MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015966	CGG	2	6	62756	62761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301948
1502	NC_015966	GGC	2	6	62778	62783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301948
1503	NC_015966	CG	3	6	62788	62793	0 %	0 %	50 %	50 %	345301948
1504	NC_015966	GCC	2	6	62799	62804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301948
1505	NC_015966	CGT	2	6	62882	62887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301948
1506	NC_015966	CGA	2	6	62896	62901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301948
1507	NC_015966	GAC	2	6	62991	62996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301948
1508	NC_015966	GAT	2	6	63010	63015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301948
1509	NC_015966	CGG	2	6	63057	63062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301948
1510	NC_015966	CCG	2	6	63097	63102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301948
1511	NC_015966	AGG	2	6	63191	63196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301948
1512	NC_015966	GGC	2	6	63218	63223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301948
1513	NC_015966	GTG	3	9	63298	63306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301948
1514	NC_015966	CGCC	2	8	63316	63323	0 %	0 %	25 %	75 %	345301948
1515	NC_015966	CTT	2	6	63360	63365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_015966	GCC	2	6	63461	63466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_015966	T	6	6	63483	63488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015966	ACCG	2	8	63507	63514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_015966	TGG	2	6	63548	63553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015966	CTG	2	6	63602	63607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1521	NC_015966	GTG	2	6	63613	63618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301949
1522	NC_015966	GGCCCA	2	12	63631	63642	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345301949
1523	NC_015966	GCGCA	2	10	63647	63656	20 %	0 %	40 %	40 %	345301949
1524	NC_015966	GCG	2	6	63688	63693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301949
1525	NC_015966	CAG	2	6	63707	63712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1526	NC_015966	GCC	2	6	63713	63718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301949
1527	NC_015966	AACG	2	8	63719	63726	50 %	0 %	25 %	25 %	345301949
1528	NC_015966	GCA	2	6	63759	63764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1529	NC_015966	CGT	2	6	63841	63846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1530	NC_015966	ACC	2	6	63854	63859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301949
1531	NC_015966	AACCTG	2	12	63887	63898	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345301949
1532	NC_015966	GCC	2	6	63950	63955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301949
1533	NC_015966	GAGCT	2	10	63959	63968	20 %	20 %	40 %	20 %	345301949
1534	NC_015966	CGCC	2	8	63970	63977	0 %	0 %	25 %	75 %	345301949
1535	NC_015966	GC	3	6	64031	64036	0 %	0 %	50 %	50 %	345301949
1536	NC_015966	GCT	2	6	64081	64086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1537	NC_015966	CAG	3	9	64142	64150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1538	NC_015966	GGC	2	6	64159	64164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301949
1539	NC_015966	GC	3	6	64296	64301	0 %	0 %	50 %	50 %	345301949
1540	NC_015966	ACG	2	6	64308	64313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1541	NC_015966	CTG	2	6	64322	64327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1542	NC_015966	GCG	2	6	64342	64347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301949
1543	NC_015966	AGC	2	6	64368	64373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1544	NC_015966	GCC	2	6	64382	64387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301949
1545	NC_015966	CGG	2	6	64511	64516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301949
1546	NC_015966	ACG	2	6	64562	64567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1547	NC_015966	GC	4	8	64582	64589	0 %	0 %	50 %	50 %	345301949
1548	NC_015966	GCA	2	6	64687	64692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1549	NC_015966	AGC	2	6	64699	64704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301949
1550	NC_015966	GCAG	2	8	64717	64724	25 %	0 %	50 %	25 %	345301949
1551	NC_015966	GGC	2	6	64738	64743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301949
1552	NC_015966	GTCGG	2	10	64763	64772	0 %	20 %	60 %	20 %	345301949
1553	NC_015966	ACGT	2	8	64805	64812	25 %	25 %	25 %	25 %	345301949
1554	NC_015966	ACT	2	6	64875	64880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301949
1555	NC_015966	CTG	2	6	64970	64975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301950
1556	NC_015966	CTG	2	6	65000	65005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301950
1557	NC_015966	GTG	2	6	65006	65011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301950
1558	NC_015966	GGC	2	6	65021	65026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301950
1559	NC_015966	GCG	2	6	65086	65091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301950
1560	NC_015966	GGT	2	6	65104	65109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301950
1561	NC_015966	GAGGTG	2	12	65135	65146	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	345301950
1562	NC_015966	TCG	2	6	65175	65180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301950
1563	NC_015966	CCGG	2	8	65236	65243	0 %	0 %	50 %	50 %	345301950
1564	NC_015966	GCA	2	6	65263	65268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301950
1565	NC_015966	AG	3	6	65355	65360	50 %	0 %	50 %	0 %	345301950
1566	NC_015966	GCC	2	6	65402	65407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301950
1567	NC_015966	CG	3	6	65446	65451	0 %	0 %	50 %	50 %	345301950
1568	NC_015966	GGT	2	6	65572	65577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301950
1569	NC_015966	CCAG	2	8	65583	65590	25 %	0 %	25 %	50 %	345301950
1570	NC_015966	ATG	2	6	65606	65611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301950
1571	NC_015966	AGT	2	6	65737	65742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301950
1572	NC_015966	TCG	2	6	65855	65860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301950
1573	NC_015966	TGG	2	6	65862	65867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301950
1574	NC_015966	TGC	2	6	65901	65906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301950
1575	NC_015966	GCCGTG	2	12	65966	65977	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345301950
1576	NC_015966	GCCG	2	8	66037	66044	0 %	0 %	50 %	50 %	345301950
1577	NC_015966	GGT	2	6	66088	66093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301950
1578	NC_015966	TGG	2	6	66123	66128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301950
1579	NC_015966	CGA	2	6	66148	66153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301950
1580	NC_015966	ATC	2	6	66200	66205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301950
1581	NC_015966	CGGC	2	8	66274	66281	0 %	0 %	50 %	50 %	345301950
1582	NC_015966	CAT	2	6	66283	66288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301950
1583	NC_015966	AACCC	2	10	66303	66312	40 %	0 %	0 %	60 %	345301950
1584	NC_015966	CGAC	2	8	66335	66342	25 %	0 %	25 %	50 %	345301951
1585	NC_015966	CAG	2	6	66400	66405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301951
1586	NC_015966	CAT	2	6	66459	66464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301951
1587	NC_015966	CGG	2	6	66528	66533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301951
1588	NC_015966	CTA	2	6	66537	66542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301951
1589	NC_015966	GAC	2	6	66574	66579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301951
1590	NC_015966	CAA	2	6	66597	66602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301951
1591	NC_015966	GCG	2	6	66724	66729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301951
1592	NC_015966	CAC	2	6	66760	66765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301951
1593	NC_015966	CGG	2	6	66783	66788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301951
1594	NC_015966	CAGCGC	2	12	66790	66801	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345301951
1595	NC_015966	CAA	2	6	66825	66830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301951
1596	NC_015966	ATC	2	6	66838	66843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301951
1597	NC_015966	CGA	2	6	66849	66854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301951
1598	NC_015966	GTT	2	6	66909	66914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301951
1599	NC_015966	GCT	2	6	66933	66938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301951
1600	NC_015966	GGT	2	6	66939	66944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301951
1601	NC_015966	CACG	2	8	66945	66952	25 %	0 %	25 %	50 %	345301951
1602	NC_015966	TCAT	2	8	66983	66990	25 %	50 %	0 %	25 %	345301951
1603	NC_015966	GCT	2	6	67035	67040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301951
1604	NC_015966	GGACCT	2	12	67044	67055	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345301951
1605	NC_015966	GCG	2	6	67060	67065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301951
1606	NC_015966	GAC	3	9	67101	67109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301952
1607	NC_015966	CTG	2	6	67110	67115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301952
1608	NC_015966	GGC	2	6	67139	67144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301952
1609	NC_015966	TGC	2	6	67252	67257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301952
1610	NC_015966	GCC	3	9	67513	67521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301952
1611	NC_015966	CCATC	2	10	67553	67562	20 %	20 %	0 %	60 %	345301952
1612	NC_015966	GCA	2	6	67595	67600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301952
1613	NC_015966	CAG	2	6	67698	67703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301952
1614	NC_015966	GGC	2	6	67730	67735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301952
1615	NC_015966	CGAC	2	8	67741	67748	25 %	0 %	25 %	50 %	345301952
1616	NC_015966	CCA	2	6	67756	67761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301952
1617	NC_015966	TCG	2	6	67764	67769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301952
1618	NC_015966	GCG	2	6	67787	67792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301953
1619	NC_015966	CAG	2	6	67793	67798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301953
1620	NC_015966	CAGG	2	8	67808	67815	25 %	0 %	50 %	25 %	345301953
1621	NC_015966	CGT	2	6	67856	67861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301953
1622	NC_015966	GCC	2	6	67862	67867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301953
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1624	NC_015966	GCC	2	6	68030	68035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301953
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1997	NC_015966	GCTGGT	2	12	84234	84245	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345301965
1998	NC_015966	GCA	2	6	84348	84353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301965
1999	NC_015966	CGG	2	6	84433	84438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301965
2000	NC_015966	GCG	2	6	84465	84470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301965

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