MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 chromosome

Total Repeats: 86129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_015730	GCG	2	6	51783	51788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501625
1003	NC_015730	TTG	2	6	51797	51802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501625
1004	NC_015730	T	6	6	51823	51828	0 %	100 %	0 %	0 %	339501625
1005	NC_015730	TGT	2	6	51912	51917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501625
1006	NC_015730	GCGGT	2	10	51935	51944	0 %	20 %	60 %	20 %	339501625
1007	NC_015730	GCG	2	6	51956	51961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501625
1008	NC_015730	TTG	2	6	51971	51976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501625
1009	NC_015730	GCA	2	6	52102	52107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501625
1010	NC_015730	GTG	2	6	52253	52258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501625
1011	NC_015730	CGC	2	6	52268	52273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501625
1012	NC_015730	GGCAA	2	10	52279	52288	40 %	0 %	40 %	20 %	339501625
1013	NC_015730	TGAT	2	8	52343	52350	25 %	50 %	25 %	0 %	339501625
1014	NC_015730	CGA	2	6	52391	52396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501625
1015	NC_015730	TGG	2	6	52398	52403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501625
1016	NC_015730	GTC	2	6	52477	52482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501625
1017	NC_015730	GAAC	2	8	52525	52532	50 %	0 %	25 %	25 %	339501625
1018	NC_015730	GGC	2	6	52606	52611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501625
1019	NC_015730	TGG	2	6	52653	52658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501625
1020	NC_015730	AAT	2	6	52678	52683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501625
1021	NC_015730	CTGAGA	2	12	52715	52726	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339501625
1022	NC_015730	TTG	2	6	52865	52870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501625
1023	NC_015730	ATT	2	6	52906	52911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501625
1024	NC_015730	AATCA	2	10	52914	52923	60 %	20 %	0 %	20 %	339501625
1025	NC_015730	CTG	2	6	52955	52960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501625
1026	NC_015730	TGA	2	6	52973	52978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501625
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1029	NC_015730	CTG	3	9	53117	53125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501625
1030	NC_015730	ACGG	2	8	53134	53141	25 %	0 %	50 %	25 %	339501625
1031	NC_015730	GAT	2	6	53170	53175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501625
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1033	NC_015730	GAT	2	6	53263	53268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501625
1034	NC_015730	CAAA	2	8	53402	53409	75 %	0 %	0 %	25 %	339501626
1035	NC_015730	GCTG	2	8	53487	53494	0 %	25 %	50 %	25 %	339501626
1036	NC_015730	TCG	2	6	53635	53640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501626
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1054	NC_015730	T	6	6	54805	54810	0 %	100 %	0 %	0 %	339501628
1055	NC_015730	TTG	2	6	54840	54845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501628
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1057	NC_015730	ATG	3	9	54872	54880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501628
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1059	NC_015730	CTCA	2	8	55070	55077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_015730	CA	3	6	55140	55145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_015730	TGC	2	6	55157	55162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015730	AAC	2	6	55220	55225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015730	CTT	2	6	55275	55280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015730	CGC	2	6	55281	55286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_015730	GCA	2	6	55320	55325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1067	NC_015730	GAC	2	6	55379	55384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_015730	T	6	6	55390	55395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1070	NC_015730	GA	3	6	55503	55508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015730	A	7	7	55636	55642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015730	GCA	2	6	55768	55773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_015730	CA	3	6	55790	55795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_015730	AAAG	2	8	55872	55879	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1076	NC_015730	GAG	3	9	56089	56097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_015730	TGT	2	6	56501	56506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015730	TGCT	2	8	56703	56710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1085	NC_015730	TGC	3	9	56799	56807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_015730	CGA	2	6	56818	56823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1088	NC_015730	CGT	2	6	56927	56932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1093	NC_015730	T	7	7	57166	57172	0 %	100 %	0 %	0 %	339501630
1094	NC_015730	GCTT	2	8	57178	57185	0 %	50 %	25 %	25 %	339501630
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1098	NC_015730	TGC	2	6	57482	57487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_015730	GCGCT	2	10	57569	57578	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1100	NC_015730	AAGCC	2	10	57782	57791	40 %	0 %	20 %	40 %	339501631
1101	NC_015730	CCA	2	6	57929	57934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501631
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1107	NC_015730	TTC	2	6	58297	58302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501631
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1109	NC_015730	ATGG	2	8	58405	58412	25 %	25 %	50 %	0 %	339501631
1110	NC_015730	TGT	2	6	58415	58420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501631
1111	NC_015730	TGA	2	6	58488	58493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501631
1112	NC_015730	TCA	2	6	58526	58531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501631
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1114	NC_015730	TCCCC	2	10	58758	58767	0 %	20 %	0 %	80 %	339501631
1115	NC_015730	A	6	6	58808	58813	100 %	0 %	0 %	0 %	339501631
1116	NC_015730	GCC	2	6	58858	58863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501631
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1119	NC_015730	CTC	2	6	58989	58994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501632
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1122	NC_015730	CCT	2	6	59120	59125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501632
1123	NC_015730	ATC	2	6	59490	59495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501632
1124	NC_015730	CG	3	6	59531	59536	0 %	0 %	50 %	50 %	339501632
1125	NC_015730	CAG	2	6	59537	59542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1126	NC_015730	ATGA	2	8	59580	59587	50 %	25 %	25 %	0 %	339501632
1127	NC_015730	GCC	2	6	59622	59627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501632
1128	NC_015730	GACC	2	8	59630	59637	25 %	0 %	25 %	50 %	339501632
1129	NC_015730	CAT	2	6	59747	59752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501632
1130	NC_015730	AGC	2	6	59802	59807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1131	NC_015730	TTG	2	6	59813	59818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501632
1132	NC_015730	CAG	2	6	59828	59833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1133	NC_015730	GGA	2	6	59882	59887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501632
1134	NC_015730	CG	3	6	60027	60032	0 %	0 %	50 %	50 %	339501632
1135	NC_015730	CGA	2	6	60058	60063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1136	NC_015730	TCC	2	6	60087	60092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501632
1137	NC_015730	CG	3	6	60139	60144	0 %	0 %	50 %	50 %	339501632
1138	NC_015730	A	6	6	60157	60162	100 %	0 %	0 %	0 %	339501632
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1141	NC_015730	TGC	2	6	60403	60408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1142	NC_015730	GACGCA	2	12	60463	60474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1143	NC_015730	ACCA	2	8	60500	60507	50 %	0 %	0 %	50 %	339501632
1144	NC_015730	GGCA	2	8	60536	60543	25 %	0 %	50 %	25 %	339501632
1145	NC_015730	GAC	2	6	60584	60589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1146	NC_015730	AAT	2	6	60608	60613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501632
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1149	NC_015730	CAA	2	6	60808	60813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501632
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1151	NC_015730	TGC	2	6	60861	60866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501632
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1153	NC_015730	GCA	2	6	60972	60977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
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1156	NC_015730	CGA	2	6	61049	61054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
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1160	NC_015730	CT	3	6	61232	61237	0 %	50 %	0 %	50 %	339501633
1161	NC_015730	TGA	2	6	61257	61262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501633
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1163	NC_015730	GAC	2	6	61459	61464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501633
1164	NC_015730	CGT	2	6	61467	61472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501633
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1203	NC_015730	CAT	2	6	63323	63328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501634
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1223	NC_015730	CTGT	2	8	64387	64394	0 %	50 %	25 %	25 %	339501634
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1239	NC_015730	CTGT	2	8	65044	65051	0 %	50 %	25 %	25 %	339501634
1240	NC_015730	CAA	2	6	65210	65215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501634
1241	NC_015730	GCC	2	6	65244	65249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1242	NC_015730	GTC	2	6	65271	65276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1243	NC_015730	GCC	2	6	65347	65352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1244	NC_015730	TCC	2	6	65391	65396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501634
1245	NC_015730	TGATC	2	10	65447	65456	20 %	40 %	20 %	20 %	339501634
1246	NC_015730	TGC	2	6	65457	65462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1247	NC_015730	GCT	2	6	65492	65497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1248	NC_015730	GGC	2	6	65538	65543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501634
1249	NC_015730	TGA	2	6	65595	65600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501634
1250	NC_015730	GTTGCG	2	12	65626	65637	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339501634
1251	NC_015730	C	7	7	65642	65648	0 %	0 %	0 %	100 %	339501634
1252	NC_015730	AGGC	2	8	65651	65658	25 %	0 %	50 %	25 %	339501634
1253	NC_015730	GGC	2	6	65721	65726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501634
1254	NC_015730	CCA	2	6	65743	65748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501634
1255	NC_015730	CCG	2	6	65831	65836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1256	NC_015730	GTTC	2	8	65837	65844	0 %	50 %	25 %	25 %	339501634
1257	NC_015730	GTTT	2	8	65959	65966	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_015730	CG	3	6	66010	66015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1262	NC_015730	GTA	2	6	66250	66255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501635
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1275	NC_015730	G	6	6	67043	67048	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_015730	GGA	2	6	67110	67115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1357	NC_015730	GTT	2	6	71551	71556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1358	NC_015730	C	6	6	71569	71574	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1359	NC_015730	ATC	2	6	71669	71674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501643
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1363	NC_015730	CGGTGC	2	12	71913	71924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339501643
1364	NC_015730	GACC	2	8	72123	72130	25 %	0 %	25 %	50 %	339501643
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1369	NC_015730	AAT	2	6	72477	72482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501643
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1371	NC_015730	GTCG	2	8	72523	72530	0 %	25 %	50 %	25 %	339501643
1372	NC_015730	AT	3	6	72533	72538	50 %	50 %	0 %	0 %	339501643
1373	NC_015730	TCG	2	6	72554	72559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501643
1374	NC_015730	GTG	2	6	72563	72568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501643
1375	NC_015730	CGG	2	6	72609	72614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501643
1376	NC_015730	CTT	2	6	72618	72623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501643
1377	NC_015730	TCAA	2	8	72716	72723	50 %	25 %	0 %	25 %	339501643
1378	NC_015730	TCG	2	6	72774	72779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501643
1379	NC_015730	CG	3	6	72778	72783	0 %	0 %	50 %	50 %	339501643
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1381	NC_015730	TTC	2	6	72958	72963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501643
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