MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 chromosome

Total Repeats: 86129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015730	GC	3	6	24511	24516	0 %	0 %	50 %	50 %	339501599
502	NC_015730	TCA	2	6	24530	24535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501599
503	NC_015730	GCT	2	6	24609	24614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501599
504	NC_015730	GCG	2	6	24692	24697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501599
505	NC_015730	TGC	2	6	24707	24712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501599
506	NC_015730	ACA	2	6	24720	24725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501599
507	NC_015730	CGC	2	6	24747	24752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501599
508	NC_015730	CAT	2	6	24786	24791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501599
509	NC_015730	GAT	2	6	24843	24848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501599
510	NC_015730	CTG	2	6	24874	24879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501599
511	NC_015730	CGC	2	6	24969	24974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501599
512	NC_015730	TGA	2	6	25059	25064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501599
513	NC_015730	TCA	2	6	25100	25105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501599
514	NC_015730	AGC	2	6	25138	25143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501599
515	NC_015730	GC	3	6	25142	25147	0 %	0 %	50 %	50 %	339501599
516	NC_015730	ACGC	2	8	25170	25177	25 %	0 %	25 %	50 %	339501599
517	NC_015730	AAG	2	6	25255	25260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501599
518	NC_015730	GTT	2	6	25296	25301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015730	ATC	2	6	25323	25328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015730	GTT	2	6	25398	25403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501600
521	NC_015730	CGG	2	6	25405	25410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501600
522	NC_015730	T	6	6	25446	25451	0 %	100 %	0 %	0 %	339501600
523	NC_015730	CG	3	6	25472	25477	0 %	0 %	50 %	50 %	339501600
524	NC_015730	GAC	2	6	25494	25499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501600
525	NC_015730	CCG	2	6	25547	25552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501600
526	NC_015730	ATG	2	6	25568	25573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501600
527	NC_015730	GCG	2	6	25645	25650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501600
528	NC_015730	CTTT	2	8	25658	25665	0 %	75 %	0 %	25 %	339501600
529	NC_015730	GCGG	2	8	25699	25706	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
530	NC_015730	CGT	2	6	25716	25721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015730	CTT	2	6	25722	25727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015730	CGA	2	6	25948	25953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501601
533	NC_015730	CTTT	2	8	25956	25963	0 %	75 %	0 %	25 %	339501601
534	NC_015730	ACA	2	6	26086	26091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501601
535	NC_015730	GCA	2	6	26281	26286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501601
536	NC_015730	GCC	2	6	26289	26294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501601
537	NC_015730	GCG	2	6	26295	26300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501601
538	NC_015730	TGCCA	2	10	26357	26366	20 %	20 %	20 %	40 %	339501601
539	NC_015730	CTT	2	6	26368	26373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501601
540	NC_015730	GCG	2	6	26391	26396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501601
541	NC_015730	GCAG	2	8	26412	26419	25 %	0 %	50 %	25 %	339501601
542	NC_015730	GGAT	2	8	26433	26440	25 %	25 %	50 %	0 %	339501601
543	NC_015730	TGG	2	6	26451	26456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501601
544	NC_015730	CAG	2	6	26495	26500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501601
545	NC_015730	GCC	2	6	26577	26582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501601
546	NC_015730	GCC	2	6	26709	26714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501601
547	NC_015730	CCA	2	6	26780	26785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501601
548	NC_015730	GCT	2	6	26811	26816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501601
549	NC_015730	CTG	2	6	26836	26841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501601
550	NC_015730	TGC	2	6	26975	26980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501601
551	NC_015730	CGA	3	9	26986	26994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501601
552	NC_015730	CAC	2	6	27081	27086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501601
553	NC_015730	GACG	2	8	27151	27158	25 %	0 %	50 %	25 %	339501601
554	NC_015730	AGC	2	6	27204	27209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501601
555	NC_015730	GT	3	6	27265	27270	0 %	50 %	50 %	0 %	339501601
556	NC_015730	GCC	2	6	27344	27349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501601
557	NC_015730	GCA	2	6	27408	27413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501601
558	NC_015730	CCT	2	6	27478	27483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_015730	GCGG	2	8	27494	27501	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
560	NC_015730	GATG	2	8	27505	27512	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015730	CT	6	12	27534	27545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_015730	AAAC	2	8	27569	27576	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_015730	CGC	2	6	27656	27661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_015730	ACGG	2	8	27667	27674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_015730	GCA	2	6	27743	27748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501602
566	NC_015730	TGAT	2	8	27763	27770	25 %	50 %	25 %	0 %	339501602
567	NC_015730	AAC	2	6	27774	27779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501602
568	NC_015730	GGC	2	6	27878	27883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501602
569	NC_015730	T	6	6	27889	27894	0 %	100 %	0 %	0 %	339501602
570	NC_015730	CTA	2	6	27899	27904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501602
571	NC_015730	G	6	6	27981	27986	0 %	0 %	100 %	0 %	339501602
572	NC_015730	TGC	2	6	27992	27997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501602
573	NC_015730	GAA	2	6	28020	28025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501602
574	NC_015730	GCCC	2	8	28061	28068	0 %	0 %	25 %	75 %	339501602
575	NC_015730	GAA	2	6	28089	28094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501602
576	NC_015730	CGG	2	6	28123	28128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501602
577	NC_015730	ACGGTG	2	12	28233	28244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339501602
578	NC_015730	TGT	2	6	28339	28344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501602
579	NC_015730	GC	4	8	28355	28362	0 %	0 %	50 %	50 %	339501602
580	NC_015730	GC	4	8	28407	28414	0 %	0 %	50 %	50 %	339501602
581	NC_015730	ACGG	2	8	28417	28424	25 %	0 %	50 %	25 %	339501602
582	NC_015730	CGA	2	6	28454	28459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501602
583	NC_015730	ATG	2	6	28558	28563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501602
584	NC_015730	CAT	2	6	28565	28570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501602
585	NC_015730	GAC	2	6	28602	28607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501602
586	NC_015730	GTT	2	6	28608	28613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501602
587	NC_015730	GATC	2	8	28702	28709	25 %	25 %	25 %	25 %	339501602
588	NC_015730	GGT	2	6	28784	28789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501602
589	NC_015730	CGA	2	6	28813	28818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501602
590	NC_015730	GAA	2	6	28902	28907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501602
591	NC_015730	CAT	2	6	28919	28924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501602
592	NC_015730	GCC	2	6	29046	29051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_015730	G	6	6	29094	29099	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015730	GCA	2	6	29102	29107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015730	A	6	6	29107	29112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015730	CAC	2	6	29227	29232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_015730	GCG	2	6	29284	29289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015730	GCA	2	6	29316	29321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_015730	CAA	2	6	29333	29338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_015730	CG	3	6	29408	29413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_015730	AACAG	2	10	29498	29507	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
602	NC_015730	ACCG	2	8	29533	29540	25 %	0 %	25 %	50 %	339501603
603	NC_015730	CGT	2	6	29726	29731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501603
604	NC_015730	TGA	2	6	29792	29797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501603
605	NC_015730	GGC	2	6	29878	29883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501603
606	NC_015730	ATC	2	6	29895	29900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501603
607	NC_015730	CGG	2	6	30018	30023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501603
608	NC_015730	ACC	2	6	30103	30108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501603
609	NC_015730	CGG	2	6	30188	30193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501603
610	NC_015730	TAT	2	6	30264	30269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501603
611	NC_015730	GCGG	2	8	30288	30295	0 %	0 %	75 %	25 %	339501603
612	NC_015730	GATG	2	8	30401	30408	25 %	25 %	50 %	0 %	339501603
613	NC_015730	AGA	2	6	30476	30481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501603
614	NC_015730	GCA	2	6	30494	30499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501603
615	NC_015730	CGG	2	6	30590	30595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501604
616	NC_015730	CG	3	6	30712	30717	0 %	0 %	50 %	50 %	339501604
617	NC_015730	TGATC	2	10	30724	30733	20 %	40 %	20 %	20 %	339501604
618	NC_015730	ACG	2	6	30742	30747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501604
619	NC_015730	CG	3	6	30794	30799	0 %	0 %	50 %	50 %	339501604
620	NC_015730	ATG	2	6	30819	30824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501604
621	NC_015730	CCG	2	6	30825	30830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501604
622	NC_015730	GTG	2	6	30853	30858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501604
623	NC_015730	CGGCG	2	10	30914	30923	0 %	0 %	60 %	40 %	339501604
624	NC_015730	GGC	2	6	31019	31024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501604
625	NC_015730	TGG	2	6	31025	31030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501604
626	NC_015730	CCGA	2	8	31241	31248	25 %	0 %	25 %	50 %	339501604
627	NC_015730	GTG	2	6	31294	31299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501604
628	NC_015730	GC	3	6	31359	31364	0 %	0 %	50 %	50 %	339501604
629	NC_015730	GCT	2	6	31391	31396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501604
630	NC_015730	TAT	2	6	31547	31552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501604
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764	NC_015730	CGC	2	6	38480	38485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501612
765	NC_015730	C	6	6	38545	38550	0 %	0 %	0 %	100 %	339501612
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