MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 32706

< Previous12...54555657585960616263646566Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_015866	ATT	2	6	1270449	1270454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32502	NC_015866	A	6	6	1270464	1270469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32503	NC_015866	GTA	2	6	1270470	1270475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32504	NC_015866	AGA	2	6	1270481	1270486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32505	NC_015866	AAC	2	6	1270554	1270559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32506	NC_015866	GAA	2	6	1270572	1270577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32507	NC_015866	AGT	2	6	1270637	1270642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32508	NC_015866	TGA	2	6	1270664	1270669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32509	NC_015866	TTC	2	6	1270675	1270680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32510	NC_015866	A	8	8	1270681	1270688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32511	NC_015866	A	7	7	1270894	1270900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32512	NC_015866	ACA	2	6	1270909	1270914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32513	NC_015866	AGA	2	6	1270915	1270920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32514	NC_015866	TAT	2	6	1271037	1271042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32515	NC_015866	ATA	2	6	1271083	1271088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32516	NC_015866	TAT	2	6	1271098	1271103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32517	NC_015866	TGT	2	6	1271181	1271186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32518	NC_015866	ATT	2	6	1271187	1271192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584514
32519	NC_015866	TTA	2	6	1271237	1271242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584514
32520	NC_015866	ATTTA	2	10	1271266	1271275	40 %	60 %	0 %	0 %	341584514
32521	NC_015866	TGC	2	6	1271278	1271283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341584514
32522	NC_015866	T	6	6	1271311	1271316	0 %	100 %	0 %	0 %	341584514
32523	NC_015866	ATC	2	6	1271359	1271364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341584514
32524	NC_015866	TAT	2	6	1271385	1271390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584514
32525	NC_015866	TTC	2	6	1271413	1271418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32526	NC_015866	AT	4	8	1271428	1271435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32527	NC_015866	TTA	2	6	1271441	1271446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32528	NC_015866	CTT	2	6	1271507	1271512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32529	NC_015866	TTTAT	2	10	1271585	1271594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32530	NC_015866	TTA	2	6	1271688	1271693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32531	NC_015866	TTA	2	6	1271745	1271750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32532	NC_015866	GTT	2	6	1271828	1271833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32533	NC_015866	CAC	2	6	1271874	1271879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32534	NC_015866	TAC	2	6	1271911	1271916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32535	NC_015866	TTAA	2	8	1271922	1271929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32536	NC_015866	AT	3	6	1271932	1271937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32537	NC_015866	A	6	6	1271938	1271943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32538	NC_015866	ATG	2	6	1271993	1271998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32539	NC_015866	TAA	2	6	1272010	1272015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32540	NC_015866	T	7	7	1272065	1272071	0 %	100 %	0 %	0 %	341584515
32541	NC_015866	T	6	6	1272125	1272130	0 %	100 %	0 %	0 %	341584515
32542	NC_015866	ATT	2	6	1272136	1272141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584515
32543	NC_015866	T	8	8	1272149	1272156	0 %	100 %	0 %	0 %	341584515
32544	NC_015866	TTC	2	6	1272182	1272187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341584515
32545	NC_015866	AGG	2	6	1272231	1272236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341584515
32546	NC_015866	ATT	2	6	1272240	1272245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584515
32547	NC_015866	GATA	2	8	1272259	1272266	50 %	25 %	25 %	0 %	341584515
32548	NC_015866	TAA	2	6	1272284	1272289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584515
32549	NC_015866	TAT	2	6	1272321	1272326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584515
32550	NC_015866	TAT	2	6	1272537	1272542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584515
32551	NC_015866	TC	3	6	1272557	1272562	0 %	50 %	0 %	50 %	341584515
32552	NC_015866	AGC	2	6	1272766	1272771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341584515
32553	NC_015866	AT	3	6	1272792	1272797	50 %	50 %	0 %	0 %	341584515
32554	NC_015866	TAT	2	6	1272808	1272813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584515
32555	NC_015866	GAT	2	6	1272876	1272881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341584515
32556	NC_015866	CGG	2	6	1272897	1272902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341584515
32557	NC_015866	TTG	2	6	1272941	1272946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341584515
32558	NC_015866	AGA	2	6	1272996	1273001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341584515
32559	NC_015866	CAA	2	6	1273009	1273014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341584515
32560	NC_015866	TA	3	6	1273069	1273074	50 %	50 %	0 %	0 %	341584515
32561	NC_015866	CGG	2	6	1273152	1273157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341584515
32562	NC_015866	TAT	2	6	1273167	1273172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584515
32563	NC_015866	TAT	2	6	1273224	1273229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584515
32564	NC_015866	TGC	2	6	1273236	1273241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341584515
32565	NC_015866	ATG	2	6	1273264	1273269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341584515
32566	NC_015866	TAA	2	6	1273293	1273298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584515
32567	NC_015866	AGT	2	6	1273328	1273333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341584516
32568	NC_015866	A	6	6	1273374	1273379	100 %	0 %	0 %	0 %	341584516
32569	NC_015866	GAA	3	9	1273382	1273390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341584516
32570	NC_015866	CGG	3	9	1273450	1273458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341584516
32571	NC_015866	TC	3	6	1273472	1273477	0 %	50 %	0 %	50 %	341584516
32572	NC_015866	AT	3	6	1273512	1273517	50 %	50 %	0 %	0 %	341584516
32573	NC_015866	CGC	2	6	1273626	1273631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341584516
32574	NC_015866	TA	3	6	1273661	1273666	50 %	50 %	0 %	0 %	341584516
32575	NC_015866	GGC	2	6	1273688	1273693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341584516
32576	NC_015866	A	7	7	1273722	1273728	100 %	0 %	0 %	0 %	341584516
32577	NC_015866	AAG	2	6	1273758	1273763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341584516
32578	NC_015866	TAT	2	6	1273787	1273792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584516
32579	NC_015866	TGA	2	6	1273813	1273818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341584516
32580	NC_015866	GAG	2	6	1273851	1273856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341584516
32581	NC_015866	AAT	2	6	1273883	1273888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584516
32582	NC_015866	TGT	2	6	1273938	1273943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341584516
32583	NC_015866	AAGT	2	8	1273966	1273973	50 %	25 %	25 %	0 %	341584516
32584	NC_015866	AGAA	2	8	1273998	1274005	75 %	0 %	25 %	0 %	341584516
32585	NC_015866	AATTT	2	10	1274037	1274046	40 %	60 %	0 %	0 %	341584516
32586	NC_015866	T	6	6	1274142	1274147	0 %	100 %	0 %	0 %	341584516
32587	NC_015866	GT	3	6	1274182	1274187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32588	NC_015866	GAT	2	6	1274266	1274271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32589	NC_015866	ATTTT	2	10	1274285	1274294	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32590	NC_015866	T	7	7	1274291	1274297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32591	NC_015866	AT	3	6	1274335	1274340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32592	NC_015866	A	6	6	1274353	1274358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32593	NC_015866	T	6	6	1274394	1274399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32594	NC_015866	AAT	2	6	1274421	1274426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32595	NC_015866	T	6	6	1274443	1274448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32596	NC_015866	TCC	2	6	1274494	1274499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32597	NC_015866	TTC	2	6	1274521	1274526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32598	NC_015866	TGT	2	6	1274533	1274538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32599	NC_015866	ATT	2	6	1274539	1274544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32600	NC_015866	AATT	2	8	1274590	1274597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32601	NC_015866	TTCA	2	8	1274602	1274609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32602	NC_015866	TGA	2	6	1274682	1274687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32603	NC_015866	ATA	2	6	1274688	1274693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32604	NC_015866	ATTC	2	8	1274710	1274717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32605	NC_015866	ATTT	2	8	1274756	1274763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32606	NC_015866	CAT	2	6	1274778	1274783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32607	NC_015866	TA	3	6	1274982	1274987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32608	NC_015866	T	6	6	1274988	1274993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32609	NC_015866	T	6	6	1275043	1275048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32610	NC_015866	ACT	2	6	1275095	1275100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32611	NC_015866	CTA	2	6	1275115	1275120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32612	NC_015866	ACT	2	6	1275126	1275131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32613	NC_015866	ACC	2	6	1275136	1275141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32614	NC_015866	TTA	2	6	1275147	1275152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32615	NC_015866	TTC	2	6	1275160	1275165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32616	NC_015866	TTA	2	6	1275195	1275200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32617	NC_015866	TAT	2	6	1275212	1275217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32618	NC_015866	ATT	2	6	1275232	1275237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32619	NC_015866	T	6	6	1275236	1275241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32620	NC_015866	TAAA	2	8	1275259	1275266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32621	NC_015866	A	6	6	1275289	1275294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32622	NC_015866	ATAA	2	8	1275303	1275310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32623	NC_015866	AGTTA	2	10	1275317	1275326	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32624	NC_015866	TC	3	6	1275421	1275426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32625	NC_015866	GGA	2	6	1275460	1275465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32626	NC_015866	TAT	2	6	1275511	1275516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32627	NC_015866	ACC	2	6	1275549	1275554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32628	NC_015866	GGT	2	6	1275573	1275578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32629	NC_015866	TAAT	2	8	1275601	1275608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32630	NC_015866	CCAA	2	8	1275626	1275633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32631	NC_015866	ACCT	2	8	1275644	1275651	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32632	NC_015866	AG	3	6	1275737	1275742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32633	NC_015866	TAT	2	6	1275827	1275832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32634	NC_015866	CTTTC	2	10	1275843	1275852	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32635	NC_015866	CAT	2	6	1275887	1275892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32636	NC_015866	GTAA	2	8	1275907	1275914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32637	NC_015866	AT	3	6	1275942	1275947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32638	NC_015866	CAA	2	6	1276017	1276022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341584517
32639	NC_015866	CAA	2	6	1276182	1276187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341584517
32640	NC_015866	TTA	2	6	1276206	1276211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584517
32641	NC_015866	AAAT	2	8	1276218	1276225	75 %	25 %	0 %	0 %	341584517
32642	NC_015866	TGATA	2	10	1276317	1276326	40 %	40 %	20 %	0 %	341584517
32643	NC_015866	TAAA	2	8	1276342	1276349	75 %	25 %	0 %	0 %	341584517
32644	NC_015866	GACT	2	8	1276387	1276394	25 %	25 %	25 %	25 %	341584517
32645	NC_015866	ATAG	2	8	1276401	1276408	50 %	25 %	25 %	0 %	341584517
32646	NC_015866	TTA	2	6	1276428	1276433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32647	NC_015866	TTA	2	6	1276519	1276524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584518
32648	NC_015866	AT	3	6	1276538	1276543	50 %	50 %	0 %	0 %	341584518
32649	NC_015866	TAA	2	6	1276556	1276561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584518
32650	NC_015866	CTA	2	6	1276646	1276651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341584518
32651	NC_015866	T	7	7	1276701	1276707	0 %	100 %	0 %	0 %	341584518
32652	NC_015866	CTACT	2	10	1276766	1276775	20 %	40 %	0 %	40 %	341584518
32653	NC_015866	TAT	2	6	1276875	1276880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584518
32654	NC_015866	T	6	6	1276880	1276885	0 %	100 %	0 %	0 %	341584518
32655	NC_015866	ATA	2	6	1276907	1276912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584518
32656	NC_015866	TAAT	2	8	1276943	1276950	50 %	50 %	0 %	0 %	341584518
32657	NC_015866	AATATC	2	12	1277010	1277021	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	341584518
32658	NC_015866	A	6	6	1277032	1277037	100 %	0 %	0 %	0 %	341584518
32659	NC_015866	GAT	2	6	1277047	1277052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341584518
32660	NC_015866	AAT	2	6	1277089	1277094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584518
32661	NC_015866	T	7	7	1277115	1277121	0 %	100 %	0 %	0 %	341584518
32662	NC_015866	CTT	2	6	1277135	1277140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341584518
32663	NC_015866	TCT	2	6	1277185	1277190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341584518
32664	NC_015866	CTC	2	6	1277232	1277237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341584518
32665	NC_015866	AGA	2	6	1277253	1277258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341584518
32666	NC_015866	ACC	2	6	1277262	1277267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341584518
32667	NC_015866	T	6	6	1277282	1277287	0 %	100 %	0 %	0 %	341584518
32668	NC_015866	T	6	6	1277292	1277297	0 %	100 %	0 %	0 %	341584518
32669	NC_015866	CT	3	6	1277298	1277303	0 %	50 %	0 %	50 %	341584518
32670	NC_015866	ATT	2	6	1277314	1277319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584518
32671	NC_015866	ATA	2	6	1277326	1277331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584518
32672	NC_015866	ATTA	2	8	1277352	1277359	50 %	50 %	0 %	0 %	341584518
32673	NC_015866	ATAGA	2	10	1277370	1277379	60 %	20 %	20 %	0 %	341584518
32674	NC_015866	TTCTT	2	10	1277447	1277456	0 %	80 %	0 %	20 %	341584518
32675	NC_015866	CTTTC	2	10	1277545	1277554	0 %	60 %	0 %	40 %	341584519
32676	NC_015866	GAA	2	6	1277562	1277567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341584519
32677	NC_015866	T	6	6	1277577	1277582	0 %	100 %	0 %	0 %	341584519
32678	NC_015866	TAA	2	6	1277586	1277591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584519
32679	NC_015866	TAA	2	6	1277605	1277610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584519
32680	NC_015866	CACTC	2	10	1277649	1277658	20 %	20 %	0 %	60 %	341584519
32681	NC_015866	T	6	6	1277664	1277669	0 %	100 %	0 %	0 %	341584519
32682	NC_015866	CTT	2	6	1277712	1277717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341584519
32683	NC_015866	AAT	2	6	1277735	1277740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584519
32684	NC_015866	CTT	2	6	1277784	1277789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341584519
32685	NC_015866	T	6	6	1277807	1277812	0 %	100 %	0 %	0 %	341584519
32686	NC_015866	GAT	2	6	1277916	1277921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341584519
32687	NC_015866	T	6	6	1277928	1277933	0 %	100 %	0 %	0 %	341584519
32688	NC_015866	TAA	2	6	1277937	1277942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584519
32689	NC_015866	TAA	2	6	1277947	1277952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341584519
32690	NC_015866	TATTT	2	10	1277965	1277974	20 %	80 %	0 %	0 %	341584519
32691	NC_015866	AT	3	6	1277977	1277982	50 %	50 %	0 %	0 %	341584519
32692	NC_015866	T	6	6	1277986	1277991	0 %	100 %	0 %	0 %	341584519
32693	NC_015866	TTTTCC	2	12	1278010	1278021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341584519
32694	NC_015866	TCA	2	6	1278036	1278041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341584519
32695	NC_015866	T	7	7	1278094	1278100	0 %	100 %	0 %	0 %	341584519
32696	NC_015866	T	7	7	1278103	1278109	0 %	100 %	0 %	0 %	341584519
32697	NC_015866	ATT	2	6	1278110	1278115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584519
32698	NC_015866	GATT	2	8	1278144	1278151	25 %	50 %	25 %	0 %	341584519
32699	NC_015866	TCT	2	6	1278167	1278172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341584519
32700	NC_015866	AT	3	6	1278252	1278257	50 %	50 %	0 %	0 %	341584519
32701	NC_015866	A	6	6	1278261	1278266	100 %	0 %	0 %	0 %	341584519
32702	NC_015866	CAT	2	6	1278330	1278335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341584519
32703	NC_015866	T	6	6	1278353	1278358	0 %	100 %	0 %	0 %	341584519
32704	NC_015866	GTT	2	6	1278359	1278364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341584519
32705	NC_015866	T	6	6	1278373	1278378	0 %	100 %	0 %	0 %	341584519
32706	NC_015866	TTA	2	6	1278428	1278433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341584519

< Previous12...54555657585960616263646566Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.