MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 32706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015866	GGT	2	6	159330	159335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583380
4002	NC_015866	AGGTG	2	10	159410	159419	20 %	20 %	60 %	0 %	341583380
4003	NC_015866	GTA	3	9	159466	159474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583380
4004	NC_015866	GAA	2	6	159477	159482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583380
4005	NC_015866	TTAA	2	8	159504	159511	50 %	50 %	0 %	0 %	341583380
4006	NC_015866	TTG	2	6	159565	159570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583380
4007	NC_015866	TGC	2	6	159767	159772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583380
4008	NC_015866	TAT	2	6	159782	159787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583380
4009	NC_015866	GTA	2	6	159810	159815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583380
4010	NC_015866	AT	3	6	159816	159821	50 %	50 %	0 %	0 %	341583380
4011	NC_015866	A	8	8	159855	159862	100 %	0 %	0 %	0 %	341583380
4012	NC_015866	T	6	6	159999	160004	0 %	100 %	0 %	0 %	341583380
4013	NC_015866	ATA	2	6	160008	160013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583380
4014	NC_015866	TGTT	2	8	160060	160067	0 %	75 %	25 %	0 %	341583380
4015	NC_015866	TAA	2	6	160079	160084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583380
4016	NC_015866	A	6	6	160083	160088	100 %	0 %	0 %	0 %	341583380
4017	NC_015866	TTG	2	6	160127	160132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015866	TCATTG	2	12	160145	160156	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4019	NC_015866	AGA	3	9	160276	160284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583381
4020	NC_015866	GCA	2	6	160309	160314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583381
4021	NC_015866	AAG	2	6	160337	160342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583381
4022	NC_015866	GAG	2	6	160344	160349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583381
4023	NC_015866	GAG	2	6	160431	160436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583381
4024	NC_015866	TAG	2	6	160503	160508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583381
4025	NC_015866	AT	3	6	160551	160556	50 %	50 %	0 %	0 %	341583381
4026	NC_015866	TTGC	3	12	160588	160599	0 %	50 %	25 %	25 %	341583381
4027	NC_015866	AAT	2	6	160619	160624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583381
4028	NC_015866	AAG	2	6	160698	160703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583381
4029	NC_015866	ATTT	2	8	160748	160755	25 %	75 %	0 %	0 %	341583381
4030	NC_015866	GAA	2	6	160787	160792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583381
4031	NC_015866	A	6	6	160820	160825	100 %	0 %	0 %	0 %	341583381
4032	NC_015866	GCC	2	6	160843	160848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583381
4033	NC_015866	ACT	2	6	160883	160888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583381
4034	NC_015866	ATAA	2	8	160889	160896	75 %	25 %	0 %	0 %	341583381
4035	NC_015866	AGT	2	6	160912	160917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583381
4036	NC_015866	GAG	2	6	160935	160940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583381
4037	NC_015866	ATTG	2	8	161059	161066	25 %	50 %	25 %	0 %	341583381
4038	NC_015866	GTG	2	6	161079	161084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583381
4039	NC_015866	GTG	2	6	161088	161093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583381
4040	NC_015866	TTC	2	6	161128	161133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583381
4041	NC_015866	TAT	2	6	161221	161226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583381
4042	NC_015866	ATT	2	6	161249	161254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583381
4043	NC_015866	CATG	2	8	161284	161291	25 %	25 %	25 %	25 %	341583381
4044	NC_015866	ATG	2	6	161348	161353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583381
4045	NC_015866	A	6	6	161375	161380	100 %	0 %	0 %	0 %	341583381
4046	NC_015866	GAAA	2	8	161410	161417	75 %	0 %	25 %	0 %	341583381
4047	NC_015866	GAG	2	6	161549	161554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_015866	GCGA	2	8	161586	161593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_015866	ATA	2	6	161628	161633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015866	AAT	2	6	161700	161705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015866	ATA	2	6	161725	161730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583382
4052	NC_015866	TAA	2	6	161744	161749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583382
4053	NC_015866	CTTTTG	2	12	161773	161784	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	341583382
4054	NC_015866	TTA	2	6	161803	161808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583382
4055	NC_015866	TTA	2	6	161815	161820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583382
4056	NC_015866	TA	3	6	161877	161882	50 %	50 %	0 %	0 %	341583382
4057	NC_015866	ATT	2	6	161914	161919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583382
4058	NC_015866	T	7	7	161927	161933	0 %	100 %	0 %	0 %	341583382
4059	NC_015866	GTG	2	6	161983	161988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583382
4060	NC_015866	AT	3	6	162029	162034	50 %	50 %	0 %	0 %	341583382
4061	NC_015866	ATTG	2	8	162071	162078	25 %	50 %	25 %	0 %	341583382
4062	NC_015866	AT	4	8	162087	162094	50 %	50 %	0 %	0 %	341583382
4063	NC_015866	A	7	7	162102	162108	100 %	0 %	0 %	0 %	341583382
4064	NC_015866	TA	3	6	162132	162137	50 %	50 %	0 %	0 %	341583382
4065	NC_015866	TA	4	8	162230	162237	50 %	50 %	0 %	0 %	341583382
4066	NC_015866	GATA	2	8	162240	162247	50 %	25 %	25 %	0 %	341583382
4067	NC_015866	T	6	6	162262	162267	0 %	100 %	0 %	0 %	341583382
4068	NC_015866	ATA	2	6	162301	162306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583382
4069	NC_015866	TAG	2	6	162323	162328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583382
4070	NC_015866	ATTT	2	8	162377	162384	25 %	75 %	0 %	0 %	341583382
4071	NC_015866	CAA	2	6	162391	162396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583382
4072	NC_015866	TGG	2	6	162405	162410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583382
4073	NC_015866	TTA	2	6	162427	162432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583382
4074	NC_015866	ACA	2	6	162607	162612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583383
4075	NC_015866	GAT	2	6	162626	162631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583383
4076	NC_015866	TTTA	2	8	162694	162701	25 %	75 %	0 %	0 %	341583383
4077	NC_015866	ACTT	2	8	162790	162797	25 %	50 %	0 %	25 %	341583383
4078	NC_015866	A	6	6	162799	162804	100 %	0 %	0 %	0 %	341583383
4079	NC_015866	TA	3	6	162806	162811	50 %	50 %	0 %	0 %	341583383
4080	NC_015866	GAA	2	6	162827	162832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583383
4081	NC_015866	GGCG	2	8	162839	162846	0 %	0 %	75 %	25 %	341583383
4082	NC_015866	TAA	2	6	162856	162861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583383
4083	NC_015866	ATC	2	6	163026	163031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583383
4084	NC_015866	ACCT	2	8	163032	163039	25 %	25 %	0 %	50 %	341583383
4085	NC_015866	AT	3	6	163040	163045	50 %	50 %	0 %	0 %	341583383
4086	NC_015866	GTAAAA	2	12	163097	163108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583383
4087	NC_015866	AACA	2	8	163116	163123	75 %	0 %	0 %	25 %	341583383
4088	NC_015866	CA	3	6	163133	163138	50 %	0 %	0 %	50 %	341583383
4089	NC_015866	GCA	2	6	163160	163165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583383
4090	NC_015866	AG	3	6	163224	163229	50 %	0 %	50 %	0 %	341583384
4091	NC_015866	GCC	2	6	163257	163262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583384
4092	NC_015866	GCA	2	6	163263	163268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583384
4093	NC_015866	AC	3	6	163273	163278	50 %	0 %	0 %	50 %	341583384
4094	NC_015866	GAG	2	6	163287	163292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583384
4095	NC_015866	GAAGT	2	10	163326	163335	40 %	20 %	40 %	0 %	341583384
4096	NC_015866	TTA	2	6	163407	163412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583384
4097	NC_015866	AAT	2	6	163418	163423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583384
4098	NC_015866	ACT	2	6	163461	163466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583384
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4100	NC_015866	TAT	2	6	163484	163489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583384
4101	NC_015866	ATT	2	6	163617	163622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583384
4102	NC_015866	TGA	2	6	163640	163645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583384
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4104	NC_015866	T	6	6	163751	163756	0 %	100 %	0 %	0 %	341583384
4105	NC_015866	ATC	2	6	163765	163770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583384
4106	NC_015866	AT	3	6	163832	163837	50 %	50 %	0 %	0 %	341583384
4107	NC_015866	GAC	2	6	163878	163883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583384
4108	NC_015866	GCA	2	6	163911	163916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583384
4109	NC_015866	AG	3	6	163926	163931	50 %	0 %	50 %	0 %	341583384
4110	NC_015866	AGAA	2	8	163951	163958	75 %	0 %	25 %	0 %	341583384
4111	NC_015866	TAG	2	6	164035	164040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583384
4112	NC_015866	AG	4	8	164046	164053	50 %	0 %	50 %	0 %	341583384
4113	NC_015866	T	6	6	164133	164138	0 %	100 %	0 %	0 %	341583384
4114	NC_015866	ATTT	2	8	164152	164159	25 %	75 %	0 %	0 %	341583384
4115	NC_015866	AAT	2	6	164190	164195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583384
4116	NC_015866	TTG	2	6	164253	164258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015866	ATA	2	6	164309	164314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_015866	AAT	2	6	164336	164341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_015866	ATA	2	6	164346	164351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583385
4120	NC_015866	AGT	2	6	164390	164395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583385
4121	NC_015866	TAT	2	6	164435	164440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583385
4122	NC_015866	TCA	2	6	164465	164470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583385
4123	NC_015866	TTA	2	6	164482	164487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583385
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4365	NC_015866	GGTG	2	8	173232	173239	0 %	25 %	75 %	0 %	341583395
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4498	NC_015866	ATGC	2	8	178673	178680	25 %	25 %	25 %	25 %	341583402
4499	NC_015866	TAA	2	6	178681	178686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583402
4500	NC_015866	AAG	2	6	178701	178706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583402

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