MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 32706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015866	TAA	2	6	40821	40826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583264
1002	NC_015866	TTA	2	6	40828	40833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583264
1003	NC_015866	AT	3	6	40853	40858	50 %	50 %	0 %	0 %	341583264
1004	NC_015866	AGT	2	6	40860	40865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583264
1005	NC_015866	AGC	2	6	40956	40961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583264
1006	NC_015866	TTG	2	6	40997	41002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583264
1007	NC_015866	TTG	2	6	41028	41033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583264
1008	NC_015866	TA	3	6	41060	41065	50 %	50 %	0 %	0 %	341583264
1009	NC_015866	TAA	2	6	41124	41129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583264
1010	NC_015866	AT	3	6	41184	41189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015866	CTT	2	6	41261	41266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015866	CTGA	2	8	41272	41279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_015866	TAT	2	6	41309	41314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015866	AT	3	6	41330	41335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015866	AAT	2	6	41365	41370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015866	AT	3	6	41374	41379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015866	T	6	6	41427	41432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015866	TA	4	8	41437	41444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015866	ATCTTT	2	12	41534	41545	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1020	NC_015866	TAA	2	6	41570	41575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015866	CTTTT	2	10	41576	41585	0 %	80 %	0 %	20 %	341583265
1022	NC_015866	TAAA	2	8	41604	41611	75 %	25 %	0 %	0 %	341583265
1023	NC_015866	AGA	2	6	41696	41701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583265
1024	NC_015866	ATTT	2	8	41709	41716	25 %	75 %	0 %	0 %	341583265
1025	NC_015866	T	6	6	41749	41754	0 %	100 %	0 %	0 %	341583265
1026	NC_015866	TCT	2	6	41792	41797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583265
1027	NC_015866	TAA	2	6	41807	41812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583265
1028	NC_015866	ATT	2	6	41875	41880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015866	TA	3	6	41884	41889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015866	CTT	2	6	41919	41924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_015866	ATTA	2	8	41926	41933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015866	AT	3	6	41951	41956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015866	TCG	3	9	41966	41974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_015866	TTATT	2	10	41979	41988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015866	ATC	2	6	42013	42018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015866	TAA	2	6	42070	42075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015866	TTA	2	6	42098	42103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583266
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1039	NC_015866	ATTA	2	8	42142	42149	50 %	50 %	0 %	0 %	341583266
1040	NC_015866	TCT	2	6	42215	42220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583267
1041	NC_015866	CAT	2	6	42228	42233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583267
1042	NC_015866	TCT	2	6	42247	42252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583267
1043	NC_015866	ATT	2	6	42270	42275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583267
1044	NC_015866	ATT	2	6	42327	42332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583267
1045	NC_015866	AAAT	2	8	42351	42358	75 %	25 %	0 %	0 %	341583267
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1048	NC_015866	TAAT	2	8	42452	42459	50 %	50 %	0 %	0 %	341583267
1049	NC_015866	GTT	2	6	42470	42475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015866	T	7	7	42474	42480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015866	TAA	2	6	42484	42489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015866	A	6	6	42499	42504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015866	TAA	2	6	42517	42522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015866	ATTA	2	8	42523	42530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015866	GAT	2	6	42578	42583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015866	AT	3	6	42593	42598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015866	TAT	2	6	42614	42619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015866	AAAT	2	8	42620	42627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015866	TAA	2	6	42630	42635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015866	ATA	2	6	42654	42659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583268
1061	NC_015866	TAT	2	6	42673	42678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583268
1062	NC_015866	ATA	2	6	42713	42718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583268
1063	NC_015866	TTC	2	6	42736	42741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583268
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1066	NC_015866	ATTT	2	8	42875	42882	25 %	75 %	0 %	0 %	341583268
1067	NC_015866	TAC	2	6	42886	42891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583268
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1071	NC_015866	AGT	2	6	42973	42978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583268
1072	NC_015866	TTA	2	6	42981	42986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583268
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1075	NC_015866	GAT	2	6	43043	43048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583268
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1097	NC_015866	ATT	2	6	43873	43878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1100	NC_015866	TAT	2	6	43929	43934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583270
1101	NC_015866	TTA	2	6	44000	44005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583270
1102	NC_015866	T	6	6	44025	44030	0 %	100 %	0 %	0 %	341583270
1103	NC_015866	AT	3	6	44037	44042	50 %	50 %	0 %	0 %	341583270
1104	NC_015866	AT	3	6	44061	44066	50 %	50 %	0 %	0 %	341583270
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1111	NC_015866	ATT	2	6	44372	44377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583270
1112	NC_015866	AAT	2	6	44461	44466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583270
1113	NC_015866	CT	3	6	44475	44480	0 %	50 %	0 %	50 %	341583270
1114	NC_015866	GAT	2	6	44503	44508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583270
1115	NC_015866	AT	4	8	44549	44556	50 %	50 %	0 %	0 %	341583270
1116	NC_015866	TTG	2	6	44603	44608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015866	TACC	2	8	44708	44715	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_015866	AAAC	2	8	44716	44723	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_015866	TAAT	2	8	44792	44799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015866	ATTA	2	8	44827	44834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015866	CGT	2	6	44840	44845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_015866	AAAT	2	8	44846	44853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015866	TAAGT	2	10	44870	44879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015866	TAA	2	6	44923	44928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015866	T	8	8	44937	44944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015866	AGT	2	6	44966	44971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015866	GCT	2	6	44977	44982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015866	CGG	2	6	45003	45008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583271
1129	NC_015866	ATT	2	6	45011	45016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583271
1130	NC_015866	TCT	2	6	45032	45037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583271
1131	NC_015866	ATGA	2	8	45050	45057	50 %	25 %	25 %	0 %	341583271
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