MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 32706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015866	AAG	2	6	138151	138156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583367
3502	NC_015866	CTTTGT	2	12	138274	138285	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	341583367
3503	NC_015866	TTG	2	6	138366	138371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583367
3504	NC_015866	CAT	2	6	138425	138430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583367
3505	NC_015866	ATA	2	6	138453	138458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583367
3506	NC_015866	AT	3	6	138474	138479	50 %	50 %	0 %	0 %	341583367
3507	NC_015866	GCA	2	6	138488	138493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583367
3508	NC_015866	TA	3	6	138584	138589	50 %	50 %	0 %	0 %	341583367
3509	NC_015866	TAC	2	6	138703	138708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583367
3510	NC_015866	TTTTA	2	10	138722	138731	20 %	80 %	0 %	0 %	341583367
3511	NC_015866	TGA	2	6	138798	138803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583367
3512	NC_015866	T	6	6	138848	138853	0 %	100 %	0 %	0 %	341583367
3513	NC_015866	GAG	2	6	138864	138869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583367
3514	NC_015866	TAAT	2	8	138909	138916	50 %	50 %	0 %	0 %	341583367
3515	NC_015866	ATA	2	6	139038	139043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583367
3516	NC_015866	GAT	2	6	139211	139216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583367
3517	NC_015866	TA	3	6	139299	139304	50 %	50 %	0 %	0 %	341583367
3518	NC_015866	TGA	2	6	139357	139362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583367
3519	NC_015866	TGC	2	6	139474	139479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583367
3520	NC_015866	CAA	2	6	139508	139513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583367
3521	NC_015866	T	7	7	139527	139533	0 %	100 %	0 %	0 %	341583367
3522	NC_015866	AT	3	6	139591	139596	50 %	50 %	0 %	0 %	341583367
3523	NC_015866	TTAA	2	8	139598	139605	50 %	50 %	0 %	0 %	341583367
3524	NC_015866	CTA	2	6	139617	139622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583367
3525	NC_015866	T	6	6	139630	139635	0 %	100 %	0 %	0 %	341583367
3526	NC_015866	AG	3	6	139748	139753	50 %	0 %	50 %	0 %	341583367
3527	NC_015866	CTGT	2	8	139821	139828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3528	NC_015866	ATT	2	6	139939	139944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583368
3529	NC_015866	GTA	2	6	139950	139955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583368
3530	NC_015866	TGC	2	6	140088	140093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583368
3531	NC_015866	TTG	2	6	140118	140123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583368
3532	NC_015866	TC	3	6	140157	140162	0 %	50 %	0 %	50 %	341583368
3533	NC_015866	ATTT	2	8	140211	140218	25 %	75 %	0 %	0 %	341583368
3534	NC_015866	GCTTT	2	10	140298	140307	0 %	60 %	20 %	20 %	341583368
3535	NC_015866	TAA	2	6	140311	140316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583368
3536	NC_015866	AATT	2	8	140322	140329	50 %	50 %	0 %	0 %	341583368
3537	NC_015866	TTGCTA	2	12	140364	140375	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583368
3538	NC_015866	GAT	2	6	140405	140410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583368
3539	NC_015866	A	8	8	140432	140439	100 %	0 %	0 %	0 %	341583368
3540	NC_015866	TGA	2	6	140473	140478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583368
3541	NC_015866	AT	3	6	140510	140515	50 %	50 %	0 %	0 %	341583368
3542	NC_015866	AAGATA	2	12	140529	140540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	341583368
3543	NC_015866	AT	3	6	140593	140598	50 %	50 %	0 %	0 %	341583368
3544	NC_015866	TAA	2	6	140626	140631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583368
3545	NC_015866	CTTTAG	2	12	140691	140702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583368
3546	NC_015866	GATG	2	8	140723	140730	25 %	25 %	50 %	0 %	341583368
3547	NC_015866	AGT	2	6	140764	140769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583368
3548	NC_015866	TATGT	2	10	140948	140957	20 %	60 %	20 %	0 %	341583368
3549	NC_015866	T	6	6	140957	140962	0 %	100 %	0 %	0 %	341583368
3550	NC_015866	GCC	2	6	140992	140997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583368
3551	NC_015866	TA	3	6	141008	141013	50 %	50 %	0 %	0 %	341583368
3552	NC_015866	TGC	2	6	141172	141177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583368
3553	NC_015866	TCCG	2	8	141178	141185	0 %	25 %	25 %	50 %	341583368
3554	NC_015866	TCTT	2	8	141205	141212	0 %	75 %	0 %	25 %	341583368
3555	NC_015866	ATT	2	6	141270	141275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583368
3556	NC_015866	AT	3	6	141285	141290	50 %	50 %	0 %	0 %	341583368
3557	NC_015866	T	6	6	141331	141336	0 %	100 %	0 %	0 %	341583368
3558	NC_015866	TTTAGT	2	12	141350	141361	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	341583368
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3560	NC_015866	TATT	2	8	141373	141380	25 %	75 %	0 %	0 %	341583368
3561	NC_015866	ATG	2	6	141410	141415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583368
3562	NC_015866	TGC	2	6	141460	141465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583368
3563	NC_015866	CTC	2	6	141525	141530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583368
3564	NC_015866	ATT	2	6	141567	141572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583368
3565	NC_015866	TGG	2	6	141618	141623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583368
3566	NC_015866	AATT	2	8	141696	141703	50 %	50 %	0 %	0 %	341583368
3567	NC_015866	AGA	2	6	141715	141720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583368
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3569	NC_015866	GAT	2	6	141785	141790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583368
3570	NC_015866	AGT	2	6	141973	141978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583368
3571	NC_015866	GTTA	2	8	142048	142055	25 %	50 %	25 %	0 %	341583368
3572	NC_015866	TAG	2	6	142090	142095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583368
3573	NC_015866	AGCT	2	8	142098	142105	25 %	25 %	25 %	25 %	341583368
3574	NC_015866	TGC	2	6	142111	142116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583368
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3576	NC_015866	GCAA	2	8	142162	142169	50 %	0 %	25 %	25 %	341583368
3577	NC_015866	TGC	2	6	142207	142212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583368
3578	NC_015866	G	6	6	142219	142224	0 %	0 %	100 %	0 %	341583368
3579	NC_015866	AGG	2	6	142243	142248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583368
3580	NC_015866	GGA	2	6	142277	142282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583368
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3582	NC_015866	TGC	2	6	142330	142335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583368
3583	NC_015866	AAC	2	6	142363	142368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583368
3584	NC_015866	TCT	2	6	142382	142387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583368
3585	NC_015866	AGT	2	6	142415	142420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583368
3586	NC_015866	TGT	2	6	142435	142440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583368
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3588	NC_015866	CAC	2	6	142470	142475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583368
3589	NC_015866	CAC	2	6	142512	142517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583368
3590	NC_015866	ATA	2	6	142560	142565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583368
3591	NC_015866	A	6	6	142577	142582	100 %	0 %	0 %	0 %	341583368
3592	NC_015866	ATA	2	6	142590	142595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583368
3593	NC_015866	A	6	6	142610	142615	100 %	0 %	0 %	0 %	341583368
3594	NC_015866	AAT	2	6	142669	142674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583368
3595	NC_015866	GGA	3	9	142799	142807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583368
3596	NC_015866	AAG	3	9	142821	142829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583368
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3599	NC_015866	ATA	2	6	142911	142916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583368
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3601	NC_015866	TAGC	2	8	142981	142988	25 %	25 %	25 %	25 %	341583369
3602	NC_015866	ACT	2	6	143025	143030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583369
3603	NC_015866	TA	3	6	143067	143072	50 %	50 %	0 %	0 %	341583369
3604	NC_015866	GTTTT	2	10	143135	143144	0 %	80 %	20 %	0 %	341583369
3605	NC_015866	GTA	3	9	143158	143166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583369
3606	NC_015866	ATA	2	6	143230	143235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583369
3607	NC_015866	A	6	6	143286	143291	100 %	0 %	0 %	0 %	341583369
3608	NC_015866	CCT	2	6	143379	143384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583369
3609	NC_015866	A	6	6	143411	143416	100 %	0 %	0 %	0 %	341583369
3610	NC_015866	TTAA	2	8	143448	143455	50 %	50 %	0 %	0 %	341583369
3611	NC_015866	TAA	2	6	143495	143500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583369
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3613	NC_015866	TGC	2	6	143561	143566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583369
3614	NC_015866	T	6	6	143631	143636	0 %	100 %	0 %	0 %	341583369
3615	NC_015866	A	6	6	143677	143682	100 %	0 %	0 %	0 %	341583369
3616	NC_015866	TAA	2	6	143695	143700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583369
3617	NC_015866	TTG	2	6	143710	143715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583369
3618	NC_015866	TC	3	6	143724	143729	0 %	50 %	0 %	50 %	341583369
3619	NC_015866	GGT	2	6	143754	143759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583369
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3621	NC_015866	GAT	2	6	143834	143839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583369
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