MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 9149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015966	GAAC	2	8	95	102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015966	ACGA	2	8	934	941	50 %	0 %	25 %	25 %	345301889
3	NC_015966	AAAG	2	8	1417	1424	75 %	0 %	25 %	0 %	345301889
4	NC_015966	AAGG	2	8	1984	1991	50 %	0 %	50 %	0 %	345301890
5	NC_015966	ACCA	2	8	2632	2639	50 %	0 %	0 %	50 %	345301890
6	NC_015966	CGGT	2	8	3431	3438	0 %	25 %	50 %	25 %	345301891
7	NC_015966	CGGT	2	8	3448	3455	0 %	25 %	50 %	25 %	345301891
8	NC_015966	ACCG	2	8	3463	3470	25 %	0 %	25 %	50 %	345301891
9	NC_015966	GGCT	2	8	3526	3533	0 %	25 %	50 %	25 %	345301891
10	NC_015966	TTCT	2	8	3981	3988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015966	CCCA	2	8	4369	4376	25 %	0 %	0 %	75 %	345301892
12	NC_015966	GCCC	2	8	4646	4653	0 %	0 %	25 %	75 %	345301892
13	NC_015966	GCAC	2	8	5196	5203	25 %	0 %	25 %	50 %	345301893
14	NC_015966	GCGG	2	8	5816	5823	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015966	GCTG	2	8	6268	6275	0 %	25 %	50 %	25 %	345301895
16	NC_015966	AGGC	2	8	6885	6892	25 %	0 %	50 %	25 %	345301896
17	NC_015966	AAGG	2	8	6971	6978	50 %	0 %	50 %	0 %	345301896
18	NC_015966	ATCG	2	8	7475	7482	25 %	25 %	25 %	25 %	345301896
19	NC_015966	GTTC	2	8	7606	7613	0 %	50 %	25 %	25 %	345301896
20	NC_015966	TGGC	2	8	7766	7773	0 %	25 %	50 %	25 %	345301897
21	NC_015966	CGCC	2	8	8325	8332	0 %	0 %	25 %	75 %	345301897
22	NC_015966	CGGG	2	8	8349	8356	0 %	0 %	75 %	25 %	345301897
23	NC_015966	CGAA	2	8	8589	8596	50 %	0 %	25 %	25 %	345301898
24	NC_015966	ATCA	2	8	9107	9114	50 %	25 %	0 %	25 %	345301898
25	NC_015966	CCGA	2	8	9176	9183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015966	TGCG	2	8	9646	9653	0 %	25 %	50 %	25 %	345301899
27	NC_015966	CGCC	2	8	9860	9867	0 %	0 %	25 %	75 %	345301899
28	NC_015966	CGGC	2	8	11427	11434	0 %	0 %	50 %	50 %	345301901
29	NC_015966	CCCG	2	8	11572	11579	0 %	0 %	25 %	75 %	345301901
30	NC_015966	ACGC	2	8	11752	11759	25 %	0 %	25 %	50 %	345301901
31	NC_015966	GAAC	2	8	11902	11909	50 %	0 %	25 %	25 %	345301901
32	NC_015966	CCGT	2	8	12149	12156	0 %	25 %	25 %	50 %	345301902
33	NC_015966	CGCC	2	8	12411	12418	0 %	0 %	25 %	75 %	345301902
34	NC_015966	CCGG	2	8	12523	12530	0 %	0 %	50 %	50 %	345301902
35	NC_015966	CGTC	2	8	13679	13686	0 %	25 %	25 %	50 %	345301903
36	NC_015966	CTCG	2	8	13936	13943	0 %	25 %	25 %	50 %	345301903
37	NC_015966	CGCT	2	8	14087	14094	0 %	25 %	25 %	50 %	345301903
38	NC_015966	CAGC	2	8	14741	14748	25 %	0 %	25 %	50 %	345301903
39	NC_015966	TCGA	2	8	14780	14787	25 %	25 %	25 %	25 %	345301903
40	NC_015966	CGCC	2	8	15440	15447	0 %	0 %	25 %	75 %	345301904
41	NC_015966	GCCG	2	8	15455	15462	0 %	0 %	50 %	50 %	345301904
42	NC_015966	CCGG	2	8	15563	15570	0 %	0 %	50 %	50 %	345301904
43	NC_015966	CGCT	2	8	15678	15685	0 %	25 %	25 %	50 %	345301904
44	NC_015966	CGCC	2	8	15831	15838	0 %	0 %	25 %	75 %	345301904
45	NC_015966	GGGC	2	8	16432	16439	0 %	0 %	75 %	25 %	345301904
46	NC_015966	GCCG	2	8	16522	16529	0 %	0 %	50 %	50 %	345301904
47	NC_015966	CCAG	2	8	16696	16703	25 %	0 %	25 %	50 %	345301904
48	NC_015966	ACGC	2	8	16862	16869	25 %	0 %	25 %	50 %	345301904
49	NC_015966	ATTG	2	8	17047	17054	25 %	50 %	25 %	0 %	345301904
50	NC_015966	CGGG	2	8	17349	17356	0 %	0 %	75 %	25 %	345301905
51	NC_015966	GCAC	2	8	17502	17509	25 %	0 %	25 %	50 %	345301905
52	NC_015966	GGGC	2	8	18133	18140	0 %	0 %	75 %	25 %	345301905
53	NC_015966	CGGC	2	8	18263	18270	0 %	0 %	50 %	50 %	345301905
54	NC_015966	ATCG	2	8	18425	18432	25 %	25 %	25 %	25 %	345301905
55	NC_015966	GGGA	2	8	18435	18442	25 %	0 %	75 %	0 %	345301905
56	NC_015966	ACCA	2	8	18481	18488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015966	GTCC	2	8	19656	19663	0 %	25 %	25 %	50 %	345301907
58	NC_015966	CCTT	2	8	20200	20207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015966	CTGC	2	8	20540	20547	0 %	25 %	25 %	50 %	345301910
60	NC_015966	CACC	2	8	20572	20579	25 %	0 %	0 %	75 %	345301910
61	NC_015966	GGCC	2	8	20901	20908	0 %	0 %	50 %	50 %	345301910
62	NC_015966	CGAC	2	8	22110	22117	25 %	0 %	25 %	50 %	345301911
63	NC_015966	CGTG	2	8	22627	22634	0 %	25 %	50 %	25 %	345301912
64	NC_015966	ACCG	2	8	22867	22874	25 %	0 %	25 %	50 %	345301912
65	NC_015966	CGCC	2	8	22958	22965	0 %	0 %	25 %	75 %	345301912
66	NC_015966	CGGG	2	8	25057	25064	0 %	0 %	75 %	25 %	345301914
67	NC_015966	CCTT	2	8	25653	25660	0 %	50 %	0 %	50 %	345301915
68	NC_015966	AGCG	2	8	25770	25777	25 %	0 %	50 %	25 %	345301915
69	NC_015966	CCGT	2	8	25909	25916	0 %	25 %	25 %	50 %	345301915
70	NC_015966	AGCC	2	8	26405	26412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015966	GGCC	2	8	26916	26923	0 %	0 %	50 %	50 %	345301916
72	NC_015966	ACCG	2	8	26927	26934	25 %	0 %	25 %	50 %	345301916
73	NC_015966	CCGG	2	8	28368	28375	0 %	0 %	50 %	50 %	345301919
74	NC_015966	CTTC	2	8	28421	28428	0 %	50 %	0 %	50 %	345301919
75	NC_015966	CGTC	2	8	28868	28875	0 %	25 %	25 %	50 %	345301919
76	NC_015966	GGCG	2	8	29201	29208	0 %	0 %	75 %	25 %	345301919
77	NC_015966	GGCT	2	8	29397	29404	0 %	25 %	50 %	25 %	345301919
78	NC_015966	GCTG	2	8	29540	29547	0 %	25 %	50 %	25 %	345301919
79	NC_015966	GGCG	2	8	29594	29601	0 %	0 %	75 %	25 %	345301919
80	NC_015966	CCAC	2	8	29871	29878	25 %	0 %	0 %	75 %	345301919
81	NC_015966	ATCG	2	8	30039	30046	25 %	25 %	25 %	25 %	345301919
82	NC_015966	AACG	2	8	30306	30313	50 %	0 %	25 %	25 %	345301919
83	NC_015966	GCTG	2	8	30349	30356	0 %	25 %	50 %	25 %	345301919
84	NC_015966	CCCG	2	8	30510	30517	0 %	0 %	25 %	75 %	345301919
85	NC_015966	CGAG	2	8	30889	30896	25 %	0 %	50 %	25 %	345301920
86	NC_015966	TCAT	2	8	31596	31603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015966	CGGC	2	8	32241	32248	0 %	0 %	50 %	50 %	345301921
88	NC_015966	AGCG	2	8	32616	32623	25 %	0 %	50 %	25 %	345301921
89	NC_015966	CGGG	2	8	32695	32702	0 %	0 %	75 %	25 %	345301921
90	NC_015966	CCAG	2	8	32809	32816	25 %	0 %	25 %	50 %	345301921
91	NC_015966	CCGC	2	8	33220	33227	0 %	0 %	25 %	75 %	345301921
92	NC_015966	GGAC	2	8	33228	33235	25 %	0 %	50 %	25 %	345301921
93	NC_015966	ATTT	2	8	33382	33389	25 %	75 %	0 %	0 %	345301922
94	NC_015966	GCCG	2	8	33754	33761	0 %	0 %	50 %	50 %	345301922
95	NC_015966	TCCG	2	8	33774	33781	0 %	25 %	25 %	50 %	345301922
96	NC_015966	CCGG	2	8	34544	34551	0 %	0 %	50 %	50 %	345301922
97	NC_015966	CTGC	2	8	34652	34659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015966	GGTC	2	8	34690	34697	0 %	25 %	50 %	25 %	345301923
99	NC_015966	CTGG	2	8	37331	37338	0 %	25 %	50 %	25 %	345301926
100	NC_015966	CGCC	2	8	37372	37379	0 %	0 %	25 %	75 %	345301926
101	NC_015966	CGGG	2	8	38051	38058	0 %	0 %	75 %	25 %	345301927
102	NC_015966	CCGG	2	8	38217	38224	0 %	0 %	50 %	50 %	345301927
103	NC_015966	GCCG	2	8	38447	38454	0 %	0 %	50 %	50 %	345301928
104	NC_015966	ACCT	2	8	38688	38695	25 %	25 %	0 %	50 %	345301928
105	NC_015966	GCTC	2	8	38884	38891	0 %	25 %	25 %	50 %	345301928
106	NC_015966	ACCG	2	8	39062	39069	25 %	0 %	25 %	50 %	345301928
107	NC_015966	CGAG	2	8	39447	39454	25 %	0 %	50 %	25 %	345301929
108	NC_015966	ACGT	2	8	39770	39777	25 %	25 %	25 %	25 %	345301929
109	NC_015966	CGCA	2	8	40133	40140	25 %	0 %	25 %	50 %	345301930
110	NC_015966	CTGC	2	8	40411	40418	0 %	25 %	25 %	50 %	345301930
111	NC_015966	CACG	2	8	41407	41414	25 %	0 %	25 %	50 %	345301930
112	NC_015966	CGAT	2	8	42364	42371	25 %	25 %	25 %	25 %	345301932
113	NC_015966	GGTG	2	8	42487	42494	0 %	25 %	75 %	0 %	345301932
114	NC_015966	CCTG	2	8	42544	42551	0 %	25 %	25 %	50 %	345301932
115	NC_015966	GGCT	2	8	43141	43148	0 %	25 %	50 %	25 %	345301933
116	NC_015966	GGAG	2	8	43642	43649	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015966	CGTC	2	8	43900	43907	0 %	25 %	25 %	50 %	345301934
118	NC_015966	CGGG	2	8	43987	43994	0 %	0 %	75 %	25 %	345301934
119	NC_015966	CCGG	2	8	44189	44196	0 %	0 %	50 %	50 %	345301934
120	NC_015966	CGAA	2	8	44269	44276	50 %	0 %	25 %	25 %	345301934
121	NC_015966	CAGC	2	8	44309	44316	25 %	0 %	25 %	50 %	345301934
122	NC_015966	GTGG	2	8	44367	44374	0 %	25 %	75 %	0 %	345301934
123	NC_015966	GGTG	2	8	44602	44609	0 %	25 %	75 %	0 %	345301934
124	NC_015966	CCGG	2	8	44840	44847	0 %	0 %	50 %	50 %	345301934
125	NC_015966	TCCC	2	8	45269	45276	0 %	25 %	0 %	75 %	345301934
126	NC_015966	GGCG	2	8	45379	45386	0 %	0 %	75 %	25 %	345301935
127	NC_015966	GTGG	2	8	45929	45936	0 %	25 %	75 %	0 %	345301935
128	NC_015966	GAGC	2	8	46012	46019	25 %	0 %	50 %	25 %	345301935
129	NC_015966	GCCG	2	8	46518	46525	0 %	0 %	50 %	50 %	345301935
130	NC_015966	CGAC	2	8	46654	46661	25 %	0 %	25 %	50 %	345301935
131	NC_015966	GGAG	2	8	47126	47133	25 %	0 %	75 %	0 %	345301936
132	NC_015966	GATC	2	8	47492	47499	25 %	25 %	25 %	25 %	345301936
133	NC_015966	TCGA	2	8	47925	47932	25 %	25 %	25 %	25 %	345301936
134	NC_015966	CGCT	2	8	48738	48745	0 %	25 %	25 %	50 %	345301936
135	NC_015966	GGCG	2	8	48760	48767	0 %	0 %	75 %	25 %	345301936
136	NC_015966	GACG	2	8	49250	49257	25 %	0 %	50 %	25 %	345301937
137	NC_015966	GCGG	2	8	50161	50168	0 %	0 %	75 %	25 %	345301938
138	NC_015966	CGAA	2	8	50340	50347	50 %	0 %	25 %	25 %	345301938
139	NC_015966	ATCC	2	8	50386	50393	25 %	25 %	0 %	50 %	345301938
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141	NC_015966	ACGA	2	8	51145	51152	50 %	0 %	25 %	25 %	345301939
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