MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 chromosome

Total Repeats: 86129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4003	NC_015730	TGC	2	6	212409	212414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501792
4004	NC_015730	GC	3	6	212460	212465	0 %	0 %	50 %	50 %	339501792
4005	NC_015730	CAT	2	6	212473	212478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501792
4006	NC_015730	CG	3	6	212498	212503	0 %	0 %	50 %	50 %	339501792
4007	NC_015730	GGA	2	6	212596	212601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501792
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4010	NC_015730	GCC	2	6	212789	212794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501792
4011	NC_015730	GC	3	6	212884	212889	0 %	0 %	50 %	50 %	339501792
4012	NC_015730	TGG	2	6	212959	212964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501792
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4019	NC_015730	ATTTT	2	10	213219	213228	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4021	NC_015730	GATTG	2	10	213253	213262	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4120	NC_015730	ACG	2	6	218415	218420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501797
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4122	NC_015730	TTC	2	6	218504	218509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_015730	CAG	2	6	218527	218532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_015730	GCT	2	6	218707	218712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501798
4125	NC_015730	AGGC	2	8	218721	218728	25 %	0 %	50 %	25 %	339501798
4126	NC_015730	CGGG	2	8	218813	218820	0 %	0 %	75 %	25 %	339501798
4127	NC_015730	GC	4	8	218881	218888	0 %	0 %	50 %	50 %	339501798
4128	NC_015730	GAT	2	6	218915	218920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501798
4129	NC_015730	GCA	2	6	218945	218950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501798
4130	NC_015730	CGG	2	6	218959	218964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501798
4131	NC_015730	CG	3	6	219064	219069	0 %	0 %	50 %	50 %	339501798
4132	NC_015730	ATGG	2	8	219092	219099	25 %	25 %	50 %	0 %	339501798
4133	NC_015730	CAC	2	6	219102	219107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501798
4134	NC_015730	GGAACA	3	18	219115	219132	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	339501798
4135	NC_015730	CGC	2	6	219151	219156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501798
4136	NC_015730	GCC	2	6	219164	219169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501798
4137	NC_015730	GCG	2	6	219188	219193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501798
4138	NC_015730	CAGCC	2	10	219225	219234	20 %	0 %	20 %	60 %	339501798
4139	NC_015730	GAT	2	6	219290	219295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501798
4140	NC_015730	TGC	2	6	219375	219380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501798
4141	NC_015730	G	7	7	219386	219392	0 %	0 %	100 %	0 %	339501798
4142	NC_015730	CTGGC	2	10	219395	219404	0 %	20 %	40 %	40 %	339501798
4143	NC_015730	GAT	2	6	219434	219439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501798
4144	NC_015730	CG	3	6	219497	219502	0 %	0 %	50 %	50 %	339501798
4145	NC_015730	AAC	2	6	219507	219512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501798
4146	NC_015730	CTGT	2	8	219546	219553	0 %	50 %	25 %	25 %	339501798
4147	NC_015730	CG	3	6	219554	219559	0 %	0 %	50 %	50 %	339501798
4148	NC_015730	GGATG	2	10	219580	219589	20 %	20 %	60 %	0 %	339501798
4149	NC_015730	TGCG	2	8	219633	219640	0 %	25 %	50 %	25 %	339501798
4150	NC_015730	ATC	2	6	219647	219652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501798
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4152	NC_015730	TGA	2	6	219696	219701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501798
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4154	NC_015730	TGA	2	6	219754	219759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501798
4155	NC_015730	TGG	2	6	219771	219776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501798
4156	NC_015730	GGCACG	2	12	219800	219811	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339501798
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4158	NC_015730	GATG	2	8	219901	219908	25 %	25 %	50 %	0 %	339501798
4159	NC_015730	CTG	2	6	219974	219979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501798
4160	NC_015730	TGC	2	6	220054	220059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501798
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4164	NC_015730	GGC	2	6	220223	220228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501798
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4166	NC_015730	TG	3	6	220254	220259	0 %	50 %	50 %	0 %	339501798
4167	NC_015730	GTG	2	6	220265	220270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501798
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4200	NC_015730	TACC	2	8	221722	221729	25 %	25 %	0 %	50 %	339501799
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4232	NC_015730	CGCGC	2	10	223196	223205	0 %	0 %	40 %	60 %	339501800
4233	NC_015730	ATC	2	6	223237	223242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501800
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4240	NC_015730	CTGT	2	8	223852	223859	0 %	50 %	25 %	25 %	339501800
4241	NC_015730	GAA	2	6	223873	223878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501800
4242	NC_015730	GAA	2	6	223945	223950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501800
4243	NC_015730	GC	3	6	223995	224000	0 %	0 %	50 %	50 %	339501800
4244	NC_015730	GGC	2	6	224001	224006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501800
4245	NC_015730	CG	3	6	224081	224086	0 %	0 %	50 %	50 %	339501800
4246	NC_015730	ATC	2	6	224129	224134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501800
4247	NC_015730	GGC	2	6	224162	224167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501800
4248	NC_015730	GAT	2	6	224205	224210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501800
4249	NC_015730	GCC	2	6	224217	224222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501800
4250	NC_015730	ACGCA	2	10	224287	224296	40 %	0 %	20 %	40 %	339501800
4251	NC_015730	GGC	2	6	224326	224331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501800
4252	NC_015730	CG	3	6	224406	224411	0 %	0 %	50 %	50 %	339501800
4253	NC_015730	CGG	2	6	224510	224515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501800
4254	NC_015730	ACG	2	6	224578	224583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501800
4255	NC_015730	CAA	2	6	224604	224609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501800
4256	NC_015730	TGA	2	6	224676	224681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501800
4257	NC_015730	CGA	3	9	224682	224690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501800
4258	NC_015730	GCT	2	6	224751	224756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501800
4259	NC_015730	ATGAA	2	10	224771	224780	60 %	20 %	20 %	0 %	339501800
4260	NC_015730	AAT	2	6	224902	224907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501801
4261	NC_015730	ACGCG	2	10	224946	224955	20 %	0 %	40 %	40 %	339501801
4262	NC_015730	GCT	2	6	225021	225026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501801
4263	NC_015730	GC	3	6	225035	225040	0 %	0 %	50 %	50 %	339501801
4264	NC_015730	GC	3	6	225042	225047	0 %	0 %	50 %	50 %	339501801
4265	NC_015730	CG	3	6	225138	225143	0 %	0 %	50 %	50 %	339501801
4266	NC_015730	GCC	2	6	225163	225168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501801
4267	NC_015730	CGG	2	6	225183	225188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501801
4268	NC_015730	TC	3	6	225203	225208	0 %	50 %	0 %	50 %	339501801
4269	NC_015730	CGG	2	6	225218	225223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501801
4270	NC_015730	CG	3	6	225327	225332	0 %	0 %	50 %	50 %	339501801
4271	NC_015730	CAT	2	6	225336	225341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501801
4272	NC_015730	CCCGAA	2	12	225382	225393	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339501801
4273	NC_015730	CGC	2	6	225411	225416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501801
4274	NC_015730	GCCA	2	8	225520	225527	25 %	0 %	25 %	50 %	339501801
4275	NC_015730	GGC	2	6	225549	225554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501801
4276	NC_015730	GGGT	2	8	225612	225619	0 %	25 %	75 %	0 %	339501801
4277	NC_015730	TCC	2	6	225652	225657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501801
4278	NC_015730	C	6	6	225695	225700	0 %	0 %	0 %	100 %	339501801
4279	NC_015730	CG	3	6	225716	225721	0 %	0 %	50 %	50 %	339501801
4280	NC_015730	AGC	2	6	225875	225880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501801
4281	NC_015730	GC	3	6	225925	225930	0 %	0 %	50 %	50 %	339501801
4282	NC_015730	TGC	2	6	226058	226063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501801
4283	NC_015730	CGC	2	6	226145	226150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501801
4284	NC_015730	T	6	6	226180	226185	0 %	100 %	0 %	0 %	339501801
4285	NC_015730	CAGC	2	8	226326	226333	25 %	0 %	25 %	50 %	339501801
4286	NC_015730	ATT	2	6	226367	226372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501801
4287	NC_015730	TCG	2	6	226373	226378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501801
4288	NC_015730	CG	3	6	226423	226428	0 %	0 %	50 %	50 %	339501801
4289	NC_015730	AAGG	2	8	226456	226463	50 %	0 %	50 %	0 %	339501801
4290	NC_015730	CCCTGA	2	12	226526	226537	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339501801
4291	NC_015730	ATG	2	6	226538	226543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501801
4292	NC_015730	GAA	2	6	226696	226701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501801
4293	NC_015730	TGC	2	6	226710	226715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501801
4294	NC_015730	ATC	2	6	226723	226728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501801
4295	NC_015730	TG	3	6	226786	226791	0 %	50 %	50 %	0 %	339501801
4296	NC_015730	GGATC	2	10	226809	226818	20 %	20 %	40 %	20 %	339501801
4297	NC_015730	TCAG	2	8	226844	226851	25 %	25 %	25 %	25 %	339501801
4298	NC_015730	TTC	2	6	226860	226865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501801
4299	NC_015730	CGG	2	6	226887	226892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501801
4300	NC_015730	GTC	2	6	227034	227039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501801
4301	NC_015730	GGC	3	9	227142	227150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501801
4302	NC_015730	GATT	2	8	227226	227233	25 %	50 %	25 %	0 %	339501801
4303	NC_015730	CAC	2	6	227258	227263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501801
4304	NC_015730	CCG	2	6	227264	227269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501801
4305	NC_015730	CAAT	2	8	227288	227295	50 %	25 %	0 %	25 %	339501801
4306	NC_015730	GC	3	6	227389	227394	0 %	0 %	50 %	50 %	339501801
4307	NC_015730	AAC	2	6	227429	227434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501801
4308	NC_015730	GCC	2	6	227440	227445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501801
4309	NC_015730	TA	3	6	227468	227473	50 %	50 %	0 %	0 %	339501801
4310	NC_015730	GA	3	6	227607	227612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4311	NC_015730	ATT	2	6	227731	227736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501802
4312	NC_015730	TGCGG	2	10	227795	227804	0 %	20 %	60 %	20 %	339501802
4313	NC_015730	G	6	6	227811	227816	0 %	0 %	100 %	0 %	339501802
4314	NC_015730	GAA	2	6	227859	227864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501802
4315	NC_015730	TGG	2	6	227884	227889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501802
4316	NC_015730	GAT	2	6	227919	227924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501802
4317	NC_015730	CGG	2	6	227954	227959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501802
4318	NC_015730	CAT	2	6	227960	227965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501802
4319	NC_015730	GCC	2	6	227976	227981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501802
4320	NC_015730	CCG	2	6	228037	228042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501802
4321	NC_015730	CGG	2	6	228079	228084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501802
4322	NC_015730	GGC	2	6	228117	228122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501802
4323	NC_015730	TGG	2	6	228136	228141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501802
4324	NC_015730	TGC	2	6	228145	228150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501802
4325	NC_015730	GGC	2	6	228155	228160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501802
4326	NC_015730	GCT	2	6	228176	228181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501802
4327	NC_015730	GGA	2	6	228188	228193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501802
4328	NC_015730	GCGA	2	8	228249	228256	25 %	0 %	50 %	25 %	339501802
4329	NC_015730	TGCGC	2	10	228272	228281	0 %	20 %	40 %	40 %	339501802
4330	NC_015730	CAG	2	6	228307	228312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501802
4331	NC_015730	GCG	3	9	228372	228380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501802
4332	NC_015730	GATG	2	8	228434	228441	25 %	25 %	50 %	0 %	339501802
4333	NC_015730	CGG	3	9	228490	228498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501802
4334	NC_015730	TAT	2	6	228501	228506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501802
4335	NC_015730	GC	4	8	228507	228514	0 %	0 %	50 %	50 %	339501802
4336	NC_015730	GCTG	2	8	228548	228555	0 %	25 %	50 %	25 %	339501802
4337	NC_015730	GACA	2	8	228581	228588	50 %	0 %	25 %	25 %	339501802
4338	NC_015730	ATT	2	6	228613	228618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501802
4339	NC_015730	TGG	2	6	228653	228658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501803
4340	NC_015730	GGC	2	6	228669	228674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501803
4341	NC_015730	GGC	2	6	228699	228704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501803
4342	NC_015730	CGC	2	6	228762	228767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501803
4343	NC_015730	TCG	2	6	228935	228940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501803
4344	NC_015730	GCC	2	6	228955	228960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501803
4345	NC_015730	GCTG	2	8	229004	229011	0 %	25 %	50 %	25 %	339501803
4346	NC_015730	CGG	2	6	229064	229069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501803
4347	NC_015730	CAA	2	6	229083	229088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501803
4348	NC_015730	AAC	2	6	229252	229257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501803
4349	NC_015730	CG	3	6	229335	229340	0 %	0 %	50 %	50 %	339501803
4350	NC_015730	TGC	2	6	229352	229357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501803
4351	NC_015730	ACA	2	6	229430	229435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501803
4352	NC_015730	TGT	2	6	229440	229445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501803
4353	NC_015730	AC	3	6	229529	229534	50 %	0 %	0 %	50 %	339501803
4354	NC_015730	CTGG	2	8	229576	229583	0 %	25 %	50 %	25 %	339501803
4355	NC_015730	GCA	2	6	229614	229619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501803
4356	NC_015730	GC	3	6	229645	229650	0 %	0 %	50 %	50 %	339501803
4357	NC_015730	GAG	2	6	229723	229728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501803
4358	NC_015730	CG	4	8	229950	229957	0 %	0 %	50 %	50 %	339501803
4359	NC_015730	TGG	2	6	230000	230005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501803
4360	NC_015730	TCGC	2	8	230113	230120	0 %	25 %	25 %	50 %	339501803
4361	NC_015730	CTG	2	6	230173	230178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501803
4362	NC_015730	GTG	2	6	230213	230218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501803
4363	NC_015730	CTT	2	6	230232	230237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501803
4364	NC_015730	CAAC	2	8	230270	230277	50 %	0 %	0 %	50 %	339501803
4365	NC_015730	CGG	2	6	230284	230289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501803
4366	NC_015730	GGGCG	2	10	230313	230322	0 %	0 %	80 %	20 %	339501803
4367	NC_015730	CAGC	2	8	230352	230359	25 %	0 %	25 %	50 %	339501803
4368	NC_015730	TGC	2	6	230399	230404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501803
4369	NC_015730	CAT	2	6	230412	230417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501803
4370	NC_015730	GTT	2	6	230457	230462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501803
4371	NC_015730	GAT	2	6	230500	230505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501803
4372	NC_015730	GCG	2	6	230551	230556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4373	NC_015730	TCGC	2	8	230566	230573	0 %	25 %	25 %	50 %	339501804
4374	NC_015730	GCG	2	6	230647	230652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501804
4375	NC_015730	GCT	3	9	230697	230705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501804
4376	NC_015730	CTG	2	6	230710	230715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501804
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4378	NC_015730	GGCG	2	8	230871	230878	0 %	0 %	75 %	25 %	339501804
4379	NC_015730	GCG	2	6	230934	230939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501804
4380	NC_015730	CG	3	6	231052	231057	0 %	0 %	50 %	50 %	339501804
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4383	NC_015730	TGT	2	6	231179	231184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501804
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4409	NC_015730	G	7	7	232634	232640	0 %	0 %	100 %	0 %	339501806
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4415	NC_015730	TGA	2	6	232968	232973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501806
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4458	NC_015730	GC	4	8	235653	235660	0 %	0 %	50 %	50 %	339501808
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4482	NC_015730	AT	3	6	236657	236662	50 %	50 %	0 %	0 %	339501809
4483	NC_015730	G	6	6	236693	236698	0 %	0 %	100 %	0 %	339501809
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4485	NC_015730	CCG	2	6	236775	236780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4486	NC_015730	AGCTT	2	10	236791	236800	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4487	NC_015730	GCAG	2	8	236843	236850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4488	NC_015730	CAT	2	6	236854	236859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4489	NC_015730	AGG	2	6	236890	236895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4493	NC_015730	CTG	2	6	237194	237199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501810
4494	NC_015730	GGCTG	2	10	237351	237360	0 %	20 %	60 %	20 %	339501810
4495	NC_015730	CGC	2	6	237385	237390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501810
4496	NC_015730	TGA	2	6	237423	237428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501810
4497	NC_015730	ATGAC	2	10	237438	237447	40 %	20 %	20 %	20 %	339501810
4498	NC_015730	ATT	2	6	237450	237455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501810
4499	NC_015730	ATC	2	6	237528	237533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501810
4500	NC_015730	CGG	2	6	237559	237564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501810

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