MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_94

Total Repeats: 1821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015741	CTG	2	6	51028	51033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505938
1002	NC_015741	GCG	2	6	51054	51059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505938
1003	NC_015741	GTG	2	6	51125	51130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505938
1004	NC_015741	GAT	2	6	51185	51190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505938
1005	NC_015741	GCC	2	6	51204	51209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505938
1006	NC_015741	AC	3	6	51270	51275	50 %	0 %	0 %	50 %	339505938
1007	NC_015741	GCT	2	6	51315	51320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505938
1008	NC_015741	GCT	2	6	51361	51366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505938
1009	NC_015741	GTT	2	6	51389	51394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505938
1010	NC_015741	CAA	2	6	51406	51411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339505938
1011	NC_015741	TGC	2	6	51416	51421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505938
1012	NC_015741	GGC	2	6	51428	51433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505938
1013	NC_015741	GTGA	2	8	51473	51480	25 %	25 %	50 %	0 %	339505938
1014	NC_015741	GCT	2	6	51517	51522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505938
1015	NC_015741	CGG	2	6	51523	51528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505938
1016	NC_015741	TGA	2	6	51543	51548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505938
1017	NC_015741	CTGG	2	8	51611	51618	0 %	25 %	50 %	25 %	339505938
1018	NC_015741	CAC	2	6	51686	51691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339505939
1019	NC_015741	GC	4	8	51709	51716	0 %	0 %	50 %	50 %	339505939
1020	NC_015741	CAC	2	6	51751	51756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339505939
1021	NC_015741	GCT	2	6	51760	51765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505939
1022	NC_015741	CG	3	6	51892	51897	0 %	0 %	50 %	50 %	339505939
1023	NC_015741	GGC	2	6	51922	51927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505939
1024	NC_015741	AGA	2	6	51934	51939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339505939
1025	NC_015741	GC	3	6	51941	51946	0 %	0 %	50 %	50 %	339505939
1026	NC_015741	CG	3	6	51993	51998	0 %	0 %	50 %	50 %	339505939
1027	NC_015741	CCG	2	6	52109	52114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505939
1028	NC_015741	AC	3	6	52145	52150	50 %	0 %	0 %	50 %	339505939
1029	NC_015741	CAAG	2	8	52198	52205	50 %	0 %	25 %	25 %	339505939
1030	NC_015741	CTCG	2	8	52213	52220	0 %	25 %	25 %	50 %	339505939
1031	NC_015741	ACG	2	6	52352	52357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505939
1032	NC_015741	A	6	6	52392	52397	100 %	0 %	0 %	0 %	339505939
1033	NC_015741	TGC	2	6	52417	52422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505939
1034	NC_015741	TCA	2	6	52428	52433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505939
1035	NC_015741	TGT	2	6	52437	52442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505939
1036	NC_015741	GCC	2	6	52448	52453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505939
1037	NC_015741	TGG	2	6	52545	52550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505939
1038	NC_015741	ATC	2	6	52554	52559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505939
1039	NC_015741	AAG	2	6	52773	52778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339505939
1040	NC_015741	TGC	2	6	52809	52814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505939
1041	NC_015741	GC	5	10	52822	52831	0 %	0 %	50 %	50 %	339505939
1042	NC_015741	ACG	2	6	52925	52930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505939
1043	NC_015741	GC	3	6	52958	52963	0 %	0 %	50 %	50 %	339505939
1044	NC_015741	CAGTG	2	10	52978	52987	20 %	20 %	40 %	20 %	339505939
1045	NC_015741	GCA	2	6	53050	53055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505939
1046	NC_015741	GCAA	2	8	53061	53068	50 %	0 %	25 %	25 %	339505939
1047	NC_015741	CG	3	6	53085	53090	0 %	0 %	50 %	50 %	339505940
1048	NC_015741	GCA	2	6	53114	53119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505940
1049	NC_015741	CGC	2	6	53155	53160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505940
1050	NC_015741	CG	3	6	53189	53194	0 %	0 %	50 %	50 %	339505940
1051	NC_015741	CCA	2	6	53524	53529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339505940
1052	NC_015741	AAC	2	6	53593	53598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339505940
1053	NC_015741	CAT	2	6	53626	53631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505940
1054	NC_015741	GC	3	6	53679	53684	0 %	0 %	50 %	50 %	339505940
1055	NC_015741	CTGA	2	8	53718	53725	25 %	25 %	25 %	25 %	339505940
1056	NC_015741	ACT	2	6	53742	53747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015741	CCGCCT	2	12	53828	53839	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_015741	CATAA	2	10	53850	53859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_015741	CGG	2	6	53988	53993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015741	GCC	2	6	54017	54022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_015741	TG	3	6	54029	54034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015741	TCG	2	6	54081	54086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015741	CAC	3	9	54121	54129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_015741	TAA	2	6	54169	54174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015741	CAT	2	6	54204	54209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015741	TTC	2	6	54253	54258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505941
1067	NC_015741	GCT	2	6	54322	54327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505941
1068	NC_015741	CG	3	6	54357	54362	0 %	0 %	50 %	50 %	339505941
1069	NC_015741	GCAA	2	8	54394	54401	50 %	0 %	25 %	25 %	339505941
1070	NC_015741	AGC	2	6	54402	54407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505941
1071	NC_015741	CCT	2	6	54457	54462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_015741	TGAA	2	8	54463	54470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015741	TAA	2	6	54479	54484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015741	ATA	2	6	54508	54513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015741	TGC	2	6	54603	54608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015741	A	6	6	54609	54614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015741	CGGAC	2	10	54706	54715	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1078	NC_015741	TGTC	2	8	54832	54839	0 %	50 %	25 %	25 %	339505942
1079	NC_015741	CAT	2	6	54852	54857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505942
1080	NC_015741	GAA	2	6	54870	54875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339505942
1081	NC_015741	CTT	2	6	55021	55026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505942
1082	NC_015741	AGA	2	6	55096	55101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339505942
1083	NC_015741	TGC	2	6	55156	55161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505942
1084	NC_015741	CTG	2	6	55233	55238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505942
1085	NC_015741	TCT	2	6	55278	55283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505942
1086	NC_015741	ATC	2	6	55344	55349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505942
1087	NC_015741	CAA	2	6	55397	55402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339505942
1088	NC_015741	AAC	2	6	55416	55421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339505942
1089	NC_015741	CGG	2	6	55444	55449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505942
1090	NC_015741	CAG	2	6	55632	55637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505942
1091	NC_015741	GC	3	6	55724	55729	0 %	0 %	50 %	50 %	339505943
1092	NC_015741	GCT	2	6	55741	55746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505943
1093	NC_015741	CG	3	6	55787	55792	0 %	0 %	50 %	50 %	339505943
1094	NC_015741	AGT	2	6	55882	55887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505943
1095	NC_015741	CGC	2	6	55898	55903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505943
1096	NC_015741	CGT	2	6	55960	55965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505943
1097	NC_015741	TGT	2	6	55972	55977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505943
1098	NC_015741	CG	3	6	56003	56008	0 %	0 %	50 %	50 %	339505943
1099	NC_015741	TCA	2	6	56028	56033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505943
1100	NC_015741	C	6	6	56106	56111	0 %	0 %	0 %	100 %	339505943
1101	NC_015741	GCC	2	6	56121	56126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505943
1102	NC_015741	CCAGCC	2	12	56206	56217	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	339505943
1103	NC_015741	GGC	2	6	56237	56242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505943
1104	NC_015741	CCG	2	6	56251	56256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505943
1105	NC_015741	GCC	2	6	56267	56272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505943
1106	NC_015741	ATCA	2	8	56294	56301	50 %	25 %	0 %	25 %	339505943
1107	NC_015741	ATC	2	6	56322	56327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505943
1108	NC_015741	TGT	2	6	56461	56466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505943
1109	NC_015741	GAC	2	6	56483	56488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505943
1110	NC_015741	CCGC	2	8	56577	56584	0 %	0 %	25 %	75 %	339505943
1111	NC_015741	CGA	2	6	56602	56607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505943
1112	NC_015741	CGGT	2	8	56644	56651	0 %	25 %	50 %	25 %	339505943
1113	NC_015741	TTC	2	6	56661	56666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505943
1114	NC_015741	GCA	2	6	56726	56731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505943
1115	NC_015741	TGAT	2	8	56937	56944	25 %	50 %	25 %	0 %	339505943
1116	NC_015741	CTT	2	6	56947	56952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505943
1117	NC_015741	CTG	2	6	57004	57009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505943
1118	NC_015741	GAG	2	6	57062	57067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339505943
1119	NC_015741	TCG	2	6	57102	57107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505943
1120	NC_015741	CGG	2	6	57140	57145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505943
1121	NC_015741	GC	3	6	57201	57206	0 %	0 %	50 %	50 %	339505943
1122	NC_015741	ATT	2	6	57366	57371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015741	GACA	2	8	57401	57408	50 %	0 %	25 %	25 %	339505944
1124	NC_015741	CACG	2	8	57415	57422	25 %	0 %	25 %	50 %	339505944
1125	NC_015741	ATC	2	6	57469	57474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505944
1126	NC_015741	CGT	2	6	57497	57502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505944
1127	NC_015741	GCG	2	6	57549	57554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505944
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1248	NC_015741	GTT	2	6	63076	63081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505946
1249	NC_015741	CGT	2	6	63103	63108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505946
1250	NC_015741	TGCC	2	8	63115	63122	0 %	25 %	25 %	50 %	339505946
1251	NC_015741	GCG	2	6	63156	63161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505946
1252	NC_015741	GGT	2	6	63205	63210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_015741	ACA	2	6	63238	63243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339505947
1254	NC_015741	TCG	2	6	63411	63416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505947
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1353	NC_015741	CG	3	6	68836	68841	0 %	0 %	50 %	50 %	339505951
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1364	NC_015741	CAG	2	6	69412	69417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505953
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1374	NC_015741	GCACA	2	10	69711	69720	40 %	0 %	20 %	40 %	339505953
1375	NC_015741	GAC	2	6	69832	69837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505953
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1377	NC_015741	CAT	2	6	70070	70075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505954
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1381	NC_015741	GGC	2	6	70224	70229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505954
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1473	NC_015741	C	7	7	74914	74920	0 %	0 %	0 %	100 %	339505958
1474	NC_015741	GAT	2	6	74957	74962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505958
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1476	NC_015741	GATCAG	2	12	75011	75022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339505958
1477	NC_015741	CGT	2	6	75031	75036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505958
1478	NC_015741	GCG	2	6	75101	75106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505958
1479	NC_015741	CACC	2	8	75187	75194	25 %	0 %	0 %	75 %	339505958
1480	NC_015741	TGGC	2	8	75207	75214	0 %	25 %	50 %	25 %	339505958
1481	NC_015741	GCA	2	6	75484	75489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505958
1482	NC_015741	GTCGG	2	10	75524	75533	0 %	20 %	60 %	20 %	339505958
1483	NC_015741	ATC	2	6	75563	75568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505958
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1485	NC_015741	AT	4	8	75639	75646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1486	NC_015741	TCAAA	2	10	75674	75683	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1487	NC_015741	AC	3	6	75897	75902	50 %	0 %	0 %	50 %	339505959
1488	NC_015741	TGA	2	6	75957	75962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505959
1489	NC_015741	GAC	2	6	75972	75977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505959
1490	NC_015741	TGCT	2	8	75989	75996	0 %	50 %	25 %	25 %	339505959
1491	NC_015741	TGC	2	6	76037	76042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505959
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1493	NC_015741	CTT	2	6	76179	76184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339505959
1494	NC_015741	CCA	2	6	76265	76270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339505959
1495	NC_015741	TGA	2	6	76274	76279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505959
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1497	NC_015741	GCC	2	6	76360	76365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505959
1498	NC_015741	ACG	2	6	76378	76383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505959
1499	NC_015741	GCA	2	6	76393	76398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505959
1500	NC_015741	GGT	2	6	76428	76433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505960

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