MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_015966	CGC	2	6	104765	104770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301982
2503	NC_015966	GCC	2	6	104811	104816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301982
2504	NC_015966	CCG	2	6	104817	104822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301982
2505	NC_015966	CAC	2	6	104875	104880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301982
2506	NC_015966	TGG	2	6	104918	104923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301982
2507	NC_015966	GTT	2	6	104925	104930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301982
2508	NC_015966	CGT	2	6	105001	105006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301982
2509	NC_015966	GCCA	2	8	105014	105021	25 %	0 %	25 %	50 %	345301982
2510	NC_015966	G	8	8	105040	105047	0 %	0 %	100 %	0 %	345301982
2511	NC_015966	TCC	2	6	105071	105076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_015966	CCA	2	6	105132	105137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_015966	GAAA	2	8	105156	105163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_015966	A	7	7	105191	105197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_015966	AGC	2	6	105319	105324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_015966	CGC	2	6	105349	105354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2517	NC_015966	TGA	2	6	105374	105379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_015966	CG	4	8	105380	105387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2519	NC_015966	TGGTC	2	10	105409	105418	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2520	NC_015966	GAT	2	6	105527	105532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301983
2521	NC_015966	GCT	2	6	105547	105552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301983
2522	NC_015966	TCA	2	6	105586	105591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301983
2523	NC_015966	CAT	2	6	105626	105631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301983
2524	NC_015966	GTA	2	6	105632	105637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301983
2525	NC_015966	GGCCG	2	10	105638	105647	0 %	0 %	60 %	40 %	345301983
2526	NC_015966	CTG	2	6	105680	105685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301983
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2530	NC_015966	CG	3	6	105781	105786	0 %	0 %	50 %	50 %	345301983
2531	NC_015966	TTGC	2	8	105830	105837	0 %	50 %	25 %	25 %	345301983
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2534	NC_015966	TCC	2	6	105870	105875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301983
2535	NC_015966	TTCG	2	8	105911	105918	0 %	50 %	25 %	25 %	345301983
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2541	NC_015966	AGTCC	2	10	106153	106162	20 %	20 %	20 %	40 %	345301983
2542	NC_015966	GCCGGC	2	12	106165	106176	0 %	0 %	50 %	50 %	345301983
2543	NC_015966	CGG	2	6	106180	106185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301983
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2554	NC_015966	GTC	2	6	106581	106586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301983
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2558	NC_015966	CAG	2	6	106897	106902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301984
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2570	NC_015966	TGG	2	6	107532	107537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301984
2571	NC_015966	AAGC	2	8	107656	107663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2574	NC_015966	AAG	2	6	107865	107870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_015966	GGCGTT	2	12	108048	108059	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345301985
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2582	NC_015966	TGC	2	6	108395	108400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301985
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2593	NC_015966	ACC	2	6	108904	108909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301986
2594	NC_015966	GCGG	2	8	108927	108934	0 %	0 %	75 %	25 %	345301986
2595	NC_015966	CGA	2	6	108992	108997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301986
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2599	NC_015966	GCG	2	6	109068	109073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301986
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2602	NC_015966	GGC	2	6	109174	109179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301986
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2604	NC_015966	GCA	2	6	109250	109255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301986
2605	NC_015966	CGG	2	6	109268	109273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301986
2606	NC_015966	CCA	2	6	109274	109279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301986
2607	NC_015966	GCGA	2	8	109350	109357	25 %	0 %	50 %	25 %	345301987
2608	NC_015966	CG	3	6	109388	109393	0 %	0 %	50 %	50 %	345301987
2609	NC_015966	GGC	2	6	109430	109435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301987
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2866	NC_015966	GAC	2	6	118927	118932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301995
2867	NC_015966	GCG	2	6	118933	118938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301995
2868	NC_015966	TGG	2	6	118995	119000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301995
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2874	NC_015966	ACG	2	6	119249	119254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2876	NC_015966	GCA	2	6	119292	119297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301996
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2920	NC_015966	GAC	2	6	121112	121117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301999
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2986	NC_015966	TAC	2	6	123919	123924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302001
2987	NC_015966	ACG	2	6	123947	123952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302001
2988	NC_015966	GGCCGA	2	12	123969	123980	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345302001
2989	NC_015966	CGC	2	6	123989	123994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302001
2990	NC_015966	CAT	2	6	124071	124076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302001
2991	NC_015966	CTG	2	6	124105	124110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302001
2992	NC_015966	ACG	2	6	124159	124164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302001
2993	NC_015966	GCC	3	9	124165	124173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302001
2994	NC_015966	GGCGC	2	10	124194	124203	0 %	0 %	60 %	40 %	345302001
2995	NC_015966	GTC	2	6	124271	124276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302001
2996	NC_015966	CCA	2	6	124295	124300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302001
2997	NC_015966	TGGG	2	8	124315	124322	0 %	25 %	75 %	0 %	345302001
2998	NC_015966	GGC	2	6	124341	124346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302001
2999	NC_015966	GGC	2	6	124353	124358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302001
3000	NC_015966	CGG	2	6	124383	124388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302001

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