MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_015966	CG	3	6	187610	187615	0 %	0 %	50 %	50 %	345302058
4503	NC_015966	GAT	2	6	187656	187661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302058
4504	NC_015966	TCG	2	6	187757	187762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302058
4505	NC_015966	GTG	2	6	187783	187788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302058
4506	NC_015966	CGG	2	6	187801	187806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302058
4507	NC_015966	GTG	2	6	187882	187887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302058
4508	NC_015966	GCA	2	6	187896	187901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302058
4509	NC_015966	ATG	3	9	187909	187917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302058
4510	NC_015966	AGC	2	6	187931	187936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302058
4511	NC_015966	CAC	3	9	187944	187952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302058
4512	NC_015966	CGT	2	6	188035	188040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302059
4513	NC_015966	GGC	2	6	188071	188076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302059
4514	NC_015966	GAG	2	6	188096	188101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302059
4515	NC_015966	CAG	2	6	188132	188137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302059
4516	NC_015966	GCC	2	6	188156	188161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302059
4517	NC_015966	GC	3	6	188171	188176	0 %	0 %	50 %	50 %	345302059
4518	NC_015966	TGC	2	6	188193	188198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302059
4519	NC_015966	GACG	2	8	188209	188216	25 %	0 %	50 %	25 %	345302059
4520	NC_015966	GGC	2	6	188227	188232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302059
4521	NC_015966	GC	3	6	188262	188267	0 %	0 %	50 %	50 %	345302059
4522	NC_015966	CAA	2	6	188281	188286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302059
4523	NC_015966	CCGG	2	8	188299	188306	0 %	0 %	50 %	50 %	345302059
4524	NC_015966	GAT	2	6	188401	188406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302059
4525	NC_015966	CGG	2	6	188411	188416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302059
4526	NC_015966	TCT	2	6	188427	188432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302059
4527	NC_015966	CTG	2	6	188501	188506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302059
4528	NC_015966	GTG	2	6	188519	188524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302059
4529	NC_015966	GAA	2	6	188528	188533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302059
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4532	NC_015966	ACC	2	6	188667	188672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302059
4533	NC_015966	ATC	2	6	188699	188704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302059
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4538	NC_015966	CGCAG	2	10	188935	188944	20 %	0 %	40 %	40 %	345302060
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4553	NC_015966	GCC	2	6	189634	189639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302060
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4557	NC_015966	CCA	2	6	189745	189750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302060
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4562	NC_015966	GTA	2	6	190019	190024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302060
4563	NC_015966	CAGCG	2	10	190061	190070	20 %	0 %	40 %	40 %	345302060
4564	NC_015966	TCG	2	6	190074	190079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302060
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4567	NC_015966	TCA	2	6	190166	190171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_015966	TG	3	6	190205	190210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015966	ACGC	2	8	190277	190284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_015966	TGA	2	6	190321	190326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302061
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4572	NC_015966	GC	3	6	190360	190365	0 %	0 %	50 %	50 %	345302061
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4603	NC_015966	GC	3	6	191848	191853	0 %	0 %	50 %	50 %	345302063
4604	NC_015966	CAG	2	6	191855	191860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302063
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4610	NC_015966	GGAC	2	8	192066	192073	25 %	0 %	50 %	25 %	345302064
4611	NC_015966	TCG	2	6	192116	192121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302064
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4619	NC_015966	T	6	6	192392	192397	0 %	100 %	0 %	0 %	345302064
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4621	NC_015966	GCC	2	6	192622	192627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302065
4622	NC_015966	GCC	2	6	192630	192635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302065
4623	NC_015966	GCG	2	6	192749	192754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302065
4624	NC_015966	CGA	2	6	192755	192760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302065
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4728	NC_015966	A	6	6	196707	196712	100 %	0 %	0 %	0 %	345302068
4729	NC_015966	CAG	2	6	196722	196727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302068
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4731	NC_015966	CAG	2	6	196749	196754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302068
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4733	NC_015966	CAC	2	6	196842	196847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302068
4734	NC_015966	CAC	2	6	196893	196898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302068
4735	NC_015966	GGC	2	6	196920	196925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302068
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4739	NC_015966	AGCCC	2	10	197111	197120	20 %	0 %	20 %	60 %	345302068
4740	NC_015966	GCA	2	6	197147	197152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302068
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4742	NC_015966	GGT	2	6	197223	197228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302068
4743	NC_015966	CGC	2	6	197235	197240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302068
4744	NC_015966	CGCC	2	8	197258	197265	0 %	0 %	25 %	75 %	345302068
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4754	NC_015966	TCG	2	6	197569	197574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302068
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4861	NC_015966	GCA	2	6	202009	202014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4864	NC_015966	ATT	2	6	202237	202242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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