MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015966	CAT	2	6	230521	230526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302100
5502	NC_015966	AGT	2	6	230628	230633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_015966	GATA	2	8	230712	230719	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_015966	GA	3	6	230758	230763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_015966	GCA	2	6	230826	230831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5506	NC_015966	CGT	2	6	230832	230837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5507	NC_015966	CGT	2	6	230840	230845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5508	NC_015966	A	6	6	230861	230866	100 %	0 %	0 %	0 %	345302101
5509	NC_015966	TCA	2	6	230878	230883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302101
5510	NC_015966	AGG	2	6	230894	230899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302101
5511	NC_015966	ACT	2	6	230917	230922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302101
5512	NC_015966	ATC	2	6	230928	230933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302101
5513	NC_015966	AGCG	2	8	230934	230941	25 %	0 %	50 %	25 %	345302101
5514	NC_015966	TCG	2	6	230971	230976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5515	NC_015966	GTG	2	6	231021	231026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302101
5516	NC_015966	CGA	2	6	231032	231037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5517	NC_015966	GGC	2	6	231050	231055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302101
5518	NC_015966	GCA	2	6	231077	231082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5519	NC_015966	TCGT	2	8	231133	231140	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5520	NC_015966	GCA	2	6	231155	231160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_015966	TGC	2	6	231227	231232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5522	NC_015966	AGG	2	6	231355	231360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302102
5523	NC_015966	GCCA	2	8	231435	231442	25 %	0 %	25 %	50 %	345302102
5524	NC_015966	CAG	2	6	231474	231479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5525	NC_015966	TGG	2	6	231496	231501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302102
5526	NC_015966	GCT	2	6	231517	231522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5527	NC_015966	GCT	2	6	231548	231553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5528	NC_015966	GCC	2	6	231575	231580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302102
5529	NC_015966	AGC	2	6	231594	231599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5530	NC_015966	GTC	2	6	231644	231649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5531	NC_015966	TCG	2	6	231703	231708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302103
5532	NC_015966	GCT	2	6	231721	231726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302103
5533	NC_015966	GAA	2	6	231878	231883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302103
5534	NC_015966	GTG	2	6	231890	231895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302103
5535	NC_015966	CGG	2	6	231924	231929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302103
5536	NC_015966	CA	3	6	231961	231966	50 %	0 %	0 %	50 %	345302103
5537	NC_015966	GTG	2	6	231983	231988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302103
5538	NC_015966	CTG	2	6	231995	232000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302103
5539	NC_015966	ACG	2	6	232014	232019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302103
5540	NC_015966	GCC	2	6	232076	232081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302103
5541	NC_015966	GCT	2	6	232084	232089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302103
5542	NC_015966	TTC	2	6	232103	232108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302104
5543	NC_015966	CGC	2	6	232117	232122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302104
5544	NC_015966	TGC	2	6	232131	232136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5545	NC_015966	GTC	2	6	232175	232180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5546	NC_015966	GCC	3	9	232212	232220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302104
5547	NC_015966	CAT	2	6	232238	232243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302104
5548	NC_015966	GAT	2	6	232256	232261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302104
5549	NC_015966	GGC	2	6	232274	232279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302104
5550	NC_015966	CTT	2	6	232340	232345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302104
5551	NC_015966	CTG	2	6	232379	232384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5552	NC_015966	AGT	2	6	232402	232407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302104
5553	NC_015966	AGC	2	6	232464	232469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5554	NC_015966	TCG	2	6	232479	232484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5555	NC_015966	CTG	2	6	232493	232498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5556	NC_015966	CCA	2	6	232543	232548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302104
5557	NC_015966	GCG	2	6	232550	232555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302104
5558	NC_015966	TCG	2	6	232563	232568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5559	NC_015966	CAC	2	6	232673	232678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302104
5560	NC_015966	GAA	2	6	232703	232708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302104
5561	NC_015966	CG	3	6	232840	232845	0 %	0 %	50 %	50 %	345302104
5562	NC_015966	GGCC	2	8	232851	232858	0 %	0 %	50 %	50 %	345302104
5563	NC_015966	CTG	2	6	232893	232898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5564	NC_015966	CCA	2	6	232981	232986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302104
5565	NC_015966	GCG	2	6	233029	233034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302104
5566	NC_015966	GCT	2	6	233062	233067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5567	NC_015966	CAG	2	6	233087	233092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5568	NC_015966	ACGC	2	8	233120	233127	25 %	0 %	25 %	50 %	345302104
5569	NC_015966	GTC	2	6	233195	233200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5570	NC_015966	TCA	2	6	233206	233211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302104
5571	NC_015966	GGTCGT	2	12	233254	233265	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345302104
5572	NC_015966	GCA	3	9	233275	233283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5573	NC_015966	CGG	2	6	233296	233301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302104
5574	NC_015966	CAC	2	6	233309	233314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302104
5575	NC_015966	CGC	2	6	233337	233342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302104
5576	NC_015966	ACCC	2	8	233396	233403	25 %	0 %	0 %	75 %	345302104
5577	NC_015966	GAA	2	6	233417	233422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302104
5578	NC_015966	AGT	2	6	233437	233442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302104
5579	NC_015966	CG	3	6	233449	233454	0 %	0 %	50 %	50 %	345302104
5580	NC_015966	GCG	2	6	233461	233466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302104
5581	NC_015966	CGC	2	6	233532	233537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302104
5582	NC_015966	CAG	2	6	233567	233572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5583	NC_015966	GTA	2	6	233594	233599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302104
5584	NC_015966	GC	3	6	233613	233618	0 %	0 %	50 %	50 %	345302104
5585	NC_015966	GAA	2	6	233633	233638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302104
5586	NC_015966	CGA	2	6	233707	233712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5587	NC_015966	GAA	2	6	233762	233767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302104
5588	NC_015966	GTT	2	6	233873	233878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302104
5589	NC_015966	GCA	2	6	233893	233898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5590	NC_015966	GCG	2	6	233947	233952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302104
5591	NC_015966	GCT	2	6	233987	233992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5592	NC_015966	GAT	3	9	233996	234004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302104
5593	NC_015966	CAG	2	6	234026	234031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5594	NC_015966	ATC	2	6	234033	234038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302104
5595	NC_015966	GGTG	2	8	234082	234089	0 %	25 %	75 %	0 %	345302104
5596	NC_015966	TAG	2	6	234090	234095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302104
5597	NC_015966	CAC	2	6	234119	234124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302104
5598	NC_015966	CAG	2	6	234134	234139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5599	NC_015966	ATG	2	6	234180	234185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302104
5600	NC_015966	GAT	2	6	234194	234199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302104
5601	NC_015966	GAT	2	6	234206	234211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302104
5602	NC_015966	ACC	2	6	234219	234224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302104
5603	NC_015966	CAGC	2	8	234242	234249	25 %	0 %	25 %	50 %	345302104
5604	NC_015966	CAG	2	6	234296	234301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5605	NC_015966	CAG	2	6	234320	234325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5606	NC_015966	GCC	2	6	234410	234415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302104
5607	NC_015966	CGG	2	6	234436	234441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302104
5608	NC_015966	GCTC	2	8	234448	234455	0 %	25 %	25 %	50 %	345302104
5609	NC_015966	CAC	2	6	234473	234478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302104
5610	NC_015966	CAC	2	6	234569	234574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302104
5611	NC_015966	GCC	2	6	234575	234580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302104
5612	NC_015966	GTC	2	6	234596	234601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5613	NC_015966	CGGC	2	8	234619	234626	0 %	0 %	50 %	50 %	345302104
5614	NC_015966	GAT	2	6	234653	234658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302104
5615	NC_015966	CAG	2	6	234668	234673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302104
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5617	NC_015966	CG	3	6	234730	234735	0 %	0 %	50 %	50 %	345302104
5618	NC_015966	CCA	2	6	234763	234768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302104
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5620	NC_015966	CGG	2	6	234788	234793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302104
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5741	NC_015966	CAG	2	6	239469	239474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302108
5742	NC_015966	CCGA	2	8	239482	239489	25 %	0 %	25 %	50 %	345302108
5743	NC_015966	TACG	2	8	239510	239517	25 %	25 %	25 %	25 %	345302108
5744	NC_015966	CGT	2	6	239519	239524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5745	NC_015966	AGC	2	6	239546	239551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5746	NC_015966	ACG	2	6	239725	239730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302109
5747	NC_015966	CGA	2	6	239732	239737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302109
5748	NC_015966	GATC	2	8	239747	239754	25 %	25 %	25 %	25 %	345302109
5749	NC_015966	CG	3	6	239767	239772	0 %	0 %	50 %	50 %	345302109
5750	NC_015966	AGC	2	6	239776	239781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302109
5751	NC_015966	CTG	3	9	239829	239837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302109
5752	NC_015966	CCG	3	9	239985	239993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302109
5753	NC_015966	ACC	2	6	240036	240041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302109
5754	NC_015966	TGC	2	6	240049	240054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302109
5755	NC_015966	GATC	2	8	240139	240146	25 %	25 %	25 %	25 %	345302109
5756	NC_015966	CGG	2	6	240164	240169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302109
5757	NC_015966	CGA	2	6	240221	240226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302109
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5759	NC_015966	ACC	2	6	240258	240263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302109
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5762	NC_015966	GGC	3	9	240323	240331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5763	NC_015966	GC	3	6	240491	240496	0 %	0 %	50 %	50 %	345302110
5764	NC_015966	GGC	2	6	240500	240505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302110
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5777	NC_015966	AGT	2	6	241052	241057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302110
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5786	NC_015966	GCGG	2	8	241527	241534	0 %	0 %	75 %	25 %	345302111
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5802	NC_015966	GTTGAC	2	12	242403	242414	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345302111
5803	NC_015966	AAAT	2	8	242422	242429	75 %	25 %	0 %	0 %	345302111
5804	NC_015966	GGC	2	6	242496	242501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302111
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5810	NC_015966	CAGA	2	8	242692	242699	50 %	0 %	25 %	25 %	345302112
5811	NC_015966	TGC	3	9	242736	242744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302112
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5813	NC_015966	ACA	2	6	242847	242852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302112
5814	NC_015966	CTG	2	6	243005	243010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302112
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5822	NC_015966	CTG	2	6	243371	243376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5844	NC_015966	GGCCT	2	10	244188	244197	0 %	20 %	40 %	40 %	345302113
5845	NC_015966	TCG	2	6	244198	244203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302113
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5848	NC_015966	CG	3	6	244298	244303	0 %	0 %	50 %	50 %	345302113
5849	NC_015966	CGA	2	6	244310	244315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302113
5850	NC_015966	TTCCGG	2	12	244317	244328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302113
5851	NC_015966	CAGG	2	8	244342	244349	25 %	0 %	50 %	25 %	345302113
5852	NC_015966	CAG	2	6	244353	244358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302113
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5854	NC_015966	CTG	2	6	244414	244419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5855	NC_015966	A	6	6	244427	244432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5856	NC_015966	CCGCA	2	10	244436	244445	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5857	NC_015966	TG	3	6	244480	244485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5858	NC_015966	GCA	2	6	244575	244580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302114
5859	NC_015966	GGC	2	6	244581	244586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302114
5860	NC_015966	CGT	2	6	244642	244647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302114
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5984	NC_015966	CG	3	6	249942	249947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5985	NC_015966	GAAAA	2	10	249953	249962	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5986	NC_015966	T	6	6	250021	250026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5987	NC_015966	TCA	2	6	250050	250055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5989	NC_015966	GTC	2	6	250082	250087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302119
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