MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 32706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015866	TGA	2	6	19970	19975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015866	AAT	2	6	20045	20050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015866	AGTA	2	8	20056	20063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015866	AT	3	6	20074	20079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015866	AAAC	2	8	20106	20113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_015866	A	6	6	20116	20121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015866	ATT	2	6	20169	20174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015866	TA	3	6	20194	20199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015866	ATTT	2	8	20213	20220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015866	TA	3	6	20242	20247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015866	TTTAA	2	10	20252	20261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015866	AAC	2	6	20293	20298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583243
513	NC_015866	A	7	7	20306	20312	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
514	NC_015866	AAT	2	6	20360	20365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583243
515	NC_015866	AAG	2	6	20398	20403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
516	NC_015866	TAA	2	6	20423	20428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583243
517	NC_015866	TTG	2	6	20430	20435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583243
518	NC_015866	CAG	2	6	20484	20489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583243
519	NC_015866	GTA	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583243
520	NC_015866	A	6	6	20704	20709	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
521	NC_015866	CAAAGT	2	12	20715	20726	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	341583243
522	NC_015866	TAA	2	6	20776	20781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583243
523	NC_015866	TAC	2	6	20846	20851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583243
524	NC_015866	TAC	2	6	20873	20878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583243
525	NC_015866	CAT	2	6	20893	20898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583243
526	NC_015866	ACC	2	6	20966	20971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583243
527	NC_015866	GCA	2	6	20994	20999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583243
528	NC_015866	CAA	2	6	21030	21035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583243
529	NC_015866	A	8	8	21107	21114	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
530	NC_015866	GCA	2	6	21129	21134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583243
531	NC_015866	GTAA	2	8	21141	21148	50 %	25 %	25 %	0 %	341583243
532	NC_015866	ATA	2	6	21168	21173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583243
533	NC_015866	A	8	8	21222	21229	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
534	NC_015866	A	6	6	21231	21236	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
535	NC_015866	AGC	2	6	21256	21261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583243
536	NC_015866	A	6	6	21274	21279	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
537	NC_015866	AGA	2	6	21284	21289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
538	NC_015866	TCAAG	2	10	21292	21301	40 %	20 %	20 %	20 %	341583243
539	NC_015866	ATAAA	2	10	21346	21355	80 %	20 %	0 %	0 %	341583243
540	NC_015866	AGAT	2	8	21395	21402	50 %	25 %	25 %	0 %	341583243
541	NC_015866	A	6	6	21418	21423	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
542	NC_015866	AGCA	2	8	21514	21521	50 %	0 %	25 %	25 %	341583243
543	NC_015866	TAA	2	6	21551	21556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583243
544	NC_015866	AAAT	2	8	21557	21564	75 %	25 %	0 %	0 %	341583243
545	NC_015866	AGT	2	6	21588	21593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583243
546	NC_015866	AGAAA	2	10	21608	21617	80 %	0 %	20 %	0 %	341583243
547	NC_015866	A	6	6	21615	21620	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
548	NC_015866	AAG	2	6	21622	21627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
549	NC_015866	GCT	2	6	21702	21707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583243
550	NC_015866	A	6	6	21714	21719	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
551	NC_015866	AATG	2	8	21758	21765	50 %	25 %	25 %	0 %	341583243
552	NC_015866	AGC	2	6	21790	21795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583243
553	NC_015866	ACCAT	2	10	21813	21822	40 %	20 %	0 %	40 %	341583243
554	NC_015866	AAC	2	6	21853	21858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583243
555	NC_015866	CAG	2	6	21897	21902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583243
556	NC_015866	ATTA	2	8	21996	22003	50 %	50 %	0 %	0 %	341583243
557	NC_015866	ATAG	2	8	22044	22051	50 %	25 %	25 %	0 %	341583243
558	NC_015866	ATAG	2	8	22056	22063	50 %	25 %	25 %	0 %	341583243
559	NC_015866	TAT	2	6	22285	22290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583243
560	NC_015866	ATC	2	6	22319	22324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583243
561	NC_015866	GAA	2	6	22332	22337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
562	NC_015866	ACA	2	6	22387	22392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583243
563	NC_015866	TTC	2	6	22415	22420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583243
564	NC_015866	ATTTAG	2	12	22453	22464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	341583243
565	NC_015866	AAC	2	6	22492	22497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583243
566	NC_015866	TAA	2	6	22528	22533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583243
567	NC_015866	AAT	2	6	22581	22586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583243
568	NC_015866	ACA	2	6	22610	22615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583243
569	NC_015866	A	6	6	22627	22632	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
570	NC_015866	GAT	2	6	22659	22664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583243
571	NC_015866	GAA	2	6	22707	22712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
572	NC_015866	AACA	2	8	22737	22744	75 %	0 %	0 %	25 %	341583243
573	NC_015866	TAATA	2	10	22748	22757	60 %	40 %	0 %	0 %	341583243
574	NC_015866	AG	3	6	22759	22764	50 %	0 %	50 %	0 %	341583243
575	NC_015866	CAAA	2	8	22791	22798	75 %	0 %	0 %	25 %	341583243
576	NC_015866	AGGAAA	2	12	22812	22823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
577	NC_015866	CAAAG	2	10	22840	22849	60 %	0 %	20 %	20 %	341583243
578	NC_015866	TAGT	2	8	22906	22913	25 %	50 %	25 %	0 %	341583243
579	NC_015866	A	6	6	22922	22927	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
580	NC_015866	AAC	2	6	22979	22984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583243
581	NC_015866	TTAGT	2	10	23008	23017	20 %	60 %	20 %	0 %	341583243
582	NC_015866	TC	3	6	23059	23064	0 %	50 %	0 %	50 %	341583243
583	NC_015866	CAG	2	6	23073	23078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583243
584	NC_015866	A	8	8	23128	23135	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
585	NC_015866	TAA	2	6	23171	23176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583243
586	NC_015866	CAGATG	2	12	23185	23196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341583243
587	NC_015866	GCC	2	6	23234	23239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583243
588	NC_015866	A	6	6	23261	23266	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
589	NC_015866	TA	3	6	23302	23307	50 %	50 %	0 %	0 %	341583243
590	NC_015866	CAA	2	6	23322	23327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583243
591	NC_015866	TAA	2	6	23353	23358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583243
592	NC_015866	GA	3	6	23405	23410	50 %	0 %	50 %	0 %	341583243
593	NC_015866	AT	3	6	23433	23438	50 %	50 %	0 %	0 %	341583243
594	NC_015866	GTA	2	6	23457	23462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583243
595	NC_015866	GAAGCT	2	12	23466	23477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341583243
596	NC_015866	A	6	6	23526	23531	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
597	NC_015866	CTA	2	6	23557	23562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583243
598	NC_015866	TA	3	6	23561	23566	50 %	50 %	0 %	0 %	341583243
599	NC_015866	GTTA	2	8	23574	23581	25 %	50 %	25 %	0 %	341583243
600	NC_015866	AT	3	6	23604	23609	50 %	50 %	0 %	0 %	341583243
601	NC_015866	ATT	2	6	23675	23680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583243
602	NC_015866	AGA	2	6	23723	23728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
603	NC_015866	ATT	2	6	23732	23737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583243
604	NC_015866	AAGC	2	8	23769	23776	50 %	0 %	25 %	25 %	341583243
605	NC_015866	AGC	2	6	23894	23899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583243
606	NC_015866	TGA	2	6	23963	23968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583243
607	NC_015866	ATCT	2	8	24001	24008	25 %	50 %	0 %	25 %	341583243
608	NC_015866	AAT	2	6	24042	24047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583243
609	NC_015866	A	7	7	24087	24093	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
610	NC_015866	ATG	2	6	24142	24147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583243
611	NC_015866	TGA	2	6	24278	24283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583243
612	NC_015866	AGT	2	6	24288	24293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583243
613	NC_015866	TGT	2	6	24299	24304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583243
614	NC_015866	TA	3	6	24357	24362	50 %	50 %	0 %	0 %	341583243
615	NC_015866	AGA	2	6	24392	24397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
616	NC_015866	AAG	2	6	24442	24447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
617	NC_015866	TA	3	6	24456	24461	50 %	50 %	0 %	0 %	341583243
618	NC_015866	A	6	6	24496	24501	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
619	NC_015866	ATG	2	6	24535	24540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583243
620	NC_015866	A	6	6	24541	24546	100 %	0 %	0 %	0 %	341583243
621	NC_015866	TTC	2	6	24548	24553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583243
622	NC_015866	GAA	2	6	24579	24584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
623	NC_015866	ATCT	2	8	24647	24654	25 %	50 %	0 %	25 %	341583243
624	NC_015866	GAA	2	6	24669	24674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
625	NC_015866	AAG	2	6	24676	24681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
626	NC_015866	GCATTA	2	12	24741	24752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341583243
627	NC_015866	GAA	2	6	24804	24809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
628	NC_015866	GAA	3	9	24834	24842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583243
629	NC_015866	TCCGAT	2	12	24858	24869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	341583243
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