MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 4713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015966	GC	3	6	1904	1909	0 %	0 %	50 %	50 %	345301890
2	NC_015966	GC	3	6	1993	1998	0 %	0 %	50 %	50 %	345301890
3	NC_015966	CG	3	6	3002	3007	0 %	0 %	50 %	50 %	345301891
4	NC_015966	GC	4	8	3028	3035	0 %	0 %	50 %	50 %	345301891
5	NC_015966	CG	3	6	3205	3210	0 %	0 %	50 %	50 %	345301891
6	NC_015966	TC	3	6	3213	3218	0 %	50 %	0 %	50 %	345301891
7	NC_015966	GC	3	6	4330	4335	0 %	0 %	50 %	50 %	345301892
8	NC_015966	GC	3	6	4626	4631	0 %	0 %	50 %	50 %	345301892
9	NC_015966	AC	5	10	4808	4817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015966	GC	3	6	5425	5430	0 %	0 %	50 %	50 %	345301894
11	NC_015966	CG	3	6	5690	5695	0 %	0 %	50 %	50 %	345301894
12	NC_015966	GC	3	6	5737	5742	0 %	0 %	50 %	50 %	345301894
13	NC_015966	CG	3	6	6138	6143	0 %	0 %	50 %	50 %	345301895
14	NC_015966	GC	3	6	6460	6465	0 %	0 %	50 %	50 %	345301895
15	NC_015966	GC	3	6	6510	6515	0 %	0 %	50 %	50 %	345301895
16	NC_015966	GC	3	6	6707	6712	0 %	0 %	50 %	50 %	345301895
17	NC_015966	CG	3	6	6739	6744	0 %	0 %	50 %	50 %	345301895
18	NC_015966	GC	4	8	8238	8245	0 %	0 %	50 %	50 %	345301897
19	NC_015966	CG	3	6	8279	8284	0 %	0 %	50 %	50 %	345301897
20	NC_015966	GC	3	6	8621	8626	0 %	0 %	50 %	50 %	345301898
21	NC_015966	GT	3	6	9247	9252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015966	GC	3	6	9817	9822	0 %	0 %	50 %	50 %	345301899
23	NC_015966	GC	3	6	10040	10045	0 %	0 %	50 %	50 %	345301899
24	NC_015966	GC	3	6	10558	10563	0 %	0 %	50 %	50 %	345301900
25	NC_015966	GC	3	6	10694	10699	0 %	0 %	50 %	50 %	345301900
26	NC_015966	GC	3	6	12879	12884	0 %	0 %	50 %	50 %	345301902
27	NC_015966	GC	4	8	13716	13723	0 %	0 %	50 %	50 %	345301903
28	NC_015966	CG	3	6	13886	13891	0 %	0 %	50 %	50 %	345301903
29	NC_015966	AC	3	6	14226	14231	50 %	0 %	0 %	50 %	345301903
30	NC_015966	TG	3	6	14296	14301	0 %	50 %	50 %	0 %	345301903
31	NC_015966	GC	3	6	14332	14337	0 %	0 %	50 %	50 %	345301903
32	NC_015966	CG	3	6	15694	15699	0 %	0 %	50 %	50 %	345301904
33	NC_015966	GT	3	6	16680	16685	0 %	50 %	50 %	0 %	345301904
34	NC_015966	TC	3	6	16978	16983	0 %	50 %	0 %	50 %	345301904
35	NC_015966	CG	3	6	17370	17375	0 %	0 %	50 %	50 %	345301905
36	NC_015966	CG	3	6	18727	18732	0 %	0 %	50 %	50 %	345301906
37	NC_015966	GC	3	6	19496	19501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015966	GC	3	6	19904	19909	0 %	0 %	50 %	50 %	345301909
39	NC_015966	CG	3	6	20125	20130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015966	CG	3	6	21076	21081	0 %	0 %	50 %	50 %	345301911
41	NC_015966	GC	3	6	21390	21395	0 %	0 %	50 %	50 %	345301911
42	NC_015966	CG	3	6	23166	23171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015966	GC	3	6	23577	23582	0 %	0 %	50 %	50 %	345301913
44	NC_015966	GC	3	6	24124	24129	0 %	0 %	50 %	50 %	345301913
45	NC_015966	GA	3	6	24289	24294	50 %	0 %	50 %	0 %	345301913
46	NC_015966	GC	4	8	25467	25474	0 %	0 %	50 %	50 %	345301915
47	NC_015966	GC	3	6	25814	25819	0 %	0 %	50 %	50 %	345301915
48	NC_015966	CG	3	6	26822	26827	0 %	0 %	50 %	50 %	345301916
49	NC_015966	GC	3	6	28661	28666	0 %	0 %	50 %	50 %	345301919
50	NC_015966	CG	3	6	28823	28828	0 %	0 %	50 %	50 %	345301919
51	NC_015966	GC	3	6	29587	29592	0 %	0 %	50 %	50 %	345301919
52	NC_015966	GC	3	6	29620	29625	0 %	0 %	50 %	50 %	345301919
53	NC_015966	CG	3	6	29937	29942	0 %	0 %	50 %	50 %	345301919
54	NC_015966	CA	3	6	30065	30070	50 %	0 %	0 %	50 %	345301919
55	NC_015966	CA	3	6	30503	30508	50 %	0 %	0 %	50 %	345301919
56	NC_015966	GC	3	6	30613	30618	0 %	0 %	50 %	50 %	345301919
57	NC_015966	TG	3	6	31536	31541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015966	CG	3	6	34410	34415	0 %	0 %	50 %	50 %	345301922
59	NC_015966	GA	3	6	34824	34829	50 %	0 %	50 %	0 %	345301923
60	NC_015966	GC	3	6	35147	35152	0 %	0 %	50 %	50 %	345301923
61	NC_015966	GC	3	6	35723	35728	0 %	0 %	50 %	50 %	345301924
62	NC_015966	CG	3	6	37915	37920	0 %	0 %	50 %	50 %	345301927
63	NC_015966	TG	3	6	38619	38624	0 %	50 %	50 %	0 %	345301928
64	NC_015966	GC	3	6	38713	38718	0 %	0 %	50 %	50 %	345301928
65	NC_015966	GT	3	6	38764	38769	0 %	50 %	50 %	0 %	345301928
66	NC_015966	GC	3	6	39184	39189	0 %	0 %	50 %	50 %	345301928
67	NC_015966	CG	3	6	39981	39986	0 %	0 %	50 %	50 %	345301930
68	NC_015966	GC	3	6	40476	40481	0 %	0 %	50 %	50 %	345301930
69	NC_015966	GC	3	6	41238	41243	0 %	0 %	50 %	50 %	345301930
70	NC_015966	CG	3	6	42819	42824	0 %	0 %	50 %	50 %	345301932
71	NC_015966	CG	4	8	43032	43039	0 %	0 %	50 %	50 %	345301933
72	NC_015966	TG	3	6	43464	43469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015966	GA	4	8	43627	43634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015966	GT	3	6	44560	44565	0 %	50 %	50 %	0 %	345301934
75	NC_015966	CG	3	6	45670	45675	0 %	0 %	50 %	50 %	345301935
76	NC_015966	CG	3	6	46624	46629	0 %	0 %	50 %	50 %	345301935
77	NC_015966	CG	3	6	46996	47001	0 %	0 %	50 %	50 %	345301935
78	NC_015966	CG	3	6	47030	47035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015966	GC	3	6	47521	47526	0 %	0 %	50 %	50 %	345301936
80	NC_015966	GC	3	6	48471	48476	0 %	0 %	50 %	50 %	345301936
81	NC_015966	CG	3	6	48916	48921	0 %	0 %	50 %	50 %	345301936
82	NC_015966	GC	3	6	49229	49234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015966	GC	3	6	49529	49534	0 %	0 %	50 %	50 %	345301937
84	NC_015966	GC	3	6	49617	49622	0 %	0 %	50 %	50 %	345301937
85	NC_015966	GC	3	6	51089	51094	0 %	0 %	50 %	50 %	345301939
86	NC_015966	GC	3	6	51912	51917	0 %	0 %	50 %	50 %	345301939
87	NC_015966	GC	4	8	52130	52137	0 %	0 %	50 %	50 %	345301939
88	NC_015966	CA	3	6	52171	52176	50 %	0 %	0 %	50 %	345301939
89	NC_015966	TA	3	6	53510	53515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015966	GC	3	6	54421	54426	0 %	0 %	50 %	50 %	345301941
91	NC_015966	GA	3	6	54743	54748	50 %	0 %	50 %	0 %	345301941
92	NC_015966	CG	3	6	55741	55746	0 %	0 %	50 %	50 %	345301943
93	NC_015966	GC	3	6	57677	57682	0 %	0 %	50 %	50 %	345301945
94	NC_015966	GC	3	6	58198	58203	0 %	0 %	50 %	50 %	345301946
95	NC_015966	GA	3	6	59617	59622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015966	TG	3	6	59728	59733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015966	GT	3	6	61817	61822	0 %	50 %	50 %	0 %	345301947
98	NC_015966	CG	3	6	62788	62793	0 %	0 %	50 %	50 %	345301948
99	NC_015966	GC	3	6	64031	64036	0 %	0 %	50 %	50 %	345301949
100	NC_015966	GC	3	6	64296	64301	0 %	0 %	50 %	50 %	345301949
101	NC_015966	GC	4	8	64582	64589	0 %	0 %	50 %	50 %	345301949
102	NC_015966	AG	3	6	65355	65360	50 %	0 %	50 %	0 %	345301950
103	NC_015966	CG	3	6	65446	65451	0 %	0 %	50 %	50 %	345301950
104	NC_015966	GC	3	6	68080	68085	0 %	0 %	50 %	50 %	345301953
105	NC_015966	GC	3	6	70598	70603	0 %	0 %	50 %	50 %	345301955
106	NC_015966	GC	3	6	70667	70672	0 %	0 %	50 %	50 %	345301955
107	NC_015966	GC	4	8	70893	70900	0 %	0 %	50 %	50 %	345301955
108	NC_015966	GC	3	6	71047	71052	0 %	0 %	50 %	50 %	345301956
109	NC_015966	CG	3	6	72263	72268	0 %	0 %	50 %	50 %	345301956
110	NC_015966	GC	3	6	72888	72893	0 %	0 %	50 %	50 %	345301957
111	NC_015966	GC	3	6	72984	72989	0 %	0 %	50 %	50 %	345301957
112	NC_015966	CG	3	6	73585	73590	0 %	0 %	50 %	50 %	345301957
113	NC_015966	CG	3	6	73955	73960	0 %	0 %	50 %	50 %	345301957
114	NC_015966	CG	3	6	74386	74391	0 %	0 %	50 %	50 %	345301957
115	NC_015966	CG	4	8	74513	74520	0 %	0 %	50 %	50 %	345301957
116	NC_015966	CG	3	6	74864	74869	0 %	0 %	50 %	50 %	345301957
117	NC_015966	TG	3	6	75370	75375	0 %	50 %	50 %	0 %	345301958
118	NC_015966	CG	3	6	75937	75942	0 %	0 %	50 %	50 %	345301958
119	NC_015966	GC	3	6	77032	77037	0 %	0 %	50 %	50 %	345301959
120	NC_015966	GC	3	6	77303	77308	0 %	0 %	50 %	50 %	345301959
121	NC_015966	GC	4	8	77829	77836	0 %	0 %	50 %	50 %	345301959
122	NC_015966	CG	3	6	80614	80619	0 %	0 %	50 %	50 %	345301961
123	NC_015966	CG	3	6	81274	81279	0 %	0 %	50 %	50 %	345301961
124	NC_015966	TG	3	6	82160	82165	0 %	50 %	50 %	0 %	345301962
125	NC_015966	TC	3	6	82337	82342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015966	GC	3	6	82487	82492	0 %	0 %	50 %	50 %	345301963
127	NC_015966	TG	3	6	82888	82893	0 %	50 %	50 %	0 %	345301964
128	NC_015966	TC	3	6	83520	83525	0 %	50 %	0 %	50 %	345301965
129	NC_015966	CG	3	6	84599	84604	0 %	0 %	50 %	50 %	345301966
130	NC_015966	CG	3	6	85858	85863	0 %	0 %	50 %	50 %	345301966
131	NC_015966	CG	3	6	86779	86784	0 %	0 %	50 %	50 %	345301966
132	NC_015966	CG	3	6	87891	87896	0 %	0 %	50 %	50 %	345301967
133	NC_015966	GC	3	6	88102	88107	0 %	0 %	50 %	50 %	345301967
134	NC_015966	CG	3	6	88246	88251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015966	GC	3	6	89336	89341	0 %	0 %	50 %	50 %	345301969
136	NC_015966	CG	3	6	90065	90070	0 %	0 %	50 %	50 %	345301969
137	NC_015966	GC	3	6	90152	90157	0 %	0 %	50 %	50 %	345301969
138	NC_015966	GC	3	6	93201	93206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015966	TC	3	6	93517	93522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015966	AC	3	6	94129	94134	50 %	0 %	0 %	50 %	345301973
141	NC_015966	CG	3	6	95134	95139	0 %	0 %	50 %	50 %	345301973
142	NC_015966	GC	4	8	95907	95914	0 %	0 %	50 %	50 %	345301973
143	NC_015966	GC	3	6	96759	96764	0 %	0 %	50 %	50 %	345301974
144	NC_015966	GC	4	8	96875	96882	0 %	0 %	50 %	50 %	345301974
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