MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 32706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015866	A	6	6	199601	199606	100 %	0 %	0 %	0 %	341583415
5002	NC_015866	GTT	2	6	199632	199637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015866	TTA	2	6	199643	199648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015866	GTA	2	6	199670	199675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015866	A	7	7	199712	199718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_015866	A	6	6	199722	199727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_015866	CAA	2	6	199856	199861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_015866	TTG	2	6	199871	199876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583416
5009	NC_015866	TCCT	2	8	199884	199891	0 %	50 %	0 %	50 %	341583416
5010	NC_015866	TTTG	2	8	199938	199945	0 %	75 %	25 %	0 %	341583416
5011	NC_015866	TCT	2	6	199960	199965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583416
5012	NC_015866	GTA	2	6	199969	199974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583416
5013	NC_015866	TAT	2	6	200014	200019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583416
5014	NC_015866	TTTA	2	8	200024	200031	25 %	75 %	0 %	0 %	341583416
5015	NC_015866	AAT	2	6	200059	200064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583416
5016	NC_015866	CT	3	6	200083	200088	0 %	50 %	0 %	50 %	341583416
5017	NC_015866	A	6	6	200095	200100	100 %	0 %	0 %	0 %	341583416
5018	NC_015866	AT	3	6	200114	200119	50 %	50 %	0 %	0 %	341583416
5019	NC_015866	TAA	2	6	200156	200161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583416
5020	NC_015866	T	7	7	200243	200249	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
5021	NC_015866	GTT	2	6	200307	200312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583416
5022	NC_015866	CAA	2	6	200329	200334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583416
5023	NC_015866	CTT	2	6	200434	200439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583416
5024	NC_015866	TTG	2	6	200474	200479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583416
5025	NC_015866	ATT	2	6	200487	200492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583416
5026	NC_015866	T	6	6	200495	200500	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
5027	NC_015866	ATT	2	6	200528	200533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583416
5028	NC_015866	ATT	2	6	200576	200581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583416
5029	NC_015866	AACC	2	8	200634	200641	50 %	0 %	0 %	50 %	341583416
5030	NC_015866	CTT	2	6	200704	200709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583416
5031	NC_015866	ATC	2	6	200759	200764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583416
5032	NC_015866	T	6	6	200796	200801	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
5033	NC_015866	T	7	7	200816	200822	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
5034	NC_015866	TCA	2	6	200826	200831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583416
5035	NC_015866	T	6	6	200833	200838	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
5036	NC_015866	TCA	2	6	200865	200870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583416
5037	NC_015866	AGC	2	6	200942	200947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583416
5038	NC_015866	TTGA	2	8	200986	200993	25 %	50 %	25 %	0 %	341583416
5039	NC_015866	A	6	6	201024	201029	100 %	0 %	0 %	0 %	341583416
5040	NC_015866	AGC	2	6	201119	201124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583416
5041	NC_015866	T	6	6	201150	201155	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
5042	NC_015866	A	6	6	201230	201235	100 %	0 %	0 %	0 %	341583416
5043	NC_015866	CTT	2	6	201289	201294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583416
5044	NC_015866	TAA	2	6	201311	201316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583416
5045	NC_015866	T	6	6	201403	201408	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
5046	NC_015866	GCA	2	6	201414	201419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583416
5047	NC_015866	TAAAA	2	10	201440	201449	80 %	20 %	0 %	0 %	341583416
5048	NC_015866	CTG	2	6	201493	201498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583416
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5050	NC_015866	TAGCA	2	10	201551	201560	40 %	20 %	20 %	20 %	341583416
5051	NC_015866	T	6	6	201569	201574	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
5052	NC_015866	TTC	2	6	201596	201601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583416
5053	NC_015866	ATC	2	6	201632	201637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583416
5054	NC_015866	ATT	2	6	201699	201704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583416
5055	NC_015866	T	6	6	201741	201746	0 %	100 %	0 %	0 %	341583416
5056	NC_015866	ATT	2	6	201747	201752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583416
5057	NC_015866	AT	3	6	201807	201812	50 %	50 %	0 %	0 %	341583416
5058	NC_015866	AGT	2	6	201821	201826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583416
5059	NC_015866	GTT	2	6	201934	201939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583416
5060	NC_015866	TAA	3	9	201944	201952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583416
5061	NC_015866	TTG	2	6	201956	201961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583416
5062	NC_015866	A	6	6	202011	202016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015866	GTT	2	6	202019	202024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015866	TCA	2	6	202041	202046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_015866	GCA	2	6	202062	202067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_015866	T	7	7	202107	202113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_015866	ATT	2	6	202114	202119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_015866	T	6	6	202118	202123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_015866	ATG	2	6	202156	202161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_015866	CAA	2	6	202176	202181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_015866	AAT	2	6	202193	202198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_015866	CAA	2	6	202223	202228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_015866	A	6	6	202312	202317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015866	TCT	2	6	202369	202374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583417
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5078	NC_015866	A	6	6	202633	202638	100 %	0 %	0 %	0 %	341583417
5079	NC_015866	AAAG	2	8	202714	202721	75 %	0 %	25 %	0 %	341583417
5080	NC_015866	ATA	2	6	202800	202805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583417
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5083	NC_015866	TCA	2	6	203018	203023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583417
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5085	NC_015866	GGC	2	6	203041	203046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583417
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5087	NC_015866	T	6	6	203128	203133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_015866	ATT	2	6	203268	203273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583418
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5092	NC_015866	T	6	6	203396	203401	0 %	100 %	0 %	0 %	341583418
5093	NC_015866	AGCA	2	8	203417	203424	50 %	0 %	25 %	25 %	341583418
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5098	NC_015866	GCT	2	6	203586	203591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583418
5099	NC_015866	TAT	2	6	203650	203655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583418
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5101	NC_015866	GAT	2	6	203708	203713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583418
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5106	NC_015866	TAA	2	6	203885	203890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_015866	AGTA	2	8	203897	203904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015866	TTA	2	6	203987	203992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_015866	GAC	2	6	203993	203998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_015866	ATTG	2	8	204040	204047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_015866	T	6	6	204062	204067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015866	TAA	2	6	204077	204082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_015866	GCA	2	6	204130	204135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_015866	A	6	6	204135	204140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_015866	ATA	2	6	204179	204184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583419
5116	NC_015866	TATT	2	8	204212	204219	25 %	75 %	0 %	0 %	341583419
5117	NC_015866	AAG	2	6	204257	204262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583419
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5123	NC_015866	TTA	2	6	204463	204468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583419
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5125	NC_015866	CGG	2	6	204486	204491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583419
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5127	NC_015866	T	6	6	204629	204634	0 %	100 %	0 %	0 %	341583419
5128	NC_015866	T	7	7	204659	204665	0 %	100 %	0 %	0 %	341583420
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5235	NC_015866	TAT	3	9	209636	209644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5238	NC_015866	ATT	2	6	209792	209797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_015866	T	6	6	209796	209801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_015866	GCT	2	6	209824	209829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5242	NC_015866	ACA	2	6	209889	209894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5244	NC_015866	ATTT	2	8	210001	210008	25 %	75 %	0 %	0 %	341583425
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5247	NC_015866	T	8	8	210105	210112	0 %	100 %	0 %	0 %	341583425
5248	NC_015866	TAA	2	6	210152	210157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583425
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5252	NC_015866	TCA	2	6	210304	210309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583425
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5373	NC_015866	ATT	2	6	214536	214541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5382	NC_015866	TAAAT	2	10	215222	215231	60 %	40 %	0 %	0 %	341583430
5383	NC_015866	TAA	2	6	215245	215250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583430
5384	NC_015866	TCC	2	6	215255	215260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583430
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5386	NC_015866	TA	3	6	215354	215359	50 %	50 %	0 %	0 %	341583430
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5401	NC_015866	AGCTA	2	10	215942	215951	40 %	20 %	20 %	20 %	341583430
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5404	NC_015866	ATTA	2	8	216017	216024	50 %	50 %	0 %	0 %	341583430
5405	NC_015866	CTT	2	6	216031	216036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583430
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5411	NC_015866	ATC	2	6	216239	216244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583430
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5439	NC_015866	TAG	2	6	217352	217357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5473	NC_015866	TAA	2	6	218483	218488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5478	NC_015866	AAATT	2	10	218708	218717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5479	NC_015866	TTTCT	2	10	218723	218732	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5485	NC_015866	ATA	2	6	218865	218870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583432
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5491	NC_015866	CTT	2	6	219260	219265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5493	NC_015866	AAT	2	6	219347	219352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583433
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5495	NC_015866	A	6	6	219395	219400	100 %	0 %	0 %	0 %	341583433
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5499	NC_015866	AGC	2	6	219562	219567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583433
5500	NC_015866	TTA	2	6	219600	219605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583433

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