MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015966	GGC	2	6	21409	21414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301911
502	NC_015966	CAC	3	9	21415	21423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301911
503	NC_015966	CGT	2	6	21471	21476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301911
504	NC_015966	GCT	3	9	21531	21539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301911
505	NC_015966	GGC	2	6	21556	21561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301911
506	NC_015966	CGT	2	6	21573	21578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301911
507	NC_015966	CTT	2	6	21633	21638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301911
508	NC_015966	CGG	2	6	21821	21826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301911
509	NC_015966	CCA	2	6	21840	21845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301911
510	NC_015966	CGC	2	6	21866	21871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301911
511	NC_015966	CGCGC	2	10	21896	21905	0 %	0 %	40 %	60 %	345301911
512	NC_015966	CAC	2	6	21946	21951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301911
513	NC_015966	CCTCGC	2	12	21960	21971	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	345301911
514	NC_015966	AGC	3	9	21980	21988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301911
515	NC_015966	GCC	2	6	22072	22077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301911
516	NC_015966	GTG	2	6	22082	22087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301911
517	NC_015966	CGAC	2	8	22110	22117	25 %	0 %	25 %	50 %	345301911
518	NC_015966	CAG	2	6	22120	22125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301911
519	NC_015966	CAC	2	6	22132	22137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301911
520	NC_015966	TCA	2	6	22152	22157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301911
521	NC_015966	CAC	2	6	22165	22170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301911
522	NC_015966	GCG	2	6	22261	22266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301911
523	NC_015966	CAG	2	6	22270	22275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301911
524	NC_015966	GAT	2	6	22397	22402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301912
525	NC_015966	GCCGG	2	10	22579	22588	0 %	0 %	60 %	40 %	345301912
526	NC_015966	CGTG	2	8	22627	22634	0 %	25 %	50 %	25 %	345301912
527	NC_015966	GTC	2	6	22635	22640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301912
528	NC_015966	CAG	2	6	22697	22702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301912
529	NC_015966	CCT	2	6	22735	22740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301912
530	NC_015966	CAG	2	6	22742	22747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301912
531	NC_015966	CGG	2	6	22749	22754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301912
532	NC_015966	GCC	2	6	22758	22763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301912
533	NC_015966	GCC	2	6	22774	22779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301912
534	NC_015966	GCCGC	2	10	22796	22805	0 %	0 %	40 %	60 %	345301912
535	NC_015966	TCC	2	6	22842	22847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301912
536	NC_015966	ACCG	2	8	22867	22874	25 %	0 %	25 %	50 %	345301912
537	NC_015966	GGT	2	6	22891	22896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301912
538	NC_015966	CAG	2	6	22901	22906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301912
539	NC_015966	CGT	2	6	22918	22923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301912
540	NC_015966	CGCC	2	8	22958	22965	0 %	0 %	25 %	75 %	345301912
541	NC_015966	C	6	6	22976	22981	0 %	0 %	0 %	100 %	345301912
542	NC_015966	CCG	2	6	23065	23070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301912
543	NC_015966	CAG	2	6	23090	23095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301912
544	NC_015966	AGC	2	6	23103	23108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301912
545	NC_015966	CGA	2	6	23131	23136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015966	AAC	2	6	23158	23163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015966	CG	3	6	23166	23171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_015966	C	6	6	23181	23186	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
549	NC_015966	GCT	3	9	23264	23272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
550	NC_015966	CTG	2	6	23274	23279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
551	NC_015966	ACG	2	6	23320	23325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301913
552	NC_015966	CGT	2	6	23435	23440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
553	NC_015966	CCGACC	2	12	23461	23472	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345301913
554	NC_015966	GC	3	6	23577	23582	0 %	0 %	50 %	50 %	345301913
555	NC_015966	GAA	2	6	23586	23591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301913
556	NC_015966	CTG	2	6	23604	23609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
557	NC_015966	ATC	2	6	23652	23657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
558	NC_015966	ACA	2	6	23710	23715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301913
559	NC_015966	CGA	2	6	23716	23721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301913
560	NC_015966	GAG	2	6	23847	23852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301913
561	NC_015966	TCG	2	6	23863	23868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
562	NC_015966	CAT	2	6	23873	23878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
563	NC_015966	CAT	2	6	23882	23887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
564	NC_015966	TGG	2	6	23917	23922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301913
565	NC_015966	GACCT	2	10	23943	23952	20 %	20 %	20 %	40 %	345301913
566	NC_015966	GGA	2	6	24032	24037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301913
567	NC_015966	GC	3	6	24124	24129	0 %	0 %	50 %	50 %	345301913
568	NC_015966	CGA	2	6	24146	24151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301913
569	NC_015966	CAT	2	6	24167	24172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
570	NC_015966	AAG	2	6	24186	24191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301913
571	NC_015966	TCA	2	6	24241	24246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
572	NC_015966	CAC	2	6	24266	24271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301913
573	NC_015966	GA	3	6	24289	24294	50 %	0 %	50 %	0 %	345301913
574	NC_015966	T	6	6	24411	24416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015966	CGC	2	6	24459	24464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_015966	CGT	2	6	24491	24496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015966	TCT	2	6	24524	24529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_015966	TGC	2	6	24584	24589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301914
579	NC_015966	CTA	2	6	24708	24713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301914
580	NC_015966	GCT	2	6	24741	24746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301914
581	NC_015966	GCG	2	6	24876	24881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301914
582	NC_015966	CGG	2	6	24932	24937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301914
583	NC_015966	GCTGG	2	10	24945	24954	0 %	20 %	60 %	20 %	345301914
584	NC_015966	CCG	2	6	24987	24992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301914
585	NC_015966	ACG	2	6	25022	25027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301914
586	NC_015966	CGGG	2	8	25057	25064	0 %	0 %	75 %	25 %	345301914
587	NC_015966	CGG	2	6	25068	25073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301914
588	NC_015966	GAT	2	6	25074	25079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301914
589	NC_015966	CAC	2	6	25113	25118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301914
590	NC_015966	ACT	2	6	25148	25153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301914
591	NC_015966	CAC	2	6	25187	25192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301914
592	NC_015966	CGG	2	6	25195	25200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301914
593	NC_015966	TTC	2	6	25201	25206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301914
594	NC_015966	TCA	2	6	25217	25222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301914
595	NC_015966	ACG	2	6	25290	25295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301915
596	NC_015966	GGC	2	6	25334	25339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301915
597	NC_015966	CGG	2	6	25426	25431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301915
598	NC_015966	CTG	2	6	25433	25438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301915
599	NC_015966	CCG	2	6	25451	25456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301915
600	NC_015966	GC	4	8	25467	25474	0 %	0 %	50 %	50 %	345301915
601	NC_015966	GAA	2	6	25493	25498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301915
602	NC_015966	CAG	2	6	25511	25516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301915
603	NC_015966	GGC	2	6	25523	25528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301915
604	NC_015966	TTC	3	9	25589	25597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301915
605	NC_015966	CAC	2	6	25637	25642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301915
606	NC_015966	CCTT	2	8	25653	25660	0 %	50 %	0 %	50 %	345301915
607	NC_015966	AGCG	2	8	25770	25777	25 %	0 %	50 %	25 %	345301915
608	NC_015966	GC	3	6	25814	25819	0 %	0 %	50 %	50 %	345301915
609	NC_015966	GCT	2	6	25829	25834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301915
610	NC_015966	CTC	2	6	25868	25873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301915
611	NC_015966	CTT	2	6	25880	25885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301915
612	NC_015966	CGC	2	6	25888	25893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301915
613	NC_015966	GGC	2	6	25898	25903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301915
614	NC_015966	CCGT	2	8	25909	25916	0 %	25 %	25 %	50 %	345301915
615	NC_015966	CAG	3	9	25949	25957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301915
616	NC_015966	GAT	2	6	25967	25972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301915
617	NC_015966	AGC	2	6	26032	26037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301915
618	NC_015966	CCA	2	6	26119	26124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301915
619	NC_015966	TGG	3	9	26149	26157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301915
620	NC_015966	CCGGCA	2	12	26209	26220	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345301915
621	NC_015966	CCGGC	2	10	26274	26283	0 %	0 %	40 %	60 %	345301915
622	NC_015966	CAGCG	2	10	26337	26346	20 %	0 %	40 %	40 %	345301915
623	NC_015966	AGCC	2	8	26405	26412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
624	NC_015966	CTG	3	9	26491	26499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301916
625	NC_015966	CGG	2	6	26513	26518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301916
626	NC_015966	TGC	2	6	26552	26557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301916
627	NC_015966	GCC	2	6	26569	26574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301916
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756	NC_015966	GCG	2	6	31199	31204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301920
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758	NC_015966	CGT	2	6	31261	31266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301920
759	NC_015966	CTT	2	6	31303	31308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301920
760	NC_015966	GTA	2	6	31337	31342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301920
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767	NC_015966	TCAT	2	8	31596	31603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
768	NC_015966	A	6	6	31621	31626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
769	NC_015966	GTC	2	6	31628	31633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
770	NC_015966	A	6	6	31687	31692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
771	NC_015966	GTT	2	6	31693	31698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
772	NC_015966	T	6	6	31931	31936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_015966	CAT	2	6	40981	40986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301930

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