970	GGC	2	6	25946	25951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301818
560	NC_015970	GGA	2	6	25978	25983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301818
561	NC_015970	CAG	2	6	26004	26009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301818
562	NC_015970	CG	3	6	26021	26026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_015970	ACA	2	6	26049	26054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_015970	GTG	2	6	26161	26166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301819
565	NC_015970	CG	3	6	26269	26274	0 %	0 %	50 %	50 %	345301819
566	NC_015970	GTC	2	6	26278	26283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301819
567	NC_015970	GTG	2	6	26366	26371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301819
568	NC_015970	ACGG	2	8	26394	26401	25 %	0 %	50 %	25 %	345301819
569	NC_015970	ATC	2	6	26447	26452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301819
570	NC_015970	GGC	2	6	26500	26505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301819
571	NC_015970	TGG	2	6	26532	26537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301819
572	NC_015970	GAC	2	6	26540	26545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301819
573	NC_015970	GGA	2	6	26554	26559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301819
574	NC_015970	GGC	2	6	26599	26604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301819
575	NC_015970	GC	3	6	26627	26632	0 %	0 %	50 %	50 %	345301819
576	NC_015970	AAC	2	6	26711	26716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301820
577	NC_015970	TGG	2	6	26869	26874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301820
578	NC_015970	GC	3	6	26891	26896	0 %	0 %	50 %	50 %	345301820
579	NC_015970	GGGAG	2	10	26942	26951	20 %	0 %	80 %	0 %	345301820
580	NC_015970	AGA	2	6	26978	26983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301820
581	NC_015970	GAC	2	6	26989	26994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301820
582	NC_015970	AGA	2	6	27077	27082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301820
583	NC_015970	CTT	2	6	27100	27105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301820
584	NC_015970	GC	3	6	27118	27123	0 %	0 %	50 %	50 %	345301820
585	NC_015970	TCTG	2	8	27126	27133	0 %	50 %	25 %	25 %	345301820
586	NC_015970	TC	3	6	27140	27145	0 %	50 %	0 %	50 %	345301820
587	NC_015970	CCCCGA	2	12	27192	27203	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345301820
588	NC_015970	AGG	2	6	27209	27214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301820
589	NC_015970	GGC	2	6	27332	27337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301820
590	NC_015970	AAT	2	6	27373	27378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345301820
591	NC_015970	CTT	2	6	27441	27446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301820
592	NC_015970	CAC	2	6	27456	27461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301820
593	NC_015970	GTC	2	6	27527	27532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301820
594	NC_015970	TCGG	2	8	27537	27544	0 %	25 %	50 %	25 %	345301820
595	NC_015970	CGG	2	6	27571	27576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301820
596	NC_015970	CTG	2	6	27577	27582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301820
597	NC_015970	GTG	2	6	27619	27624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301820
598	NC_015970	TTC	2	6	27631	27636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301820
599	NC_015970	CTG	2	6	27668	27673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301820
600	NC_015970	CTC	2	6	27831	27836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301820
601	NC_015970	CGG	2	6	27840	27845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301820
602	NC_015970	GTCGG	2	10	27962	27971	0 %	20 %	60 %	20 %	345301821
603	NC_015970	TGG	2	6	28047	28052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301821
604	NC_015970	CGG	2	6	28111	28116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301821
605	NC_015970	TAC	2	6	28121	28126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301821
606	NC_015970	TTC	2	6	28146	28151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301821
607	NC_015970	ACTG	2	8	28180	28187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_015970	GCGA	2	8	28272	28279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
609	NC_015970	GCG	2	6	28286	28291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015970	CG	3	6	28312	28317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_015970	GGC	2	6	28329	28334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015970	CGG	2	6	28367	28372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015970	GGC	2	6	28395	28400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015970	A	6	6	28460	28465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015970	GAC	2	6	28477	28482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015970	GCT	2	6	28671	28676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301822
617	NC_015970	TCG	2	6	28755	28760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301822
618	NC_015970	GAA	2	6	28774	28779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301822
619	NC_015970	GAA	2	6	28849	28854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301822
620	NC_015970	TAC	2	6	28922	28927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301823
621	NC_015970	TGA	2	6	29006	29011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301823
622	NC_015970	AATTGA	2	12	29030	29041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015970	TTG	2	6	29056	29061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015970	TGT	2	6	29093	29098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015970	GA	3	6	29115	29120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015970	T	6	6	29301	29306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015970	AAG	2	6	29311	29316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015970	GC	3	6	29347	29352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_015970	GCC	2	6	29354	29359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_015970	CAC	2	6	29407	29412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_015970	CTG	2	6	29455	29460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_015970	TAT	2	6	29533	29538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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746	NC_015970	TAA	2	6	35896	35901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
747	NC_015970	A	7	7	35910	35916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
748	NC_015970	CTT	2	6	35921	35926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
749	NC_015970	TAG	2	6	35977	35982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
750	NC_015970	TGG	2	6	35988	35993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
751	NC_015970	ACCG	2	8	36008	36015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
752	NC_015970	CA	3	6	36059	36064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
753	NC_015970	ATT	2	6	36085	36090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
754	NC_015970	GCT	2	6	36140	36145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_015970	CGC	2	6	36154	36159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
756	NC_015970	GCA	4	12	36226	36237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301829
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763	NC_015970	ACT	2	6	36718	36723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301829
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