MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015866	AAAGTA	2	12	1471	1482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583224
2	NC_015866	AAAACC	2	12	5311	5322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583227
3	NC_015866	CAAAAT	2	12	6163	6174	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	341583227
4	NC_015866	ACCGTA	2	12	7747	7758	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341583230
5	NC_015866	AGAAAA	2	12	14286	14297	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	341583237
6	NC_015866	ATTAAA	2	12	15462	15473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583238
7	NC_015866	TTTAAA	2	12	17059	17070	50 %	50 %	0 %	0 %	341583240
8	NC_015866	CTAATT	2	12	17108	17119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	341583240
9	NC_015866	CTATAT	2	12	17723	17734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	341583240
10	NC_015866	AAAACA	2	12	18290	18301	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015866	CAAAGT	2	12	20715	20726	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	341583243
12	NC_015866	ATTTAG	2	12	22453	22464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	341583243
13	NC_015866	AGGAAA	2	12	22812	22823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
14	NC_015866	CAGATG	2	12	23185	23196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341583243
15	NC_015866	GAAGCT	2	12	23466	23477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341583243
16	NC_015866	GCATTA	2	12	24741	24752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341583243
17	NC_015866	TCCGAT	2	12	24858	24869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	341583243
18	NC_015866	ATTTAA	2	12	25256	25267	50 %	50 %	0 %	0 %	341583243
19	NC_015866	AGAAAA	2	12	26677	26688	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	341583245
20	NC_015866	CAAATA	2	12	27483	27494	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015866	TAAAGT	2	12	27651	27662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583248
22	NC_015866	CATATA	2	12	34173	34184	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341583257
23	NC_015866	AATACA	2	12	37595	37606	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	341583261
24	NC_015866	TTTTTG	2	12	38167	38178	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	341583262
25	NC_015866	AAGAAA	2	12	39094	39105	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015866	TTTTAT	2	12	39353	39364	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015866	ATCTTT	2	12	41534	41545	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015866	ATATTA	2	12	45148	45159	50 %	50 %	0 %	0 %	341583271
29	NC_015866	TACTAA	2	12	45536	45547	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015866	ATTAAT	2	12	45895	45906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015866	ATACTG	2	12	45981	45992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341583272
32	NC_015866	TTAAGG	2	12	46215	46226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583272
33	NC_015866	TTAAAG	2	12	47951	47962	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583274
34	NC_015866	ATTTTT	2	12	48481	48492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	341583275
35	NC_015866	GAGTAT	2	12	53050	53061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583281
36	NC_015866	ATTGCT	2	12	57510	57521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583285
37	NC_015866	ATTTAT	2	12	58097	58108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583286
38	NC_015866	ATAAGG	2	12	58296	58307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	341583286
39	NC_015866	ATCAGA	2	12	62151	62162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	341583292
40	NC_015866	TGGTGT	2	12	66882	66893	0 %	50 %	50 %	0 %	341583295
41	NC_015866	ATAAAA	2	12	70732	70743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015866	ATTTAT	2	12	70765	70776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015866	TAATAT	2	12	71583	71594	50 %	50 %	0 %	0 %	341583301
44	NC_015866	CAGCAA	2	12	72251	72262	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	341583302
45	NC_015866	ATAGTG	2	12	72582	72593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583302
46	NC_015866	ATTACT	2	12	72659	72670	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	341583302
47	NC_015866	AAAAAG	2	12	73410	73421	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	341583302
48	NC_015866	TATAGT	2	12	77169	77180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	341583306
49	NC_015866	GAAAGA	2	12	77250	77261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583306
50	NC_015866	AAAGCT	2	12	79366	79377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	341583309
51	NC_015866	GTAATA	2	12	80005	80016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583309
52	NC_015866	AGTAAA	2	12	88698	88709	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583318
53	NC_015866	AAGGAC	2	12	90588	90599	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	341583320
54	NC_015866	CGTGAT	2	12	91557	91568	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341583324
55	NC_015866	TTGATT	2	12	94017	94028	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	341583325
56	NC_015866	CCAAAG	2	12	94916	94927	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	341583326
57	NC_015866	GAAGCA	2	12	95109	95120	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	341583326
58	NC_015866	TTTTAA	2	12	95382	95393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015866	TAAAGG	2	12	97215	97226	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	341583327
60	NC_015866	TTTAAT	2	12	99629	99640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015866	TTTTTA	2	12	100242	100253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	341583329
62	NC_015866	CCTATA	2	12	105089	105100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583335
63	NC_015866	ACCTAT	2	12	105322	105333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583335
64	NC_015866	ACCGCT	2	12	106670	106681	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341583336
65	NC_015866	TGTATT	2	12	112401	112412	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	341583341
66	NC_015866	ACTAGT	2	12	119754	119765	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015866	TAGCGG	2	12	121521	121532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341583347
68	NC_015866	CTTTTT	2	12	121880	121891	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	341583347
69	NC_015866	CTCAAT	2	12	124838	124849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583350
70	NC_015866	TTTATT	2	12	127040	127051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	341583354
71	NC_015866	TAAAAT	2	12	131025	131036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583357
72	NC_015866	TATTTT	2	12	133082	133093	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015866	CTTTGT	2	12	138274	138285	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	341583367
74	NC_015866	TTGCTA	2	12	140364	140375	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583368
75	NC_015866	AAGATA	2	12	140529	140540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583368
76	NC_015866	CTTTAG	2	12	140691	140702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583368
77	NC_015866	TTTAGT	2	12	141350	141361	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	341583368
78	NC_015866	TATACC	2	12	144032	144043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583369
79	NC_015866	TAATGC	2	12	145121	145132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341583370
80	NC_015866	GATTCC	2	12	145355	145366	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	341583370
81	NC_015866	AAAGAT	2	12	145944	145955	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583370
82	NC_015866	TAAAGA	2	12	146168	146179	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583370
83	NC_015866	TTTATC	2	12	158922	158933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	341583379
84	NC_015866	GATTTT	2	12	159216	159227	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	341583380
85	NC_015866	TCATTG	2	12	160145	160156	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015866	CTTTTG	2	12	161773	161784	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	341583382
87	NC_015866	GTAAAA	2	12	163097	163108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583383
88	NC_015866	CAATAT	2	12	166040	166051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341583388
89	NC_015866	ATTGAG	2	12	166391	166402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583389
90	NC_015866	AAAGAA	2	12	169032	169043	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	341583391
91	NC_015866	TCAAGC	2	12	169049	169060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341583391
92	NC_015866	GTTGAG	2	12	169604	169615	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	341583392
93	NC_015866	ATCTAA	2	12	170241	170252	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341583392
94	NC_015866	AAGTAA	2	12	171400	171411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583393
95	NC_015866	TTTTAA	2	12	172815	172826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015866	TAGAGC	2	12	174252	174263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341583398
97	NC_015866	AATTTA	2	12	176564	176575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015866	GAACAA	2	12	177761	177772	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	341583402
99	NC_015866	ATAAAA	2	12	179178	179189	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	341583402
100	NC_015866	TTTTTA	2	12	180240	180251	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	341583403
101	NC_015866	CTGTAG	2	12	183235	183246	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341583408
102	NC_015866	TTAAAA	2	12	185478	185489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583409
103	NC_015866	ATAATT	2	12	193431	193442	50 %	50 %	0 %	0 %	341583411
104	NC_015866	GATGTT	2	12	195324	195335	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	341583412
105	NC_015866	AAAAAT	2	12	197804	197815	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	341583415
106	NC_015866	AAGCCC	2	12	206826	206837	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	341583421
107	NC_015866	TATTTA	2	12	212651	212662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015866	AAATGA	2	12	213968	213979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015866	CTTTAG	2	12	215926	215937	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583430
110	NC_015866	TGCCGA	2	12	216416	216427	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341583430
111	NC_015866	ATATTT	2	12	216915	216926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583430
112	NC_015866	GTTTCA	2	12	220205	220216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583434
113	NC_015866	AAAAGC	2	12	221391	221402	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	341583435
114	NC_015866	TTTCTT	2	12	222840	222851	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	341583437
115	NC_015866	AAATTA	2	12	224013	224024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583439
116	NC_015866	AGTTAA	2	12	225948	225959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583440
117	NC_015866	TCATAA	2	12	227925	227936	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341583441
118	NC_015866	TAAATT	2	12	229625	229636	50 %	50 %	0 %	0 %	341583443
119	NC_015866	CACTAC	2	12	231133	231144	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015866	AGCTTC	2	12	233076	233087	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015866	CTAGCA	2	12	233466	233477	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341583445
122	NC_015866	AAAGCA	2	12	237171	237182	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	341583451
123	NC_015866	GTACGA	2	12	241216	241227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341583455
124	NC_015866	CTTCTA	2	12	242213	242224	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	341583455
125	NC_015866	ATCTCA	2	12	244981	244992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583457
126	NC_015866	TTCTTT	2	12	246374	246385	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	341583458
127	NC_015866	TAGGGA	2	12	246813	246824	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	341583458
128	NC_015866	TACTTC	2	12	248710	248721	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	341583462
129	NC_015866	TATTTT	2	12	257373	257384	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015866	CAATAT	2	12	257788	257799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341583472
131	NC_015866	AAATTT	2	12	262970	262981	50 %	50 %	0 %	0 %	341583475
132	NC_015866	GCACCG	2	12	265399	265410	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	341583480
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134	NC_015866	AAATAA	2	12	265868	265879	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015866	TAAAAA	2	12	265920	265931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015866	TGCAGT	2	12	267172	267183	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341583484
137	NC_015866	CTATAT	2	12	272687	272698	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	341583491
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139	NC_015866	TGTAAT	2	12	278985	278996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015866	TTAAAG	2	12	281370	281381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583498
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145	NC_015866	TAAAAT	2	12	287246	287257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015866	CCTGAA	2	12	288864	288875	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015866	GCCTTT	2	12	291159	291170	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_015866	CCTGAA	2	12	296102	296113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341583513
153	NC_015866	TATTGT	2	12	297816	297827	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_015866	TCAATA	2	12	310524	310535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_015866	ATCTTT	2	12	310600	310611	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	341583528
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181	NC_015866	AATTTA	2	12	347845	347856	50 %	50 %	0 %	0 %	341583572
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233	NC_015866	TGTAGG	2	12	471197	471208	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_015866	TTTCAG	2	12	482969	482980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583709
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349	NC_015866	TACAAA	2	12	716092	716103	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
350	NC_015866	ATTATA	2	12	718240	718251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
351	NC_015866	TAAAGA	2	12	725342	725353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583955
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355	NC_015866	TATTTT	2	12	739637	739648	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
356	NC_015866	CGGCAT	2	12	742454	742465	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341583971
357	NC_015866	TTAAAT	2	12	745279	745290	50 %	50 %	0 %	0 %	341583977
358	NC_015866	TGCTAC	2	12	751877	751888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	341583985
359	NC_015866	TAAAGC	2	12	756915	756926	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
360	NC_015866	AAGTAA	2	12	763041	763052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
361	NC_015866	GATTAT	2	12	764423	764434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	341583996
362	NC_015866	ATGCCG	2	12	765408	765419	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341583996
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364	NC_015866	ATTGAT	2	12	767190	767201	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	341583997
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369	NC_015866	CTACCG	2	12	774791	774802	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341584003
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375	NC_015866	ATAATT	2	12	790809	790820	50 %	50 %	0 %	0 %	341584023
376	NC_015866	AAATTT	2	12	791408	791419	50 %	50 %	0 %	0 %	341584023
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388	NC_015866	AATCAA	2	12	824897	824908	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	341584053
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463	NC_015866	ATATCC	2	12	993004	993015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_015866	ATTAGG	2	12	998308	998319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
465	NC_015866	AATTAT	2	12	1001161	1001172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_015866	ATCAAT	2	12	1002112	1002123	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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470	NC_015866	AATTTA	2	12	1022354	1022365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_015866	AGACCT	2	12	1025584	1025595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341584260
472	NC_015866	TAGCTA	2	12	1026623	1026634	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341584260
473	NC_015866	CAAATT	2	12	1032934	1032945	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341584266
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