MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_94

Total Repeats: 1821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015741	CCT	2	6	24837	24842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_015741	GCA	2	6	24925	24930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505914
503	NC_015741	TGA	2	6	24959	24964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505914
504	NC_015741	GC	3	6	24968	24973	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
505	NC_015741	GTCA	2	8	24990	24997	25 %	25 %	25 %	25 %	339505914
506	NC_015741	CGC	2	6	25069	25074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505914
507	NC_015741	G	6	6	25167	25172	0 %	0 %	100 %	0 %	339505914
508	NC_015741	GCG	2	6	25221	25226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505914
509	NC_015741	CCG	2	6	25246	25251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505914
510	NC_015741	GCGGTC	2	12	25299	25310	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339505914
511	NC_015741	GATC	2	8	25321	25328	25 %	25 %	25 %	25 %	339505914
512	NC_015741	CGC	2	6	25420	25425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505914
513	NC_015741	GTC	2	6	25439	25444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505914
514	NC_015741	CG	3	6	25471	25476	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
515	NC_015741	TGG	2	6	25487	25492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505914
516	NC_015741	AGC	2	6	25519	25524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505914
517	NC_015741	CGTG	2	8	25538	25545	0 %	25 %	50 %	25 %	339505914
518	NC_015741	GC	3	6	25556	25561	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
519	NC_015741	T	6	6	25599	25604	0 %	100 %	0 %	0 %	339505914
520	NC_015741	CG	3	6	25689	25694	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
521	NC_015741	ACCGG	2	10	25695	25704	20 %	0 %	40 %	40 %	339505914
522	NC_015741	TGC	2	6	25716	25721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505914
523	NC_015741	CAAGGG	2	12	25727	25738	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339505914
524	NC_015741	CCG	2	6	25747	25752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505914
525	NC_015741	AGGCCA	2	12	25810	25821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505914
526	NC_015741	CGG	2	6	25843	25848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505914
527	NC_015741	GAA	2	6	25878	25883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339505914
528	NC_015741	CGT	2	6	25892	25897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505914
529	NC_015741	CGG	2	6	25906	25911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505914
530	NC_015741	GGC	2	6	26018	26023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505914
531	NC_015741	ATG	2	6	26092	26097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505914
532	NC_015741	CGGG	2	8	26136	26143	0 %	0 %	75 %	25 %	339505914
533	NC_015741	TGG	2	6	26215	26220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505914
534	NC_015741	GCC	2	6	26226	26231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505914
535	NC_015741	CGG	2	6	26266	26271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505914
536	NC_015741	GC	3	6	26272	26277	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
537	NC_015741	CG	3	6	26308	26313	0 %	0 %	50 %	50 %	339505914
538	NC_015741	CTG	2	6	26424	26429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505914
539	NC_015741	GGC	3	9	26441	26449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505914
540	NC_015741	CCA	2	6	26479	26484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339505914
541	NC_015741	TCA	2	6	26557	26562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505914
542	NC_015741	GCC	2	6	26616	26621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505914
543	NC_015741	CTG	2	6	26628	26633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505914
544	NC_015741	TTG	2	6	26737	26742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505914
545	NC_015741	CG	3	6	26882	26887	0 %	0 %	50 %	50 %	339505915
546	NC_015741	GCC	2	6	26964	26969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505915
547	NC_015741	CCAT	2	8	26985	26992	25 %	25 %	0 %	50 %	339505915
548	NC_015741	GC	4	8	27015	27022	0 %	0 %	50 %	50 %	339505915
549	NC_015741	CAT	2	6	27028	27033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505915
550	NC_015741	TGG	2	6	27166	27171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505915
551	NC_015741	GCA	2	6	27216	27221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505915
552	NC_015741	CGC	2	6	27266	27271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505915
553	NC_015741	GTT	2	6	27345	27350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505915
554	NC_015741	CGG	2	6	27411	27416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505915
555	NC_015741	CG	3	6	27536	27541	0 %	0 %	50 %	50 %	339505915
556	NC_015741	CAA	2	6	27550	27555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339505915
557	NC_015741	CGC	2	6	27556	27561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505915
558	NC_015741	CAG	2	6	27638	27643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505915
559	NC_015741	GC	3	6	27664	27669	0 %	0 %	50 %	50 %	339505915
560	NC_015741	GTC	2	6	27740	27745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015741	GGGCC	2	10	27795	27804	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
562	NC_015741	GGC	2	6	27825	27830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505916
563	NC_015741	CAG	2	6	27876	27881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505916
564	NC_015741	AGAA	2	8	28006	28013	75 %	0 %	25 %	0 %	339505916
565	NC_015741	ATC	2	6	28014	28019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505916
566	NC_015741	TCGTTG	2	12	28075	28086	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339505916
567	NC_015741	TCC	2	6	28248	28253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339505917
568	NC_015741	GC	3	6	28296	28301	0 %	0 %	50 %	50 %	339505917
569	NC_015741	ATC	2	6	28425	28430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505917
570	NC_015741	CG	3	6	28516	28521	0 %	0 %	50 %	50 %	339505917
571	NC_015741	GGGC	2	8	28621	28628	0 %	0 %	75 %	25 %	339505917
572	NC_015741	TTG	2	6	28647	28652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505917
573	NC_015741	CG	4	8	28679	28686	0 %	0 %	50 %	50 %	339505917
574	NC_015741	CGG	3	9	28774	28782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505917
575	NC_015741	TAA	2	6	28873	28878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339505917
576	NC_015741	CTC	2	6	28910	28915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_015741	GC	3	6	29020	29025	0 %	0 %	50 %	50 %	339505918
578	NC_015741	GCC	2	6	29034	29039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505918
579	NC_015741	AGC	2	6	29142	29147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505918
580	NC_015741	CCA	2	6	29159	29164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339505918
581	NC_015741	CCA	2	6	29206	29211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339505918
582	NC_015741	TGG	2	6	29264	29269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505918
583	NC_015741	CGG	2	6	29272	29277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505918
584	NC_015741	A	7	7	29279	29285	100 %	0 %	0 %	0 %	339505918
585	NC_015741	TCA	2	6	29301	29306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505918
586	NC_015741	GCTGT	2	10	29372	29381	0 %	40 %	40 %	20 %	339505918
587	NC_015741	TGAT	2	8	29385	29392	25 %	50 %	25 %	0 %	339505918
588	NC_015741	GAT	2	6	29402	29407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505918
589	NC_015741	GCA	2	6	29461	29466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015741	TTA	2	6	29484	29489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015741	GGC	2	6	29599	29604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015741	TGC	2	6	29679	29684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015741	GCGCC	2	10	29707	29716	0 %	0 %	40 %	60 %	339505919
594	NC_015741	GT	3	6	29780	29785	0 %	50 %	50 %	0 %	339505919
595	NC_015741	GCTG	2	8	29816	29823	0 %	25 %	50 %	25 %	339505919
596	NC_015741	TCA	2	6	29837	29842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505919
597	NC_015741	GCT	2	6	29868	29873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505919
598	NC_015741	CGG	2	6	29885	29890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505919
599	NC_015741	AT	3	6	29892	29897	50 %	50 %	0 %	0 %	339505919
600	NC_015741	GCC	2	6	29899	29904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505919
601	NC_015741	CGG	2	6	30014	30019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505919
602	NC_015741	CTG	2	6	30031	30036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505919
603	NC_015741	TGC	2	6	30047	30052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505919
604	NC_015741	CAT	2	6	30063	30068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505919
605	NC_015741	CCCG	2	8	30075	30082	0 %	0 %	25 %	75 %	339505919
606	NC_015741	G	6	6	30082	30087	0 %	0 %	100 %	0 %	339505919
607	NC_015741	TGA	2	6	30257	30262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505919
608	NC_015741	GAA	2	6	30274	30279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339505919
609	NC_015741	GTT	2	6	30300	30305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505919
610	NC_015741	CAG	2	6	30314	30319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505919
611	NC_015741	G	7	7	30319	30325	0 %	0 %	100 %	0 %	339505919
612	NC_015741	GGT	2	6	30429	30434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505919
613	NC_015741	GCT	2	6	30435	30440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505919
614	NC_015741	GTG	2	6	30443	30448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339505919
615	NC_015741	GAA	2	6	30460	30465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339505919
616	NC_015741	CAA	2	6	30492	30497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339505919
617	NC_015741	CGCGC	2	10	30534	30543	0 %	0 %	40 %	60 %	339505919
618	NC_015741	GGTC	2	8	30578	30585	0 %	25 %	50 %	25 %	339505919
619	NC_015741	GGC	2	6	30587	30592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505919
620	NC_015741	GC	3	6	30669	30674	0 %	0 %	50 %	50 %	339505919
621	NC_015741	ACG	2	6	30727	30732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505919
622	NC_015741	CGC	2	6	30799	30804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505919
623	NC_015741	TGA	2	6	30829	30834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339505919
624	NC_015741	CAG	2	6	30899	30904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015741	TGT	2	6	30940	30945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015741	GTC	2	6	30953	30958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015741	GTT	2	6	30980	30985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015741	CAC	2	6	31015	31020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_015741	CAT	2	6	31064	31069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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759	NC_015741	GCA	2	6	38494	38499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505926
760	NC_015741	CAT	2	6	38572	38577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505926
761	NC_015741	GC	3	6	38584	38589	0 %	0 %	50 %	50 %	339505926
762	NC_015741	TCGG	2	8	38660	38667	0 %	25 %	50 %	25 %	339505926
763	NC_015741	AGC	2	6	38684	38689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505926
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767	NC_015741	AG	3	6	38848	38853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
768	NC_015741	GCA	2	6	38876	38881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
769	NC_015741	TCAG	2	8	38921	38928	25 %	25 %	25 %	25 %	339505927
770	NC_015741	ATC	2	6	38952	38957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339505927
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872	NC_015741	AGG	2	6	44259	44264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339505931
873	NC_015741	AT	3	6	44271	44276	50 %	50 %	0 %	0 %	339505931
874	NC_015741	T	6	6	44398	44403	0 %	100 %	0 %	0 %	339505932
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879	NC_015741	TTTTG	2	10	44712	44721	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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881	NC_015741	GC	3	6	44853	44858	0 %	0 %	50 %	50 %	339505933
882	NC_015741	CG	3	6	44891	44896	0 %	0 %	50 %	50 %	339505933
883	NC_015741	CGC	2	6	45003	45008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339505933
884	NC_015741	CGT	2	6	45020	45025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339505933
885	NC_015741	GT	3	6	45164	45169	0 %	50 %	50 %	0 %	339505933
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887	NC_015741	GCA	2	6	45238	45243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339505933
888	NC_015741	GCG	2	6	45311	45316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339505933
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901	NC_015741	TGT	2	6	45949	45954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339505934
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997	NC_015741	GC	3	6	50870	50875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
998	NC_015741	ACAA	2	8	50894	50901	75 %	0 %	0 %	25 %	339505938
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