MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
76501	NC_015966	CCGG	2	8	3214398	3214405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76502	NC_015966	T	6	6	3214443	3214448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76503	NC_015966	CGA	2	6	3214477	3214482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76504	NC_015966	TTCTT	2	10	3214487	3214496	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76505	NC_015966	GC	3	6	3214521	3214526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76506	NC_015966	CTG	3	9	3214548	3214556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304629
76507	NC_015966	CTG	2	6	3214563	3214568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304629
76508	NC_015966	CCTG	2	8	3214736	3214743	0 %	25 %	25 %	50 %	345304629
76509	NC_015966	CACG	2	8	3214769	3214776	25 %	0 %	25 %	50 %	345304629
76510	NC_015966	CGC	2	6	3214819	3214824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304629
76511	NC_015966	GCC	2	6	3214826	3214831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304629
76512	NC_015966	CGC	2	6	3214839	3214844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304629
76513	NC_015966	TCA	2	6	3214873	3214878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304629
76514	NC_015966	TGC	2	6	3214960	3214965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304629
76515	NC_015966	CTA	2	6	3215036	3215041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304629
76516	NC_015966	CTG	2	6	3215061	3215066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304629
76517	NC_015966	CCA	2	6	3215149	3215154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304629
76518	NC_015966	GGC	2	6	3215183	3215188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304629
76519	NC_015966	GCT	2	6	3215213	3215218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304629
76520	NC_015966	CTG	2	6	3215235	3215240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304629
76521	NC_015966	GCCG	2	8	3215303	3215310	0 %	0 %	50 %	50 %	345304629
76522	NC_015966	CGC	2	6	3215372	3215377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304629
76523	NC_015966	TCT	2	6	3215383	3215388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304629
76524	NC_015966	CGG	2	6	3215443	3215448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304629
76525	NC_015966	ATCCCG	2	12	3215451	3215462	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345304629
76526	NC_015966	ACG	2	6	3215476	3215481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304629
76527	NC_015966	CGC	2	6	3215482	3215487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304629
76528	NC_015966	GGT	2	6	3215543	3215548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304629
76529	NC_015966	GC	3	6	3215571	3215576	0 %	0 %	50 %	50 %	345304629
76530	NC_015966	CGA	3	9	3215609	3215617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304629
76531	NC_015966	GGC	2	6	3215664	3215669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304629
76532	NC_015966	CTA	2	6	3215756	3215761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304629
76533	NC_015966	CG	3	6	3215764	3215769	0 %	0 %	50 %	50 %	345304629
76534	NC_015966	CG	3	6	3215850	3215855	0 %	0 %	50 %	50 %	345304629
76535	NC_015966	GGCC	2	8	3215897	3215904	0 %	0 %	50 %	50 %	345304629
76536	NC_015966	GCC	2	6	3215922	3215927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304629
76537	NC_015966	TCG	2	6	3215935	3215940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304629
76538	NC_015966	GTCT	2	8	3216000	3216007	0 %	50 %	25 %	25 %	345304629
76539	NC_015966	GGT	2	6	3216035	3216040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304629
76540	NC_015966	CGG	2	6	3216051	3216056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304629
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76542	NC_015966	GTG	2	6	3216087	3216092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304629
76543	NC_015966	CGG	2	6	3216098	3216103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304629
76544	NC_015966	CGA	2	6	3216104	3216109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304629
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76546	NC_015966	CCG	2	6	3216172	3216177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304629
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76552	NC_015966	CGA	2	6	3216473	3216478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304629
76553	NC_015966	GGGC	2	8	3216493	3216500	0 %	0 %	75 %	25 %	345304629
76554	NC_015966	ACG	2	6	3216511	3216516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304629
76555	NC_015966	CTGG	2	8	3216566	3216573	0 %	25 %	50 %	25 %	345304629
76556	NC_015966	CCCG	2	8	3216584	3216591	0 %	0 %	25 %	75 %	345304629
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76573	NC_015966	GC	3	6	3217540	3217545	0 %	0 %	50 %	50 %	345304630
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76582	NC_015966	A	6	6	3217841	3217846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76583	NC_015966	TCA	2	6	3217864	3217869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76584	NC_015966	TAG	2	6	3217876	3217881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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76588	NC_015966	GCA	2	6	3218161	3218166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304631
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76591	NC_015966	GCG	2	6	3218287	3218292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304631
76592	NC_015966	GAC	2	6	3218320	3218325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304631
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76601	NC_015966	CAG	2	6	3218657	3218662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304631
76602	NC_015966	CAG	2	6	3218756	3218761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304631
76603	NC_015966	CTT	2	6	3218779	3218784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304632
76604	NC_015966	CGGG	2	8	3218811	3218818	0 %	0 %	75 %	25 %	345304632
76605	NC_015966	CCA	2	6	3218901	3218906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304632
76606	NC_015966	CAG	2	6	3218914	3218919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304632
76607	NC_015966	CCA	2	6	3218946	3218951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304632
76608	NC_015966	GC	3	6	3218962	3218967	0 %	0 %	50 %	50 %	345304632
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76611	NC_015966	GCG	2	6	3219132	3219137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304632
76612	NC_015966	GTG	2	6	3219152	3219157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304632
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76614	NC_015966	GTA	2	6	3219199	3219204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304632
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76616	NC_015966	CG	3	6	3219264	3219269	0 %	0 %	50 %	50 %	345304632
76617	NC_015966	CCA	2	6	3219285	3219290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304632
76618	NC_015966	GAT	2	6	3219436	3219441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304632
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76622	NC_015966	GC	4	8	3219643	3219650	0 %	0 %	50 %	50 %	345304632
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76631	NC_015966	GGC	2	6	3220132	3220137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304632
76632	NC_015966	CTG	2	6	3220138	3220143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304632
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76636	NC_015966	CTG	2	6	3220225	3220230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304632
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76719	NC_015966	GA	3	6	3222809	3222814	50 %	0 %	50 %	0 %	345304635
76720	NC_015966	GAA	2	6	3222874	3222879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304635
76721	NC_015966	ATCC	2	8	3222928	3222935	25 %	25 %	0 %	50 %	345304635
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76725	NC_015966	CGG	2	6	3223116	3223121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304635
76726	NC_015966	GGC	3	9	3223182	3223190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304636
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76729	NC_015966	C	7	7	3223313	3223319	0 %	0 %	0 %	100 %	345304636
76730	NC_015966	TTC	2	6	3223323	3223328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304636
76731	NC_015966	GCA	2	6	3223343	3223348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304636
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76734	NC_015966	CGA	2	6	3223427	3223432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304636
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