MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 chromosome

Total Repeats: 86129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015730	CAT	2	6	262404	262409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501837
5002	NC_015730	CGGG	2	8	262410	262417	0 %	0 %	75 %	25 %	339501837
5003	NC_015730	AAT	2	6	262423	262428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501837
5004	NC_015730	CCA	2	6	262454	262459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501837
5005	NC_015730	TGC	2	6	262493	262498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501837
5006	NC_015730	GCG	2	6	262527	262532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501837
5007	NC_015730	ATGA	2	8	262560	262567	50 %	25 %	25 %	0 %	339501837
5008	NC_015730	CGG	2	6	262577	262582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501838
5009	NC_015730	GCA	2	6	262587	262592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501838
5010	NC_015730	ACA	2	6	262648	262653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501838
5011	NC_015730	GCTC	2	8	262675	262682	0 %	25 %	25 %	50 %	339501838
5012	NC_015730	CTT	2	6	262689	262694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501838
5013	NC_015730	GAC	3	9	262715	262723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501838
5014	NC_015730	AGG	2	6	262909	262914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501838
5015	NC_015730	GC	5	10	262917	262926	0 %	0 %	50 %	50 %	339501838
5016	NC_015730	CGG	2	6	262994	262999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501838
5017	NC_015730	CAG	3	9	263001	263009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501838
5018	NC_015730	CG	3	6	263025	263030	0 %	0 %	50 %	50 %	339501838
5019	NC_015730	TGC	2	6	263050	263055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501838
5020	NC_015730	CG	3	6	263118	263123	0 %	0 %	50 %	50 %	339501838
5021	NC_015730	CAG	2	6	263127	263132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501838
5022	NC_015730	GAA	2	6	263172	263177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501838
5023	NC_015730	GCC	2	6	263217	263222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501838
5024	NC_015730	ATG	2	6	263254	263259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501838
5025	NC_015730	TCG	2	6	263275	263280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501838
5026	NC_015730	TCG	2	6	263320	263325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501838
5027	NC_015730	CG	4	8	263381	263388	0 %	0 %	50 %	50 %	339501838
5028	NC_015730	CGTA	2	8	263492	263499	25 %	25 %	25 %	25 %	339501838
5029	NC_015730	GAT	2	6	263547	263552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501838
5030	NC_015730	GAT	2	6	263556	263561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501838
5031	NC_015730	GCC	2	6	263598	263603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501838
5032	NC_015730	CTG	2	6	263616	263621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501838
5033	NC_015730	TCA	2	6	263653	263658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501839
5034	NC_015730	GCCC	2	8	263685	263692	0 %	0 %	25 %	75 %	339501839
5035	NC_015730	GC	4	8	263727	263734	0 %	0 %	50 %	50 %	339501839
5036	NC_015730	ACAG	2	8	263807	263814	50 %	0 %	25 %	25 %	339501839
5037	NC_015730	CAGA	2	8	263850	263857	50 %	0 %	25 %	25 %	339501839
5038	NC_015730	GCC	2	6	263900	263905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501839
5039	NC_015730	C	6	6	263904	263909	0 %	0 %	0 %	100 %	339501839
5040	NC_015730	GCC	2	6	263919	263924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501839
5041	NC_015730	CG	4	8	263975	263982	0 %	0 %	50 %	50 %	339501839
5042	NC_015730	CAC	2	6	264027	264032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501839
5043	NC_015730	GTT	2	6	264077	264082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501839
5044	NC_015730	CAC	2	6	264243	264248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_015730	ACT	2	6	264249	264254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_015730	GCG	2	6	264358	264363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_015730	ATG	2	6	264406	264411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501840
5048	NC_015730	TGC	2	6	264534	264539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501840
5049	NC_015730	GGC	2	6	264547	264552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501840
5050	NC_015730	GGT	2	6	264597	264602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501840
5051	NC_015730	CGG	3	9	264671	264679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501840
5052	NC_015730	CGGG	2	8	264715	264722	0 %	0 %	75 %	25 %	339501840
5053	NC_015730	CGA	2	6	264849	264854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501840
5054	NC_015730	ATCA	2	8	265054	265061	50 %	25 %	0 %	25 %	339501840
5055	NC_015730	C	6	6	265098	265103	0 %	0 %	0 %	100 %	339501840
5056	NC_015730	GTC	2	6	265105	265110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501840
5057	NC_015730	GAA	2	6	265114	265119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501840
5058	NC_015730	CTG	2	6	265311	265316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_015730	CG	3	6	265328	265333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_015730	CCG	2	6	265365	265370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_015730	TCG	2	6	265391	265396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_015730	TGC	2	6	265453	265458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_015730	GGA	2	6	265462	265467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015730	CG	4	8	265582	265589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_015730	GCG	2	6	265677	265682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_015730	GCG	2	6	265700	265705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_015730	CG	3	6	265717	265722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_015730	AAAC	2	8	265744	265751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_015730	GGC	2	6	265819	265824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501841
5070	NC_015730	GCCT	2	8	265864	265871	0 %	25 %	25 %	50 %	339501841
5071	NC_015730	TTG	2	6	265891	265896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501841
5072	NC_015730	GAA	2	6	265900	265905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501841
5073	NC_015730	GC	3	6	266073	266078	0 %	0 %	50 %	50 %	339501841
5074	NC_015730	GC	3	6	266107	266112	0 %	0 %	50 %	50 %	339501841
5075	NC_015730	CTG	2	6	266230	266235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501841
5076	NC_015730	GCCAAG	2	12	266236	266247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501841
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5078	NC_015730	CG	4	8	266361	266368	0 %	0 %	50 %	50 %	339501841
5079	NC_015730	TTG	2	6	266387	266392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501841
5080	NC_015730	GC	3	6	266400	266405	0 %	0 %	50 %	50 %	339501841
5081	NC_015730	CGAAGG	2	12	266421	266432	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339501841
5082	NC_015730	CAC	2	6	266475	266480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501841
5083	NC_015730	GCG	2	6	266540	266545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501841
5084	NC_015730	CTG	2	6	266557	266562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501841
5085	NC_015730	G	6	6	266562	266567	0 %	0 %	100 %	0 %	339501841
5086	NC_015730	CTG	2	6	266578	266583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501841
5087	NC_015730	GCG	2	6	266608	266613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501841
5088	NC_015730	CG	3	6	266674	266679	0 %	0 %	50 %	50 %	339501841
5089	NC_015730	ACG	2	6	266689	266694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501841
5090	NC_015730	GAT	2	6	266733	266738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501841
5091	NC_015730	TGT	2	6	266744	266749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501841
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5093	NC_015730	CATG	2	8	266802	266809	25 %	25 %	25 %	25 %	339501841
5094	NC_015730	ATC	2	6	266984	266989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501841
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5096	NC_015730	AGA	2	6	267125	267130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501842
5097	NC_015730	GCACG	2	10	267247	267256	20 %	0 %	40 %	40 %	339501842
5098	NC_015730	CAG	2	6	267317	267322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501842
5099	NC_015730	TCTG	2	8	267353	267360	0 %	50 %	25 %	25 %	339501842
5100	NC_015730	TGT	2	6	267377	267382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501842
5101	NC_015730	TCA	2	6	267409	267414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501842
5102	NC_015730	GAC	2	6	267506	267511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501842
5103	NC_015730	TGC	2	6	267593	267598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501843
5104	NC_015730	TCGCC	2	10	267767	267776	0 %	20 %	20 %	60 %	339501843
5105	NC_015730	TGA	2	6	267785	267790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501843
5106	NC_015730	TGC	2	6	267797	267802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501843
5107	NC_015730	GGC	2	6	267845	267850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501843
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5109	NC_015730	GCTGG	2	10	267923	267932	0 %	20 %	60 %	20 %	339501843
5110	NC_015730	GGC	2	6	267947	267952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501843
5111	NC_015730	GGT	2	6	267972	267977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501843
5112	NC_015730	TGA	2	6	268003	268008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501843
5113	NC_015730	GCA	2	6	268098	268103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501843
5114	NC_015730	TGA	2	6	268118	268123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501843
5115	NC_015730	G	7	7	268137	268143	0 %	0 %	100 %	0 %	339501843
5116	NC_015730	GCA	2	6	268155	268160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501843
5117	NC_015730	ACGGC	2	10	268168	268177	20 %	0 %	40 %	40 %	339501843
5118	NC_015730	CGG	2	6	268228	268233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501843
5119	NC_015730	GCG	2	6	268238	268243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501843
5120	NC_015730	GC	3	6	268369	268374	0 %	0 %	50 %	50 %	339501843
5121	NC_015730	TGC	2	6	268397	268402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501843
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5123	NC_015730	CGGTGG	2	12	268414	268425	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339501843
5124	NC_015730	GCG	2	6	268454	268459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501843
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5126	NC_015730	GC	3	6	268594	268599	0 %	0 %	50 %	50 %	339501843
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5187	NC_015730	GGTAC	2	10	271595	271604	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5235	NC_015730	TGC	2	6	274203	274208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501851
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5242	NC_015730	AGGGCA	2	12	274541	274552	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339501851
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5244	NC_015730	ATG	2	6	274589	274594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501851
5245	NC_015730	AAC	2	6	274633	274638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5246	NC_015730	GCT	2	6	274672	274677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5247	NC_015730	GAATTG	2	12	274756	274767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_015730	AC	3	6	274769	274774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5249	NC_015730	GTT	2	6	274832	274837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_015730	TAC	2	6	274840	274845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501852
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5252	NC_015730	GC	5	10	274971	274980	0 %	0 %	50 %	50 %	339501852
5253	NC_015730	CGG	2	6	274989	274994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501852
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5257	NC_015730	TGA	2	6	275159	275164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501852
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5260	NC_015730	GCG	2	6	275227	275232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501852
5261	NC_015730	TCG	2	6	275233	275238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501852
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5263	NC_015730	TCT	2	6	275461	275466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501852
5264	NC_015730	CAT	2	6	275681	275686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501852
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5274	NC_015730	GC	3	6	276171	276176	0 %	0 %	50 %	50 %	339501852
5275	NC_015730	TGG	2	6	276196	276201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501852
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5277	NC_015730	CCA	2	6	276390	276395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501853
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5280	NC_015730	GCT	2	6	276604	276609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501853
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5282	NC_015730	CCTG	2	8	276712	276719	0 %	25 %	25 %	50 %	339501853
5283	NC_015730	GGGCA	2	10	276806	276815	20 %	0 %	60 %	20 %	339501853
5284	NC_015730	TGG	2	6	276894	276899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501853
5285	NC_015730	CAT	2	6	276943	276948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501853
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5288	NC_015730	CCGCC	2	10	277030	277039	0 %	0 %	20 %	80 %	339501853
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5370	NC_015730	GC	3	6	280719	280724	0 %	0 %	50 %	50 %	339501858
5371	NC_015730	CGG	2	6	280730	280735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501858
5372	NC_015730	GC	3	6	280796	280801	0 %	0 %	50 %	50 %	339501859
5373	NC_015730	CTG	2	6	280827	280832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501859
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5375	NC_015730	GAT	2	6	280865	280870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501859
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5430	NC_015730	TCGC	2	8	283902	283909	0 %	25 %	25 %	50 %	339501862
5431	NC_015730	GC	4	8	283958	283965	0 %	0 %	50 %	50 %	339501862
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5434	NC_015730	GTA	2	6	284039	284044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501862
5435	NC_015730	GGT	2	6	284271	284276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5436	NC_015730	GGC	2	6	284294	284299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5442	NC_015730	CAT	2	6	284472	284477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501863
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5453	NC_015730	GC	3	6	285130	285135	0 %	0 %	50 %	50 %	339501863
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5466	NC_015730	CCGC	2	8	285788	285795	0 %	0 %	25 %	75 %	339501864
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5470	NC_015730	CACCGC	2	12	286052	286063	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	339501864
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5472	NC_015730	GC	3	6	286260	286265	0 %	0 %	50 %	50 %	339501864
5473	NC_015730	GCCA	2	8	286342	286349	25 %	0 %	25 %	50 %	339501864
5474	NC_015730	GCA	2	6	286361	286366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501864
5475	NC_015730	CGG	2	6	286382	286387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501864
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5478	NC_015730	CGC	2	6	286654	286659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501864
5479	NC_015730	CAGGG	2	10	286832	286841	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5480	NC_015730	CAG	2	6	286927	286932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5481	NC_015730	CTG	2	6	286950	286955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5482	NC_015730	GC	3	6	287040	287045	0 %	0 %	50 %	50 %	339501865
5483	NC_015730	G	7	7	287143	287149	0 %	0 %	100 %	0 %	339501865
5484	NC_015730	GAA	3	9	287152	287160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501865
5485	NC_015730	AGC	2	6	287161	287166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501865
5486	NC_015730	CAT	2	6	287184	287189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501865
5487	NC_015730	GCC	2	6	287197	287202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501865
5488	NC_015730	GGCGTT	2	12	287209	287220	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339501865
5489	NC_015730	CGT	2	6	287244	287249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501865
5490	NC_015730	CGA	2	6	287252	287257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501865
5491	NC_015730	AGC	2	6	287299	287304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501865
5492	NC_015730	TGA	2	6	287315	287320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501865
5493	NC_015730	CG	3	6	287347	287352	0 %	0 %	50 %	50 %	339501865
5494	NC_015730	GAT	2	6	287383	287388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501865
5495	NC_015730	GC	3	6	287412	287417	0 %	0 %	50 %	50 %	339501865
5496	NC_015730	CG	3	6	287526	287531	0 %	0 %	50 %	50 %	339501865
5497	NC_015730	TTGG	2	8	287589	287596	0 %	50 %	50 %	0 %	339501865
5498	NC_015730	CTT	2	6	287604	287609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501865
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