MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56502	NC_015966	GCA	2	6	2392729	2392734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303945
56503	NC_015966	AGC	2	6	2392811	2392816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303945
56504	NC_015966	GCG	2	6	2392854	2392859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303945
56505	NC_015966	CGA	2	6	2392885	2392890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303945
56506	NC_015966	CGG	3	9	2392897	2392905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303945
56507	NC_015966	GCG	2	6	2392944	2392949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303945
56508	NC_015966	CGA	2	6	2392975	2392980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303945
56509	NC_015966	CCA	2	6	2393023	2393028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56510	NC_015966	GAGC	2	8	2393050	2393057	25 %	0 %	50 %	25 %	345303946
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56515	NC_015966	CGA	2	6	2393167	2393172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303946
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56595	NC_015966	G	6	6	2396608	2396613	0 %	0 %	100 %	0 %	345303948
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56729	NC_015966	CTG	2	6	2401751	2401756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303954
56730	NC_015966	TCG	2	6	2401767	2401772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303954
56731	NC_015966	TGA	2	6	2401782	2401787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303954
56732	NC_015966	ATG	3	9	2401796	2401804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303954
56733	NC_015966	GCC	2	6	2401807	2401812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303954
56734	NC_015966	GCT	3	9	2401837	2401845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303954
56735	NC_015966	GTG	2	6	2401874	2401879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303954
56736	NC_015966	TCGT	2	8	2401887	2401894	0 %	50 %	25 %	25 %	345303954
56737	NC_015966	CGG	2	6	2401903	2401908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303954
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56741	NC_015966	TGC	2	6	2402107	2402112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303955
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56746	NC_015966	TGC	2	6	2402234	2402239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303956
56747	NC_015966	TGC	2	6	2402264	2402269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303956
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56754	NC_015966	CTG	3	9	2402437	2402445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303956
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56759	NC_015966	GTG	2	6	2402626	2402631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303956
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56766	NC_015966	GC	3	6	2402803	2402808	0 %	0 %	50 %	50 %	345303956
56767	NC_015966	GTC	2	6	2402809	2402814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303956
56768	NC_015966	GCT	2	6	2402853	2402858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303956
56769	NC_015966	CGA	3	9	2402931	2402939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303956
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56773	NC_015966	CGTC	2	8	2402996	2403003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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56779	NC_015966	GC	3	6	2403258	2403263	0 %	0 %	50 %	50 %	345303957
56780	NC_015966	TGA	2	6	2403268	2403273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303957
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56782	NC_015966	GCC	2	6	2403343	2403348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303957
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56784	NC_015966	TGC	2	6	2403643	2403648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303957
56785	NC_015966	GGC	2	6	2403653	2403658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303957
56786	NC_015966	GCT	4	12	2403674	2403685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303957
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56790	NC_015966	TGC	2	6	2403856	2403861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303957
56791	NC_015966	TCCG	2	8	2403917	2403924	0 %	25 %	25 %	50 %	345303957
56792	NC_015966	CG	3	6	2403937	2403942	0 %	0 %	50 %	50 %	345303957
56793	NC_015966	GCGCTG	2	12	2403984	2403995	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345303957
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56798	NC_015966	GCG	2	6	2404235	2404240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303958
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56800	NC_015966	CAG	2	6	2404265	2404270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303958
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56802	NC_015966	CTG	2	6	2404317	2404322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
56803	NC_015966	CCA	2	6	2404336	2404341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303958
56804	NC_015966	CTG	2	6	2404365	2404370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
56805	NC_015966	TGC	2	6	2404423	2404428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
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56807	NC_015966	TCG	2	6	2404525	2404530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
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56812	NC_015966	GCC	2	6	2404629	2404634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303958
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56814	NC_015966	GAA	2	6	2404731	2404736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303958
56815	NC_015966	TCA	2	6	2404816	2404821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303958
56816	NC_015966	CAT	2	6	2404832	2404837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303958
56817	NC_015966	GCA	2	6	2404862	2404867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303958
56818	NC_015966	GCC	2	6	2404878	2404883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303958
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56823	NC_015966	GCT	2	6	2405048	2405053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
56824	NC_015966	GTT	2	6	2405075	2405080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303958
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56827	NC_015966	CTG	2	6	2405139	2405144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
56828	NC_015966	CGT	2	6	2405154	2405159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
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56830	NC_015966	GCC	2	6	2405175	2405180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303958
56831	NC_015966	GCCG	2	8	2405186	2405193	0 %	0 %	50 %	50 %	345303958
56832	NC_015966	C	6	6	2405215	2405220	0 %	0 %	0 %	100 %	345303958
56833	NC_015966	ACCG	2	8	2405222	2405229	25 %	0 %	25 %	50 %	345303958
56834	NC_015966	CAGC	2	8	2405237	2405244	25 %	0 %	25 %	50 %	345303958
56835	NC_015966	GCTGGA	2	12	2405261	2405272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345303958
56836	NC_015966	CTG	2	6	2405322	2405327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
56837	NC_015966	TGC	2	6	2405341	2405346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
56838	NC_015966	CCG	2	6	2405382	2405387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303958
56839	NC_015966	ACA	2	6	2405401	2405406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303958
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56841	NC_015966	GCT	2	6	2405492	2405497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303958
56842	NC_015966	GAA	2	6	2405511	2405516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303958
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56943	NC_015966	CAT	2	6	2409967	2409972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303963
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56951	NC_015966	CG	3	6	2410189	2410194	0 %	0 %	50 %	50 %	345303963
56952	NC_015966	CTA	2	6	2410264	2410269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303963
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56954	NC_015966	AGCGCA	2	12	2410293	2410304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303963
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56992	NC_015966	GCA	2	6	2411578	2411583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303963
56993	NC_015966	GCT	2	6	2411584	2411589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303963
56994	NC_015966	GCG	2	6	2411596	2411601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303963
56995	NC_015966	CAG	2	6	2411603	2411608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303963
56996	NC_015966	TGGC	2	8	2411621	2411628	0 %	25 %	50 %	25 %	345303963
56997	NC_015966	CGA	2	6	2411706	2411711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56998	NC_015966	GC	3	6	2411787	2411792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56999	NC_015966	CCG	2	6	2411872	2411877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303964
57000	NC_015966	CGT	2	6	2411905	2411910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303964

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